MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 8941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015944	TCG	2	6	205021	205026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210125
4502	NC_015944	AC	4	8	205028	205035	50 %	0 %	0 %	50 %	344210125
4503	NC_015944	GCG	2	6	205065	205070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210125
4504	NC_015944	CGA	2	6	205142	205147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210125
4505	NC_015944	GAG	2	6	205179	205184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210125
4506	NC_015944	CGA	2	6	205187	205192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210125
4507	NC_015944	GT	3	6	205198	205203	0 %	50 %	50 %	0 %	344210125
4508	NC_015944	CGT	3	9	205220	205228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210125
4509	NC_015944	CGG	3	9	205229	205237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210125
4510	NC_015944	GGT	2	6	205248	205253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210125
4511	NC_015944	GGA	2	6	205256	205261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210125
4512	NC_015944	CGG	2	6	205295	205300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210125
4513	NC_015944	GCC	2	6	205320	205325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210125
4514	NC_015944	GCGGT	2	10	205414	205423	0 %	20 %	60 %	20 %	344210125
4515	NC_015944	GCA	2	6	205424	205429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210125
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4521	NC_015944	ACG	2	6	205552	205557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210125
4522	NC_015944	GCC	2	6	205619	205624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_015944	GAC	2	6	205639	205644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210126
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4525	NC_015944	GAC	2	6	205756	205761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210126
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4528	NC_015944	CGA	2	6	205821	205826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210126
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4530	NC_015944	CGT	2	6	205842	205847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210126
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4532	NC_015944	GTC	2	6	205859	205864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210126
4533	NC_015944	CGA	2	6	205878	205883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210126
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4535	NC_015944	CAG	2	6	206130	206135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015944	CGGC	2	8	206139	206146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_015944	CGA	2	6	206196	206201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210127
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4552	NC_015944	CGA	3	9	206652	206660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210127
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4554	NC_015944	GCG	2	6	206716	206721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210127
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4557	NC_015944	TCG	2	6	206766	206771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_015944	TCG	2	6	206868	206873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210128
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4560	NC_015944	CAGGC	2	10	206906	206915	20 %	0 %	40 %	40 %	344210128
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4593	NC_015944	GC	3	6	208032	208037	0 %	0 %	50 %	50 %	344210128
4594	NC_015944	GTT	2	6	208049	208054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210128
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4606	NC_015944	CAT	2	6	208685	208690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015944	CAG	3	9	208723	208731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_015944	CGGCAG	2	12	208738	208749	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_015944	GCC	2	6	208791	208796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_015944	GAG	2	6	208800	208805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015944	GCC	4	12	208890	208901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_015944	TATGG	2	10	208906	208915	20 %	40 %	40 %	0 %	344210129
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4621	NC_015944	CGG	2	6	209343	209348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210129
4622	NC_015944	ACG	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4623	NC_015944	AC	3	6	209412	209417	50 %	0 %	0 %	50 %	344210129
4624	NC_015944	CGC	2	6	209471	209476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4625	NC_015944	GGT	2	6	209554	209559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210129
4626	NC_015944	CCG	2	6	209576	209581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4627	NC_015944	TCGAA	2	10	209645	209654	40 %	20 %	20 %	20 %	344210129
4628	NC_015944	CGC	2	6	209697	209702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4629	NC_015944	CGA	2	6	209724	209729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4630	NC_015944	CGAC	2	8	209795	209802	25 %	0 %	25 %	50 %	344210129
4631	NC_015944	TGG	2	6	209807	209812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210129
4632	NC_015944	CA	3	6	209825	209830	50 %	0 %	0 %	50 %	344210129
4633	NC_015944	ACA	2	6	209854	209859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210129
4634	NC_015944	ACG	2	6	209879	209884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4635	NC_015944	CGC	2	6	209901	209906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4636	NC_015944	ACGA	2	8	209924	209931	50 %	0 %	25 %	25 %	344210129
4637	NC_015944	CGC	2	6	209967	209972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4638	NC_015944	TCGC	2	8	210007	210014	0 %	25 %	25 %	50 %	344210129
4639	NC_015944	GCAG	2	8	210030	210037	25 %	0 %	50 %	25 %	344210129
4640	NC_015944	CAG	2	6	210046	210051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4641	NC_015944	CGGC	2	8	210092	210099	0 %	0 %	50 %	50 %	344210129
4642	NC_015944	GAC	2	6	210103	210108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4643	NC_015944	TC	3	6	210127	210132	0 %	50 %	0 %	50 %	344210129
4644	NC_015944	CAG	2	6	210193	210198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4645	NC_015944	CGG	2	6	210203	210208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210129
4646	NC_015944	CCA	2	6	210243	210248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210129
4647	NC_015944	GCG	2	6	210270	210275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210129
4648	NC_015944	CAGG	2	8	210280	210287	25 %	0 %	50 %	25 %	344210129
4649	NC_015944	CGT	2	6	210288	210293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4650	NC_015944	GCG	2	6	210314	210319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210129
4651	NC_015944	TCG	2	6	210359	210364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4652	NC_015944	ACG	2	6	210367	210372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4653	NC_015944	CGC	2	6	210383	210388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4654	NC_015944	TCGG	2	8	210437	210444	0 %	25 %	50 %	25 %	344210129
4655	NC_015944	CGC	2	6	210488	210493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
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4657	NC_015944	ACG	2	6	210554	210559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4658	NC_015944	GCG	2	6	210560	210565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210129
4659	NC_015944	GTCA	2	8	210589	210596	25 %	25 %	25 %	25 %	344210129
4660	NC_015944	GAT	2	6	210606	210611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210129
4661	NC_015944	TCG	2	6	210629	210634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4662	NC_015944	CGG	2	6	210639	210644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210129
4663	NC_015944	GTA	2	6	210700	210705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210129
4664	NC_015944	ACC	2	6	210736	210741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210129
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4666	NC_015944	ACG	2	6	210860	210865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4667	NC_015944	CGTC	2	8	210866	210873	0 %	25 %	25 %	50 %	344210129
4668	NC_015944	ACG	3	9	210926	210934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
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4670	NC_015944	ACG	2	6	210941	210946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4671	NC_015944	TCG	2	6	211013	211018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210129
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4674	NC_015944	TCG	2	6	211064	211069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210129
4675	NC_015944	GCC	2	6	211198	211203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210129
4676	NC_015944	ACG	2	6	211232	211237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210129
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4678	NC_015944	ACA	2	6	211302	211307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210129
4679	NC_015944	GTAT	2	8	211331	211338	25 %	50 %	25 %	0 %	344210130
4680	NC_015944	GCA	2	6	211394	211399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210130
4681	NC_015944	CGT	2	6	211411	211416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210130
4682	NC_015944	TCT	2	6	211417	211422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210130
4683	NC_015944	TCG	2	6	211431	211436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210130
4684	NC_015944	GAG	2	6	211514	211519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210130
4685	NC_015944	GAC	2	6	211520	211525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210130
4686	NC_015944	CGT	2	6	211528	211533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210130
4687	NC_015944	GAC	2	6	211550	211555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210130
4688	NC_015944	GCA	2	6	211659	211664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4689	NC_015944	TCG	2	6	211852	211857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210131
4690	NC_015944	AC	3	6	211873	211878	50 %	0 %	0 %	50 %	344210131
4691	NC_015944	CG	3	6	211900	211905	0 %	0 %	50 %	50 %	344210131
4692	NC_015944	GGC	2	6	211954	211959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210131
4693	NC_015944	CCCA	2	8	211967	211974	25 %	0 %	0 %	75 %	344210131
4694	NC_015944	CGT	2	6	211982	211987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210131
4695	NC_015944	CGT	3	9	211989	211997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210131
4696	NC_015944	GTAT	2	8	212127	212134	25 %	50 %	25 %	0 %	344210131
4697	NC_015944	TGA	2	6	212177	212182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210131
4698	NC_015944	GGC	2	6	212271	212276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210132
4699	NC_015944	TGT	2	6	212280	212285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210132
4700	NC_015944	CGT	2	6	212292	212297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210132
4701	NC_015944	CTCGT	2	10	212350	212359	0 %	40 %	20 %	40 %	344210132
4702	NC_015944	GCG	2	6	212400	212405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210132
4703	NC_015944	CGA	2	6	212415	212420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210132
4704	NC_015944	TCG	2	6	212486	212491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210132
4705	NC_015944	TCG	2	6	212495	212500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210132
4706	NC_015944	CAA	2	6	212513	212518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210132
4707	NC_015944	TCA	2	6	212570	212575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210132
4708	NC_015944	CTC	2	6	212629	212634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210132
4709	NC_015944	GCC	2	6	212651	212656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210132
4710	NC_015944	CTC	2	6	212671	212676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210132
4711	NC_015944	CCG	2	6	212720	212725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210132
4712	NC_015944	CGC	2	6	212751	212756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210132
4713	NC_015944	CGG	2	6	212766	212771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210132
4714	NC_015944	ACGG	2	8	212799	212806	25 %	0 %	50 %	25 %	344210132
4715	NC_015944	GGC	2	6	212821	212826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210132
4716	NC_015944	GTC	2	6	212930	212935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4717	NC_015944	TCG	2	6	212964	212969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4718	NC_015944	CGG	2	6	212971	212976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210133
4719	NC_015944	ACG	2	6	212979	212984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4720	NC_015944	AG	3	6	213002	213007	50 %	0 %	50 %	0 %	344210133
4721	NC_015944	CGC	2	6	213154	213159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210133
4722	NC_015944	CGT	2	6	213226	213231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4723	NC_015944	CCCG	2	8	213236	213243	0 %	0 %	25 %	75 %	344210133
4724	NC_015944	GAC	2	6	213279	213284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4725	NC_015944	GAA	2	6	213290	213295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210133
4726	NC_015944	TGA	2	6	213298	213303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210133
4727	NC_015944	CAG	2	6	213305	213310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4728	NC_015944	CAG	2	6	213353	213358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4729	NC_015944	CAG	2	6	213419	213424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4730	NC_015944	GCC	2	6	213443	213448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210133
4731	NC_015944	GGAA	2	8	213483	213490	50 %	0 %	50 %	0 %	344210133
4732	NC_015944	CGGA	2	8	213513	213520	25 %	0 %	50 %	25 %	344210133
4733	NC_015944	GC	3	6	213536	213541	0 %	0 %	50 %	50 %	344210133
4734	NC_015944	CGA	2	6	213553	213558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210133
4735	NC_015944	CCA	2	6	213575	213580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210133
4736	NC_015944	CGC	2	6	213620	213625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210133
4737	NC_015944	AGT	2	6	213744	213749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210133
4738	NC_015944	CGC	2	6	213790	213795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210133
4739	NC_015944	CACCG	2	10	213884	213893	20 %	0 %	20 %	60 %	344210133
4740	NC_015944	CGC	2	6	213901	213906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210133
4741	NC_015944	GAA	2	6	214088	214093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210133
4742	NC_015944	GAA	2	6	214148	214153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210133
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4744	NC_015944	CGC	2	6	214175	214180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210133
4745	NC_015944	GAA	2	6	214205	214210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210133
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4747	NC_015944	AGT	2	6	214228	214233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210133
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4772	NC_015944	CGA	2	6	215404	215409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210135
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4863	NC_015944	TCG	2	6	219402	219407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210137
4864	NC_015944	AG	3	6	219422	219427	50 %	0 %	50 %	0 %	344210137
4865	NC_015944	GTA	2	6	219440	219445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210137
4866	NC_015944	ATG	2	6	219486	219491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210137
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4869	NC_015944	AG	3	6	219749	219754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4870	NC_015944	GTAG	2	8	219788	219795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4871	NC_015944	GAA	2	6	219799	219804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4872	NC_015944	CGT	2	6	219904	219909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210138
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4874	NC_015944	TCG	2	6	220038	220043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210138
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4877	NC_015944	TCG	3	9	220083	220091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210138
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4882	NC_015944	GGAG	2	8	220264	220271	25 %	0 %	75 %	0 %	344210138
4883	NC_015944	GC	3	6	220276	220281	0 %	0 %	50 %	50 %	344210138
4884	NC_015944	CTC	2	6	220307	220312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210138
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4902	NC_015944	CAG	2	6	220928	220933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210138
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4911	NC_015944	CCG	2	6	221241	221246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210138
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4915	NC_015944	TCG	2	6	221391	221396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210138
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4932	NC_015944	GGA	2	6	222118	222123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210138
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4934	NC_015944	GCC	2	6	222158	222163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210138
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4937	NC_015944	CCA	2	6	222297	222302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210138
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4949	NC_015944	CGGG	2	8	223254	223261	0 %	0 %	75 %	25 %	344210139
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4962	NC_015944	GAG	2	6	223783	223788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4963	NC_015944	GT	3	6	223813	223818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4969	NC_015944	GCTT	2	8	224218	224225	0 %	50 %	25 %	25 %	344210140
4970	NC_015944	GC	3	6	224257	224262	0 %	0 %	50 %	50 %	344210140
4971	NC_015944	CAGC	2	8	224272	224279	25 %	0 %	25 %	50 %	344210140
4972	NC_015944	CGACG	2	10	224312	224321	20 %	0 %	40 %	40 %	344210140
4973	NC_015944	GGT	2	6	224355	224360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210140
4974	NC_015944	GAGG	2	8	224406	224413	25 %	0 %	75 %	0 %	344210140
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4979	NC_015944	GATG	2	8	224609	224616	25 %	25 %	50 %	0 %	344210140
4980	NC_015944	TCC	2	6	224619	224624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210140
4981	NC_015944	CCG	2	6	224633	224638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210140
4982	NC_015944	ACA	2	6	224677	224682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210140
4983	NC_015944	CGA	2	6	224690	224695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210140
4984	NC_015944	GAA	3	9	224697	224705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210140
4985	NC_015944	TCGG	2	8	224820	224827	0 %	25 %	50 %	25 %	344210140
4986	NC_015944	GTC	2	6	224907	224912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210140
4987	NC_015944	CTG	2	6	224976	224981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210140
4988	NC_015944	CCCA	2	8	225131	225138	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4989	NC_015944	GCT	2	6	225224	225229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210141
4990	NC_015944	CGA	2	6	225269	225274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210141
4991	NC_015944	CAC	2	6	225322	225327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210141
4992	NC_015944	GGA	2	6	225359	225364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210141
4993	NC_015944	CA	3	6	225394	225399	50 %	0 %	0 %	50 %	344210141
4994	NC_015944	GCAG	2	8	225458	225465	25 %	0 %	50 %	25 %	344210141
4995	NC_015944	AGG	2	6	225488	225493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210141
4996	NC_015944	CCGG	2	8	225507	225514	0 %	0 %	50 %	50 %	344210141
4997	NC_015944	CGA	3	9	225617	225625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210141
4998	NC_015944	TGA	2	6	225775	225780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210141
4999	NC_015944	TC	3	6	225802	225807	0 %	50 %	0 %	50 %	344210141
5000	NC_015944	GTCGGT	2	12	225813	225824	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344210141

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