MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015948	AC	3	6	333749	333754	50 %	0 %	0 %	50 %	344210649
8502	NC_015948	TCG	2	6	333756	333761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210649
8503	NC_015948	GTGC	2	8	333769	333776	0 %	25 %	50 %	25 %	344210649
8504	NC_015948	TTCG	2	8	333830	333837	0 %	50 %	25 %	25 %	344210649
8505	NC_015948	AC	3	6	333842	333847	50 %	0 %	0 %	50 %	344210649
8506	NC_015948	GTC	2	6	333863	333868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210649
8507	NC_015948	TGGC	2	8	333885	333892	0 %	25 %	50 %	25 %	344210649
8508	NC_015948	GTC	2	6	333893	333898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210649
8509	NC_015948	CCGCT	2	10	333965	333974	0 %	20 %	20 %	60 %	344210649
8510	NC_015948	CCG	2	6	333996	334001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8511	NC_015948	CGG	2	6	334010	334015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_015948	A	6	6	334050	334055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_015948	GGCG	2	8	334116	334123	0 %	0 %	75 %	25 %	344210650
8514	NC_015948	TCG	2	6	334124	334129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8515	NC_015948	CTT	2	6	334152	334157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210650
8516	NC_015948	CGG	2	6	334257	334262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210650
8517	NC_015948	GAG	2	6	334277	334282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210650
8518	NC_015948	CGTTC	2	10	334331	334340	0 %	40 %	20 %	40 %	344210650
8519	NC_015948	GTT	2	6	334383	334388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210650
8520	NC_015948	GTT	2	6	334407	334412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210650
8521	NC_015948	GTC	2	6	334444	334449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8522	NC_015948	CTT	2	6	334555	334560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210650
8523	NC_015948	ATC	2	6	334562	334567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210650
8524	NC_015948	CGC	2	6	334569	334574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210650
8525	NC_015948	CTT	2	6	334609	334614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210650
8526	NC_015948	GC	3	6	334722	334727	0 %	0 %	50 %	50 %	344210650
8527	NC_015948	CGA	2	6	334731	334736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8528	NC_015948	GAC	2	6	334816	334821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8529	NC_015948	TCG	2	6	334838	334843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8530	NC_015948	TGA	2	6	334845	334850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210650
8531	NC_015948	TCG	2	6	334886	334891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8532	NC_015948	TCT	2	6	334920	334925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210650
8533	NC_015948	CTG	2	6	334933	334938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8534	NC_015948	GTG	2	6	334957	334962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210650
8535	NC_015948	GAC	2	6	334978	334983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8536	NC_015948	TCT	2	6	334988	334993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210650
8537	NC_015948	GTTC	2	8	335001	335008	0 %	50 %	25 %	25 %	344210650
8538	NC_015948	CGA	2	6	335025	335030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8539	NC_015948	CGT	2	6	335044	335049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8540	NC_015948	TTC	2	6	335051	335056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210650
8541	NC_015948	CCT	2	6	335139	335144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210650
8542	NC_015948	TGG	2	6	335153	335158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210650
8543	NC_015948	TCG	2	6	335181	335186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8544	NC_015948	GTA	2	6	335191	335196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210650
8545	NC_015948	CGA	2	6	335211	335216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210650
8546	NC_015948	ACC	2	6	335258	335263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210650
8547	NC_015948	GGA	2	6	335286	335291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210650
8548	NC_015948	AGT	2	6	335324	335329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210650
8549	NC_015948	CGA	2	6	335411	335416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_015948	CAC	2	6	335472	335477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_015948	CGG	2	6	335519	335524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_015948	ACTG	2	8	335546	335553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8553	NC_015948	TCTAC	2	10	335565	335574	20 %	40 %	0 %	40 %	344210651
8554	NC_015948	GT	3	6	335625	335630	0 %	50 %	50 %	0 %	344210651
8555	NC_015948	CGTC	2	8	335633	335640	0 %	25 %	25 %	50 %	344210651
8556	NC_015948	GAC	2	6	335644	335649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8557	NC_015948	TCG	2	6	335696	335701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8558	NC_015948	CGT	2	6	335724	335729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8559	NC_015948	GCT	2	6	335760	335765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8560	NC_015948	CGG	2	6	335778	335783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210651
8561	NC_015948	TCG	2	6	335786	335791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8562	NC_015948	CT	3	6	335837	335842	0 %	50 %	0 %	50 %	344210651
8563	NC_015948	TCC	2	6	335873	335878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210651
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8568	NC_015948	TCG	2	6	336326	336331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8569	NC_015948	CGC	2	6	336357	336362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210651
8570	NC_015948	GCCGG	2	10	336454	336463	0 %	0 %	60 %	40 %	344210651
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8579	NC_015948	CG	3	6	336658	336663	0 %	0 %	50 %	50 %	344210651
8580	NC_015948	CGG	2	6	336672	336677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210651
8581	NC_015948	CAG	2	6	336807	336812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210651
8582	NC_015948	CGT	2	6	336900	336905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_015948	GTCT	2	8	336932	336939	0 %	50 %	25 %	25 %	344210652
8584	NC_015948	TGG	2	6	336946	336951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210652
8585	NC_015948	AGGA	2	8	337074	337081	50 %	0 %	50 %	0 %	344210652
8586	NC_015948	CGA	2	6	337129	337134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210652
8587	NC_015948	ACTG	2	8	337185	337192	25 %	25 %	25 %	25 %	344210652
8588	NC_015948	CAG	2	6	337225	337230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210652
8589	NC_015948	TCT	2	6	337270	337275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210652
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8591	NC_015948	CAGAT	2	10	337404	337413	40 %	20 %	20 %	20 %	344210652
8592	NC_015948	TCCCAG	2	12	337657	337668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344210652
8593	NC_015948	GCTT	2	8	337734	337741	0 %	50 %	25 %	25 %	344210652
8594	NC_015948	GTG	2	6	337865	337870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210652
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8596	NC_015948	ACC	2	6	337930	337935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210653
8597	NC_015948	CTCG	2	8	337943	337950	0 %	25 %	25 %	50 %	344210653
8598	NC_015948	GCT	2	6	337958	337963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210653
8599	NC_015948	GC	3	6	338005	338010	0 %	0 %	50 %	50 %	344210653
8600	NC_015948	TAA	2	6	338074	338079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210653
8601	NC_015948	CGG	2	6	338167	338172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210653
8602	NC_015948	TCG	2	6	338228	338233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210653
8603	NC_015948	GCG	3	9	338293	338301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210653
8604	NC_015948	TCG	2	6	338344	338349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210653
8605	NC_015948	TCG	2	6	338398	338403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210653
8606	NC_015948	AGT	2	6	338427	338432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210653
8607	NC_015948	TTG	2	6	338441	338446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210653
8608	NC_015948	ACCG	2	8	338481	338488	25 %	0 %	25 %	50 %	344210653
8609	NC_015948	CGC	2	6	338492	338497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210653
8610	NC_015948	TCC	2	6	338527	338532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210653
8611	NC_015948	GAT	2	6	338610	338615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210653
8612	NC_015948	GGCGA	2	10	338718	338727	20 %	0 %	60 %	20 %	344210653
8613	NC_015948	CGT	3	9	338757	338765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210653
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8615	NC_015948	TGGC	2	8	339033	339040	0 %	25 %	50 %	25 %	344210654
8616	NC_015948	CGG	2	6	339065	339070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210654
8617	NC_015948	CGT	2	6	339077	339082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210654
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8619	NC_015948	GCA	2	6	339096	339101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210654
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8990	NC_015948	TTCT	2	8	358587	358594	0 %	75 %	0 %	25 %	344210671
8991	NC_015948	TGA	2	6	358598	358603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210671
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8993	NC_015948	CGC	2	6	358658	358663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210671
8994	NC_015948	CGC	2	6	358705	358710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210671
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