MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 458

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	A	6	6	12694	12699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015666	C	6	6	17614	17619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_015666	C	6	6	18439	18444	0 %	0 %	0 %	100 %	336252113
4	NC_015666	G	6	6	25590	25595	0 %	0 %	100 %	0 %	336252118
5	NC_015666	C	6	6	30810	30815	0 %	0 %	0 %	100 %	336252122
6	NC_015666	C	6	6	35834	35839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_015666	A	6	6	48356	48361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015666	A	6	6	66898	66903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015666	C	6	6	77396	77401	0 %	0 %	0 %	100 %	336252176
10	NC_015666	G	6	6	87457	87462	0 %	0 %	100 %	0 %	336252184
11	NC_015666	G	6	6	92628	92633	0 %	0 %	100 %	0 %	336252188
12	NC_015666	C	6	6	107475	107480	0 %	0 %	0 %	100 %	336252208
13	NC_015666	T	6	6	110527	110532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015666	G	6	6	135330	135335	0 %	0 %	100 %	0 %	336252237
15	NC_015666	C	6	6	145902	145907	0 %	0 %	0 %	100 %	336252250
16	NC_015666	G	6	6	146731	146736	0 %	0 %	100 %	0 %	336252251
17	NC_015666	G	6	6	165911	165916	0 %	0 %	100 %	0 %	336252270
18	NC_015666	A	6	6	180493	180498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015666	A	6	6	211741	211746	100 %	0 %	0 %	0 %	336252317
20	NC_015666	C	6	6	215282	215287	0 %	0 %	0 %	100 %	336252321
21	NC_015666	C	6	6	221155	221160	0 %	0 %	0 %	100 %	336252326
22	NC_015666	C	6	6	234419	234424	0 %	0 %	0 %	100 %	336252336
23	NC_015666	T	6	6	238125	238130	0 %	100 %	0 %	0 %	336252340
24	NC_015666	C	6	6	244192	244197	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_015666	C	7	7	246800	246806	0 %	0 %	0 %	100 %	336252346
26	NC_015666	G	6	6	257115	257120	0 %	0 %	100 %	0 %	336252351
27	NC_015666	G	6	6	257243	257248	0 %	0 %	100 %	0 %	336252352
28	NC_015666	G	6	6	265705	265710	0 %	0 %	100 %	0 %	336252357
29	NC_015666	G	6	6	288656	288661	0 %	0 %	100 %	0 %	336252383
30	NC_015666	C	6	6	294367	294372	0 %	0 %	0 %	100 %	336252387
31	NC_015666	A	6	6	298626	298631	100 %	0 %	0 %	0 %	336252389
32	NC_015666	C	6	6	311610	311615	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_015666	G	6	6	311634	311639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015666	C	6	6	311926	311931	0 %	0 %	0 %	100 %	336252401
35	NC_015666	G	6	6	312674	312679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015666	T	6	6	330858	330863	0 %	100 %	0 %	0 %	336252417
37	NC_015666	T	6	6	332826	332831	0 %	100 %	0 %	0 %	336252418
38	NC_015666	G	6	6	345249	345254	0 %	0 %	100 %	0 %	336252441
39	NC_015666	T	6	6	352272	352277	0 %	100 %	0 %	0 %	336252450
40	NC_015666	G	6	6	363393	363398	0 %	0 %	100 %	0 %	336252462
41	NC_015666	C	6	6	374182	374187	0 %	0 %	0 %	100 %	336252473
42	NC_015666	T	6	6	377029	377034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015666	T	6	6	377143	377148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015666	A	6	6	380410	380415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015666	T	6	6	383378	383383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015666	A	6	6	383517	383522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015666	G	6	6	385897	385902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015666	G	6	6	385986	385991	0 %	0 %	100 %	0 %	336252482
49	NC_015666	T	6	6	387055	387060	0 %	100 %	0 %	0 %	336252483
50	NC_015666	G	6	6	388808	388813	0 %	0 %	100 %	0 %	336252485
51	NC_015666	C	6	6	405016	405021	0 %	0 %	0 %	100 %	336252501
52	NC_015666	G	6	6	409208	409213	0 %	0 %	100 %	0 %	336252505
53	NC_015666	G	6	6	424805	424810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015666	G	6	6	442742	442747	0 %	0 %	100 %	0 %	336252533
55	NC_015666	A	6	6	445935	445940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015666	T	6	6	449001	449006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015666	G	6	6	461738	461743	0 %	0 %	100 %	0 %	336252551
58	NC_015666	A	6	6	490484	490489	100 %	0 %	0 %	0 %	336252575
59	NC_015666	G	6	6	494587	494592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015666	T	6	6	528178	528183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015666	C	6	6	534587	534592	0 %	0 %	0 %	100 %	336252618
62	NC_015666	A	6	6	548920	548925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015666	A	6	6	549470	549475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015666	A	6	6	550874	550879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015666	A	6	6	554683	554688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015666	C	6	6	558222	558227	0 %	0 %	0 %	100 %	336252640
67	NC_015666	G	6	6	559305	559310	0 %	0 %	100 %	0 %	336252641
68	NC_015666	C	6	6	561469	561474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_015666	C	6	6	565320	565325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_015666	G	7	7	571224	571230	0 %	0 %	100 %	0 %	336252653
71	NC_015666	C	6	6	583799	583804	0 %	0 %	0 %	100 %	336252666
72	NC_015666	A	6	6	584301	584306	100 %	0 %	0 %	0 %	336252667
73	NC_015666	G	6	6	593538	593543	0 %	0 %	100 %	0 %	336252675
74	NC_015666	C	6	6	601034	601039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_015666	G	6	6	602376	602381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015666	C	6	6	605474	605479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_015666	T	6	6	606003	606008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015666	G	6	6	607696	607701	0 %	0 %	100 %	0 %	336252690
79	NC_015666	A	6	6	620515	620520	100 %	0 %	0 %	0 %	336252707
80	NC_015666	C	6	6	634747	634752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_015666	G	6	6	636926	636931	0 %	0 %	100 %	0 %	336252725
82	NC_015666	T	6	6	642680	642685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015666	T	6	6	643346	643351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015666	A	6	6	644894	644899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015666	T	6	6	651839	651844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015666	G	6	6	688880	688885	0 %	0 %	100 %	0 %	336252786
87	NC_015666	G	6	6	694851	694856	0 %	0 %	100 %	0 %	336252792
88	NC_015666	G	6	6	704470	704475	0 %	0 %	100 %	0 %	336252797
89	NC_015666	C	6	6	708443	708448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_015666	G	6	6	716980	716985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015666	G	6	6	730242	730247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015666	A	6	6	755594	755599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015666	G	6	6	755997	756002	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015666	T	7	7	758237	758243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015666	A	6	6	762128	762133	100 %	0 %	0 %	0 %	336252858
96	NC_015666	T	6	6	764267	764272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015666	C	6	6	778225	778230	0 %	0 %	0 %	100 %	336252875
98	NC_015666	G	6	6	780121	780126	0 %	0 %	100 %	0 %	336252876
99	NC_015666	A	6	6	783002	783007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015666	C	6	6	787878	787883	0 %	0 %	0 %	100 %	336252885
101	NC_015666	C	6	6	788231	788236	0 %	0 %	0 %	100 %	336252885
102	NC_015666	C	6	6	794726	794731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_015666	G	6	6	794874	794879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015666	G	6	6	805030	805035	0 %	0 %	100 %	0 %	336252900
105	NC_015666	G	6	6	811783	811788	0 %	0 %	100 %	0 %	336252904
106	NC_015666	C	6	6	818163	818168	0 %	0 %	0 %	100 %	336252913
107	NC_015666	C	6	6	825379	825384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_015666	G	6	6	863529	863534	0 %	0 %	100 %	0 %	336252958
109	NC_015666	C	6	6	867869	867874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_015666	G	6	6	871146	871151	0 %	0 %	100 %	0 %	336252966
111	NC_015666	C	6	6	872463	872468	0 %	0 %	0 %	100 %	336252968
112	NC_015666	G	6	6	891731	891736	0 %	0 %	100 %	0 %	336252986
113	NC_015666	G	6	6	926885	926890	0 %	0 %	100 %	0 %	336253016
114	NC_015666	T	6	6	940130	940135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015666	C	6	6	945408	945413	0 %	0 %	0 %	100 %	336253033
116	NC_015666	C	6	6	945622	945627	0 %	0 %	0 %	100 %	336253033
117	NC_015666	G	6	6	947326	947331	0 %	0 %	100 %	0 %	336253035
118	NC_015666	C	6	6	947336	947341	0 %	0 %	0 %	100 %	336253035
119	NC_015666	G	6	6	953784	953789	0 %	0 %	100 %	0 %	336253043
120	NC_015666	T	6	6	961778	961783	0 %	100 %	0 %	0 %	336253051
121	NC_015666	G	6	6	971228	971233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015666	C	6	6	973814	973819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_015666	C	6	6	974217	974222	0 %	0 %	0 %	100 %	336253060
124	NC_015666	C	6	6	978918	978923	0 %	0 %	0 %	100 %	336253065
125	NC_015666	G	6	6	980361	980366	0 %	0 %	100 %	0 %	336253066
126	NC_015666	C	6	6	981129	981134	0 %	0 %	0 %	100 %	336253067
127	NC_015666	T	6	6	1000251	1000256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015666	C	7	7	1004967	1004973	0 %	0 %	0 %	100 %	336253093
129	NC_015666	A	6	6	1008483	1008488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015666	C	6	6	1020678	1020683	0 %	0 %	0 %	100 %	336253109
131	NC_015666	G	6	6	1025555	1025560	0 %	0 %	100 %	0 %	336253112
132	NC_015666	C	6	6	1032221	1032226	0 %	0 %	0 %	100 %	336253120
133	NC_015666	C	6	6	1052878	1052883	0 %	0 %	0 %	100 %	336253139
134	NC_015666	C	6	6	1053174	1053179	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_015666	G	6	6	1054293	1054298	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015666	T	6	6	1059284	1059289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015666	G	6	6	1060882	1060887	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015666	T	6	6	1090498	1090503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015666	C	6	6	1092736	1092741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_015666	A	6	6	1093978	1093983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015666	G	6	6	1096554	1096559	0 %	0 %	100 %	0 %	336253183
142	NC_015666	G	6	6	1097888	1097893	0 %	0 %	100 %	0 %	336253183
143	NC_015666	T	6	6	1104132	1104137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.