MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	CT	3	6	215	220	0 %	50 %	0 %	50 %	336251561
2	NC_015667	TC	3	6	1518	1523	0 %	50 %	0 %	50 %	336251563
3	NC_015667	CG	3	6	1907	1912	0 %	0 %	50 %	50 %	336251563
4	NC_015667	CT	3	6	2963	2968	0 %	50 %	0 %	50 %	336251564
5	NC_015667	TA	3	6	3194	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	336251564
6	NC_015667	AC	3	6	3718	3723	50 %	0 %	0 %	50 %	336251565
7	NC_015667	TC	3	6	3964	3969	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
8	NC_015667	GA	3	6	4002	4007	50 %	0 %	50 %	0 %	336251565
9	NC_015667	GC	3	6	4182	4187	0 %	0 %	50 %	50 %	336251565
10	NC_015667	TC	3	6	4229	4234	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
11	NC_015667	CT	3	6	4245	4250	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
12	NC_015667	TC	3	6	4740	4745	0 %	50 %	0 %	50 %	336251566
13	NC_015667	AT	3	6	4789	4794	50 %	50 %	0 %	0 %	336251566
14	NC_015667	CG	3	6	6545	6550	0 %	0 %	50 %	50 %	336251567
15	NC_015667	AC	3	6	9349	9354	50 %	0 %	0 %	50 %	336251568
16	NC_015667	GC	3	6	10314	10319	0 %	0 %	50 %	50 %	336251568
17	NC_015667	CT	3	6	10567	10572	0 %	50 %	0 %	50 %	336251568
18	NC_015667	GC	3	6	11281	11286	0 %	0 %	50 %	50 %	336251568
19	NC_015667	AG	3	6	11865	11870	50 %	0 %	50 %	0 %	336251569
20	NC_015667	AG	3	6	12488	12493	50 %	0 %	50 %	0 %	336251569
21	NC_015667	GT	3	6	13499	13504	0 %	50 %	50 %	0 %	336251570
22	NC_015667	CT	3	6	14452	14457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015667	GT	3	6	14527	14532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015667	GA	3	6	14970	14975	50 %	0 %	50 %	0 %	336251571
25	NC_015667	CG	3	6	16419	16424	0 %	0 %	50 %	50 %	336251573
26	NC_015667	CT	3	6	17756	17761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015667	GT	3	6	18073	18078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015667	GA	3	6	18275	18280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015667	TA	3	6	20114	20119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015667	GA	3	6	21163	21168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015667	AT	3	6	21643	21648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015667	AT	3	6	21923	21928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015667	CT	3	6	23457	23462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015667	TC	3	6	23573	23578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015667	GA	3	6	23902	23907	50 %	0 %	50 %	0 %	336251584
36	NC_015667	TG	3	6	24404	24409	0 %	50 %	50 %	0 %	336251584
37	NC_015667	GA	3	6	24503	24508	50 %	0 %	50 %	0 %	336251584
38	NC_015667	GC	3	6	25415	25420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015667	GC	3	6	25448	25453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015667	GC	3	6	25498	25503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015667	AC	3	6	25950	25955	50 %	0 %	0 %	50 %	336251585
42	NC_015667	AC	3	6	26046	26051	50 %	0 %	0 %	50 %	336251585
43	NC_015667	TC	3	6	26535	26540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015667	GC	3	6	26551	26556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015667	AG	3	6	26844	26849	50 %	0 %	50 %	0 %	336251586
46	NC_015667	AG	3	6	27817	27822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015667	GC	4	8	28032	28039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015667	AG	3	6	28244	28249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015667	AG	3	6	28258	28263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015667	CG	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
51	NC_015667	GC	3	6	29142	29147	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
52	NC_015667	GC	3	6	29151	29156	0 %	0 %	50 %	50 %	336251587
53	NC_015667	CG	3	6	34000	34005	0 %	0 %	50 %	50 %	336251591
54	NC_015667	GA	3	6	34798	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	336251592
55	NC_015667	GA	3	6	35533	35538	50 %	0 %	50 %	0 %	336251592
56	NC_015667	CG	3	6	35990	35995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015667	TG	3	6	36128	36133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015667	TC	3	6	37033	37038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015667	CA	3	6	37647	37652	50 %	0 %	0 %	50 %	336251594
60	NC_015667	AG	3	6	38041	38046	50 %	0 %	50 %	0 %	336251595
61	NC_015667	AG	3	6	38280	38285	50 %	0 %	50 %	0 %	336251595
62	NC_015667	GA	3	6	38673	38678	50 %	0 %	50 %	0 %	336251595
63	NC_015667	AC	3	6	39004	39009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015667	CG	3	6	40120	40125	0 %	0 %	50 %	50 %	336251598
65	NC_015667	CA	3	6	40154	40159	50 %	0 %	0 %	50 %	336251598
66	NC_015667	GA	3	6	41049	41054	50 %	0 %	50 %	0 %	336251599
67	NC_015667	AT	4	8	41702	41709	50 %	50 %	0 %	0 %	336251600
68	NC_015667	AT	3	6	42232	42237	50 %	50 %	0 %	0 %	336251601
69	NC_015667	CA	3	6	42262	42267	50 %	0 %	0 %	50 %	336251601
70	NC_015667	CT	3	6	42832	42837	0 %	50 %	0 %	50 %	336251602
71	NC_015667	TC	3	6	43388	43393	0 %	50 %	0 %	50 %	336251602
72	NC_015667	AG	3	6	43715	43720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015667	GA	3	6	44032	44037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015667	CG	3	6	46189	46194	0 %	0 %	50 %	50 %	336251604
75	NC_015667	TC	3	6	46240	46245	0 %	50 %	0 %	50 %	336251604
76	NC_015667	CT	3	6	46319	46324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015667	CG	3	6	47034	47039	0 %	0 %	50 %	50 %	336251605
78	NC_015667	AC	3	6	48307	48312	50 %	0 %	0 %	50 %	336251606
79	NC_015667	GC	3	6	48433	48438	0 %	0 %	50 %	50 %	336251606
80	NC_015667	GC	3	6	48485	48490	0 %	0 %	50 %	50 %	336251606
81	NC_015667	CA	3	6	48916	48921	50 %	0 %	0 %	50 %	336251606
82	NC_015667	TC	3	6	49124	49129	0 %	50 %	0 %	50 %	336251607
83	NC_015667	GC	3	6	49467	49472	0 %	0 %	50 %	50 %	336251607
84	NC_015667	AT	3	6	49680	49685	50 %	50 %	0 %	0 %	336251607
85	NC_015667	AG	3	6	49692	49697	50 %	0 %	50 %	0 %	336251607
86	NC_015667	CT	3	6	49897	49902	0 %	50 %	0 %	50 %	336251607
87	NC_015667	TG	4	8	49974	49981	0 %	50 %	50 %	0 %	336251607
88	NC_015667	GC	3	6	50492	50497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015667	AG	3	6	51077	51082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015667	GA	3	6	51281	51286	50 %	0 %	50 %	0 %	336251609
91	NC_015667	AC	3	6	51993	51998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015667	GA	3	6	52690	52695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015667	AC	3	6	54928	54933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015667	GT	3	6	55285	55290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015667	AG	3	6	55363	55368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015667	CG	3	6	55472	55477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015667	TC	3	6	55697	55702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015667	CG	3	6	55748	55753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015667	CG	3	6	55761	55766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015667	TC	3	6	55774	55779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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104	NC_015667	GA	3	6	57271	57276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015667	CT	3	6	57381	57386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015667	CT	3	6	57497	57502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015667	GA	3	6	57555	57560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015667	GA	3	6	58792	58797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015667	GC	3	6	58810	58815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015667	AC	4	8	59183	59190	50 %	0 %	0 %	50 %	336251614
111	NC_015667	GA	3	6	60726	60731	50 %	0 %	50 %	0 %	336251617
112	NC_015667	AC	3	6	62296	62301	50 %	0 %	0 %	50 %	336251620
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114	NC_015667	CG	3	6	63189	63194	0 %	0 %	50 %	50 %	336251620
115	NC_015667	GA	3	6	63325	63330	50 %	0 %	50 %	0 %	336251620
116	NC_015667	GC	3	6	64633	64638	0 %	0 %	50 %	50 %	336251622
117	NC_015667	GC	3	6	65484	65489	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
118	NC_015667	CG	3	6	65722	65727	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
119	NC_015667	CG	3	6	65733	65738	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
120	NC_015667	GC	3	6	68083	68088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015667	AG	3	6	68242	68247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_015667	GA	3	6	73418	73423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015667	GA	3	6	74878	74883	50 %	0 %	50 %	0 %	336251633
126	NC_015667	AC	3	6	75139	75144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015667	CT	3	6	75260	75265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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129	NC_015667	TG	3	6	76725	76730	0 %	50 %	50 %	0 %	336251635
130	NC_015667	CT	3	6	77034	77039	0 %	50 %	0 %	50 %	336251635
131	NC_015667	CT	3	6	77122	77127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015667	AG	3	6	77310	77315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015667	AG	3	6	77370	77375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015667	CT	3	6	77900	77905	0 %	50 %	0 %	50 %	336251636
135	NC_015667	CG	3	6	78727	78732	0 %	0 %	50 %	50 %	336251637
136	NC_015667	CT	3	6	79477	79482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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140	NC_015667	TA	3	6	80841	80846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015667	AC	3	6	80868	80873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015667	AG	3	6	81463	81468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_015667	GC	3	6	82563	82568	0 %	0 %	50 %	50 %	336251640
147	NC_015667	TG	3	6	82912	82917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015667	GC	3	6	83144	83149	0 %	0 %	50 %	50 %	336251641
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295	NC_015667	CG	3	6	175780	175785	0 %	0 %	50 %	50 %	336251741
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304	NC_015667	TC	3	6	181410	181415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
305	NC_015667	GT	3	6	181678	181683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.