MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 3587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015717	ACCAC	2	10	1411	1420	40 %	0 %	0 %	60 %	338736864
2	NC_015717	TCCCC	2	10	2973	2982	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_015717	GGGGT	2	10	3000	3009	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015717	GGGGA	2	10	3393	3402	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015717	GCTCG	2	10	6783	6792	0 %	20 %	40 %	40 %	338736867
6	NC_015717	GCCGC	2	10	7098	7107	0 %	0 %	40 %	60 %	338736867
7	NC_015717	CGATG	2	10	7745	7754	20 %	20 %	40 %	20 %	338736868
8	NC_015717	GCGTT	2	10	8232	8241	0 %	40 %	40 %	20 %	338736868
9	NC_015717	CGGCG	2	10	8608	8617	0 %	0 %	60 %	40 %	338736868
10	NC_015717	AGGGG	2	10	9669	9678	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015717	GCATC	2	10	11875	11884	20 %	20 %	20 %	40 %	338736869
12	NC_015717	CGGCG	2	10	12663	12672	0 %	0 %	60 %	40 %	338736870
13	NC_015717	CGAAG	2	10	17777	17786	40 %	0 %	40 %	20 %	338736876
14	NC_015717	GGCGC	2	10	18480	18489	0 %	0 %	60 %	40 %	338736876
15	NC_015717	TCTGC	2	10	19186	19195	0 %	40 %	20 %	40 %	338736877
16	NC_015717	CGATA	2	10	19757	19766	40 %	20 %	20 %	20 %	338736878
17	NC_015717	ACGCG	2	10	21930	21939	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015717	CAGAA	2	10	21994	22003	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015717	TCGGC	2	10	24760	24769	0 %	20 %	40 %	40 %	338736885
20	NC_015717	TGCCC	2	10	27781	27790	0 %	20 %	20 %	60 %	338736888
21	NC_015717	GATCC	2	10	30332	30341	20 %	20 %	20 %	40 %	338736890
22	NC_015717	AAAGC	2	10	31848	31857	60 %	0 %	20 %	20 %	338736894
23	NC_015717	CCGCG	2	10	33036	33045	0 %	0 %	40 %	60 %	338736896
24	NC_015717	CGGGC	2	10	33746	33755	0 %	0 %	60 %	40 %	338736898
25	NC_015717	CGAGA	2	10	35354	35363	40 %	0 %	40 %	20 %	338736899
26	NC_015717	GACCG	2	10	35745	35754	20 %	0 %	40 %	40 %	338736900
27	NC_015717	GGCCG	2	10	36039	36048	0 %	0 %	60 %	40 %	338736900
28	NC_015717	GCGAT	2	10	38026	38035	20 %	20 %	40 %	20 %	338736903
29	NC_015717	AATTG	2	10	40722	40731	40 %	40 %	20 %	0 %	338736906
30	NC_015717	TGCGA	2	10	41386	41395	20 %	20 %	40 %	20 %	338736906
31	NC_015717	GACCG	2	10	41874	41883	20 %	0 %	40 %	40 %	338736906
32	NC_015717	TGAAT	2	10	41976	41985	40 %	40 %	20 %	0 %	338736906
33	NC_015717	AGGGC	2	10	44325	44334	20 %	0 %	60 %	20 %	338736908
34	NC_015717	GGGCA	2	10	45843	45852	20 %	0 %	60 %	20 %	338736909
35	NC_015717	GATCG	2	10	48776	48785	20 %	20 %	40 %	20 %	338736913
36	NC_015717	GCGGG	2	10	49778	49787	0 %	0 %	80 %	20 %	338736914
37	NC_015717	CGGCG	2	10	49881	49890	0 %	0 %	60 %	40 %	338736914
38	NC_015717	CCGTG	2	10	50411	50420	0 %	20 %	40 %	40 %	338736914
39	NC_015717	GGGGT	2	10	51686	51695	0 %	20 %	80 %	0 %	338736914
40	NC_015717	GACGA	2	10	53422	53431	40 %	0 %	40 %	20 %	338736915
41	NC_015717	TGGTC	2	10	56666	56675	0 %	40 %	40 %	20 %	338736915
42	NC_015717	CTCGC	2	10	57823	57832	0 %	20 %	20 %	60 %	338736916
43	NC_015717	CGGGG	2	10	58586	58595	0 %	0 %	80 %	20 %	338736917
44	NC_015717	TGGCG	2	10	58620	58629	0 %	20 %	60 %	20 %	338736917
45	NC_015717	CGGCG	2	10	58991	59000	0 %	0 %	60 %	40 %	338736917
46	NC_015717	CGGCA	2	10	59256	59265	20 %	0 %	40 %	40 %	338736917
47	NC_015717	CGCGG	2	10	60987	60996	0 %	0 %	60 %	40 %	338736918
48	NC_015717	CGTCG	2	10	61177	61186	0 %	20 %	40 %	40 %	338736918
49	NC_015717	CGCGG	2	10	61521	61530	0 %	0 %	60 %	40 %	338736918
50	NC_015717	TTTCA	2	10	62260	62269	20 %	60 %	0 %	20 %	338736918
51	NC_015717	TCAAC	2	10	63444	63453	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015717	ATTTT	2	10	63956	63965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015717	AGCGC	2	10	64555	64564	20 %	0 %	40 %	40 %	338736919
54	NC_015717	CGTTT	2	10	65132	65141	0 %	60 %	20 %	20 %	338736919
55	NC_015717	CGGTG	2	10	65914	65923	0 %	20 %	60 %	20 %	338736919
56	NC_015717	GCGCG	2	10	66655	66664	0 %	0 %	60 %	40 %	338736919
57	NC_015717	TGCGA	2	10	67156	67165	20 %	20 %	40 %	20 %	338736919
58	NC_015717	CGGAG	2	10	68162	68171	20 %	0 %	60 %	20 %	338736920
59	NC_015717	CGGGC	2	10	68243	68252	0 %	0 %	60 %	40 %	338736920
60	NC_015717	GGCGG	2	10	68836	68845	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015717	CGCGG	2	10	70841	70850	0 %	0 %	60 %	40 %	338736924
62	NC_015717	TCGCT	2	10	71215	71224	0 %	40 %	20 %	40 %	338736924
63	NC_015717	GTGTC	2	10	72691	72700	0 %	40 %	40 %	20 %	338736925
64	NC_015717	CGATG	2	10	74403	74412	20 %	20 %	40 %	20 %	338736926
65	NC_015717	TTTCG	2	10	74823	74832	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015717	GCGAG	2	10	75507	75516	20 %	0 %	60 %	20 %	338736928
67	NC_015717	GCGTG	2	10	76179	76188	0 %	20 %	60 %	20 %	338736929
68	NC_015717	GACGT	2	10	78473	78482	20 %	20 %	40 %	20 %	338736931
69	NC_015717	CTGCG	2	10	79172	79181	0 %	20 %	40 %	40 %	338736932
70	NC_015717	CACCC	2	10	83026	83035	20 %	0 %	0 %	80 %	338736937
71	NC_015717	TGGGA	2	10	83495	83504	20 %	20 %	60 %	0 %	338736937
72	NC_015717	CGCGG	2	10	83739	83748	0 %	0 %	60 %	40 %	338736937
73	NC_015717	GCTGC	2	10	84044	84053	0 %	20 %	40 %	40 %	338736938
74	NC_015717	GAGCT	2	10	84092	84101	20 %	20 %	40 %	20 %	338736938
75	NC_015717	ATTTC	2	10	85282	85291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015717	CAAGG	2	10	85829	85838	40 %	0 %	40 %	20 %	338736941
77	NC_015717	GGCGG	2	10	87357	87366	0 %	0 %	80 %	20 %	338736942
78	NC_015717	CGGTG	2	10	87495	87504	0 %	20 %	60 %	20 %	338736942
79	NC_015717	GGCTT	2	10	88053	88062	0 %	40 %	40 %	20 %	338736942
80	NC_015717	CCGTC	2	10	91475	91484	0 %	20 %	20 %	60 %	338736946
81	NC_015717	GCGGT	2	10	92606	92615	0 %	20 %	60 %	20 %	338736947
82	NC_015717	TTCAC	2	10	93011	93020	20 %	40 %	0 %	40 %	338736947
83	NC_015717	TCGCT	2	10	94293	94302	0 %	40 %	20 %	40 %	338736949
84	NC_015717	CGTGG	2	10	94794	94803	0 %	20 %	60 %	20 %	338736951
85	NC_015717	CGGGG	2	10	95262	95271	0 %	0 %	80 %	20 %	338736952
86	NC_015717	AGCCG	2	10	96473	96482	20 %	0 %	40 %	40 %	338736953
87	NC_015717	GGATG	2	10	97657	97666	20 %	20 %	60 %	0 %	338736954
88	NC_015717	AGCCA	2	10	97871	97880	40 %	0 %	20 %	40 %	338736954
89	NC_015717	GAGCG	2	10	100938	100947	20 %	0 %	60 %	20 %	338736958
90	NC_015717	ACCGA	2	10	101751	101760	40 %	0 %	20 %	40 %	338736958
91	NC_015717	CGGTG	2	10	103370	103379	0 %	20 %	60 %	20 %	338736960
92	NC_015717	AGCCT	2	10	103956	103965	20 %	20 %	20 %	40 %	338736961
93	NC_015717	GAGGC	2	10	105754	105763	20 %	0 %	60 %	20 %	338736964
94	NC_015717	CGAGG	2	10	105846	105855	20 %	0 %	60 %	20 %	338736964
95	NC_015717	TTCTT	2	10	107442	107451	0 %	80 %	0 %	20 %	338736965
96	NC_015717	TGGCG	2	10	107453	107462	0 %	20 %	60 %	20 %	338736965
97	NC_015717	GTCCG	2	10	108609	108618	0 %	20 %	40 %	40 %	338736966
98	NC_015717	GCCGA	2	10	108627	108636	20 %	0 %	40 %	40 %	338736966
99	NC_015717	TGCGC	2	10	108649	108658	0 %	20 %	40 %	40 %	338736966
100	NC_015717	ACGTC	2	10	109554	109563	20 %	20 %	20 %	40 %	338736967
101	NC_015717	TGGCG	2	10	110816	110825	0 %	20 %	60 %	20 %	338736968
102	NC_015717	GCCGG	2	10	113286	113295	0 %	0 %	60 %	40 %	338736972
103	NC_015717	TGCCG	2	10	114965	114974	0 %	20 %	40 %	40 %	338736973
104	NC_015717	TCGGA	2	10	115749	115758	20 %	20 %	40 %	20 %	338736974
105	NC_015717	CGGCA	2	10	120218	120227	20 %	0 %	40 %	40 %	338736976
106	NC_015717	CGCGC	2	10	122142	122151	0 %	0 %	40 %	60 %	338736978
107	NC_015717	CAAGG	2	10	123117	123126	40 %	0 %	40 %	20 %	338736979
108	NC_015717	GTCTT	2	10	125398	125407	0 %	60 %	20 %	20 %	338736983
109	NC_015717	CGGCG	2	10	125455	125464	0 %	0 %	60 %	40 %	338736983
110	NC_015717	TGTGC	2	10	125674	125683	0 %	40 %	40 %	20 %	338736984
111	NC_015717	GGCTT	2	10	126590	126599	0 %	40 %	40 %	20 %	338736984
112	NC_015717	ATTGA	2	10	126965	126974	40 %	40 %	20 %	0 %	338736985
113	NC_015717	TAGGC	2	10	128029	128038	20 %	20 %	40 %	20 %	338736986
114	NC_015717	GACGC	2	10	129633	129642	20 %	0 %	40 %	40 %	338736988
115	NC_015717	TTTTC	2	10	129720	129729	0 %	80 %	0 %	20 %	338736989
116	NC_015717	AGGAC	2	10	130807	130816	40 %	0 %	40 %	20 %	338736989
117	NC_015717	GGGAA	2	10	132995	133004	40 %	0 %	60 %	0 %	338736992
118	NC_015717	GTCAT	2	10	136085	136094	20 %	40 %	20 %	20 %	338736995
119	NC_015717	GCCCT	2	10	136259	136268	0 %	20 %	20 %	60 %	338736996
120	NC_015717	GTTCG	2	10	136648	136657	0 %	40 %	40 %	20 %	338736996
121	NC_015717	TCTGC	2	10	139409	139418	0 %	40 %	20 %	40 %	338736998
122	NC_015717	CGTGC	2	10	139779	139788	0 %	20 %	40 %	40 %	338736998
123	NC_015717	GCTGA	2	10	142723	142732	20 %	20 %	40 %	20 %	338737000
124	NC_015717	GACCA	2	10	145125	145134	40 %	0 %	20 %	40 %	338737002
125	NC_015717	CGCGC	2	10	147219	147228	0 %	0 %	40 %	60 %	338737004
126	NC_015717	GGCGC	2	10	148258	148267	0 %	0 %	60 %	40 %	338737004
127	NC_015717	TGCTT	2	10	148673	148682	0 %	60 %	20 %	20 %	338737005
128	NC_015717	CGCGG	2	10	150004	150013	0 %	0 %	60 %	40 %	338737006
129	NC_015717	GAGAG	2	10	151439	151448	40 %	0 %	60 %	0 %	338737007
130	NC_015717	GACGC	2	10	153789	153798	20 %	0 %	40 %	40 %	338737010
131	NC_015717	CGCTT	2	10	158540	158549	0 %	40 %	20 %	40 %	338737015
132	NC_015717	GAAAC	2	10	162210	162219	60 %	0 %	20 %	20 %	338737019
133	NC_015717	GCAAA	2	10	162270	162279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015717	GCGCC	2	10	162857	162866	0 %	0 %	40 %	60 %	338737020
135	NC_015717	ATCAC	2	10	164107	164116	40 %	20 %	0 %	40 %	338737021
136	NC_015717	TCGCA	2	10	165184	165193	20 %	20 %	20 %	40 %	338737022
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