MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 5126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015954	CG	3	6	116	121	0 %	0 %	50 %	50 %	345004011
2	NC_015954	GC	4	8	1000	1007	0 %	0 %	50 %	50 %	345004011
3	NC_015954	AT	3	6	1162	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015954	GC	3	6	1313	1318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015954	TC	3	6	1411	1416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015954	GC	3	6	1787	1792	0 %	0 %	50 %	50 %	345004012
7	NC_015954	TG	3	6	2192	2197	0 %	50 %	50 %	0 %	345004012
8	NC_015954	GC	3	6	2577	2582	0 %	0 %	50 %	50 %	345004012
9	NC_015954	CG	3	6	2702	2707	0 %	0 %	50 %	50 %	345004012
10	NC_015954	TC	3	6	2759	2764	0 %	50 %	0 %	50 %	345004012
11	NC_015954	AC	3	6	3369	3374	50 %	0 %	0 %	50 %	345004012
12	NC_015954	CG	4	8	3407	3414	0 %	0 %	50 %	50 %	345004012
13	NC_015954	AG	3	6	4224	4229	50 %	0 %	50 %	0 %	345004013
14	NC_015954	GA	3	6	4533	4538	50 %	0 %	50 %	0 %	345004014
15	NC_015954	CG	3	6	5238	5243	0 %	0 %	50 %	50 %	345004014
16	NC_015954	CG	3	6	6722	6727	0 %	0 %	50 %	50 %	345004015
17	NC_015954	CA	3	6	7165	7170	50 %	0 %	0 %	50 %	345004016
18	NC_015954	CG	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	345004017
19	NC_015954	GC	3	6	8678	8683	0 %	0 %	50 %	50 %	345004017
20	NC_015954	TG	3	6	9162	9167	0 %	50 %	50 %	0 %	345004017
21	NC_015954	CG	3	6	9771	9776	0 %	0 %	50 %	50 %	345004018
22	NC_015954	TC	3	6	10845	10850	0 %	50 %	0 %	50 %	345004019
23	NC_015954	GC	3	6	12646	12651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015954	GA	3	6	13114	13119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015954	TC	3	6	13364	13369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015954	CG	3	6	13933	13938	0 %	0 %	50 %	50 %	345004021
27	NC_015954	CA	3	6	14188	14193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015954	GT	3	6	15773	15778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015954	CG	3	6	17008	17013	0 %	0 %	50 %	50 %	345004023
30	NC_015954	CG	4	8	17567	17574	0 %	0 %	50 %	50 %	345004024
31	NC_015954	TG	3	6	18503	18508	0 %	50 %	50 %	0 %	345004024
32	NC_015954	CG	3	6	19287	19292	0 %	0 %	50 %	50 %	345004025
33	NC_015954	AG	3	6	19382	19387	50 %	0 %	50 %	0 %	345004025
34	NC_015954	GA	3	6	19516	19521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015954	CT	3	6	19528	19533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015954	TC	3	6	19714	19719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015954	GC	3	6	20267	20272	0 %	0 %	50 %	50 %	345004026
38	NC_015954	GC	3	6	20481	20486	0 %	0 %	50 %	50 %	345004026
39	NC_015954	CG	3	6	20674	20679	0 %	0 %	50 %	50 %	345004026
40	NC_015954	AT	3	6	22820	22825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015954	AT	3	6	22860	22865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015954	TC	3	6	22956	22961	0 %	50 %	0 %	50 %	345004029
43	NC_015954	AC	3	6	23081	23086	50 %	0 %	0 %	50 %	345004029
44	NC_015954	CA	3	6	24748	24753	50 %	0 %	0 %	50 %	345004031
45	NC_015954	AC	3	6	24776	24781	50 %	0 %	0 %	50 %	345004031
46	NC_015954	GC	3	6	24882	24887	0 %	0 %	50 %	50 %	345004031
47	NC_015954	TG	3	6	25168	25173	0 %	50 %	50 %	0 %	345004031
48	NC_015954	GC	3	6	26070	26075	0 %	0 %	50 %	50 %	345004032
49	NC_015954	GC	3	6	26760	26765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015954	CG	3	6	27065	27070	0 %	0 %	50 %	50 %	345004034
51	NC_015954	GC	3	6	28962	28967	0 %	0 %	50 %	50 %	345004037
52	NC_015954	GC	4	8	29227	29234	0 %	0 %	50 %	50 %	345004038
53	NC_015954	GC	3	6	29463	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	345004038
54	NC_015954	GC	3	6	31324	31329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015954	CG	3	6	31572	31577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015954	CT	3	6	32030	32035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015954	AG	3	6	32914	32919	50 %	0 %	50 %	0 %	345004041
58	NC_015954	GC	3	6	33023	33028	0 %	0 %	50 %	50 %	345004041
59	NC_015954	TG	3	6	34875	34880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015954	CT	3	6	34932	34937	0 %	50 %	0 %	50 %	345004044
61	NC_015954	CG	3	6	37421	37426	0 %	0 %	50 %	50 %	345004045
62	NC_015954	GC	3	6	38353	38358	0 %	0 %	50 %	50 %	345004047
63	NC_015954	GA	3	6	38411	38416	50 %	0 %	50 %	0 %	345004047
64	NC_015954	CG	3	6	41104	41109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015954	GC	3	6	41494	41499	0 %	0 %	50 %	50 %	345004050
66	NC_015954	TC	3	6	41854	41859	0 %	50 %	0 %	50 %	345004051
67	NC_015954	TC	3	6	42863	42868	0 %	50 %	0 %	50 %	345004052
68	NC_015954	GC	3	6	43224	43229	0 %	0 %	50 %	50 %	345004052
69	NC_015954	AC	3	6	43445	43450	50 %	0 %	0 %	50 %	345004052
70	NC_015954	CG	3	6	43960	43965	0 %	0 %	50 %	50 %	345004052
71	NC_015954	CG	3	6	44259	44264	0 %	0 %	50 %	50 %	345004053
72	NC_015954	GC	4	8	44384	44391	0 %	0 %	50 %	50 %	345004053
73	NC_015954	GC	3	6	45303	45308	0 %	0 %	50 %	50 %	345004054
74	NC_015954	GC	3	6	45333	45338	0 %	0 %	50 %	50 %	345004054
75	NC_015954	CG	3	6	45861	45866	0 %	0 %	50 %	50 %	345004054
76	NC_015954	CA	3	6	46527	46532	50 %	0 %	0 %	50 %	345004056
77	NC_015954	GC	3	6	48722	48727	0 %	0 %	50 %	50 %	345004060
78	NC_015954	CG	4	8	50468	50475	0 %	0 %	50 %	50 %	345004061
79	NC_015954	GA	3	6	51293	51298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015954	GC	4	8	51974	51981	0 %	0 %	50 %	50 %	345004063
81	NC_015954	AG	3	6	52077	52082	50 %	0 %	50 %	0 %	345004063
82	NC_015954	GC	3	6	52124	52129	0 %	0 %	50 %	50 %	345004063
83	NC_015954	GC	3	6	53539	53544	0 %	0 %	50 %	50 %	345004064
84	NC_015954	GT	3	6	53961	53966	0 %	50 %	50 %	0 %	345004065
85	NC_015954	GC	3	6	57453	57458	0 %	0 %	50 %	50 %	345004067
86	NC_015954	CT	3	6	57665	57670	0 %	50 %	0 %	50 %	345004067
87	NC_015954	TC	3	6	57717	57722	0 %	50 %	0 %	50 %	345004067
88	NC_015954	CG	3	6	57858	57863	0 %	0 %	50 %	50 %	345004067
89	NC_015954	CG	3	6	58255	58260	0 %	0 %	50 %	50 %	345004068
90	NC_015954	CG	3	6	59466	59471	0 %	0 %	50 %	50 %	345004070
91	NC_015954	CG	3	6	61022	61027	0 %	0 %	50 %	50 %	345004071
92	NC_015954	GC	3	6	61498	61503	0 %	0 %	50 %	50 %	345004071
93	NC_015954	GT	3	6	61570	61575	0 %	50 %	50 %	0 %	345004072
94	NC_015954	TC	3	6	61797	61802	0 %	50 %	0 %	50 %	345004072
95	NC_015954	GA	3	6	62484	62489	50 %	0 %	50 %	0 %	345004072
96	NC_015954	GT	4	8	62679	62686	0 %	50 %	50 %	0 %	345004072
97	NC_015954	CG	3	6	62954	62959	0 %	0 %	50 %	50 %	345004072
98	NC_015954	GC	3	6	63288	63293	0 %	0 %	50 %	50 %	345004072
99	NC_015954	GA	3	6	64308	64313	50 %	0 %	50 %	0 %	345004074
100	NC_015954	GC	3	6	64756	64761	0 %	0 %	50 %	50 %	345004075
101	NC_015954	CG	3	6	66102	66107	0 %	0 %	50 %	50 %	345004076
102	NC_015954	GT	3	6	67754	67759	0 %	50 %	50 %	0 %	345004079
103	NC_015954	GC	3	6	68847	68852	0 %	0 %	50 %	50 %	345004081
104	NC_015954	CG	3	6	69080	69085	0 %	0 %	50 %	50 %	345004081
105	NC_015954	CG	3	6	69869	69874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015954	CT	3	6	73505	73510	0 %	50 %	0 %	50 %	345004084
107	NC_015954	CG	3	6	74668	74673	0 %	0 %	50 %	50 %	345004085
108	NC_015954	CG	3	6	75741	75746	0 %	0 %	50 %	50 %	345004087
109	NC_015954	CG	3	6	76321	76326	0 %	0 %	50 %	50 %	345004088
110	NC_015954	GC	3	6	76978	76983	0 %	0 %	50 %	50 %	345004089
111	NC_015954	GA	3	6	77060	77065	50 %	0 %	50 %	0 %	345004089
112	NC_015954	AC	3	6	77455	77460	50 %	0 %	0 %	50 %	345004089
113	NC_015954	AG	3	6	77938	77943	50 %	0 %	50 %	0 %	345004090
114	NC_015954	GC	5	10	77993	78002	0 %	0 %	50 %	50 %	345004090
115	NC_015954	GT	4	8	78098	78105	0 %	50 %	50 %	0 %	345004090
116	NC_015954	TC	3	6	78835	78840	0 %	50 %	0 %	50 %	345004091
117	NC_015954	AG	3	6	78956	78961	50 %	0 %	50 %	0 %	345004091
118	NC_015954	GC	4	8	79058	79065	0 %	0 %	50 %	50 %	345004091
119	NC_015954	CG	3	6	79707	79712	0 %	0 %	50 %	50 %	345004092
120	NC_015954	GC	3	6	79730	79735	0 %	0 %	50 %	50 %	345004092
121	NC_015954	CT	3	6	79958	79963	0 %	50 %	0 %	50 %	345004093
122	NC_015954	AG	3	6	82227	82232	50 %	0 %	50 %	0 %	345004095
123	NC_015954	TG	3	6	82805	82810	0 %	50 %	50 %	0 %	345004095
124	NC_015954	GC	3	6	83274	83279	0 %	0 %	50 %	50 %	345004095
125	NC_015954	GT	3	6	83311	83316	0 %	50 %	50 %	0 %	345004095
126	NC_015954	CG	3	6	83418	83423	0 %	0 %	50 %	50 %	345004095
127	NC_015954	TC	3	6	83549	83554	0 %	50 %	0 %	50 %	345004095
128	NC_015954	GC	3	6	83750	83755	0 %	0 %	50 %	50 %	345004095
129	NC_015954	TG	3	6	84813	84818	0 %	50 %	50 %	0 %	345004096
130	NC_015954	GC	3	6	84866	84871	0 %	0 %	50 %	50 %	345004096
131	NC_015954	GC	3	6	85041	85046	0 %	0 %	50 %	50 %	345004096
132	NC_015954	TC	3	6	86477	86482	0 %	50 %	0 %	50 %	345004097
133	NC_015954	AC	3	6	86591	86596	50 %	0 %	0 %	50 %	345004097
134	NC_015954	CT	3	6	86652	86657	0 %	50 %	0 %	50 %	345004097
135	NC_015954	GC	3	6	87995	88000	0 %	0 %	50 %	50 %	345004098
136	NC_015954	TC	3	6	88161	88166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015954	GC	3	6	88941	88946	0 %	0 %	50 %	50 %	345004099
138	NC_015954	AC	3	6	90340	90345	50 %	0 %	0 %	50 %	345004100
139	NC_015954	TC	3	6	90494	90499	0 %	50 %	0 %	50 %	345004100
140	NC_015954	GC	3	6	91893	91898	0 %	0 %	50 %	50 %	345004101
141	NC_015954	CG	3	6	92056	92061	0 %	0 %	50 %	50 %	345004102
142	NC_015954	GT	3	6	92268	92273	0 %	50 %	50 %	0 %	345004102
143	NC_015954	CG	3	6	93600	93605	0 %	0 %	50 %	50 %	345004104
144	NC_015954	GC	3	6	93708	93713	0 %	0 %	50 %	50 %	345004104
145	NC_015954	GC	3	6	93749	93754	0 %	0 %	50 %	50 %	345004104
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