MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 8941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015944	CGA	2	6	73521	73526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1502	NC_015944	GC	3	6	73587	73592	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
1503	NC_015944	CG	3	6	73655	73660	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
1504	NC_015944	GC	3	6	73668	73673	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
1505	NC_015944	TCG	2	6	73676	73681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1506	NC_015944	GCGA	2	8	73699	73706	25 %	0 %	50 %	25 %	344210003
1507	NC_015944	CGA	2	6	73752	73757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1508	NC_015944	AGG	2	6	73761	73766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210003
1509	NC_015944	GTCGC	2	10	73808	73817	0 %	20 %	40 %	40 %	344210003
1510	NC_015944	GTC	2	6	73847	73852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1511	NC_015944	GTC	2	6	73855	73860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1512	NC_015944	CGC	2	6	73920	73925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210003
1513	NC_015944	CGG	2	6	73932	73937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210003
1514	NC_015944	GCG	2	6	74048	74053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210003
1515	NC_015944	CGGT	2	8	74066	74073	0 %	25 %	50 %	25 %	344210003
1516	NC_015944	GAT	2	6	74092	74097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210003
1517	NC_015944	GGC	2	6	74098	74103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210003
1518	NC_015944	CGT	3	9	74109	74117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1519	NC_015944	GTGCCG	2	12	74168	74179	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210003
1520	NC_015944	TTCGAC	2	12	74188	74199	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210003
1521	NC_015944	GGT	2	6	74241	74246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210003
1522	NC_015944	CGT	2	6	74250	74255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1523	NC_015944	GCC	2	6	74296	74301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210003
1524	NC_015944	GTC	2	6	74329	74334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1525	NC_015944	GTC	2	6	74365	74370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1526	NC_015944	TCG	2	6	74432	74437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1527	NC_015944	CG	3	6	74453	74458	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
1528	NC_015944	GTC	2	6	74548	74553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210003
1529	NC_015944	TAAA	2	8	74656	74663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015944	ATA	2	6	74681	74686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015944	AGT	2	6	74713	74718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015944	GTG	2	6	74874	74879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210004
1533	NC_015944	CGA	2	6	74897	74902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210004
1534	NC_015944	CGAC	2	8	74935	74942	25 %	0 %	25 %	50 %	344210004
1535	NC_015944	GCA	2	6	74947	74952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210004
1536	NC_015944	GGC	2	6	74972	74977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210004
1537	NC_015944	TCG	2	6	74998	75003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210004
1538	NC_015944	AGG	3	9	75007	75015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210004
1539	NC_015944	CGA	2	6	75017	75022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210004
1540	NC_015944	AC	3	6	75069	75074	50 %	0 %	0 %	50 %	344210005
1541	NC_015944	CGA	2	6	75088	75093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1542	NC_015944	GCC	2	6	75116	75121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210005
1543	NC_015944	CGA	2	6	75127	75132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1544	NC_015944	CGAG	2	8	75159	75166	25 %	0 %	50 %	25 %	344210005
1545	NC_015944	GAC	2	6	75167	75172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1546	NC_015944	GAA	2	6	75175	75180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210005
1547	NC_015944	CAT	2	6	75187	75192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210005
1548	NC_015944	CGA	2	6	75195	75200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1549	NC_015944	C	6	6	75223	75228	0 %	0 %	0 %	100 %	344210005
1550	NC_015944	CCG	2	6	75246	75251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210005
1551	NC_015944	TCC	2	6	75303	75308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210005
1552	NC_015944	GAA	2	6	75322	75327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210005
1553	NC_015944	ATGCCG	2	12	75359	75370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1554	NC_015944	CGC	2	6	75379	75384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210005
1555	NC_015944	ACG	2	6	75407	75412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1556	NC_015944	GAT	2	6	75415	75420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210005
1557	NC_015944	AAC	2	6	75437	75442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210005
1558	NC_015944	CGA	2	6	75450	75455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1559	NC_015944	GAG	2	6	75458	75463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210005
1560	NC_015944	CTG	2	6	75464	75469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1561	NC_015944	ACG	2	6	75534	75539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1562	NC_015944	ACG	2	6	75552	75557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210005
1563	NC_015944	ACC	2	6	75563	75568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210005
1564	NC_015944	GCCGAC	2	12	75602	75613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210005
1565	NC_015944	CTT	2	6	75620	75625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210005
1566	NC_015944	AGCT	2	8	75649	75656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_015944	GC	3	6	75687	75692	0 %	0 %	50 %	50 %	344210006
1568	NC_015944	GACC	2	8	75781	75788	25 %	0 %	25 %	50 %	344210006
1569	NC_015944	GTC	3	9	75854	75862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210006
1570	NC_015944	TGC	2	6	75863	75868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210006
1571	NC_015944	TCG	3	9	75924	75932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210006
1572	NC_015944	GCG	2	6	75936	75941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210006
1573	NC_015944	TCG	2	6	75978	75983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210006
1574	NC_015944	TCG	2	6	76077	76082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210006
1575	NC_015944	CGAG	2	8	76168	76175	25 %	0 %	50 %	25 %	344210006
1576	NC_015944	CGA	2	6	76213	76218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210006
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1579	NC_015944	GCG	2	6	76371	76376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210007
1580	NC_015944	CGA	2	6	76407	76412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210007
1581	NC_015944	ACG	2	6	76413	76418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210007
1582	NC_015944	CGT	2	6	76458	76463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210007
1583	NC_015944	CGA	2	6	76512	76517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210007
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1585	NC_015944	CGG	2	6	76596	76601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210007
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1588	NC_015944	CCG	2	6	76679	76684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210007
1589	NC_015944	GAG	2	6	76702	76707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210007
1590	NC_015944	GGTC	2	8	76719	76726	0 %	25 %	50 %	25 %	344210007
1591	NC_015944	GAA	2	6	76777	76782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210007
1592	NC_015944	TCGG	2	8	76815	76822	0 %	25 %	50 %	25 %	344210007
1593	NC_015944	CGT	2	6	76887	76892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210007
1594	NC_015944	GTC	2	6	76918	76923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210007
1595	NC_015944	GTG	2	6	76944	76949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210007
1596	NC_015944	CCG	2	6	76950	76955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210007
1597	NC_015944	GTA	2	6	77050	77055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210007
1598	NC_015944	GTAGTC	2	12	77125	77136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210007
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1602	NC_015944	TA	3	6	77301	77306	50 %	50 %	0 %	0 %	344210007
1603	NC_015944	CGT	2	6	77319	77324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210007
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1605	NC_015944	CGG	2	6	77349	77354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210007
1606	NC_015944	GTCG	2	8	77370	77377	0 %	25 %	50 %	25 %	344210007
1607	NC_015944	CAC	2	6	77412	77417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210007
1608	NC_015944	CGA	2	6	77418	77423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210007
1609	NC_015944	GAC	2	6	77425	77430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210007
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1611	NC_015944	CTC	2	6	77478	77483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210008
1612	NC_015944	TCG	2	6	77653	77658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210008
1613	NC_015944	GTCA	2	8	77667	77674	25 %	25 %	25 %	25 %	344210008
1614	NC_015944	AGG	2	6	77687	77692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015944	ATCG	2	8	77776	77783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_015944	CCG	2	6	77800	77805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_015944	GC	3	6	77809	77814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_015944	CGG	2	6	77853	77858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210009
1619	NC_015944	CGG	2	6	77943	77948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210009
1620	NC_015944	CG	3	6	77981	77986	0 %	0 %	50 %	50 %	344210009
1621	NC_015944	ACG	2	6	78004	78009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210009
1622	NC_015944	GTC	2	6	78066	78071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210009
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1854	NC_015944	CAA	3	9	88072	88080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1872	NC_015944	CGGC	2	8	88859	88866	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
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1874	NC_015944	ACCG	2	8	88980	88987	25 %	0 %	25 %	50 %	344210022
1875	NC_015944	CGG	2	6	89004	89009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210022
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1950	NC_015944	AG	3	6	91880	91885	50 %	0 %	50 %	0 %	344210025
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1953	NC_015944	CGG	2	6	91931	91936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210025
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1971	NC_015944	CGA	2	6	92631	92636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210026
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1974	NC_015944	CCTGCT	2	12	92766	92777	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344210026
1975	NC_015944	CGAG	2	8	92786	92793	25 %	0 %	50 %	25 %	344210026
1976	NC_015944	GAC	2	6	92859	92864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210026
1977	NC_015944	TCG	2	6	92873	92878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210026
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1981	NC_015944	TGT	2	6	93097	93102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1982	NC_015944	GCAA	2	8	93128	93135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1983	NC_015944	GCC	2	6	93228	93233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210027
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1986	NC_015944	TCG	4	12	93325	93336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210027
1987	NC_015944	TCGC	2	8	93410	93417	0 %	25 %	25 %	50 %	344210027
1988	NC_015944	ACG	2	6	93465	93470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210027
1989	NC_015944	GTC	2	6	93495	93500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210027
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1994	NC_015944	CGT	2	6	93698	93703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210027
1995	NC_015944	GCC	2	6	93753	93758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210027
1996	NC_015944	CGC	2	6	93797	93802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210027
1997	NC_015944	GCG	2	6	93828	93833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210027
1998	NC_015944	CTCG	2	8	93854	93861	0 %	25 %	25 %	50 %	344210027
1999	NC_015944	CGA	2	6	93896	93901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210027
2000	NC_015944	GTC	2	6	93975	93980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210027

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