MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 8941

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015944	CT	3	6	380377	380382	0 %	50 %	0 %	50 %	344210285
8502	NC_015944	CGT	3	9	380426	380434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210285
8503	NC_015944	AAC	2	6	380440	380445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210285
8504	NC_015944	CTC	2	6	380498	380503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210285
8505	NC_015944	TCG	2	6	380590	380595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210285
8506	NC_015944	TCTGC	2	10	380624	380633	0 %	40 %	20 %	40 %	344210285
8507	NC_015944	TGC	2	6	380643	380648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210285
8508	NC_015944	GGA	2	6	380681	380686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210285
8509	NC_015944	TGG	3	9	380717	380725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210285
8510	NC_015944	CTG	2	6	380765	380770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_015944	ACC	2	6	380792	380797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210286
8512	NC_015944	AGG	2	6	380909	380914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210286
8513	NC_015944	GT	3	6	380934	380939	0 %	50 %	50 %	0 %	344210286
8514	NC_015944	GTA	2	6	381045	381050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210286
8515	NC_015944	GCA	2	6	381196	381201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210286
8516	NC_015944	GAGTAC	2	12	381225	381236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344210286
8517	NC_015944	GGT	2	6	381249	381254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210286
8518	NC_015944	TGG	2	6	381269	381274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210286
8519	NC_015944	TTA	2	6	381338	381343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210286
8520	NC_015944	AGG	2	6	381367	381372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210286
8521	NC_015944	GAACC	2	10	381407	381416	40 %	0 %	20 %	40 %	344210286
8522	NC_015944	GA	3	6	381445	381450	50 %	0 %	50 %	0 %	344210286
8523	NC_015944	TGA	2	6	381521	381526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210286
8524	NC_015944	CT	3	6	381579	381584	0 %	50 %	0 %	50 %	344210286
8525	NC_015944	GCT	2	6	381586	381591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210286
8526	NC_015944	ATC	2	6	381600	381605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210286
8527	NC_015944	TAT	2	6	381624	381629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210286
8528	NC_015944	GAA	2	6	381677	381682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210286
8529	NC_015944	GAT	2	6	381810	381815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210286
8530	NC_015944	ATGA	2	8	381907	381914	50 %	25 %	25 %	0 %	344210286
8531	NC_015944	GA	3	6	381934	381939	50 %	0 %	50 %	0 %	344210286
8532	NC_015944	GCT	2	6	381970	381975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210286
8533	NC_015944	TCCGAT	2	12	382026	382037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210286
8534	NC_015944	CGT	2	6	382047	382052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210286
8535	NC_015944	ACA	2	6	382055	382060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210286
8536	NC_015944	GAA	2	6	382251	382256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210286
8537	NC_015944	GCT	2	6	382324	382329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210286
8538	NC_015944	AGGATA	2	12	382456	382467	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	344210286
8539	NC_015944	TTA	2	6	382563	382568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_015944	ACC	2	6	382703	382708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8541	NC_015944	CTG	2	6	382829	382834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210287
8542	NC_015944	CGT	2	6	382933	382938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210287
8543	NC_015944	TC	3	6	383043	383048	0 %	50 %	0 %	50 %	344210287
8544	NC_015944	CAA	2	6	383091	383096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210287
8545	NC_015944	GCT	2	6	383174	383179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210287
8546	NC_015944	AGA	2	6	383295	383300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210287
8547	NC_015944	GCC	2	6	383404	383409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210287
8548	NC_015944	CAG	2	6	383439	383444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210287
8549	NC_015944	GTT	2	6	383470	383475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210287
8550	NC_015944	GAA	2	6	383698	383703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210287
8551	NC_015944	GAG	2	6	383785	383790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210287
8552	NC_015944	CGG	2	6	383800	383805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210287
8553	NC_015944	ATGT	2	8	383920	383927	25 %	50 %	25 %	0 %	344210287
8554	NC_015944	CAC	2	6	383937	383942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210287
8555	NC_015944	ATTT	2	8	383987	383994	25 %	75 %	0 %	0 %	344210287
8556	NC_015944	T	6	6	384037	384042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_015944	TGG	2	6	384080	384085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_015944	CGC	2	6	384239	384244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210288
8559	NC_015944	GTTT	2	8	384343	384350	0 %	75 %	25 %	0 %	344210288
8560	NC_015944	CAT	2	6	384376	384381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210288
8561	NC_015944	AGTT	2	8	384419	384426	25 %	50 %	25 %	0 %	344210288
8562	NC_015944	GGAAC	2	10	384475	384484	40 %	0 %	40 %	20 %	344210288
8563	NC_015944	GAGT	2	8	384494	384501	25 %	25 %	50 %	0 %	344210288
8564	NC_015944	ATCTG	2	10	384534	384543	20 %	40 %	20 %	20 %	344210288
8565	NC_015944	CT	4	8	384585	384592	0 %	50 %	0 %	50 %	344210288
8566	NC_015944	GTC	2	6	384689	384694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8567	NC_015944	GACTC	2	10	384882	384891	20 %	20 %	20 %	40 %	344210288
8568	NC_015944	AG	3	6	384935	384940	50 %	0 %	50 %	0 %	344210288
8569	NC_015944	GCC	2	6	385116	385121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210288
8570	NC_015944	TCG	2	6	385128	385133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8571	NC_015944	ATC	2	6	385175	385180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210288
8572	NC_015944	CGA	2	6	385201	385206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8573	NC_015944	TCG	2	6	385210	385215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8574	NC_015944	C	6	6	385223	385228	0 %	0 %	0 %	100 %	344210288
8575	NC_015944	CCG	2	6	385276	385281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210288
8576	NC_015944	CGA	2	6	385285	385290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8577	NC_015944	CGT	2	6	385375	385380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8578	NC_015944	AT	3	6	385449	385454	50 %	50 %	0 %	0 %	344210288
8579	NC_015944	GCC	2	6	385493	385498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210288
8580	NC_015944	GTC	2	6	385553	385558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8581	NC_015944	GCGAAC	2	12	385638	385649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8582	NC_015944	TCG	2	6	385662	385667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8583	NC_015944	CTT	2	6	385681	385686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210288
8584	NC_015944	TC	3	6	385783	385788	0 %	50 %	0 %	50 %	344210288
8585	NC_015944	CGG	2	6	385866	385871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210288
8586	NC_015944	TCG	2	6	385908	385913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210288
8587	NC_015944	CA	3	6	386002	386007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_015944	CCCT	2	8	386044	386051	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8589	NC_015944	TGAA	2	8	386155	386162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_015944	CA	3	6	386255	386260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_015944	TTC	2	6	386297	386302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210289
8592	NC_015944	CT	3	6	386308	386313	0 %	50 %	0 %	50 %	344210289
8593	NC_015944	GGT	2	6	386321	386326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210289
8594	NC_015944	CT	3	6	386360	386365	0 %	50 %	0 %	50 %	344210289
8595	NC_015944	TGTCG	2	10	386389	386398	0 %	40 %	40 %	20 %	344210289
8596	NC_015944	CGT	2	6	386443	386448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210289
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8599	NC_015944	TCGCC	2	10	386686	386695	0 %	20 %	20 %	60 %	344210289
8600	NC_015944	TCG	2	6	386712	386717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210289
8601	NC_015944	TCC	2	6	386784	386789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210289
8602	NC_015944	ATC	2	6	386841	386846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210289
8603	NC_015944	CGT	2	6	386872	386877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210289
8604	NC_015944	GA	3	6	386897	386902	50 %	0 %	50 %	0 %	344210289
8605	NC_015944	GAA	2	6	386905	386910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210289
8606	NC_015944	TCC	2	6	386922	386927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210289
8607	NC_015944	ATT	2	6	386972	386977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210289
8608	NC_015944	CGC	2	6	387037	387042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210289
8609	NC_015944	GTTTC	2	10	387044	387053	0 %	60 %	20 %	20 %	344210289
8610	NC_015944	GTC	2	6	387170	387175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210289
8611	NC_015944	TCG	2	6	387234	387239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210289
8612	NC_015944	GAC	2	6	387248	387253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210289
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8616	NC_015944	TAG	2	6	387446	387451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_015944	GAC	2	6	387480	387485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_015944	GT	3	6	387499	387504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_015944	CCAT	2	8	387541	387548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8620	NC_015944	GTT	2	6	387584	387589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8743	NC_015944	TACA	2	8	395239	395246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8744	NC_015944	TA	3	6	395280	395285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8745	NC_015944	ATA	2	6	395357	395362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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