MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 71994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015954	CTT	2	6	103268	103273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_015954	CGG	2	6	103304	103309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_015954	CG	3	6	103332	103337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_015954	ACA	2	6	103355	103360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_015954	GCTG	2	8	103531	103538	0 %	25 %	50 %	25 %	345004115
2506	NC_015954	GCCG	2	8	103564	103571	0 %	0 %	50 %	50 %	345004115
2507	NC_015954	CCG	3	9	103569	103577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004115
2508	NC_015954	CCG	2	6	103583	103588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004115
2509	NC_015954	CGG	2	6	103639	103644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004115
2510	NC_015954	GCC	2	6	103645	103650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004115
2511	NC_015954	CTG	2	6	103691	103696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004115
2512	NC_015954	TCG	3	9	103768	103776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2513	NC_015954	CCG	2	6	103790	103795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004116
2514	NC_015954	CGTC	2	8	103799	103806	0 %	25 %	25 %	50 %	345004116
2515	NC_015954	CTT	2	6	103808	103813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345004116
2516	NC_015954	GTC	2	6	103837	103842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2517	NC_015954	GAC	2	6	103845	103850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2518	NC_015954	CCT	2	6	103886	103891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004116
2519	NC_015954	GTC	2	6	103920	103925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2520	NC_015954	AGA	3	9	103982	103990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345004116
2521	NC_015954	AGC	2	6	104098	104103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2522	NC_015954	ACG	2	6	104110	104115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2523	NC_015954	GTA	2	6	104157	104162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004116
2524	NC_015954	GCCC	2	8	104163	104170	0 %	0 %	25 %	75 %	345004116
2525	NC_015954	GGCCC	2	10	104189	104198	0 %	0 %	40 %	60 %	345004116
2526	NC_015954	CGG	2	6	104228	104233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004116
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2529	NC_015954	CAGC	2	8	104399	104406	25 %	0 %	25 %	50 %	345004116
2530	NC_015954	ACG	2	6	104434	104439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
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2532	NC_015954	CGC	2	6	104511	104516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004116
2533	NC_015954	GT	3	6	104558	104563	0 %	50 %	50 %	0 %	345004116
2534	NC_015954	CGA	2	6	104579	104584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2535	NC_015954	GAG	2	6	104634	104639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004116
2536	NC_015954	CGA	2	6	104642	104647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
2537	NC_015954	AGA	2	6	104702	104707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345004116
2538	NC_015954	GCG	2	6	104713	104718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004116
2539	NC_015954	ACG	3	9	104722	104730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004116
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2541	NC_015954	TCC	2	6	104797	104802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004116
2542	NC_015954	CCT	3	9	104828	104836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004116
2543	NC_015954	GCC	2	6	104839	104844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004116
2544	NC_015954	CCG	2	6	104917	104922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_015954	GCA	2	6	104929	104934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_015954	CCGG	2	8	104944	104951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_015954	GGC	2	6	105062	105067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004117
2548	NC_015954	TGG	2	6	105103	105108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004117
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2550	NC_015954	GCC	2	6	105204	105209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004117
2551	NC_015954	GAG	2	6	105210	105215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004117
2552	NC_015954	CCTT	2	8	105226	105233	0 %	50 %	0 %	50 %	345004117
2553	NC_015954	GAT	2	6	105248	105253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004117
2554	NC_015954	CGA	2	6	105256	105261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004117
2555	NC_015954	CA	3	6	105286	105291	50 %	0 %	0 %	50 %	345004117
2556	NC_015954	CGA	2	6	105385	105390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004117
2557	NC_015954	CGG	2	6	105413	105418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004117
2558	NC_015954	GAC	2	6	105420	105425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004117
2559	NC_015954	CGA	2	6	105506	105511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004117
2560	NC_015954	GAG	2	6	105546	105551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004117
2561	NC_015954	GCT	2	6	105578	105583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004117
2562	NC_015954	GTC	2	6	105612	105617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004117
2563	NC_015954	GCAG	2	8	105627	105634	25 %	0 %	50 %	25 %	345004117
2564	NC_015954	CCA	2	6	105728	105733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004117
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2569	NC_015954	TCG	2	6	105872	105877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004118
2570	NC_015954	GAT	2	6	105904	105909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004118
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2572	NC_015954	ACGAG	2	10	106008	106017	40 %	0 %	40 %	20 %	345004118
2573	NC_015954	TCG	2	6	106022	106027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004118
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2578	NC_015954	CG	3	6	106177	106182	0 %	0 %	50 %	50 %	345004118
2579	NC_015954	GCG	2	6	106271	106276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004118
2580	NC_015954	CGA	2	6	106311	106316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004118
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2583	NC_015954	TC	4	8	106386	106393	0 %	50 %	0 %	50 %	345004118
2584	NC_015954	CCG	2	6	106425	106430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004118
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2587	NC_015954	AGGC	2	8	106532	106539	25 %	0 %	50 %	25 %	345004118
2588	NC_015954	AAC	2	6	106604	106609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345004118
2589	NC_015954	CCAG	2	8	106611	106618	25 %	0 %	25 %	50 %	345004118
2590	NC_015954	CT	3	6	106675	106680	0 %	50 %	0 %	50 %	345004118
2591	NC_015954	TGC	2	6	106693	106698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004118
2592	NC_015954	GA	3	6	106739	106744	50 %	0 %	50 %	0 %	345004118
2593	NC_015954	GAC	2	6	106780	106785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004118
2594	NC_015954	TGG	2	6	106859	106864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_015954	CTG	2	6	106881	106886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_015954	GAAA	2	8	106908	106915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_015954	GCGACA	2	12	107025	107036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2598	NC_015954	TCG	2	6	107079	107084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2599	NC_015954	GTTG	2	8	107090	107097	0 %	50 %	50 %	0 %	345004119
2600	NC_015954	GTTGCC	2	12	107133	107144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2601	NC_015954	ATG	2	6	107208	107213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004119
2602	NC_015954	GGA	2	6	107276	107281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004119
2603	NC_015954	CGTCC	2	10	107312	107321	0 %	20 %	20 %	60 %	345004119
2604	NC_015954	GAA	2	6	107348	107353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345004119
2605	NC_015954	GC	3	6	107382	107387	0 %	0 %	50 %	50 %	345004119
2606	NC_015954	TCG	2	6	107529	107534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2607	NC_015954	GAG	2	6	107537	107542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004119
2608	NC_015954	GTC	2	6	107546	107551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2609	NC_015954	TCG	2	6	107577	107582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2610	NC_015954	CGG	3	9	107587	107595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004119
2611	NC_015954	CGT	2	6	107620	107625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2612	NC_015954	GTCGGC	2	12	107642	107653	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345004119
2613	NC_015954	GAT	3	9	107660	107668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004119
2614	NC_015954	GAA	2	6	107669	107674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345004119
2615	NC_015954	ACC	2	6	107691	107696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004119
2616	NC_015954	ACC	2	6	107816	107821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004119
2617	NC_015954	TGG	2	6	107862	107867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004119
2618	NC_015954	GAG	2	6	107870	107875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004119
2619	NC_015954	GTG	2	6	107883	107888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004119
2620	NC_015954	TGA	2	6	107905	107910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004119
2621	NC_015954	CGG	2	6	107923	107928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004119
2622	NC_015954	CGT	3	9	107956	107964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2623	NC_015954	GCTG	2	8	108010	108017	0 %	25 %	50 %	25 %	345004119
2624	NC_015954	CGT	2	6	108052	108057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
2625	NC_015954	CGT	2	6	108115	108120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004119
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2693	NC_015954	AGG	2	6	110795	110800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2703	NC_015954	GCG	2	6	111155	111160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2704	NC_015954	CGG	2	6	111204	111209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2713	NC_015954	GAC	2	6	111588	111593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004123
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2723	NC_015954	CGT	2	6	112005	112010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004124
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2730	NC_015954	GTC	2	6	112288	112293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004124
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2734	NC_015954	CGG	2	6	112370	112375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004124
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2736	NC_015954	GC	3	6	112481	112486	0 %	0 %	50 %	50 %	345004124
2737	NC_015954	CTC	3	9	112499	112507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2738	NC_015954	CGT	2	6	112737	112742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004125
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2742	NC_015954	CCA	2	6	112861	112866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004125
2743	NC_015954	TCG	2	6	112877	112882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004125
2744	NC_015954	ATC	2	6	112898	112903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004125
2745	NC_015954	CGGG	2	8	113001	113008	0 %	0 %	75 %	25 %	345004125
2746	NC_015954	CCG	2	6	113024	113029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004125
2747	NC_015954	CCT	2	6	113049	113054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004125
2748	NC_015954	ACGG	2	8	113068	113075	25 %	0 %	50 %	25 %	345004125
2749	NC_015954	CGT	2	6	113115	113120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004125
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2752	NC_015954	CAT	2	6	113275	113280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004125
2753	NC_015954	AGC	2	6	113395	113400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2754	NC_015954	CGA	2	6	113483	113488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2755	NC_015954	AGC	2	6	113494	113499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2756	NC_015954	TTC	2	6	113518	113523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2757	NC_015954	CG	4	8	113529	113536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2758	NC_015954	CAGA	2	8	113569	113576	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2759	NC_015954	CG	3	6	113616	113621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2760	NC_015954	CGA	2	6	113628	113633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_015954	GTCC	2	8	113647	113654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2762	NC_015954	CGT	2	6	113698	113703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2764	NC_015954	CGA	2	6	113760	113765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2765	NC_015954	GAG	2	6	113766	113771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2766	NC_015954	CGG	2	6	113782	113787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2767	NC_015954	G	6	6	113794	113799	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2768	NC_015954	GAT	2	6	113816	113821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004126
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2772	NC_015954	CTG	2	6	113864	113869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004126
2773	NC_015954	TCG	2	6	113928	113933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004126
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2775	NC_015954	G	6	6	113973	113978	0 %	0 %	100 %	0 %	345004126
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2805	NC_015954	CG	3	6	115011	115016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2831	NC_015954	CGCC	2	8	116092	116099	0 %	0 %	25 %	75 %	345004128
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2855	NC_015954	GTA	2	6	116855	116860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004128
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2862	NC_015954	GA	3	6	117204	117209	50 %	0 %	50 %	0 %	345004128
2863	NC_015954	GCC	2	6	117212	117217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004128
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2866	NC_015954	GGT	2	6	117248	117253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004128
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2983	NC_015954	G	6	6	121692	121697	0 %	0 %	100 %	0 %	345004132
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2988	NC_015954	CGA	2	6	121802	121807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004133
2989	NC_015954	GCC	2	6	121809	121814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004133
2990	NC_015954	CCT	2	6	121826	121831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004133
2991	NC_015954	GAGT	3	12	121948	121959	25 %	25 %	50 %	0 %	345004133
2992	NC_015954	CGA	2	6	121964	121969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004133
2993	NC_015954	GTG	2	6	121996	122001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004133
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2995	NC_015954	CGA	2	6	122162	122167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004133
2996	NC_015954	ACGG	2	8	122168	122175	25 %	0 %	50 %	25 %	345004133
2997	NC_015954	GAC	2	6	122244	122249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004133
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2999	NC_015954	CTC	2	6	122274	122279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004134
3000	NC_015954	CTC	2	6	122325	122330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004134

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