MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 71994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015954	CG	3	6	62954	62959	0 %	0 %	50 %	50 %	345004072
1502	NC_015954	CGG	2	6	62965	62970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004072
1503	NC_015954	GGC	2	6	62982	62987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004072
1504	NC_015954	TCG	2	6	62997	63002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004072
1505	NC_015954	TCG	2	6	63029	63034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004072
1506	NC_015954	AGC	2	6	63046	63051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004072
1507	NC_015954	AGCG	2	8	63124	63131	25 %	0 %	50 %	25 %	345004072
1508	NC_015954	GGT	2	6	63145	63150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004072
1509	NC_015954	CAGC	2	8	63198	63205	25 %	0 %	25 %	50 %	345004072
1510	NC_015954	TCA	2	6	63221	63226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004072
1511	NC_015954	GTA	2	6	63229	63234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004072
1512	NC_015954	GC	3	6	63288	63293	0 %	0 %	50 %	50 %	345004072
1513	NC_015954	CCGT	2	8	63300	63307	0 %	25 %	25 %	50 %	345004072
1514	NC_015954	GTC	2	6	63349	63354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004072
1515	NC_015954	GTC	2	6	63379	63384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004072
1516	NC_015954	GGCT	2	8	63397	63404	0 %	25 %	50 %	25 %	345004072
1517	NC_015954	AGT	2	6	63455	63460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004072
1518	NC_015954	TGG	2	6	63465	63470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004072
1519	NC_015954	GAC	2	6	63523	63528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004073
1520	NC_015954	GGC	2	6	63543	63548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004073
1521	NC_015954	GCC	2	6	63630	63635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004073
1522	NC_015954	CCA	2	6	63650	63655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004073
1523	NC_015954	GCT	2	6	63776	63781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004073
1524	NC_015954	CTG	2	6	63797	63802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004073
1525	NC_015954	CGC	2	6	63838	63843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004073
1526	NC_015954	TGT	2	6	63844	63849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345004073
1527	NC_015954	CGGA	2	8	63860	63867	25 %	0 %	50 %	25 %	345004073
1528	NC_015954	GGC	2	6	63898	63903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004073
1529	NC_015954	GAC	2	6	63922	63927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004073
1530	NC_015954	CCT	2	6	64021	64026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004074
1531	NC_015954	TCCT	2	8	64050	64057	0 %	50 %	0 %	50 %	345004074
1532	NC_015954	CGG	2	6	64085	64090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004074
1533	NC_015954	CCG	2	6	64141	64146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004074
1534	NC_015954	TCG	2	6	64264	64269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004074
1535	NC_015954	CGT	2	6	64300	64305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004074
1536	NC_015954	GA	3	6	64308	64313	50 %	0 %	50 %	0 %	345004074
1537	NC_015954	CGG	2	6	64329	64334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004074
1538	NC_015954	ACG	3	9	64489	64497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1539	NC_015954	CGG	2	6	64616	64621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004075
1540	NC_015954	CTG	2	6	64668	64673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1541	NC_015954	TCG	2	6	64720	64725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1542	NC_015954	GGC	2	6	64752	64757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004075
1543	NC_015954	GC	3	6	64756	64761	0 %	0 %	50 %	50 %	345004075
1544	NC_015954	TCC	2	6	64819	64824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004075
1545	NC_015954	CGCT	2	8	64866	64873	0 %	25 %	25 %	50 %	345004075
1546	NC_015954	ACTC	2	8	64880	64887	25 %	25 %	0 %	50 %	345004075
1547	NC_015954	ACG	2	6	64918	64923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1548	NC_015954	GCA	2	6	64930	64935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1549	NC_015954	GGA	2	6	64949	64954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004075
1550	NC_015954	CTG	2	6	64998	65003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1551	NC_015954	CGT	2	6	65081	65086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1552	NC_015954	TCA	2	6	65101	65106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004075
1553	NC_015954	GGC	2	6	65129	65134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004075
1554	NC_015954	GAC	2	6	65172	65177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1555	NC_015954	CGT	2	6	65186	65191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1556	NC_015954	CGC	2	6	65255	65260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004075
1557	NC_015954	GCG	2	6	65362	65367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004075
1558	NC_015954	CTG	2	6	65406	65411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1559	NC_015954	GCGG	2	8	65453	65460	0 %	0 %	75 %	25 %	345004075
1560	NC_015954	GAC	2	6	65477	65482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1561	NC_015954	ACG	2	6	65527	65532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004075
1562	NC_015954	A	6	6	65551	65556	100 %	0 %	0 %	0 %	345004075
1563	NC_015954	GTT	2	6	65570	65575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015954	CCA	2	6	65586	65591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_015954	GTTGCC	2	12	65707	65718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004076
1566	NC_015954	GCTC	2	8	65744	65751	0 %	25 %	25 %	50 %	345004076
1567	NC_015954	CTC	2	6	65769	65774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004076
1568	NC_015954	ACT	2	6	65777	65782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004076
1569	NC_015954	CGGT	2	8	65788	65795	0 %	25 %	50 %	25 %	345004076
1570	NC_015954	ACG	2	6	65810	65815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004076
1571	NC_015954	GAC	2	6	65922	65927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004076
1572	NC_015954	ACC	2	6	65941	65946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004076
1573	NC_015954	GAG	2	6	65974	65979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004076
1574	NC_015954	GCT	2	6	66016	66021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004076
1575	NC_015954	GCG	2	6	66032	66037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004076
1576	NC_015954	GACCG	2	10	66076	66085	20 %	0 %	40 %	40 %	345004076
1577	NC_015954	CG	3	6	66102	66107	0 %	0 %	50 %	50 %	345004076
1578	NC_015954	GTTG	2	8	66123	66130	0 %	50 %	50 %	0 %	345004076
1579	NC_015954	CGA	2	6	66192	66197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015954	TTG	2	6	66328	66333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345004077
1581	NC_015954	CCG	2	6	66362	66367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004077
1582	NC_015954	TCG	2	6	66383	66388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004077
1583	NC_015954	CTT	2	6	66516	66521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345004077
1584	NC_015954	CTG	2	6	66565	66570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004077
1585	NC_015954	CGAG	2	8	66617	66624	25 %	0 %	50 %	25 %	345004077
1586	NC_015954	CAC	2	6	66648	66653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004077
1587	NC_015954	TCG	2	6	66695	66700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004077
1588	NC_015954	CGC	2	6	66714	66719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004077
1589	NC_015954	CTG	2	6	66730	66735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004077
1590	NC_015954	CCG	2	6	66748	66753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004077
1591	NC_015954	TAG	2	6	66805	66810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004077
1592	NC_015954	CGT	2	6	66818	66823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004078
1593	NC_015954	TGGG	2	8	66852	66859	0 %	25 %	75 %	0 %	345004078
1594	NC_015954	GAA	2	6	66876	66881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345004078
1595	NC_015954	TGG	2	6	66967	66972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004078
1596	NC_015954	GAG	2	6	67087	67092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004078
1597	NC_015954	TTG	2	6	67138	67143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345004078
1598	NC_015954	GGGA	2	8	67150	67157	25 %	0 %	75 %	0 %	345004078
1599	NC_015954	TGA	2	6	67304	67309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004078
1600	NC_015954	GAG	2	6	67341	67346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004078
1601	NC_015954	TCG	2	6	67408	67413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004078
1602	NC_015954	GAC	2	6	67506	67511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004078
1603	NC_015954	GGCC	2	8	67581	67588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_015954	ACCC	2	8	67624	67631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1605	NC_015954	GCT	2	6	67632	67637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_015954	CCA	2	6	67717	67722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004079
1607	NC_015954	GAC	2	6	67723	67728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004079
1608	NC_015954	GT	3	6	67754	67759	0 %	50 %	50 %	0 %	345004079
1609	NC_015954	CGA	2	6	67804	67809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004079
1610	NC_015954	ACG	2	6	67839	67844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004079
1611	NC_015954	AGG	2	6	67854	67859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004079
1612	NC_015954	AGG	2	6	67881	67886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004079
1613	NC_015954	GGA	2	6	67891	67896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004079
1614	NC_015954	CAA	2	6	67922	67927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345004079
1615	NC_015954	CGG	2	6	67939	67944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004079
1616	NC_015954	GAT	3	9	68005	68013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004080
1617	NC_015954	AGT	2	6	68043	68048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004080
1618	NC_015954	CGA	2	6	68082	68087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004080
1619	NC_015954	GCC	2	6	68178	68183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004080
1620	NC_015954	TCG	2	6	68198	68203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004080
1621	NC_015954	CGG	2	6	68211	68216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004080
1622	NC_015954	ACTC	2	8	68352	68359	25 %	25 %	0 %	50 %	345004080
1623	NC_015954	TGC	2	6	68416	68421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004080
1624	NC_015954	GTC	2	6	68485	68490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004080
1625	NC_015954	CTT	2	6	68499	68504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345004080
1626	NC_015954	CGG	2	6	68526	68531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004080
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1633	NC_015954	CGG	2	6	68745	68750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1750	NC_015954	CTCGA	2	10	73386	73395	20 %	20 %	20 %	40 %	345004084
1751	NC_015954	CGG	2	6	73417	73422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004084
1752	NC_015954	CAGC	2	8	73436	73443	25 %	0 %	25 %	50 %	345004084
1753	NC_015954	CGG	2	6	73444	73449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004084
1754	NC_015954	CT	3	6	73505	73510	0 %	50 %	0 %	50 %	345004084
1755	NC_015954	CCTT	2	8	73573	73580	0 %	50 %	0 %	50 %	345004084
1756	NC_015954	ACC	2	6	73596	73601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004084
1757	NC_015954	TCA	2	6	73612	73617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004084
1758	NC_015954	TCA	2	6	73657	73662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004084
1759	NC_015954	GCT	2	6	73670	73675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004084
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1761	NC_015954	CAAG	2	8	73724	73731	50 %	0 %	25 %	25 %	345004084
1762	NC_015954	GTC	4	12	73776	73787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004084
1763	NC_015954	CCT	2	6	73790	73795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004084
1764	NC_015954	CGG	3	9	73814	73822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004084
1765	NC_015954	TCA	2	6	73825	73830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004084
1766	NC_015954	GCT	2	6	73885	73890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004085
1767	NC_015954	CGT	2	6	73918	73923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004085
1768	NC_015954	CGG	2	6	73990	73995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004085
1769	NC_015954	CCG	2	6	74009	74014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004085
1770	NC_015954	CGCTG	2	10	74025	74034	0 %	20 %	40 %	40 %	345004085
1771	NC_015954	AAC	2	6	74051	74056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345004085
1772	NC_015954	GCC	2	6	74069	74074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004085
1773	NC_015954	GAC	2	6	74080	74085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004085
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1780	NC_015954	GAG	2	6	74372	74377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004085
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1783	NC_015954	CAT	2	6	74449	74454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004085
1784	NC_015954	CGG	2	6	74458	74463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004085
1785	NC_015954	CTG	2	6	74465	74470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004085
1786	NC_015954	TCA	2	6	74592	74597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004085
1787	NC_015954	CGT	2	6	74599	74604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004085
1788	NC_015954	CTG	2	6	74609	74614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004085
1789	NC_015954	TGG	2	6	74634	74639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004085
1790	NC_015954	CG	3	6	74668	74673	0 %	0 %	50 %	50 %	345004085
1791	NC_015954	GCC	2	6	74824	74829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1792	NC_015954	GTC	2	6	74861	74866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004086
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1811	NC_015954	GTTG	2	8	75484	75491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1812	NC_015954	TGT	2	6	75516	75521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1823	NC_015954	AAC	2	6	76007	76012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1824	NC_015954	CCA	2	6	76052	76057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1825	NC_015954	AGGC	2	8	76067	76074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1826	NC_015954	ACCCC	2	10	76079	76088	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1827	NC_015954	ACA	2	6	76094	76099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1832	NC_015954	CTG	2	6	76305	76310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004088
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1843	NC_015954	ATCG	2	8	76634	76641	25 %	25 %	25 %	25 %	345004089
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1852	NC_015954	CGA	2	6	77023	77028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004089
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