MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 10748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015658	TCG	2	6	64850	64855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251801
1502	NC_015658	AGC	2	6	64864	64869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251801
1503	NC_015658	TCT	2	6	64879	64884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251801
1504	NC_015658	GTC	2	6	64909	64914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251801
1505	NC_015658	GC	3	6	64931	64936	0 %	0 %	50 %	50 %	336251801
1506	NC_015658	CTC	2	6	64998	65003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251801
1507	NC_015658	GAT	2	6	65109	65114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251801
1508	NC_015658	CTC	2	6	65115	65120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251801
1509	NC_015658	CGT	2	6	65216	65221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251801
1510	NC_015658	CTC	2	6	65259	65264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251801
1511	NC_015658	GAG	2	6	65268	65273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251801
1512	NC_015658	CCGG	2	8	65315	65322	0 %	0 %	50 %	50 %	336251801
1513	NC_015658	CCG	2	6	65340	65345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251801
1514	NC_015658	CGT	2	6	65394	65399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251801
1515	NC_015658	CCT	2	6	65402	65407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251801
1516	NC_015658	CTC	4	12	65418	65429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251801
1517	NC_015658	GAT	2	6	65526	65531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251801
1518	NC_015658	CGT	2	6	65538	65543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251801
1519	NC_015658	AT	3	6	65637	65642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015658	AGG	2	6	65707	65712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015658	AGGT	2	8	65720	65727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015658	TA	3	6	65773	65778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015658	CGGA	2	8	65807	65814	25 %	0 %	50 %	25 %	336251802
1524	NC_015658	CGG	2	6	65839	65844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1525	NC_015658	CGA	2	6	65857	65862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1526	NC_015658	CGT	3	9	65912	65920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1527	NC_015658	CG	3	6	65924	65929	0 %	0 %	50 %	50 %	336251802
1528	NC_015658	GAC	2	6	65937	65942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1529	NC_015658	GAG	2	6	65946	65951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251802
1530	NC_015658	CGA	2	6	65966	65971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1531	NC_015658	CGG	2	6	66001	66006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1532	NC_015658	TC	3	6	66008	66013	0 %	50 %	0 %	50 %	336251802
1533	NC_015658	TCG	2	6	66037	66042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1534	NC_015658	TCGA	2	8	66048	66055	25 %	25 %	25 %	25 %	336251802
1535	NC_015658	CAA	2	6	66083	66088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251802
1536	NC_015658	CGC	2	6	66089	66094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251802
1537	NC_015658	GAG	3	9	66105	66113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251802
1538	NC_015658	CCTC	2	8	66127	66134	0 %	25 %	0 %	75 %	336251802
1539	NC_015658	GGC	2	6	66146	66151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1540	NC_015658	CG	3	6	66168	66173	0 %	0 %	50 %	50 %	336251802
1541	NC_015658	CGG	2	6	66264	66269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1542	NC_015658	CGGG	2	8	66271	66278	0 %	0 %	75 %	25 %	336251802
1543	NC_015658	CGG	2	6	66304	66309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1544	NC_015658	AGG	2	6	66349	66354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251802
1545	NC_015658	CGC	2	6	66425	66430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251802
1546	NC_015658	CCG	2	6	66448	66453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251802
1547	NC_015658	GAG	2	6	66465	66470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251802
1548	NC_015658	CGA	2	6	66476	66481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1549	NC_015658	CGC	2	6	66548	66553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251802
1550	NC_015658	CGT	2	6	66560	66565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1551	NC_015658	GCG	3	9	66586	66594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1552	NC_015658	CGC	2	6	66620	66625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_015658	CTC	2	6	66642	66647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_015658	CAC	2	6	66678	66683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251803
1555	NC_015658	GAT	3	9	66764	66772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251803
1556	NC_015658	CGGCC	2	10	66814	66823	0 %	0 %	40 %	60 %	336251803
1557	NC_015658	CGA	2	6	66835	66840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1558	NC_015658	GCG	3	9	66846	66854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251803
1559	NC_015658	CG	3	6	66863	66868	0 %	0 %	50 %	50 %	336251803
1560	NC_015658	TCC	2	6	66879	66884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251803
1561	NC_015658	CGT	3	9	66964	66972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1562	NC_015658	GTC	3	9	67064	67072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1563	NC_015658	ACG	2	6	67077	67082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1564	NC_015658	GCC	4	12	67085	67096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251803
1565	NC_015658	CGT	2	6	67099	67104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1566	NC_015658	GGC	2	6	67115	67120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251803
1567	NC_015658	TCG	2	6	67128	67133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1568	NC_015658	CG	3	6	67175	67180	0 %	0 %	50 %	50 %	336251803
1569	NC_015658	GAG	2	6	67187	67192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251803
1570	NC_015658	TCC	2	6	67284	67289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251803
1571	NC_015658	GCT	2	6	67306	67311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1572	NC_015658	GGTCGG	2	12	67435	67446	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336251803
1573	NC_015658	CCG	2	6	67447	67452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251803
1574	NC_015658	CCGCG	2	10	67454	67463	0 %	0 %	40 %	60 %	336251803
1575	NC_015658	ACG	2	6	67467	67472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1576	NC_015658	TGG	2	6	67479	67484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251803
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1579	NC_015658	GGA	2	6	67566	67571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251803
1580	NC_015658	TCG	2	6	67608	67613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1581	NC_015658	CGA	2	6	67627	67632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1582	NC_015658	CCG	2	6	67659	67664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251803
1583	NC_015658	TCT	2	6	67681	67686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251803
1584	NC_015658	TCG	2	6	67704	67709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251803
1585	NC_015658	GCC	2	6	67739	67744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251803
1586	NC_015658	GAT	2	6	67751	67756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251803
1587	NC_015658	GTGAC	2	10	67869	67878	20 %	20 %	40 %	20 %	336251804
1588	NC_015658	TCG	2	6	67884	67889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1589	NC_015658	CAT	2	6	67898	67903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251804
1590	NC_015658	CGG	2	6	67928	67933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251804
1591	NC_015658	GTA	2	6	67973	67978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251804
1592	NC_015658	CGC	2	6	67994	67999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251804
1593	NC_015658	GGCC	2	8	68015	68022	0 %	0 %	50 %	50 %	336251804
1594	NC_015658	GAC	2	6	68069	68074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1595	NC_015658	CGT	2	6	68098	68103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1596	NC_015658	CG	3	6	68114	68119	0 %	0 %	50 %	50 %	336251804
1597	NC_015658	GCC	2	6	68132	68137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251804
1598	NC_015658	GGA	2	6	68188	68193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251804
1599	NC_015658	CCG	2	6	68244	68249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251804
1600	NC_015658	TCG	2	6	68286	68291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1601	NC_015658	GC	3	6	68293	68298	0 %	0 %	50 %	50 %	336251804
1602	NC_015658	TCG	2	6	68364	68369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1603	NC_015658	TCGA	2	8	68391	68398	25 %	25 %	25 %	25 %	336251804
1604	NC_015658	GCC	2	6	68435	68440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251804
1605	NC_015658	GCC	2	6	68522	68527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251804
1606	NC_015658	TCG	2	6	68532	68537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1607	NC_015658	CAG	2	6	68585	68590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1608	NC_015658	CGT	2	6	68605	68610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1609	NC_015658	TTC	2	6	68724	68729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251804
1610	NC_015658	CGA	2	6	68731	68736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1611	NC_015658	CCG	2	6	68781	68786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251804
1612	NC_015658	TCG	2	6	68808	68813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
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1614	NC_015658	TCG	2	6	68886	68891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1615	NC_015658	TCG	2	6	68944	68949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251804
1616	NC_015658	GAAC	2	8	69039	69046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_015658	CGTT	2	8	69067	69074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_015658	CGG	2	6	69100	69105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015658	GAC	2	6	69108	69113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015658	GCT	2	6	69122	69127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015658	CGTCT	2	10	69152	69161	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1622	NC_015658	CGC	2	6	69169	69174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_015658	GTT	2	6	69234	69239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015658	CGC	2	6	69327	69332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1998	NC_015658	CGA	2	6	83334	83339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251814
1999	NC_015658	CGA	2	6	83369	83374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251814
2000	NC_015658	CCG	2	6	83414	83419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251814

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