MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015948	CGGC	2	8	19858	19865	0 %	0 %	50 %	50 %	344210325
502	NC_015948	TGAC	2	8	20038	20045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_015948	TGATTC	2	12	20122	20133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
504	NC_015948	TCG	2	6	20176	20181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015948	TCG	2	6	20228	20233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015948	AAC	2	6	20242	20247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015948	TTCGGC	2	12	20250	20261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015948	GTCG	2	8	20285	20292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015948	GCT	2	6	20314	20319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015948	ATG	2	6	20337	20342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015948	TCC	2	6	20349	20354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_015948	ACTC	2	8	20370	20377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_015948	CGTTG	2	10	20386	20395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
514	NC_015948	GAG	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210326
515	NC_015948	GGGC	2	8	20483	20490	0 %	0 %	75 %	25 %	344210326
516	NC_015948	CGA	2	6	20513	20518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210326
517	NC_015948	GTC	2	6	20562	20567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210326
518	NC_015948	GCTGGT	2	12	20573	20584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344210326
519	NC_015948	GC	3	6	20635	20640	0 %	0 %	50 %	50 %	344210326
520	NC_015948	GTC	3	9	20667	20675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210326
521	NC_015948	CTC	2	6	20697	20702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210326
522	NC_015948	TAT	2	6	20705	20710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210326
523	NC_015948	CGT	2	6	20729	20734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210326
524	NC_015948	CGC	2	6	20760	20765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210326
525	NC_015948	CGTC	2	8	20768	20775	0 %	25 %	25 %	50 %	344210326
526	NC_015948	ATC	2	6	20817	20822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210326
527	NC_015948	CCG	2	6	20863	20868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210326
528	NC_015948	GCG	2	6	20871	20876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210326
529	NC_015948	TCA	2	6	20884	20889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210326
530	NC_015948	CGC	2	6	20900	20905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210326
531	NC_015948	TCG	2	6	20914	20919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210326
532	NC_015948	GCG	2	6	20921	20926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210326
533	NC_015948	AAG	2	6	20969	20974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015948	TGC	2	6	21004	21009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
535	NC_015948	CGA	3	9	21029	21037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
536	NC_015948	CGT	2	6	21086	21091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
537	NC_015948	GGA	2	6	21125	21130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210327
538	NC_015948	ACG	2	6	21169	21174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
539	NC_015948	CGA	2	6	21182	21187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
540	NC_015948	GCC	2	6	21234	21239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210327
541	NC_015948	GAG	2	6	21255	21260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210327
542	NC_015948	GGC	2	6	21284	21289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
543	NC_015948	GGT	2	6	21341	21346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210327
544	NC_015948	CCG	2	6	21383	21388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210327
545	NC_015948	CGT	3	9	21389	21397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
546	NC_015948	TAC	2	6	21426	21431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210327
547	NC_015948	CGA	2	6	21449	21454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
548	NC_015948	TCC	2	6	21493	21498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210327
549	NC_015948	GAC	2	6	21641	21646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
550	NC_015948	ATC	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210327
551	NC_015948	CGT	2	6	21686	21691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
552	NC_015948	GCT	2	6	21701	21706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
553	NC_015948	CGG	2	6	21713	21718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
554	NC_015948	GCG	2	6	21724	21729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
555	NC_015948	GACC	2	8	21749	21756	25 %	0 %	25 %	50 %	344210327
556	NC_015948	CGC	3	9	21809	21817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210327
557	NC_015948	CGA	2	6	21848	21853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
558	NC_015948	GCC	2	6	21915	21920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210327
559	NC_015948	CTT	2	6	21941	21946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210327
560	NC_015948	CGG	2	6	21989	21994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
561	NC_015948	TGGTC	2	10	22004	22013	0 %	40 %	40 %	20 %	344210327
562	NC_015948	ACC	2	6	22051	22056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210327
563	NC_015948	CGG	2	6	22079	22084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
564	NC_015948	TGCG	2	8	22128	22135	0 %	25 %	50 %	25 %	344210328
565	NC_015948	CGC	2	6	22204	22209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210328
566	NC_015948	GGC	2	6	22216	22221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210328
567	NC_015948	CGA	2	6	22255	22260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210328
568	NC_015948	CTG	2	6	22262	22267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210328
569	NC_015948	ACG	2	6	22352	22357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210328
570	NC_015948	TGA	2	6	22360	22365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210328
571	NC_015948	GAA	2	6	22370	22375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210328
572	NC_015948	TGAC	2	8	22390	22397	25 %	25 %	25 %	25 %	344210328
573	NC_015948	GCA	2	6	22591	22596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015948	CGAA	2	8	22624	22631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_015948	GGCCT	2	10	22636	22645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
576	NC_015948	CCA	2	6	22658	22663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_015948	GAG	2	6	22712	22717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015948	AAC	2	6	22730	22735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015948	GC	3	6	22739	22744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_015948	ACT	2	6	22863	22868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015948	G	6	6	22920	22925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015948	CTA	2	6	23040	23045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015948	GTC	2	6	23164	23169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
584	NC_015948	CGT	3	9	23205	23213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
585	NC_015948	CTT	2	6	23271	23276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210329
586	NC_015948	CGT	2	6	23319	23324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
587	NC_015948	CCG	2	6	23336	23341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210329
588	NC_015948	TGA	2	6	23352	23357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210329
589	NC_015948	TGG	2	6	23366	23371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210329
590	NC_015948	GTCG	2	8	23389	23396	0 %	25 %	50 %	25 %	344210329
591	NC_015948	GTC	2	6	23422	23427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
592	NC_015948	ACC	2	6	23453	23458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210329
593	NC_015948	CCG	2	6	23477	23482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210329
594	NC_015948	CGGC	2	8	23530	23537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015948	CGC	2	6	23572	23577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_015948	CCGA	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	344210330
597	NC_015948	ACC	2	6	23682	23687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210330
598	NC_015948	CGGT	2	8	23730	23737	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
599	NC_015948	TCG	3	9	23772	23780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
600	NC_015948	GCT	2	6	23801	23806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
601	NC_015948	CGGT	2	8	23835	23842	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
602	NC_015948	CGC	2	6	23854	23859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
603	NC_015948	CGAA	2	8	23928	23935	50 %	0 %	25 %	25 %	344210330
604	NC_015948	GTC	2	6	23945	23950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
605	NC_015948	GTCG	2	8	24050	24057	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
606	NC_015948	GGCG	2	8	24067	24074	0 %	0 %	75 %	25 %	344210330
607	NC_015948	CGA	2	6	24085	24090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210330
608	NC_015948	GC	3	6	24112	24117	0 %	0 %	50 %	50 %	344210330
609	NC_015948	GTCAG	2	10	24144	24153	20 %	20 %	40 %	20 %	344210330
610	NC_015948	GTC	2	6	24279	24284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
611	NC_015948	ACGG	2	8	24338	24345	25 %	0 %	50 %	25 %	344210330
612	NC_015948	CCCG	2	8	24395	24402	0 %	0 %	25 %	75 %	344210330
613	NC_015948	GTTC	2	8	24409	24416	0 %	50 %	25 %	25 %	344210330
614	NC_015948	CGA	2	6	24421	24426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210330
615	NC_015948	CGG	2	6	24454	24459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
616	NC_015948	CGG	2	6	24496	24501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
617	NC_015948	GCC	2	6	24525	24530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
618	NC_015948	GGC	2	6	24596	24601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
619	NC_015948	GC	3	6	24672	24677	0 %	0 %	50 %	50 %	344210330
620	NC_015948	CAG	2	6	24716	24721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210330
621	NC_015948	CGG	2	6	24739	24744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
622	NC_015948	CGT	2	6	24758	24763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
623	NC_015948	CGC	2	6	24811	24816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
624	NC_015948	GGA	2	6	24859	24864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210330
625	NC_015948	GTC	2	6	24867	24872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
626	NC_015948	CCG	2	6	24874	24879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
627	NC_015948	TCG	2	6	24922	24927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
628	NC_015948	CT	3	6	24959	24964	0 %	50 %	0 %	50 %	344210330
629	NC_015948	TCGCTG	2	12	24996	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
630	NC_015948	GACTC	2	10	25027	25036	20 %	20 %	20 %	40 %	344210330
631	NC_015948	GT	3	6	25159	25164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015948	TAA	2	6	25185	25190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015948	GCG	2	6	25199	25204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015948	GAC	2	6	25275	25280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210331
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719	NC_015948	TCGACG	2	12	28193	28204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210335
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742	NC_015948	TCC	2	6	28730	28735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210335
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1000	NC_015948	GAT	2	6	39164	39169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210346

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