MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015948	GTG	2	6	135853	135858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210449
3502	NC_015948	GAC	2	6	135897	135902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210449
3503	NC_015948	GCA	2	6	135906	135911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210449
3504	NC_015948	CGG	2	6	135917	135922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210449
3505	NC_015948	CTG	2	6	136044	136049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210449
3506	NC_015948	CGC	2	6	136112	136117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210449
3507	NC_015948	TG	3	6	136195	136200	0 %	50 %	50 %	0 %	344210449
3508	NC_015948	AAC	2	6	136209	136214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210449
3509	NC_015948	CCG	2	6	136339	136344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_015948	CGAA	2	8	136386	136393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_015948	GAC	2	6	136401	136406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210450
3512	NC_015948	ACCGG	2	10	136466	136475	20 %	0 %	40 %	40 %	344210450
3513	NC_015948	GCC	2	6	136485	136490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210450
3514	NC_015948	CGC	2	6	136521	136526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210450
3515	NC_015948	ACGG	2	8	136569	136576	25 %	0 %	50 %	25 %	344210450
3516	NC_015948	GCGACA	2	12	136604	136615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210450
3517	NC_015948	CG	3	6	136624	136629	0 %	0 %	50 %	50 %	344210450
3518	NC_015948	GGCC	2	8	136701	136708	0 %	0 %	50 %	50 %	344210450
3519	NC_015948	GCG	2	6	136718	136723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210450
3520	NC_015948	CGG	2	6	136749	136754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210450
3521	NC_015948	CAG	2	6	136824	136829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210450
3522	NC_015948	CGT	2	6	136962	136967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210450
3523	NC_015948	GCG	2	6	136992	136997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210450
3524	NC_015948	GCAGC	2	10	137001	137010	20 %	0 %	40 %	40 %	344210450
3525	NC_015948	GTG	2	6	137019	137024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210450
3526	NC_015948	ACT	2	6	137039	137044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210450
3527	NC_015948	CGA	2	6	137072	137077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210450
3528	NC_015948	GGT	2	6	137117	137122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210450
3529	NC_015948	GGC	2	6	137130	137135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210450
3530	NC_015948	CCG	2	6	137188	137193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210450
3531	NC_015948	CTG	2	6	137235	137240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210450
3532	NC_015948	GTC	2	6	137254	137259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3533	NC_015948	GAC	2	6	137266	137271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3534	NC_015948	TCG	2	6	137294	137299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3535	NC_015948	TCG	2	6	137333	137338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3536	NC_015948	CGA	2	6	137349	137354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3537	NC_015948	CGG	2	6	137364	137369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210451
3538	NC_015948	GTCG	2	8	137373	137380	0 %	25 %	50 %	25 %	344210451
3539	NC_015948	GA	3	6	137417	137422	50 %	0 %	50 %	0 %	344210451
3540	NC_015948	CAGG	2	8	137436	137443	25 %	0 %	50 %	25 %	344210451
3541	NC_015948	TGA	2	6	137460	137465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210451
3542	NC_015948	CGA	2	6	137472	137477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3543	NC_015948	TCTGC	2	10	137511	137520	0 %	40 %	20 %	40 %	344210451
3544	NC_015948	TCG	2	6	137525	137530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3545	NC_015948	CGC	2	6	137553	137558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210451
3546	NC_015948	CGG	2	6	137562	137567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210451
3547	NC_015948	CGT	2	6	137580	137585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3548	NC_015948	CGCCGA	2	12	137619	137630	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210451
3549	NC_015948	GGC	2	6	137631	137636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210451
3550	NC_015948	GGT	2	6	137640	137645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210451
3551	NC_015948	TCC	2	6	137723	137728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210451
3552	NC_015948	CGA	2	6	137769	137774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210451
3553	NC_015948	CTC	2	6	137991	137996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_015948	CAAT	2	8	138019	138026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_015948	TTG	2	6	138059	138064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_015948	CGA	2	6	138093	138098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210452
3557	NC_015948	GAT	2	6	138100	138105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210452
3558	NC_015948	CTG	2	6	138109	138114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210452
3559	NC_015948	AACAGC	2	12	138164	138175	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	344210452
3560	NC_015948	TGA	2	6	138179	138184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210452
3561	NC_015948	CGA	2	6	138327	138332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210452
3562	NC_015948	CGT	2	6	138351	138356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210452
3563	NC_015948	AAC	3	9	138370	138378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210452
3564	NC_015948	CAA	2	6	138390	138395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210453
3565	NC_015948	TTCC	2	8	138484	138491	0 %	50 %	0 %	50 %	344210453
3566	NC_015948	AC	3	6	138528	138533	50 %	0 %	0 %	50 %	344210453
3567	NC_015948	CAG	2	6	138566	138571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210453
3568	NC_015948	CGA	2	6	138606	138611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210453
3569	NC_015948	CGA	2	6	138655	138660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210453
3570	NC_015948	ACA	2	6	138702	138707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210453
3571	NC_015948	ACG	2	6	138741	138746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210453
3572	NC_015948	CGA	2	6	138754	138759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210453
3573	NC_015948	CCG	2	6	138768	138773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210453
3574	NC_015948	TCG	2	6	138795	138800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210453
3575	NC_015948	GCC	2	6	138836	138841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210453
3576	NC_015948	GAA	2	6	138863	138868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210453
3577	NC_015948	GCC	2	6	138923	138928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210453
3578	NC_015948	T	7	7	138966	138972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_015948	CGC	2	6	138980	138985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_015948	TAT	2	6	138994	138999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210454
3581	NC_015948	ACAA	2	8	139007	139014	75 %	0 %	0 %	25 %	344210454
3582	NC_015948	AGG	2	6	139020	139025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210454
3583	NC_015948	GAG	2	6	139043	139048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210454
3584	NC_015948	GGC	2	6	139096	139101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210454
3585	NC_015948	AGA	2	6	139147	139152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210454
3586	NC_015948	GATG	2	8	139168	139175	25 %	25 %	50 %	0 %	344210454
3587	NC_015948	CGC	2	6	139207	139212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210454
3588	NC_015948	CGAC	2	8	139233	139240	25 %	0 %	25 %	50 %	344210454
3589	NC_015948	CCG	2	6	139266	139271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210454
3590	NC_015948	GCC	2	6	139343	139348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210454
3591	NC_015948	TCG	2	6	139359	139364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210454
3592	NC_015948	GAT	2	6	139369	139374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210454
3593	NC_015948	AGG	2	6	139386	139391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210454
3594	NC_015948	CGA	2	6	139393	139398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210454
3595	NC_015948	CGA	2	6	139450	139455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210454
3596	NC_015948	CGC	2	6	139621	139626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210455
3597	NC_015948	CGA	2	6	139645	139650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3598	NC_015948	CGT	2	6	139699	139704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3599	NC_015948	GAG	2	6	139709	139714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210455
3600	NC_015948	CTC	2	6	139727	139732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210455
3601	NC_015948	ACG	2	6	139737	139742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3602	NC_015948	GAG	2	6	139769	139774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210455
3603	NC_015948	TCA	2	6	139812	139817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210455
3604	NC_015948	CGGT	2	8	139850	139857	0 %	25 %	50 %	25 %	344210455
3605	NC_015948	ACG	2	6	139884	139889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3606	NC_015948	GGC	2	6	140036	140041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210455
3607	NC_015948	CGG	2	6	140128	140133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210455
3608	NC_015948	GAG	2	6	140156	140161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210455
3609	NC_015948	TAC	2	6	140162	140167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210455
3610	NC_015948	CGT	2	6	140179	140184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3611	NC_015948	TCG	2	6	140304	140309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3612	NC_015948	ACA	2	6	140400	140405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210455
3613	NC_015948	ACA	2	6	140454	140459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210455
3614	NC_015948	TCC	2	6	140472	140477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210455
3615	NC_015948	ACC	2	6	140496	140501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210455
3616	NC_015948	CCG	2	6	140507	140512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210455
3617	NC_015948	ACG	2	6	140532	140537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3618	NC_015948	CGA	2	6	140548	140553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210455
3619	NC_015948	TC	3	6	140590	140595	0 %	50 %	0 %	50 %	344210455
3620	NC_015948	TCG	3	9	140600	140608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210455
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3980	NC_015948	CGA	2	6	153553	153558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3981	NC_015948	ATG	2	6	153561	153566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3982	NC_015948	CTG	2	6	153575	153580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3983	NC_015948	ACT	2	6	153602	153607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3984	NC_015948	TGCG	2	8	153670	153677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3985	NC_015948	CGA	2	6	153705	153710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210472
3986	NC_015948	CGGC	2	8	153773	153780	0 %	0 %	50 %	50 %	344210472
3987	NC_015948	GGC	2	6	153787	153792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210472
3988	NC_015948	GGA	2	6	153855	153860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210472
3989	NC_015948	CGC	2	6	153861	153866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210472
3990	NC_015948	GC	3	6	153885	153890	0 %	0 %	50 %	50 %	344210472
3991	NC_015948	CG	4	8	153937	153944	0 %	0 %	50 %	50 %	344210472
3992	NC_015948	GTA	2	6	153958	153963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210472
3993	NC_015948	ACT	2	6	153971	153976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210472
3994	NC_015948	CGT	2	6	154056	154061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210472
3995	NC_015948	CGG	2	6	154113	154118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210472
3996	NC_015948	GC	3	6	154125	154130	0 %	0 %	50 %	50 %	344210472
3997	NC_015948	ACG	2	6	154199	154204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210472
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3999	NC_015948	GTCGCC	2	12	154309	154320	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210472
4000	NC_015948	CAG	2	6	154405	154410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210472

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