MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	GGAAG	2	10	930	939	40 %	0 %	60 %	0 %	344209943
2	NC_015944	AGCGA	2	10	1210	1219	40 %	0 %	40 %	20 %	344209943
3	NC_015944	CTTCA	2	10	1350	1359	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015944	CAATC	2	10	2210	2219	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015944	GATTG	2	10	6216	6225	20 %	40 %	40 %	0 %	344209948
6	NC_015944	AGCAC	2	10	6473	6482	40 %	0 %	20 %	40 %	344209948
7	NC_015944	ATGGG	2	10	7026	7035	20 %	20 %	60 %	0 %	344209948
8	NC_015944	CATCA	2	10	9073	9082	40 %	20 %	0 %	40 %	344209949
9	NC_015944	ACGTT	2	10	11231	11240	20 %	40 %	20 %	20 %	344209951
10	NC_015944	GGACG	2	10	13357	13366	20 %	0 %	60 %	20 %	344209953
11	NC_015944	CCAAA	2	10	15773	15782	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015944	AACCG	2	10	16704	16713	40 %	0 %	20 %	40 %	344209955
13	NC_015944	TCGAC	2	10	18219	18228	20 %	20 %	20 %	40 %	344209956
14	NC_015944	TCGAG	2	10	18552	18561	20 %	20 %	40 %	20 %	344209956
15	NC_015944	CAGTA	2	10	20071	20080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015944	GAAAG	2	10	20379	20388	60 %	0 %	40 %	0 %	344209959
17	NC_015944	TCGAC	2	10	21391	21400	20 %	20 %	20 %	40 %	344209960
18	NC_015944	AGTGG	2	10	22001	22010	20 %	20 %	60 %	0 %	344209960
19	NC_015944	ACGCG	2	10	22890	22899	20 %	0 %	40 %	40 %	344209961
20	NC_015944	CCGCG	2	10	24438	24447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015944	CGTGT	2	10	24808	24817	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015944	GCATT	2	10	26963	26972	20 %	40 %	20 %	20 %	344209964
23	NC_015944	ATCGG	2	10	27265	27274	20 %	20 %	40 %	20 %	344209964
24	NC_015944	CGTCG	2	10	30941	30950	0 %	20 %	40 %	40 %	344209968
25	NC_015944	CGTCC	2	10	31824	31833	0 %	20 %	20 %	60 %	344209968
26	NC_015944	CCGAC	2	10	32361	32370	20 %	0 %	20 %	60 %	344209968
27	NC_015944	GTCGA	2	10	35385	35394	20 %	20 %	40 %	20 %	344209970
28	NC_015944	GTTCC	2	10	38058	38067	0 %	40 %	20 %	40 %	344209973
29	NC_015944	ACGGA	2	10	38171	38180	40 %	0 %	40 %	20 %	344209973
30	NC_015944	AGCTG	2	10	38257	38266	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015944	TCCAC	2	10	38605	38614	20 %	20 %	0 %	60 %	344209974
32	NC_015944	GACGG	2	10	39100	39109	20 %	0 %	60 %	20 %	344209974
33	NC_015944	TTCGG	2	10	39292	39301	0 %	40 %	40 %	20 %	344209974
34	NC_015944	GGACG	2	10	41098	41107	20 %	0 %	60 %	20 %	344209974
35	NC_015944	TGACG	2	10	42006	42015	20 %	20 %	40 %	20 %	344209976
36	NC_015944	CGAGA	2	10	42127	42136	40 %	0 %	40 %	20 %	344209976
37	NC_015944	TCCCG	2	10	46778	46787	0 %	20 %	20 %	60 %	344209977
38	NC_015944	TGCTG	2	10	47246	47255	0 %	40 %	40 %	20 %	344209978
39	NC_015944	ACTGC	2	10	48815	48824	20 %	20 %	20 %	40 %	344209978
40	NC_015944	GCTGG	2	10	48918	48927	0 %	20 %	60 %	20 %	344209978
41	NC_015944	CTTAC	2	10	49310	49319	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015944	AATCG	2	10	52176	52185	40 %	20 %	20 %	20 %	344209980
43	NC_015944	CCACA	2	10	56714	56723	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_015944	GTCCG	2	10	57201	57210	0 %	20 %	40 %	40 %	344209984
45	NC_015944	GCGAC	2	10	61297	61306	20 %	0 %	40 %	40 %	344209988
46	NC_015944	GGTGA	2	10	61503	61512	20 %	20 %	60 %	0 %	344209989
47	NC_015944	CGTAT	2	10	62425	62434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015944	GAACG	2	10	66896	66905	40 %	0 %	40 %	20 %	344209995
49	NC_015944	TACCG	2	10	68170	68179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015944	CGACG	2	10	68858	68867	20 %	0 %	40 %	40 %	344209996
51	NC_015944	CAGCG	2	10	69176	69185	20 %	0 %	40 %	40 %	344209996
52	NC_015944	TCACG	2	10	69517	69526	20 %	20 %	20 %	40 %	344209996
53	NC_015944	TCCGT	2	10	71511	71520	0 %	40 %	20 %	40 %	344209999
54	NC_015944	TCGGC	2	10	71695	71704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015944	ACACG	2	10	73087	73096	40 %	0 %	20 %	40 %	344210002
56	NC_015944	GTCGC	2	10	73808	73817	0 %	20 %	40 %	40 %	344210003
57	NC_015944	GAGCG	2	10	79686	79695	20 %	0 %	60 %	20 %	344210011
58	NC_015944	TTTGT	2	10	80691	80700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015944	ACAGC	2	10	82429	82438	40 %	0 %	20 %	40 %	344210015
60	NC_015944	TCGTC	2	10	84408	84417	0 %	40 %	20 %	40 %	344210018
61	NC_015944	CCGAC	2	10	85046	85055	20 %	0 %	20 %	60 %	344210019
62	NC_015944	GAGTC	2	10	85539	85548	20 %	20 %	40 %	20 %	344210020
63	NC_015944	ATAAG	2	10	87942	87951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015944	GGCGA	2	10	90372	90381	20 %	0 %	60 %	20 %	344210024
65	NC_015944	CGACC	2	10	91208	91217	20 %	0 %	20 %	60 %	344210024
66	NC_015944	GTGAG	2	10	91489	91498	20 %	20 %	60 %	0 %	344210024
67	NC_015944	ACGAC	2	10	92342	92351	40 %	0 %	20 %	40 %	344210026
68	NC_015944	TGCGT	2	10	95510	95519	0 %	40 %	40 %	20 %	344210029
69	NC_015944	TCGTC	2	10	96562	96571	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015944	TTGGA	2	10	97383	97392	20 %	40 %	40 %	0 %	344210031
71	NC_015944	GTAGC	2	10	98347	98356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015944	TCGTT	2	10	98375	98384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015944	CGGCA	2	10	99486	99495	20 %	0 %	40 %	40 %	344210033
74	NC_015944	CGAGT	2	10	99926	99935	20 %	20 %	40 %	20 %	344210034
75	NC_015944	TACGA	2	10	103247	103256	40 %	20 %	20 %	20 %	344210039
76	NC_015944	CGCGT	2	10	104498	104507	0 %	20 %	40 %	40 %	344210040
77	NC_015944	CGCGG	2	10	106674	106683	0 %	0 %	60 %	40 %	344210042
78	NC_015944	ATCGA	2	10	107120	107129	40 %	20 %	20 %	20 %	344210043
79	NC_015944	CAGGA	2	10	108359	108368	40 %	0 %	40 %	20 %	344210044
80	NC_015944	TCGAT	2	10	108453	108462	20 %	40 %	20 %	20 %	344210044
81	NC_015944	CCGCC	2	10	108952	108961	0 %	0 %	20 %	80 %	344210044
82	NC_015944	TGAAC	2	10	110863	110872	40 %	20 %	20 %	20 %	344210047
83	NC_015944	ACCGG	2	10	111096	111105	20 %	0 %	40 %	40 %	344210047
84	NC_015944	TTCCT	2	10	113339	113348	0 %	60 %	0 %	40 %	344210049
85	NC_015944	CACAC	2	10	113818	113827	40 %	0 %	0 %	60 %	344210049
86	NC_015944	TCCGC	2	10	114192	114201	0 %	20 %	20 %	60 %	344210050
87	NC_015944	GTTCA	2	10	114948	114957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015944	CGAAC	2	10	115863	115872	40 %	0 %	20 %	40 %	344210051
89	NC_015944	TGCAG	2	10	119956	119965	20 %	20 %	40 %	20 %	344210056
90	NC_015944	GTGTC	2	10	120503	120512	0 %	40 %	40 %	20 %	344210057
91	NC_015944	CGAAA	2	10	122041	122050	60 %	0 %	20 %	20 %	344210058
92	NC_015944	GATCC	2	10	122993	123002	20 %	20 %	20 %	40 %	344210059
93	NC_015944	CCGCC	2	10	124524	124533	0 %	0 %	20 %	80 %	344210060
94	NC_015944	CAGAC	2	10	124886	124895	40 %	0 %	20 %	40 %	344210060
95	NC_015944	GAGCG	2	10	125110	125119	20 %	0 %	60 %	20 %	344210061
96	NC_015944	ACCGA	2	10	127013	127022	40 %	0 %	20 %	40 %	344210063
97	NC_015944	GTGAC	2	10	127122	127131	20 %	20 %	40 %	20 %	344210063
98	NC_015944	CGCTC	2	10	127580	127589	0 %	20 %	20 %	60 %	344210063
99	NC_015944	CTGGC	2	10	127964	127973	0 %	20 %	40 %	40 %	344210063
100	NC_015944	CCGAA	2	10	129015	129024	40 %	0 %	20 %	40 %	344210065
101	NC_015944	TCGAT	2	10	130811	130820	20 %	40 %	20 %	20 %	344210067
102	NC_015944	ACCGA	2	10	131081	131090	40 %	0 %	20 %	40 %	344210068
103	NC_015944	GTCGG	2	10	131590	131599	0 %	20 %	60 %	20 %	344210069
104	NC_015944	CTCGT	2	10	132029	132038	0 %	40 %	20 %	40 %	344210069
105	NC_015944	TCATT	2	10	134361	134370	20 %	60 %	0 %	20 %	344210071
106	NC_015944	GAGCC	2	10	135018	135027	20 %	0 %	40 %	40 %	344210072
107	NC_015944	TCGGT	2	10	135566	135575	0 %	40 %	40 %	20 %	344210072
108	NC_015944	CCGCC	2	10	136600	136609	0 %	0 %	20 %	80 %	344210073
109	NC_015944	AACGT	2	10	136701	136710	40 %	20 %	20 %	20 %	344210073
110	NC_015944	CAGCC	2	10	137574	137583	20 %	0 %	20 %	60 %	344210074
111	NC_015944	TCGCC	2	10	137864	137873	0 %	20 %	20 %	60 %	344210074
112	NC_015944	ACTGC	2	10	138664	138673	20 %	20 %	20 %	40 %	344210075
113	NC_015944	AACAC	2	10	142456	142465	60 %	0 %	0 %	40 %	344210077
114	NC_015944	GCGCC	2	10	142628	142637	0 %	0 %	40 %	60 %	344210077
115	NC_015944	GAGCG	2	10	143546	143555	20 %	0 %	60 %	20 %	344210078
116	NC_015944	GCCGC	2	10	143808	143817	0 %	0 %	40 %	60 %	344210078
117	NC_015944	ACCCG	2	10	144307	144316	20 %	0 %	20 %	60 %	344210078
118	NC_015944	GACCC	2	10	155135	155144	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_015944	CGACC	2	10	155185	155194	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_015944	ACAGT	2	10	156334	156343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015944	CGACG	2	10	156611	156620	20 %	0 %	40 %	40 %	344210089
122	NC_015944	TATTC	2	10	157341	157350	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015944	ACGAG	2	10	158266	158275	40 %	0 %	40 %	20 %	344210090
124	NC_015944	GGACA	2	10	160593	160602	40 %	0 %	40 %	20 %	344210092
125	NC_015944	CACCG	2	10	161141	161150	20 %	0 %	20 %	60 %	344210092
126	NC_015944	CGACA	2	10	161168	161177	40 %	0 %	20 %	40 %	344210092
127	NC_015944	CGAGC	2	10	161534	161543	20 %	0 %	40 %	40 %	344210092
128	NC_015944	CCGTC	2	10	164184	164193	0 %	20 %	20 %	60 %	344210094
129	NC_015944	CGGGG	2	10	164988	164997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015944	CAGTC	2	10	165472	165481	20 %	20 %	20 %	40 %	344210095
131	NC_015944	TCTGT	2	10	167352	167361	0 %	60 %	20 %	20 %	344210096
132	NC_015944	CTTGC	2	10	168099	168108	0 %	40 %	20 %	40 %	344210097
133	NC_015944	AACCG	2	10	170102	170111	40 %	0 %	20 %	40 %	344210098
134	NC_015944	GGAGT	2	10	171983	171992	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015944	CATCG	2	10	173320	173329	20 %	20 %	20 %	40 %	344210101
136	NC_015944	CCTGG	2	10	174512	174521	0 %	20 %	40 %	40 %	344210102
137	NC_015944	GCTGT	2	10	175200	175209	0 %	40 %	40 %	20 %	344210102
138	NC_015944	AGATG	2	10	177293	177302	40 %	20 %	40 %	0 %	344210103
139	NC_015944	CGACA	2	10	178217	178226	40 %	0 %	20 %	40 %	344210104
140	NC_015944	CGAAC	2	10	179700	179709	40 %	0 %	20 %	40 %	344210105
141	NC_015944	ACCGA	2	10	183229	183238	40 %	0 %	20 %	40 %	344210108
142	NC_015944	ACGAT	2	10	183345	183354	40 %	20 %	20 %	20 %	344210108
143	NC_015944	ACCAG	2	10	183669	183678	40 %	0 %	20 %	40 %	344210108
144	NC_015944	CGGAA	2	10	185245	185254	40 %	0 %	40 %	20 %	344210109
145	NC_015944	AAACG	2	10	186913	186922	60 %	0 %	20 %	20 %	344210111
146	NC_015944	ACTGT	2	10	187225	187234	20 %	40 %	20 %	20 %	344210111
147	NC_015944	TTCGA	2	10	187312	187321	20 %	40 %	20 %	20 %	344210111
148	NC_015944	AGGCA	2	10	187675	187684	40 %	0 %	40 %	20 %	344210111
149	NC_015944	GATGA	2	10	188593	188602	40 %	20 %	40 %	0 %	344210111
150	NC_015944	GTTCG	2	10	188766	188775	0 %	40 %	40 %	20 %	344210112
151	NC_015944	CGAAG	2	10	189380	189389	40 %	0 %	40 %	20 %	344210112
152	NC_015944	GTTCG	2	10	189779	189788	0 %	40 %	40 %	20 %	344210112
153	NC_015944	GTTCG	2	10	193118	193127	0 %	40 %	40 %	20 %	344210115
154	NC_015944	CCGAC	2	10	193229	193238	20 %	0 %	20 %	60 %	344210115
155	NC_015944	CCGAA	2	10	196733	196742	40 %	0 %	20 %	40 %	344210119
156	NC_015944	ACGAG	2	10	196817	196826	40 %	0 %	40 %	20 %	344210119
157	NC_015944	GTTCC	2	10	197964	197973	0 %	40 %	20 %	40 %	344210120
158	NC_015944	TATAA	2	10	198162	198171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015944	GTCAG	2	10	198764	198773	20 %	20 %	40 %	20 %	344210121
160	NC_015944	ACGTC	2	10	200771	200780	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_015944	GGACG	2	10	204294	204303	20 %	0 %	60 %	20 %	344210124
162	NC_015944	GCGGT	2	10	205414	205423	0 %	20 %	60 %	20 %	344210125
163	NC_015944	CGTCG	2	10	206202	206211	0 %	20 %	40 %	40 %	344210127
164	NC_015944	CAGGC	2	10	206906	206915	20 %	0 %	40 %	40 %	344210128
165	NC_015944	TATGG	2	10	208906	208915	20 %	40 %	40 %	0 %	344210129
166	NC_015944	TCGAA	2	10	209645	209654	40 %	20 %	20 %	20 %	344210129
167	NC_015944	CTCGT	2	10	212350	212359	0 %	40 %	20 %	40 %	344210132
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169	NC_015944	CGCGT	2	10	215838	215847	0 %	20 %	40 %	40 %	344210136
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171	NC_015944	TCGGT	2	10	218968	218977	0 %	40 %	40 %	20 %	344210137
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174	NC_015944	CGGCA	2	10	223220	223229	20 %	0 %	40 %	40 %	344210139
175	NC_015944	CGACG	2	10	224312	224321	20 %	0 %	40 %	40 %	344210140
176	NC_015944	ATCCC	2	10	226565	226574	20 %	20 %	0 %	60 %	344210142
177	NC_015944	GAGGT	2	10	226609	226618	20 %	20 %	60 %	0 %	344210142
178	NC_015944	GTTTC	2	10	229611	229620	0 %	60 %	20 %	20 %	344210145
179	NC_015944	TATTG	2	10	230275	230284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_015944	CATCG	2	10	230786	230795	20 %	20 %	20 %	40 %	344210147
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182	NC_015944	AGTCC	2	10	232250	232259	20 %	20 %	20 %	40 %	344210149
183	NC_015944	ACGCG	2	10	232656	232665	20 %	0 %	40 %	40 %	344210149
184	NC_015944	CGGTC	2	10	232763	232772	0 %	20 %	40 %	40 %	344210149
185	NC_015944	TTTCG	2	10	234351	234360	0 %	60 %	20 %	20 %	344210151
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188	NC_015944	CCCCG	2	10	242788	242797	0 %	0 %	20 %	80 %	344210158
189	NC_015944	GTAGT	2	10	247854	247863	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015944	TCGTC	2	10	247951	247960	0 %	40 %	20 %	40 %	344210164
191	NC_015944	CGGGA	2	10	250502	250511	20 %	0 %	60 %	20 %	344210167
192	NC_015944	ACCGA	2	10	251855	251864	40 %	0 %	20 %	40 %	344210167
193	NC_015944	TTTCT	2	10	252472	252481	0 %	80 %	0 %	20 %	344210169
194	NC_015944	CGGAG	2	10	253541	253550	20 %	0 %	60 %	20 %	344210169
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196	NC_015944	GCGAT	2	10	255198	255207	20 %	20 %	40 %	20 %	344210170
197	NC_015944	GTCCG	2	10	255644	255653	0 %	20 %	40 %	40 %	344210170
198	NC_015944	CGGCG	2	10	256051	256060	0 %	0 %	60 %	40 %	344210171
199	NC_015944	CCCCG	2	10	257516	257525	0 %	0 %	20 %	80 %	344210174
200	NC_015944	CGGCG	2	10	259555	259564	0 %	0 %	60 %	40 %	344210175
201	NC_015944	CACGG	2	10	260789	260798	20 %	0 %	40 %	40 %	344210175
202	NC_015944	CGACC	2	10	261892	261901	20 %	0 %	20 %	60 %	344210175
203	NC_015944	CTCCC	2	10	262371	262380	0 %	20 %	0 %	80 %	344210176
204	NC_015944	ACCGG	2	10	265103	265112	20 %	0 %	40 %	40 %	344210178
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206	NC_015944	CTGGG	2	10	266367	266376	0 %	20 %	60 %	20 %	344210179
207	NC_015944	AGCCG	2	10	266617	266626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
208	NC_015944	ATCGA	2	10	269034	269043	40 %	20 %	20 %	20 %	344210181
209	NC_015944	GTCGG	2	10	269932	269941	0 %	20 %	60 %	20 %	344210182
210	NC_015944	ACCGA	2	10	270108	270117	40 %	0 %	20 %	40 %	344210182
211	NC_015944	GAGCG	2	10	270393	270402	20 %	0 %	60 %	20 %	344210183
212	NC_015944	CGTCA	2	10	273156	273165	20 %	20 %	20 %	40 %	344210186
213	NC_015944	GAATC	2	10	273825	273834	40 %	20 %	20 %	20 %	344210187
214	NC_015944	CGACG	2	10	274255	274264	20 %	0 %	40 %	40 %	344210188
215	NC_015944	CGTTG	2	10	275982	275991	0 %	40 %	40 %	20 %	344210189
216	NC_015944	GTGCT	2	10	278733	278742	0 %	40 %	40 %	20 %	344210192
217	NC_015944	TCGCG	2	10	280019	280028	0 %	20 %	40 %	40 %	344210192
218	NC_015944	GGGGT	2	10	280940	280949	0 %	20 %	80 %	0 %	344210193
219	NC_015944	TGGTG	2	10	281042	281051	0 %	40 %	60 %	0 %	344210193
220	NC_015944	TCCGA	2	10	282261	282270	20 %	20 %	20 %	40 %	344210196
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224	NC_015944	GCGAT	2	10	288324	288333	20 %	20 %	40 %	20 %	344210203
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231	NC_015944	CGTGT	2	10	300751	300760	0 %	40 %	40 %	20 %	344210215
232	NC_015944	TGCCG	2	10	302977	302986	0 %	20 %	40 %	40 %	344210216
233	NC_015944	CCATC	2	10	305054	305063	20 %	20 %	0 %	60 %	344210217
234	NC_015944	CCGAT	2	10	305347	305356	20 %	20 %	20 %	40 %	344210217
235	NC_015944	TGTCT	2	10	305508	305517	0 %	60 %	20 %	20 %	344210218
236	NC_015944	CGGAG	2	10	307540	307549	20 %	0 %	60 %	20 %	344210220
237	NC_015944	TCCGA	2	10	308713	308722	20 %	20 %	20 %	40 %	344210221
238	NC_015944	GTCCA	2	10	309319	309328	20 %	20 %	20 %	40 %	344210221
239	NC_015944	GGATT	2	10	309957	309966	20 %	40 %	40 %	0 %	344210222
240	NC_015944	GACTG	2	10	310734	310743	20 %	20 %	40 %	20 %	344210222
241	NC_015944	GCCCC	2	10	311507	311516	0 %	0 %	20 %	80 %	344210223
242	NC_015944	TGTCG	2	10	315620	315629	0 %	40 %	40 %	20 %	344210226
243	NC_015944	TGTCG	2	10	315733	315742	0 %	40 %	40 %	20 %	344210226
244	NC_015944	CAGGT	2	10	316025	316034	20 %	20 %	40 %	20 %	344210227
245	NC_015944	TGCGA	2	10	316622	316631	20 %	20 %	40 %	20 %	344210228
246	NC_015944	GCGAG	2	10	317725	317734	20 %	0 %	60 %	20 %	344210230
247	NC_015944	AACAG	2	10	318134	318143	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
248	NC_015944	GACCG	2	10	318776	318785	20 %	0 %	40 %	40 %	344210231
249	NC_015944	CACGG	2	10	320901	320910	20 %	0 %	40 %	40 %	344210233
250	NC_015944	TCGGT	2	10	321366	321375	0 %	40 %	40 %	20 %	344210234
251	NC_015944	CGAGT	2	10	321727	321736	20 %	20 %	40 %	20 %	344210234
252	NC_015944	CGTCA	2	10	322984	322993	20 %	20 %	20 %	40 %	344210235
253	NC_015944	GTCAG	2	10	323087	323096	20 %	20 %	40 %	20 %	344210235
254	NC_015944	GACCG	2	10	324758	324767	20 %	0 %	40 %	40 %	344210236
255	NC_015944	GGACG	2	10	325847	325856	20 %	0 %	60 %	20 %	344210237
256	NC_015944	ACGGC	2	10	327686	327695	20 %	0 %	40 %	40 %	344210238
257	NC_015944	TCCGG	2	10	328509	328518	0 %	20 %	40 %	40 %	344210239
258	NC_015944	GTCAC	2	10	331645	331654	20 %	20 %	20 %	40 %	344210242
259	NC_015944	AACAC	2	10	333416	333425	60 %	0 %	0 %	40 %	344210243
260	NC_015944	TCAGT	2	10	334304	334313	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_015944	CGACC	2	10	335175	335184	20 %	0 %	20 %	60 %	344210244
262	NC_015944	TGACG	2	10	341134	341143	20 %	20 %	40 %	20 %	344210248
263	NC_015944	GACGG	2	10	341288	341297	20 %	0 %	60 %	20 %	344210248
264	NC_015944	GACAG	2	10	343489	343498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
265	NC_015944	CGAGC	2	10	343845	343854	20 %	0 %	40 %	40 %	344210252
266	NC_015944	CGGCG	2	10	345030	345039	0 %	0 %	60 %	40 %	344210252
267	NC_015944	GGTCA	2	10	348613	348622	20 %	20 %	40 %	20 %	344210257
268	NC_015944	CGTAC	2	10	351177	351186	20 %	20 %	20 %	40 %	344210260
269	NC_015944	ACGAA	2	10	353374	353383	60 %	0 %	20 %	20 %	344210263
270	NC_015944	ACGAG	2	10	353405	353414	40 %	0 %	40 %	20 %	344210263
271	NC_015944	CCAGT	2	10	354266	354275	20 %	20 %	20 %	40 %	344210264
272	NC_015944	TCGAT	2	10	354323	354332	20 %	40 %	20 %	20 %	344210264
273	NC_015944	AGCGT	2	10	355026	355035	20 %	20 %	40 %	20 %	344210265
274	NC_015944	GGGTC	2	10	355928	355937	0 %	20 %	60 %	20 %	344210266
275	NC_015944	GCACC	2	10	357494	357503	20 %	0 %	20 %	60 %	344210266
276	NC_015944	TCAGT	2	10	357521	357530	20 %	40 %	20 %	20 %	344210266
277	NC_015944	TCGGT	2	10	358191	358200	0 %	40 %	40 %	20 %	344210267
278	NC_015944	ACAGC	2	10	361815	361824	40 %	0 %	20 %	40 %	344210268
279	NC_015944	TGGGG	2	10	367015	367024	0 %	20 %	80 %	0 %	344210275
280	NC_015944	CTCGT	2	10	370184	370193	0 %	40 %	20 %	40 %	344210278
281	NC_015944	GTATC	2	10	370877	370886	20 %	40 %	20 %	20 %	344210278
282	NC_015944	AGGCG	2	10	372997	373006	20 %	0 %	60 %	20 %	344210280
283	NC_015944	GCCAG	2	10	373627	373636	20 %	0 %	40 %	40 %	344210280
284	NC_015944	TCGCG	2	10	374119	374128	0 %	20 %	40 %	40 %	344210280
285	NC_015944	TCGAT	2	10	377271	377280	20 %	40 %	20 %	20 %	344210283
286	NC_015944	CAGAA	2	10	378009	378018	60 %	0 %	20 %	20 %	344210283
287	NC_015944	TCCGC	2	10	378354	378363	0 %	20 %	20 %	60 %	344210283
288	NC_015944	GACGG	2	10	379726	379735	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
289	NC_015944	TCTGC	2	10	380624	380633	0 %	40 %	20 %	40 %	344210285
290	NC_015944	GAACC	2	10	381407	381416	40 %	0 %	20 %	40 %	344210286
291	NC_015944	GGAAC	2	10	384475	384484	40 %	0 %	40 %	20 %	344210288
292	NC_015944	ATCTG	2	10	384534	384543	20 %	40 %	20 %	20 %	344210288
293	NC_015944	GACTC	2	10	384882	384891	20 %	20 %	20 %	40 %	344210288
294	NC_015944	TGTCG	2	10	386389	386398	0 %	40 %	40 %	20 %	344210289
295	NC_015944	TCGCC	2	10	386686	386695	0 %	20 %	20 %	60 %	344210289
296	NC_015944	GTTTC	2	10	387044	387053	0 %	60 %	20 %	20 %	344210289
297	NC_015944	GAGTG	2	10	389494	389503	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015944	GATTC	2	10	389911	389920	20 %	40 %	20 %	20 %	344210292
299	NC_015944	CGAAC	2	10	390386	390395	40 %	0 %	20 %	40 %	344210292
300	NC_015944	TCGTT	2	10	390707	390716	0 %	60 %	20 %	20 %	344210292
301	NC_015944	ACGTC	2	10	391310	391319	20 %	20 %	20 %	40 %	344210292
302	NC_015944	TTGTT	2	10	391347	391356	0 %	80 %	20 %	0 %	344210292
303	NC_015944	TCGAA	2	10	391969	391978	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
304	NC_015944	CACCC	2	10	395510	395519	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
305	NC_015944	GCAGT	2	10	396245	396254	20 %	20 %	40 %	20 %	344210296
306	NC_015944	TTCGT	2	10	396951	396960	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
307	NC_015944	AGGCA	2	10	398085	398094	40 %	0 %	40 %	20 %	344210297
308	NC_015944	ATATC	2	10	398932	398941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
309	NC_015944	TACTG	2	10	402085	402094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
310	NC_015944	CGAAC	2	10	402449	402458	40 %	0 %	20 %	40 %	344210302
311	NC_015944	ACAGC	2	10	402504	402513	40 %	0 %	20 %	40 %	344210302
312	NC_015944	CCCGT	2	10	402680	402689	0 %	20 %	20 %	60 %	344210302
313	NC_015944	ATCGA	2	10	402847	402856	40 %	20 %	20 %	20 %	344210302
314	NC_015944	AGGTC	2	10	403277	403286	20 %	20 %	40 %	20 %	344210303
315	NC_015944	CCAGT	2	10	403290	403299	20 %	20 %	20 %	40 %	344210303
316	NC_015944	CGGGG	2	10	403471	403480	0 %	0 %	80 %	20 %	344210303
317	NC_015944	CCCAC	2	10	405357	405366	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
318	NC_015944	CTAGA	2	10	405545	405554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
319	NC_015944	GTGGG	2	10	405703	405712	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.