MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter bizzozeronii CIII-1 plasmid phbz1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015670	CTTGT	2	10	69	78	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015670	AAAGC	2	10	320	329	60 %	0 %	20 %	20 %	336319057
3	NC_015670	ACACA	2	10	1544	1553	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015670	ACCCC	2	10	5340	5349	20 %	0 %	0 %	80 %	336319066
5	NC_015670	GCGAT	2	10	5452	5461	20 %	20 %	40 %	20 %	336319066
6	NC_015670	AGAAA	2	10	5966	5975	80 %	0 %	20 %	0 %	336319066
7	NC_015670	CAAAA	2	10	8416	8425	80 %	0 %	0 %	20 %	336319070
8	NC_015670	CAAAA	2	10	8453	8462	80 %	0 %	0 %	20 %	336319070
9	NC_015670	GCTTG	2	10	8563	8572	0 %	40 %	40 %	20 %	336319070
10	NC_015670	GATTG	2	10	8674	8683	20 %	40 %	40 %	0 %	336319070
11	NC_015670	GATCA	2	10	9199	9208	40 %	20 %	20 %	20 %	336319070
12	NC_015670	AGAGC	2	10	9549	9558	40 %	0 %	40 %	20 %	336319070
13	NC_015670	AAATC	2	10	12229	12238	60 %	20 %	0 %	20 %	336319075
14	NC_015670	CCTTG	2	10	12861	12870	0 %	40 %	20 %	40 %	336319076
15	NC_015670	CACTC	2	10	14062	14071	20 %	20 %	0 %	60 %	336319077
16	NC_015670	AAGCA	2	10	14935	14944	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015670	GTTTG	2	10	14977	14986	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015670	CTTGC	2	10	15065	15074	0 %	40 %	20 %	40 %	336319080
19	NC_015670	TTGTA	2	10	16355	16364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015670	ATAGA	2	10	16438	16447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015670	AAACT	2	10	23407	23416	60 %	20 %	0 %	20 %	336319089
22	NC_015670	CATGC	2	10	23768	23777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015670	ATCTT	2	10	25901	25910	20 %	60 %	0 %	20 %	336319091
24	NC_015670	CTTTT	2	10	28163	28172	0 %	80 %	0 %	20 %	336319093
25	NC_015670	TGGGT	2	10	28764	28773	0 %	40 %	60 %	0 %	336319094
26	NC_015670	CACCC	2	10	28828	28837	20 %	0 %	0 %	80 %	336319094
27	NC_015670	CTTTG	2	10	30853	30862	0 %	60 %	20 %	20 %	336319095
28	NC_015670	GAACA	2	10	31282	31291	60 %	0 %	20 %	20 %	336319097
29	NC_015670	GGCAA	2	10	33340	33349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015670	TTGTA	2	10	33552	33561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015670	TGTGG	2	10	33580	33589	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015670	GTATG	2	10	33604	33613	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015670	GGCGT	2	10	34873	34882	0 %	20 %	60 %	20 %	336319105
34	NC_015670	TCAAA	2	10	36137	36146	60 %	20 %	0 %	20 %	336319106
35	NC_015670	GGCAC	2	10	36918	36927	20 %	0 %	40 %	40 %	336319108
36	NC_015670	TGCTT	2	10	37094	37103	0 %	60 %	20 %	20 %	336319108
37	NC_015670	AAAAG	2	10	38074	38083	80 %	0 %	20 %	0 %	336319109
38	NC_015670	TTGGG	2	10	38380	38389	0 %	40 %	60 %	0 %	336319110
39	NC_015670	CAACG	2	10	38979	38988	40 %	0 %	20 %	40 %	336319110
40	NC_015670	CAAAT	2	10	39552	39561	60 %	20 %	0 %	20 %	336319111
41	NC_015670	GTGTA	2	10	41562	41571	20 %	40 %	40 %	0 %	336319114
42	NC_015670	AATGC	2	10	42470	42479	40 %	20 %	20 %	20 %	336319115
43	NC_015670	TATTG	2	10	42704	42713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015670	TATTT	2	10	42714	42723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015670	GTATT	2	10	42733	42742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015670	CTGTT	2	10	43221	43230	0 %	60 %	20 %	20 %	336319118
47	NC_015670	AAAAT	2	10	43635	43644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015670	TGCAA	2	10	44125	44134	40 %	20 %	20 %	20 %	336319120
49	NC_015670	CAAGC	2	10	44683	44692	40 %	0 %	20 %	40 %	336319121
50	NC_015670	GATCG	2	10	46859	46868	20 %	20 %	40 %	20 %	336319122
51	NC_015670	ACCAA	2	10	48289	48298	60 %	0 %	0 %	40 %	336319124
52	NC_015670	TTAAT	2	10	49158	49167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015670	TGGCA	2	10	50142	50151	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015670	CTTGT	2	10	51925	51934	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.