MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 8941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015944	GTGG	2	8	51129	51136	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015944	CA	3	6	51137	51142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_015944	CCG	2	6	51159	51164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_015944	CTG	2	6	51225	51230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015944	GTAA	2	8	51255	51262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015944	GTCA	2	8	51286	51293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_015944	GGT	2	6	51320	51325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015944	ACA	2	6	51401	51406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015944	TCG	2	6	51547	51552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1010	NC_015944	TGA	2	6	51593	51598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209980
1011	NC_015944	CCG	2	6	51619	51624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209980
1012	NC_015944	TCC	2	6	51637	51642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209980
1013	NC_015944	CGG	2	6	51647	51652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209980
1014	NC_015944	T	6	6	51861	51866	0 %	100 %	0 %	0 %	344209980
1015	NC_015944	GAA	2	6	51909	51914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209980
1016	NC_015944	AG	3	6	52016	52021	50 %	0 %	50 %	0 %	344209980
1017	NC_015944	AGC	2	6	52029	52034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1018	NC_015944	CTG	2	6	52069	52074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1019	NC_015944	GTA	2	6	52092	52097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209980
1020	NC_015944	CAC	2	6	52109	52114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209980
1021	NC_015944	GTC	2	6	52131	52136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1022	NC_015944	GCG	2	6	52146	52151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209980
1023	NC_015944	AATCG	2	10	52176	52185	40 %	20 %	20 %	20 %	344209980
1024	NC_015944	GTA	2	6	52218	52223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209980
1025	NC_015944	GTC	2	6	52299	52304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1026	NC_015944	CGG	2	6	52394	52399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209980
1027	NC_015944	TCC	2	6	52438	52443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209980
1028	NC_015944	CGA	2	6	52460	52465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1029	NC_015944	AAC	2	6	52583	52588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209980
1030	NC_015944	CGAG	2	8	52592	52599	25 %	0 %	50 %	25 %	344209980
1031	NC_015944	CAG	2	6	52608	52613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209980
1032	NC_015944	CTCC	2	8	52635	52642	0 %	25 %	0 %	75 %	344209980
1033	NC_015944	AAT	2	6	52736	52741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015944	AGG	2	6	52816	52821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015944	TTC	2	6	52876	52881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209981
1036	NC_015944	CGC	2	6	52933	52938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209981
1037	NC_015944	CGC	2	6	52963	52968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209981
1038	NC_015944	CCG	2	6	52975	52980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209981
1039	NC_015944	GC	3	6	53022	53027	0 %	0 %	50 %	50 %	344209981
1040	NC_015944	TGC	2	6	53044	53049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1041	NC_015944	GAA	2	6	53067	53072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209981
1042	NC_015944	AGC	2	6	53099	53104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1043	NC_015944	TCG	3	9	53191	53199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1044	NC_015944	CGA	2	6	53252	53257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1045	NC_015944	CAT	2	6	53273	53278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209981
1046	NC_015944	CGC	3	9	53318	53326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209981
1047	NC_015944	CAC	2	6	53372	53377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209981
1048	NC_015944	GCC	2	6	53436	53441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209981
1049	NC_015944	GGC	2	6	53472	53477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209981
1050	NC_015944	GGA	2	6	53558	53563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209981
1051	NC_015944	GTC	2	6	53577	53582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1052	NC_015944	ACC	2	6	53625	53630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209981
1053	NC_015944	TGA	2	6	53648	53653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209981
1054	NC_015944	AAC	2	6	53661	53666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209981
1055	NC_015944	CGA	2	6	53675	53680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1056	NC_015944	GAG	2	6	53730	53735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209981
1057	NC_015944	CT	3	6	53760	53765	0 %	50 %	0 %	50 %	344209981
1058	NC_015944	CA	3	6	53897	53902	50 %	0 %	0 %	50 %	344209981
1059	NC_015944	GGC	2	6	53924	53929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209981
1060	NC_015944	CGA	2	6	53939	53944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209981
1061	NC_015944	TGA	2	6	54021	54026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015944	TGT	2	6	54055	54060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015944	TCG	2	6	54073	54078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209982
1064	NC_015944	GTC	3	9	54099	54107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209982
1065	NC_015944	TC	3	6	54110	54115	0 %	50 %	0 %	50 %	344209982
1066	NC_015944	CG	3	6	54171	54176	0 %	0 %	50 %	50 %	344209982
1067	NC_015944	TTC	2	6	54229	54234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209982
1068	NC_015944	ACG	2	6	54286	54291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209982
1069	NC_015944	CTG	2	6	54308	54313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209982
1070	NC_015944	TC	3	6	54487	54492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_015944	CCG	2	6	54525	54530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209983
1072	NC_015944	GCC	2	6	54641	54646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209983
1073	NC_015944	GCC	2	6	54653	54658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209983
1074	NC_015944	CGCT	2	8	54677	54684	0 %	25 %	25 %	50 %	344209983
1075	NC_015944	CGA	3	9	54687	54695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1076	NC_015944	GCG	2	6	54722	54727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209983
1077	NC_015944	TCC	2	6	54755	54760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209983
1078	NC_015944	GAGT	2	8	54792	54799	25 %	25 %	50 %	0 %	344209983
1079	NC_015944	GC	3	6	54822	54827	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
1080	NC_015944	CGT	2	6	54832	54837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1081	NC_015944	GTT	2	6	54846	54851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209983
1082	NC_015944	AGC	2	6	54893	54898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1083	NC_015944	CCG	2	6	54963	54968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209983
1084	NC_015944	CGT	2	6	55002	55007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1085	NC_015944	CTC	2	6	55045	55050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209983
1086	NC_015944	CGT	2	6	55068	55073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1087	NC_015944	GCC	2	6	55101	55106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209983
1088	NC_015944	CGG	2	6	55136	55141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209983
1089	NC_015944	CGCATC	2	12	55169	55180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344209983
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1091	NC_015944	GTTC	2	8	55428	55435	0 %	50 %	25 %	25 %	344209983
1092	NC_015944	GGC	2	6	55436	55441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209983
1093	NC_015944	TCG	2	6	55454	55459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1094	NC_015944	GC	3	6	55521	55526	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
1095	NC_015944	GTT	2	6	55549	55554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209983
1096	NC_015944	CAG	2	6	55606	55611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1097	NC_015944	CATCCC	2	12	55663	55674	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	344209983
1098	NC_015944	CGC	2	6	55684	55689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209983
1099	NC_015944	GGC	2	6	55714	55719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209983
1100	NC_015944	CGT	2	6	55776	55781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1101	NC_015944	TCG	2	6	55835	55840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1102	NC_015944	CTC	2	6	55849	55854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209983
1103	NC_015944	ACG	2	6	55856	55861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1104	NC_015944	GAG	2	6	55879	55884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209983
1105	NC_015944	GGAC	2	8	55901	55908	25 %	0 %	50 %	25 %	344209983
1106	NC_015944	CGG	2	6	55923	55928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209983
1107	NC_015944	CG	3	6	55947	55952	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
1108	NC_015944	GCAG	2	8	56052	56059	25 %	0 %	50 %	25 %	344209983
1109	NC_015944	GCTC	2	8	56112	56119	0 %	25 %	25 %	50 %	344209983
1110	NC_015944	CGA	2	6	56134	56139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1111	NC_015944	GTT	2	6	56167	56172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209983
1112	NC_015944	TCGT	2	8	56216	56223	0 %	50 %	25 %	25 %	344209983
1113	NC_015944	CGA	2	6	56230	56235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209983
1114	NC_015944	GAA	2	6	56239	56244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209983
1115	NC_015944	GAT	2	6	56272	56277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209983
1116	NC_015944	TC	3	6	56418	56423	0 %	50 %	0 %	50 %	344209983
1117	NC_015944	GT	3	6	56620	56625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015944	GCC	2	6	56697	56702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015944	CCACA	2	10	56714	56723	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1120	NC_015944	GAC	2	6	56772	56777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209984
1121	NC_015944	CGT	2	6	56831	56836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209984
1122	NC_015944	ACC	2	6	56848	56853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209984
1123	NC_015944	GCCC	2	8	56857	56864	0 %	0 %	25 %	75 %	344209984
1124	NC_015944	ACA	2	6	56882	56887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209984
1125	NC_015944	CGG	2	6	56906	56911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209984
1126	NC_015944	CGA	2	6	56913	56918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209984
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1233	NC_015944	TAC	2	6	61515	61520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209989
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1238	NC_015944	CT	3	6	61880	61885	0 %	50 %	0 %	50 %	344209990
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1247	NC_015944	TAC	2	6	62154	62159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209990
1248	NC_015944	GGCT	2	8	62164	62171	0 %	25 %	50 %	25 %	344209990
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1250	NC_015944	GT	3	6	62245	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	344209990
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1374	NC_015944	GGC	2	6	68110	68115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_015944	CTC	2	6	68151	68156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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