MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 6509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	TCG	2	6	77	82	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209943
2	NC_015944	CAA	2	6	147	152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209943
3	NC_015944	TCT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209943
4	NC_015944	CTG	2	6	188	193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209943
5	NC_015944	GAA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209943
6	NC_015944	AGT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209943
7	NC_015944	CGA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
8	NC_015944	ATC	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209943
9	NC_015944	ACG	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
10	NC_015944	ACG	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
11	NC_015944	ATC	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209943
12	NC_015944	GAC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
13	NC_015944	GAT	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209943
14	NC_015944	CGA	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
15	NC_015944	CGG	2	6	1249	1254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015944	TGG	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015944	TGG	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015944	GCC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015944	GGT	2	6	1383	1388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015944	ATT	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015944	GGT	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015944	AAG	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015944	AGG	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015944	TAG	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209944
25	NC_015944	TCG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209944
26	NC_015944	GTC	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209944
27	NC_015944	AAC	2	6	2150	2155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015944	ATA	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015944	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015944	ACT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015944	GTA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015944	GCG	2	6	2460	2465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
33	NC_015944	GGC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
34	NC_015944	CGG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
35	NC_015944	CGA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209945
36	NC_015944	CAG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209945
37	NC_015944	ACA	2	6	2716	2721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209945
38	NC_015944	GGA	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209945
39	NC_015944	TAC	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209945
40	NC_015944	CGG	3	9	3073	3081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
41	NC_015944	CAG	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015944	CCG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209946
43	NC_015944	TCG	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209946
44	NC_015944	TCA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209946
45	NC_015944	TCG	3	9	3373	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209946
46	NC_015944	TGC	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209946
47	NC_015944	AGG	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015944	CAA	2	6	3552	3557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015944	ATG	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015944	CTA	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015944	CAC	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015944	TCC	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015944	TGG	2	6	4049	4054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015944	ACC	2	6	4131	4136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015944	GAA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015944	GAT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209947
57	NC_015944	AAC	2	6	4428	4433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
58	NC_015944	AAC	2	6	4439	4444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
59	NC_015944	GAC	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
60	NC_015944	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209947
61	NC_015944	GGC	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
62	NC_015944	TGA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209947
63	NC_015944	CAG	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
64	NC_015944	GTC	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209947
65	NC_015944	CTC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209947
66	NC_015944	CTC	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209947
67	NC_015944	AAC	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
68	NC_015944	ACA	2	6	5271	5276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
69	NC_015944	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209947
70	NC_015944	CAG	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
71	NC_015944	CGA	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
72	NC_015944	CGG	2	6	5941	5946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
73	NC_015944	GTT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209947
74	NC_015944	GGC	2	6	6123	6128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
75	NC_015944	GTC	2	6	6129	6134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209947
76	NC_015944	GGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
77	NC_015944	GTC	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
78	NC_015944	CGG	2	6	6280	6285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209948
79	NC_015944	CGA	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
80	NC_015944	ACG	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
81	NC_015944	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209948
82	NC_015944	ACG	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
83	NC_015944	GAG	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
84	NC_015944	GAC	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
85	NC_015944	TCA	2	6	6774	6779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209948
86	NC_015944	CAG	2	6	6795	6800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
87	NC_015944	TCG	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
88	NC_015944	TGT	2	6	6920	6925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209948
89	NC_015944	TTC	2	6	6936	6941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209948
90	NC_015944	TTA	2	6	6943	6948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209948
91	NC_015944	CTG	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
92	NC_015944	CCG	2	6	7071	7076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209948
93	NC_015944	GAA	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209948
94	NC_015944	CGC	2	6	7235	7240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209948
95	NC_015944	TCC	2	6	7330	7335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209948
96	NC_015944	CGT	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
97	NC_015944	CGG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209948
98	NC_015944	CAC	2	6	7547	7552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209948
99	NC_015944	TCC	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209948
100	NC_015944	GGA	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
101	NC_015944	GAG	2	6	7734	7739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
102	NC_015944	CGG	2	6	7784	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209948
103	NC_015944	TCG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
104	NC_015944	TGA	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209948
105	NC_015944	CAG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
106	NC_015944	GAT	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209948
107	NC_015944	GCC	2	6	8262	8267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209948
108	NC_015944	ACG	2	6	8319	8324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
109	NC_015944	GGA	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
110	NC_015944	GGT	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209948
111	NC_015944	GTA	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209948
112	NC_015944	CAC	3	9	8471	8479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209948
113	NC_015944	TCC	2	6	8584	8589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209948
114	NC_015944	ATG	2	6	8712	8717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015944	GGA	2	6	8804	8809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015944	CGA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209949
117	NC_015944	GAC	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209949
118	NC_015944	ACC	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209949
119	NC_015944	CTC	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209949
120	NC_015944	GAG	2	6	9112	9117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209949
121	NC_015944	AGG	2	6	9170	9175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209949
122	NC_015944	ATC	2	6	9220	9225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209949
123	NC_015944	TCG	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209949
124	NC_015944	GCC	2	6	9329	9334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209949
125	NC_015944	AGC	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209949
126	NC_015944	GTC	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015944	CGG	2	6	9487	9492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015944	GCT	2	6	9520	9525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015944	CGT	2	6	9565	9570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015944	GGC	2	6	9642	9647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015944	ACC	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015944	TGT	2	6	9667	9672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015944	GGA	2	6	9742	9747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209950
134	NC_015944	CCT	2	6	9784	9789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209950
135	NC_015944	CGC	2	6	9871	9876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209950
136	NC_015944	CGA	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209950
137	NC_015944	AGT	2	6	9988	9993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209950
138	NC_015944	CGG	2	6	10011	10016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209950
139	NC_015944	CGT	3	9	10033	10041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
140	NC_015944	TCG	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
141	NC_015944	CGA	2	6	10102	10107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209950
142	NC_015944	CGT	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
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147	NC_015944	TCA	2	6	10555	10560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015944	GGA	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015944	TGG	2	6	10922	10927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209951
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162	NC_015944	CCT	2	6	11417	11422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209951
163	NC_015944	ACG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209951
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228	NC_015944	TTG	2	6	15554	15559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_015944	ACT	2	6	16028	16033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209955
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240	NC_015944	GCA	2	6	16737	16742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209955
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247	NC_015944	TCA	2	6	17325	17330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209956
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249	NC_015944	TCT	2	6	17497	17502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209956
250	NC_015944	CAG	2	6	17678	17683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209956
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252	NC_015944	TCG	2	6	17724	17729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209956
253	NC_015944	ACG	2	6	17883	17888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209956
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255	NC_015944	CGA	2	6	18208	18213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209956
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257	NC_015944	CGC	2	6	18331	18336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209956
258	NC_015944	TGT	2	6	18361	18366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209956
259	NC_015944	CGC	2	6	18474	18479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209956
260	NC_015944	GAC	2	6	18565	18570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209956
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262	NC_015944	ATT	2	6	18697	18702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015944	GTA	2	6	18816	18821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015944	GTC	2	6	18903	18908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209957
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278	NC_015944	TAG	2	6	20004	20009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_015944	CTG	2	6	20050	20055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_015944	CAG	2	6	20090	20095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015944	AGG	2	6	20096	20101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015944	TCG	2	6	20146	20151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_015944	GTT	2	6	20764	20769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015944	TCG	2	6	21061	21066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_015944	TAC	2	6	28473	28478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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