MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 8941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015944	CAG	2	6	25986	25991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209963
502	NC_015944	TCC	2	6	26070	26075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209963
503	NC_015944	TCC	2	6	26164	26169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209963
504	NC_015944	CAA	2	6	26276	26281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209963
505	NC_015944	TCA	2	6	26326	26331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209963
506	NC_015944	TCGC	2	8	26383	26390	0 %	25 %	25 %	50 %	344209963
507	NC_015944	CGG	2	6	26424	26429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209963
508	NC_015944	CT	3	6	26609	26614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015944	TTA	2	6	26625	26630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015944	GCACAC	2	12	26747	26758	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
511	NC_015944	GAA	2	6	26765	26770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015944	ACG	2	6	26834	26839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209964
513	NC_015944	GACC	2	8	26854	26861	25 %	0 %	25 %	50 %	344209964
514	NC_015944	CT	3	6	26862	26867	0 %	50 %	0 %	50 %	344209964
515	NC_015944	TAT	2	6	26886	26891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209964
516	NC_015944	CTC	2	6	26953	26958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209964
517	NC_015944	GCATT	2	10	26963	26972	20 %	40 %	20 %	20 %	344209964
518	NC_015944	TAC	2	6	26989	26994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209964
519	NC_015944	AT	3	6	27002	27007	50 %	50 %	0 %	0 %	344209964
520	NC_015944	GCT	2	6	27042	27047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209964
521	NC_015944	TAC	2	6	27136	27141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209964
522	NC_015944	CTG	2	6	27151	27156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209964
523	NC_015944	TCA	2	6	27220	27225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209964
524	NC_015944	ATCGG	2	10	27265	27274	20 %	20 %	40 %	20 %	344209964
525	NC_015944	CAC	2	6	27344	27349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209964
526	NC_015944	CGG	2	6	27374	27379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209964
527	NC_015944	GGCA	2	8	27420	27427	25 %	0 %	50 %	25 %	344209964
528	NC_015944	TGT	2	6	27450	27455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209964
529	NC_015944	CG	3	6	27478	27483	0 %	0 %	50 %	50 %	344209964
530	NC_015944	TC	3	6	27548	27553	0 %	50 %	0 %	50 %	344209964
531	NC_015944	CGCT	2	8	27554	27561	0 %	25 %	25 %	50 %	344209964
532	NC_015944	TTC	2	6	27562	27567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209964
533	NC_015944	CCT	2	6	27747	27752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209964
534	NC_015944	CGG	2	6	27771	27776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209964
535	NC_015944	CGC	2	6	27801	27806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209964
536	NC_015944	GGT	2	6	27817	27822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209964
537	NC_015944	TCA	2	6	27916	27921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209964
538	NC_015944	GTT	2	6	27964	27969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209964
539	NC_015944	GC	3	6	28061	28066	0 %	0 %	50 %	50 %	344209964
540	NC_015944	GCG	2	6	28082	28087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209964
541	NC_015944	CTA	2	6	28137	28142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209964
542	NC_015944	CTT	2	6	28143	28148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209964
543	NC_015944	CGC	2	6	28160	28165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209964
544	NC_015944	ACCGAG	2	12	28210	28221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209964
545	NC_015944	TA	3	6	28463	28468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015944	TAC	2	6	28473	28478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015944	G	6	6	28549	28554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015944	CGGT	2	8	28707	28714	0 %	25 %	50 %	25 %	344209965
549	NC_015944	CAG	2	6	28719	28724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209965
550	NC_015944	TCGT	2	8	28774	28781	0 %	50 %	25 %	25 %	344209965
551	NC_015944	ATC	2	6	28866	28871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209965
552	NC_015944	GCG	2	6	28928	28933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209965
553	NC_015944	GTC	2	6	28988	28993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209965
554	NC_015944	GT	3	6	29112	29117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015944	CGA	2	6	29266	29271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209966
556	NC_015944	CGG	2	6	29285	29290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209966
557	NC_015944	AC	3	6	29309	29314	50 %	0 %	0 %	50 %	344209966
558	NC_015944	AG	3	6	29522	29527	50 %	0 %	50 %	0 %	344209966
559	NC_015944	GTCG	2	8	29602	29609	0 %	25 %	50 %	25 %	344209966
560	NC_015944	G	6	6	29620	29625	0 %	0 %	100 %	0 %	344209966
561	NC_015944	CAG	2	6	29771	29776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015944	ATC	2	6	29883	29888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209967
563	NC_015944	CGT	2	6	29938	29943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209967
564	NC_015944	GAC	2	6	29960	29965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209967
565	NC_015944	CGG	2	6	29990	29995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209967
566	NC_015944	AC	3	6	30059	30064	50 %	0 %	0 %	50 %	344209967
567	NC_015944	GA	3	6	30066	30071	50 %	0 %	50 %	0 %	344209967
568	NC_015944	ATC	2	6	30072	30077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209967
569	NC_015944	GTG	2	6	30171	30176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209967
570	NC_015944	CGA	2	6	30220	30225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209967
571	NC_015944	GCTG	2	8	30300	30307	0 %	25 %	50 %	25 %	344209967
572	NC_015944	CGGA	2	8	30320	30327	25 %	0 %	50 %	25 %	344209967
573	NC_015944	CTG	2	6	30332	30337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209967
574	NC_015944	TTC	2	6	30345	30350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209967
575	NC_015944	CCG	2	6	30390	30395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209967
576	NC_015944	CGT	2	6	30445	30450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209967
577	NC_015944	CGT	2	6	30482	30487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209967
578	NC_015944	TCGG	2	8	30527	30534	0 %	25 %	50 %	25 %	344209967
579	NC_015944	CCG	2	6	30639	30644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209967
580	NC_015944	TCGA	2	8	30650	30657	25 %	25 %	25 %	25 %	344209967
581	NC_015944	CTG	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209967
582	NC_015944	GAG	2	6	30758	30763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209967
583	NC_015944	TCG	2	6	30925	30930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209968
584	NC_015944	CGTCG	2	10	30941	30950	0 %	20 %	40 %	40 %	344209968
585	NC_015944	CTG	2	6	30980	30985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209968
586	NC_015944	CGC	2	6	30998	31003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
587	NC_015944	GTC	2	6	31027	31032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209968
588	NC_015944	CGC	2	6	31109	31114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
589	NC_015944	CCG	2	6	31137	31142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
590	NC_015944	GTCT	2	8	31170	31177	0 %	50 %	25 %	25 %	344209968
591	NC_015944	GACGGT	2	12	31179	31190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344209968
592	NC_015944	GCC	2	6	31206	31211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
593	NC_015944	CGC	3	9	31226	31234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
594	NC_015944	GACG	2	8	31237	31244	25 %	0 %	50 %	25 %	344209968
595	NC_015944	CGC	2	6	31370	31375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
596	NC_015944	GAT	2	6	31416	31421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209968
597	NC_015944	GTT	2	6	31425	31430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209968
598	NC_015944	GCC	2	6	31483	31488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
599	NC_015944	GCTG	2	8	31508	31515	0 %	25 %	50 %	25 %	344209968
600	NC_015944	CGA	2	6	31532	31537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209968
601	NC_015944	GCT	2	6	31540	31545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209968
602	NC_015944	GGC	2	6	31546	31551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209968
603	NC_015944	CGG	2	6	31614	31619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209968
604	NC_015944	GAC	2	6	31644	31649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209968
605	NC_015944	GCG	2	6	31679	31684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209968
606	NC_015944	CGG	2	6	31709	31714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209968
607	NC_015944	CGTCC	2	10	31824	31833	0 %	20 %	20 %	60 %	344209968
608	NC_015944	TTC	2	6	31917	31922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209968
609	NC_015944	GAG	2	6	31923	31928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209968
610	NC_015944	GC	3	6	31963	31968	0 %	0 %	50 %	50 %	344209968
611	NC_015944	CGC	2	6	32048	32053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
612	NC_015944	CGA	2	6	32057	32062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209968
613	NC_015944	ATG	2	6	32151	32156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209968
614	NC_015944	TCG	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209968
615	NC_015944	TCG	2	6	32201	32206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209968
616	NC_015944	GT	3	6	32229	32234	0 %	50 %	50 %	0 %	344209968
617	NC_015944	CCG	2	6	32236	32241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209968
618	NC_015944	GGA	2	6	32291	32296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209968
619	NC_015944	CCGAC	2	10	32361	32370	20 %	0 %	20 %	60 %	344209968
620	NC_015944	C	6	6	32426	32431	0 %	0 %	0 %	100 %	344209968
621	NC_015944	CCT	2	6	32510	32515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209968
622	NC_015944	TGG	2	6	32531	32536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209968
623	NC_015944	TCAT	2	8	32542	32549	25 %	50 %	0 %	25 %	344209968
624	NC_015944	TCG	2	6	32550	32555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
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626	NC_015944	GTG	2	6	32668	32673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209969
627	NC_015944	CGG	2	6	32774	32779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209969
628	NC_015944	GTC	3	9	32796	32804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
629	NC_015944	GCT	2	6	32865	32870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209969
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743	NC_015944	AT	3	6	37829	37834	50 %	50 %	0 %	0 %	344209972
744	NC_015944	CTAT	2	8	37862	37869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
745	NC_015944	AGTA	2	8	37903	37910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
746	NC_015944	GTTCC	2	10	38058	38067	0 %	40 %	20 %	40 %	344209973
747	NC_015944	ACG	2	6	38113	38118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209973
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749	NC_015944	CT	3	6	38220	38225	0 %	50 %	0 %	50 %	344209973
750	NC_015944	CAT	2	6	38251	38256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209973
751	NC_015944	AGCTG	2	10	38257	38266	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
752	NC_015944	CGG	2	6	38270	38275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_015944	GAC	2	6	38300	38305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_015944	GACC	2	8	38313	38320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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756	NC_015944	TCC	2	6	38438	38443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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998	NC_015944	GAC	2	6	50958	50963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
999	NC_015944	TCC	2	6	51063	51068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1000	NC_015944	TCC	2	6	51080	51085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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