MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	CGAT	2	8	438	445	25 %	25 %	25 %	25 %	336251751
2	NC_015658	GCCG	2	8	447	454	0 %	0 %	50 %	50 %	336251751
3	NC_015658	GATC	2	8	498	505	25 %	25 %	25 %	25 %	336251751
4	NC_015658	AAGC	2	8	885	892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015658	GACG	2	8	978	985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015658	CTCG	2	8	1368	1375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015658	TGGG	2	8	1473	1480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015658	GTGC	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015658	TACT	2	8	3512	3519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015658	GTTC	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015658	ACTC	2	8	4681	4688	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015658	GTCT	2	8	4810	4817	0 %	50 %	25 %	25 %	336251754
13	NC_015658	GAAA	2	8	5061	5068	75 %	0 %	25 %	0 %	336251754
14	NC_015658	ATCT	2	8	5501	5508	25 %	50 %	0 %	25 %	336251754
15	NC_015658	TTTA	2	8	5528	5535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015658	GCGT	2	8	5767	5774	0 %	25 %	50 %	25 %	336251755
17	NC_015658	TCCG	2	8	6814	6821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015658	AATC	2	8	7556	7563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015658	AGTG	2	8	7604	7611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015658	CGGC	2	8	8095	8102	0 %	0 %	50 %	50 %	336251757
21	NC_015658	GATA	2	8	9449	9456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015658	CGGT	3	12	9672	9683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015658	CTCG	3	12	10192	10203	0 %	25 %	25 %	50 %	336251758
24	NC_015658	GACG	2	8	10411	10418	25 %	0 %	50 %	25 %	336251758
25	NC_015658	CGGC	2	8	10888	10895	0 %	0 %	50 %	50 %	336251758
26	NC_015658	GCTC	2	8	10970	10977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015658	CGGC	2	8	12927	12934	0 %	0 %	50 %	50 %	336251760
28	NC_015658	CGGT	2	8	13187	13194	0 %	25 %	50 %	25 %	336251760
29	NC_015658	CGAT	2	8	13289	13296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015658	ATCG	2	8	13344	13351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015658	ACCG	2	8	14059	14066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015658	ACTA	2	8	14155	14162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015658	CGAT	2	8	14634	14641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015658	CCGT	2	8	14735	14742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015658	TTCT	2	8	14853	14860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015658	GGGT	2	8	15066	15073	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015658	CTGT	2	8	15122	15129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015658	CGAT	2	8	15246	15253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015658	GAAC	2	8	15286	15293	50 %	0 %	25 %	25 %	336251761
40	NC_015658	GGAT	2	8	15350	15357	25 %	25 %	50 %	0 %	336251761
41	NC_015658	AATA	2	8	16377	16384	75 %	25 %	0 %	0 %	336251762
42	NC_015658	CCGA	2	8	16585	16592	25 %	0 %	25 %	50 %	336251762
43	NC_015658	CGAT	2	8	17412	17419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015658	GACC	2	8	17476	17483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015658	GATA	2	8	18388	18395	50 %	25 %	25 %	0 %	336251764
46	NC_015658	GCGT	2	8	18835	18842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015658	TCGA	2	8	18869	18876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015658	CCGA	2	8	19132	19139	25 %	0 %	25 %	50 %	336251765
49	NC_015658	GCCG	2	8	19151	19158	0 %	0 %	50 %	50 %	336251765
50	NC_015658	CCGG	2	8	19382	19389	0 %	0 %	50 %	50 %	336251765
51	NC_015658	GCTC	2	8	19457	19464	0 %	25 %	25 %	50 %	336251765
52	NC_015658	GAGC	2	8	19622	19629	25 %	0 %	50 %	25 %	336251765
53	NC_015658	GCTC	2	8	20624	20631	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
54	NC_015658	CCTG	2	8	20706	20713	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
55	NC_015658	TCCG	2	8	20767	20774	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
56	NC_015658	CTCG	2	8	20907	20914	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
57	NC_015658	TCGA	2	8	20957	20964	25 %	25 %	25 %	25 %	336251766
58	NC_015658	TCGA	2	8	21289	21296	25 %	25 %	25 %	25 %	336251766
59	NC_015658	GCCG	2	8	21397	21404	0 %	0 %	50 %	50 %	336251766
60	NC_015658	CGAA	2	8	21815	21822	50 %	0 %	25 %	25 %	336251766
61	NC_015658	TAAA	2	8	22054	22061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015658	GGAC	2	8	22097	22104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015658	CGAA	2	8	22110	22117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015658	CGCC	2	8	22232	22239	0 %	0 %	25 %	75 %	336251767
65	NC_015658	GCGA	2	8	22333	22340	25 %	0 %	50 %	25 %	336251767
66	NC_015658	TCGG	2	8	23199	23206	0 %	25 %	50 %	25 %	336251769
67	NC_015658	GTTC	2	8	23964	23971	0 %	50 %	25 %	25 %	336251770
68	NC_015658	CCCG	2	8	24208	24215	0 %	0 %	25 %	75 %	336251770
69	NC_015658	GAGC	2	8	24784	24791	25 %	0 %	50 %	25 %	336251770
70	NC_015658	GTTC	2	8	24835	24842	0 %	50 %	25 %	25 %	336251770
71	NC_015658	TCGA	2	8	24954	24961	25 %	25 %	25 %	25 %	336251770
72	NC_015658	CGGA	2	8	25185	25192	25 %	0 %	50 %	25 %	336251770
73	NC_015658	TGAG	2	8	25272	25279	25 %	25 %	50 %	0 %	336251770
74	NC_015658	CAGT	2	8	25661	25668	25 %	25 %	25 %	25 %	336251771
75	NC_015658	ACTG	2	8	25682	25689	25 %	25 %	25 %	25 %	336251771
76	NC_015658	TCGA	2	8	25698	25705	25 %	25 %	25 %	25 %	336251771
77	NC_015658	AAGG	2	8	25728	25735	50 %	0 %	50 %	0 %	336251771
78	NC_015658	TCCA	2	8	25779	25786	25 %	25 %	0 %	50 %	336251771
79	NC_015658	CGTA	2	8	26520	26527	25 %	25 %	25 %	25 %	336251772
80	NC_015658	GTCG	2	8	26635	26642	0 %	25 %	50 %	25 %	336251772
81	NC_015658	CAGC	2	8	26861	26868	25 %	0 %	25 %	50 %	336251773
82	NC_015658	GAGC	2	8	26887	26894	25 %	0 %	50 %	25 %	336251773
83	NC_015658	TTCG	2	8	27160	27167	0 %	50 %	25 %	25 %	336251773
84	NC_015658	CGAA	2	8	27208	27215	50 %	0 %	25 %	25 %	336251773
85	NC_015658	ACGC	2	8	27622	27629	25 %	0 %	25 %	50 %	336251773
86	NC_015658	TAAC	2	8	27816	27823	50 %	25 %	0 %	25 %	336251773
87	NC_015658	CGCA	2	8	27915	27922	25 %	0 %	25 %	50 %	336251773
88	NC_015658	TCGG	2	8	28620	28627	0 %	25 %	50 %	25 %	336251774
89	NC_015658	ACGT	2	8	28915	28922	25 %	25 %	25 %	25 %	336251774
90	NC_015658	CAGA	2	8	29304	29311	50 %	0 %	25 %	25 %	336251775
91	NC_015658	TCGA	2	8	29472	29479	25 %	25 %	25 %	25 %	336251775
92	NC_015658	TGCT	2	8	29831	29838	0 %	50 %	25 %	25 %	336251775
93	NC_015658	GACC	2	8	29901	29908	25 %	0 %	25 %	50 %	336251775
94	NC_015658	CAAA	2	8	30209	30216	75 %	0 %	0 %	25 %	336251775
95	NC_015658	CTCA	2	8	30558	30565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015658	AATT	2	8	30767	30774	50 %	50 %	0 %	0 %	336251776
97	NC_015658	AAAC	2	8	31842	31849	75 %	0 %	0 %	25 %	336251776
98	NC_015658	ATCT	2	8	31870	31877	25 %	50 %	0 %	25 %	336251776
99	NC_015658	CGAA	2	8	32109	32116	50 %	0 %	25 %	25 %	336251777
100	NC_015658	ATTC	2	8	32267	32274	25 %	50 %	0 %	25 %	336251777
101	NC_015658	CGAA	2	8	32612	32619	50 %	0 %	25 %	25 %	336251777
102	NC_015658	GGTC	2	8	33036	33043	0 %	25 %	50 %	25 %	336251777
103	NC_015658	GAAC	2	8	33380	33387	50 %	0 %	25 %	25 %	336251777
104	NC_015658	ATTT	2	8	34494	34501	25 %	75 %	0 %	0 %	336251778
105	NC_015658	TTCT	2	8	34723	34730	0 %	75 %	0 %	25 %	336251778
106	NC_015658	CGAT	2	8	34970	34977	25 %	25 %	25 %	25 %	336251778
107	NC_015658	ATCC	2	8	35124	35131	25 %	25 %	0 %	50 %	336251778
108	NC_015658	ACGA	3	12	35270	35281	50 %	0 %	25 %	25 %	336251778
109	NC_015658	ACCG	2	8	35481	35488	25 %	0 %	25 %	50 %	336251779
110	NC_015658	ATTT	2	8	35498	35505	25 %	75 %	0 %	0 %	336251779
111	NC_015658	ATCG	2	8	36869	36876	25 %	25 %	25 %	25 %	336251780
112	NC_015658	CGTC	2	8	37249	37256	0 %	25 %	25 %	50 %	336251780
113	NC_015658	TTCC	2	8	37604	37611	0 %	50 %	0 %	50 %	336251780
114	NC_015658	GTTC	2	8	37829	37836	0 %	50 %	25 %	25 %	336251780
115	NC_015658	TTCG	2	8	38265	38272	0 %	50 %	25 %	25 %	336251781
116	NC_015658	CTCC	2	8	38298	38305	0 %	25 %	0 %	75 %	336251781
117	NC_015658	GACG	2	8	38539	38546	25 %	0 %	50 %	25 %	336251781
118	NC_015658	CCGA	2	8	38770	38777	25 %	0 %	25 %	50 %	336251781
119	NC_015658	GAAC	2	8	38928	38935	50 %	0 %	25 %	25 %	336251781
120	NC_015658	CGAC	2	8	39149	39156	25 %	0 %	25 %	50 %	336251781
121	NC_015658	CGTC	2	8	39686	39693	0 %	25 %	25 %	50 %	336251782
122	NC_015658	ACGA	2	8	39807	39814	50 %	0 %	25 %	25 %	336251782
123	NC_015658	CGTG	2	8	39824	39831	0 %	25 %	50 %	25 %	336251782
124	NC_015658	CGTG	2	8	40142	40149	0 %	25 %	50 %	25 %	336251782
125	NC_015658	AGAA	2	8	40168	40175	75 %	0 %	25 %	0 %	336251782
126	NC_015658	CGTT	2	8	40216	40223	0 %	50 %	25 %	25 %	336251782
127	NC_015658	CGAC	2	8	41397	41404	25 %	0 %	25 %	50 %	336251783
128	NC_015658	ACGT	2	8	42521	42528	25 %	25 %	25 %	25 %	336251784
129	NC_015658	CCCG	2	8	42838	42845	0 %	0 %	25 %	75 %	336251784
130	NC_015658	AAGA	2	8	43026	43033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015658	TCCA	2	8	43054	43061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015658	CTTT	2	8	43064	43071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015658	CGTT	2	8	43136	43143	0 %	50 %	25 %	25 %	336251785
134	NC_015658	CGGT	2	8	43418	43425	0 %	25 %	50 %	25 %	336251785
135	NC_015658	GTCG	2	8	43537	43544	0 %	25 %	50 %	25 %	336251785
136	NC_015658	CTTT	2	8	44267	44274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015658	TACG	2	8	44559	44566	25 %	25 %	25 %	25 %	336251786
138	NC_015658	CCGT	2	8	44707	44714	0 %	25 %	25 %	50 %	336251786
139	NC_015658	TCGA	2	8	44876	44883	25 %	25 %	25 %	25 %	336251786
140	NC_015658	GACG	2	8	45147	45154	25 %	0 %	50 %	25 %	336251786
141	NC_015658	CGGT	2	8	45210	45217	0 %	25 %	50 %	25 %	336251786
142	NC_015658	GATG	2	8	45615	45622	25 %	25 %	50 %	0 %	336251786
143	NC_015658	CGTC	2	8	45852	45859	0 %	25 %	25 %	50 %	336251787
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