MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015943	TTCC	2	8	168364	168371	0 %	50 %	0 %	50 %	344209668
3502	NC_015943	GTGA	2	8	168373	168380	25 %	25 %	50 %	0 %	344209668
3503	NC_015943	AC	3	6	168408	168413	50 %	0 %	0 %	50 %	344209668
3504	NC_015943	GAA	2	6	168427	168432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209668
3505	NC_015943	TAT	2	6	168453	168458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209668
3506	NC_015943	AGA	2	6	168474	168479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209668
3507	NC_015943	ATC	2	6	168486	168491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209668
3508	NC_015943	TAA	2	6	168510	168515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209668
3509	NC_015943	TC	3	6	168566	168571	0 %	50 %	0 %	50 %	344209668
3510	NC_015943	GA	3	6	168587	168592	50 %	0 %	50 %	0 %	344209668
3511	NC_015943	TGA	2	6	168597	168602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209668
3512	NC_015943	A	6	6	168631	168636	100 %	0 %	0 %	0 %	344209668
3513	NC_015943	CT	3	6	168669	168674	0 %	50 %	0 %	50 %	344209668
3514	NC_015943	AG	3	6	168678	168683	50 %	0 %	50 %	0 %	344209668
3515	NC_015943	GA	3	6	168684	168689	50 %	0 %	50 %	0 %	344209668
3516	NC_015943	G	6	6	168738	168743	0 %	0 %	100 %	0 %	344209668
3517	NC_015943	CAG	2	6	168913	168918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209669
3518	NC_015943	TC	3	6	168994	168999	0 %	50 %	0 %	50 %	344209669
3519	NC_015943	GAT	2	6	169107	169112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209669
3520	NC_015943	CCG	2	6	169140	169145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209669
3521	NC_015943	AGA	2	6	169147	169152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209669
3522	NC_015943	GTA	2	6	169248	169253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015943	CGC	2	6	169304	169309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_015943	GCTG	2	8	169355	169362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_015943	CGC	2	6	169440	169445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_015943	CGG	2	6	169522	169527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015943	CCG	2	6	169566	169571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_015943	GC	3	6	169576	169581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_015943	GAGCG	2	10	169591	169600	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3530	NC_015943	CGT	2	6	169604	169609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_015943	GAC	2	6	169642	169647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_015943	CG	3	6	169671	169676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_015943	ACCA	2	8	169689	169696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_015943	CA	5	10	169734	169743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_015943	CT	3	6	169756	169761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_015943	CCA	2	6	169770	169775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_015943	GC	3	6	169821	169826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_015943	CGC	3	9	169835	169843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_015943	GGC	3	9	169857	169865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_015943	C	6	6	169906	169911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3541	NC_015943	TTC	2	6	169962	169967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209670
3542	NC_015943	TCG	2	6	170025	170030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209670
3543	NC_015943	TGA	2	6	170049	170054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209670
3544	NC_015943	GGC	2	6	170057	170062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209670
3545	NC_015943	CG	3	6	170135	170140	0 %	0 %	50 %	50 %	344209670
3546	NC_015943	ACG	2	6	170191	170196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209670
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3548	NC_015943	CGAAC	2	10	170219	170228	40 %	0 %	20 %	40 %	344209670
3549	NC_015943	GCC	2	6	170231	170236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209670
3550	NC_015943	CGC	2	6	170263	170268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209670
3551	NC_015943	GAT	2	6	170273	170278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209670
3552	NC_015943	GTC	2	6	170327	170332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209670
3553	NC_015943	CGC	2	6	170389	170394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209670
3554	NC_015943	CATG	2	8	170395	170402	25 %	25 %	25 %	25 %	344209670
3555	NC_015943	TCG	2	6	170439	170444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209670
3556	NC_015943	GAT	2	6	170492	170497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209670
3557	NC_015943	GTTC	2	8	170572	170579	0 %	50 %	25 %	25 %	344209670
3558	NC_015943	CGG	2	6	170661	170666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209670
3559	NC_015943	CGC	3	9	170669	170677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209670
3560	NC_015943	CTG	2	6	170714	170719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209670
3561	NC_015943	TCCA	2	8	170745	170752	25 %	25 %	0 %	50 %	344209670
3562	NC_015943	TTC	2	6	170903	170908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209670
3563	NC_015943	CTG	2	6	170909	170914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209670
3564	NC_015943	CCT	3	9	170977	170985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209670
3565	NC_015943	TCG	2	6	171042	171047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209670
3566	NC_015943	TTGC	2	8	171126	171133	0 %	50 %	25 %	25 %	344209670
3567	NC_015943	GCG	2	6	171227	171232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015943	CTGCC	2	10	171238	171247	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3569	NC_015943	CGT	2	6	171259	171264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_015943	CGTA	2	8	171272	171279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_015943	ACT	2	6	171295	171300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_015943	GCG	2	6	171364	171369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_015943	AG	3	6	171389	171394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_015943	TA	3	6	171400	171405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3576	NC_015943	CGG	2	6	171429	171434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_015943	TGCGGT	2	12	171449	171460	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3578	NC_015943	CG	3	6	171473	171478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_015943	AGC	2	6	171526	171531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_015943	GCCG	2	8	171579	171586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_015943	CG	3	6	171585	171590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_015943	CG	4	8	171607	171614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_015943	CTG	2	6	171637	171642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015943	TGT	2	6	171643	171648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015943	CGC	2	6	171681	171686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_015943	TTG	2	6	171693	171698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_015943	GCT	2	6	171778	171783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3590	NC_015943	AGT	2	6	171821	171826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_015943	CAG	2	6	171856	171861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015943	CAG	2	6	171871	171876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015943	CCG	2	6	171888	171893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_015943	CAG	2	6	171952	171957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015943	CCT	2	6	171966	171971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_015943	CA	3	6	171978	171983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_015943	AC	3	6	171988	171993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_015943	CT	3	6	172006	172011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_015943	AGCG	2	8	172046	172053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_015943	GCC	2	6	172055	172060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_015943	GCG	2	6	172063	172068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_015943	CGG	2	6	172075	172080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_015943	CCAG	2	8	172093	172100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_015943	AC	4	8	172136	172143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_015943	TC	3	6	172147	172152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_015943	GCT	2	6	172181	172186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_015943	CAC	2	6	172226	172231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_015943	CAA	2	6	172244	172249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015943	GCG	2	6	172304	172309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_015943	CGA	2	6	172387	172392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_015943	AC	3	6	172454	172459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_015943	ATC	2	6	172521	172526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_015943	TCA	2	6	172568	172573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_015943	AGA	2	6	172601	172606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_015943	CGG	2	6	172641	172646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015943	CAT	2	6	172657	172662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_015943	TGA	2	6	172691	172696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_015943	TACT	2	8	172725	172732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_015943	TC	4	8	172744	172751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_015943	GTG	2	6	172756	172761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015943	AAAC	2	8	172762	172769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_015943	CG	3	6	172893	172898	0 %	0 %	50 %	50 %	344209671
3624	NC_015943	AGT	2	6	172904	172909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209671
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3626	NC_015943	TCCGG	2	10	172982	172991	0 %	20 %	40 %	40 %	344209671
3627	NC_015943	GAC	2	6	173024	173029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209671
3628	NC_015943	CCT	2	6	173083	173088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3840	NC_015943	AGTAG	2	10	183877	183886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3845	NC_015943	TA	4	8	184169	184176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3859	NC_015943	A	6	6	185239	185244	100 %	0 %	0 %	0 %	344209684
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3872	NC_015943	ACT	2	6	185584	185589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209684
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3875	NC_015943	TCG	2	6	185714	185719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209684
3876	NC_015943	GCT	2	6	185787	185792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209684
3877	NC_015943	TGA	2	6	185951	185956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209684
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