MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 10748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015658	GAC	2	6	178609	178614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_015658	GAC	2	6	178704	178709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_015658	ACG	2	6	178868	178873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4504	NC_015658	CGC	2	6	178909	178914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251895
4505	NC_015658	ATGG	2	8	178917	178924	25 %	25 %	50 %	0 %	336251895
4506	NC_015658	CGT	3	9	178938	178946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4507	NC_015658	GACG	2	8	178956	178963	25 %	0 %	50 %	25 %	336251895
4508	NC_015658	CGGCGT	2	12	178974	178985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336251895
4509	NC_015658	GCG	2	6	179000	179005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251895
4510	NC_015658	CGT	2	6	179016	179021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4511	NC_015658	GAG	2	6	179023	179028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251895
4512	NC_015658	CCCA	2	8	179059	179066	25 %	0 %	0 %	75 %	336251895
4513	NC_015658	CG	3	6	179095	179100	0 %	0 %	50 %	50 %	336251895
4514	NC_015658	TCGG	2	8	179111	179118	0 %	25 %	50 %	25 %	336251895
4515	NC_015658	CGG	2	6	179211	179216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251895
4516	NC_015658	CGA	2	6	179226	179231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4517	NC_015658	GAG	2	6	179305	179310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251895
4518	NC_015658	TCC	2	6	179336	179341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251895
4519	NC_015658	GGCC	2	8	179352	179359	0 %	0 %	50 %	50 %	336251895
4520	NC_015658	GAA	2	6	179370	179375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251895
4521	NC_015658	GAG	2	6	179380	179385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251895
4522	NC_015658	CGA	2	6	179415	179420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4523	NC_015658	GGTC	2	8	179453	179460	0 %	25 %	50 %	25 %	336251895
4524	NC_015658	AGA	2	6	179471	179476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251895
4525	NC_015658	CGA	2	6	179532	179537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4526	NC_015658	GCCGAT	2	12	179571	179582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4527	NC_015658	CGG	2	6	179586	179591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251895
4528	NC_015658	GTCG	2	8	179665	179672	0 %	25 %	50 %	25 %	336251895
4529	NC_015658	CGG	2	6	179676	179681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251895
4530	NC_015658	GAT	2	6	179691	179696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251895
4531	NC_015658	ACG	2	6	179723	179728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4532	NC_015658	GAG	2	6	179830	179835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251895
4533	NC_015658	CAG	2	6	179836	179841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4534	NC_015658	GAG	2	6	179842	179847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251895
4535	NC_015658	CGA	2	6	179919	179924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251895
4536	NC_015658	CGA	2	6	179991	179996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4537	NC_015658	GC	3	6	180032	180037	0 %	0 %	50 %	50 %	336251896
4538	NC_015658	CGA	3	9	180048	180056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4539	NC_015658	GACTG	2	10	180089	180098	20 %	20 %	40 %	20 %	336251896
4540	NC_015658	GAC	2	6	180102	180107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4541	NC_015658	AGG	2	6	180110	180115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251896
4542	NC_015658	CGC	2	6	180147	180152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251896
4543	NC_015658	ACC	2	6	180164	180169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251896
4544	NC_015658	GCT	2	6	180210	180215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4545	NC_015658	CGA	2	6	180237	180242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4546	NC_015658	GCTC	2	8	180254	180261	0 %	25 %	25 %	50 %	336251896
4547	NC_015658	GCC	2	6	180335	180340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251896
4548	NC_015658	ACG	2	6	180380	180385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4549	NC_015658	CGA	2	6	180432	180437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4550	NC_015658	TGA	2	6	180449	180454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251896
4551	NC_015658	GCGA	2	8	180466	180473	25 %	0 %	50 %	25 %	336251896
4552	NC_015658	CCG	2	6	180559	180564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251896
4553	NC_015658	CGG	2	6	180573	180578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251896
4554	NC_015658	TCG	2	6	180605	180610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4555	NC_015658	CGA	2	6	180720	180725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4556	NC_015658	CGA	2	6	180765	180770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4557	NC_015658	TGA	2	6	180797	180802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251896
4558	NC_015658	TTC	2	6	180871	180876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251896
4559	NC_015658	GAG	2	6	180892	180897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251896
4560	NC_015658	CGA	2	6	180996	181001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251896
4561	NC_015658	GCTTCG	2	12	181029	181040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_015658	CGCT	2	8	181076	181083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_015658	ATCG	2	8	181089	181096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_015658	GAG	2	6	181166	181171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015658	AT	3	6	181341	181346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015658	GTCG	2	8	181347	181354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_015658	CCG	2	6	181454	181459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_015658	GAA	2	6	181460	181465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015658	GATT	2	8	181474	181481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015658	TCCG	2	8	181486	181493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_015658	CGAG	2	8	181581	181588	25 %	0 %	50 %	25 %	336251897
4572	NC_015658	CGG	2	6	181655	181660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4573	NC_015658	TCG	2	6	181686	181691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4574	NC_015658	GAC	3	9	181718	181726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4575	NC_015658	CG	3	6	181727	181732	0 %	0 %	50 %	50 %	336251897
4576	NC_015658	CGG	2	6	181759	181764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4577	NC_015658	GACG	2	8	181783	181790	25 %	0 %	50 %	25 %	336251897
4578	NC_015658	CGG	2	6	181800	181805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4579	NC_015658	TCG	2	6	181818	181823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4580	NC_015658	GGC	2	6	181825	181830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4581	NC_015658	CGG	2	6	181840	181845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4582	NC_015658	AAC	2	6	181862	181867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251897
4583	NC_015658	GCT	2	6	181891	181896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4584	NC_015658	GGC	2	6	181966	181971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4585	NC_015658	CGC	2	6	181972	181977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251897
4586	NC_015658	ATC	2	6	182009	182014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251897
4587	NC_015658	CGC	2	6	182056	182061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251897
4588	NC_015658	GCG	2	6	182078	182083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4589	NC_015658	ATG	2	6	182087	182092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251897
4590	NC_015658	ACG	2	6	182187	182192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4591	NC_015658	ACCG	2	8	182201	182208	25 %	0 %	25 %	50 %	336251897
4592	NC_015658	CGG	2	6	182240	182245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4593	NC_015658	CTACCT	2	12	182272	182283	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336251897
4594	NC_015658	CGA	2	6	182290	182295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4595	NC_015658	CGT	2	6	182298	182303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251897
4596	NC_015658	CGG	2	6	182332	182337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251897
4597	NC_015658	CGA	2	6	182442	182447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4598	NC_015658	CGT	2	6	182456	182461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4599	NC_015658	CGGCG	2	10	182511	182520	0 %	0 %	60 %	40 %	336251898
4600	NC_015658	GAG	2	6	182551	182556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251898
4601	NC_015658	TGG	2	6	182557	182562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251898
4602	NC_015658	GCG	2	6	182577	182582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251898
4603	NC_015658	CG	3	6	182581	182586	0 %	0 %	50 %	50 %	336251898
4604	NC_015658	CGA	2	6	182646	182651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4605	NC_015658	CGG	2	6	182652	182657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251898
4606	NC_015658	TCGA	2	8	182692	182699	25 %	25 %	25 %	25 %	336251898
4607	NC_015658	ACA	2	6	182708	182713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251898
4608	NC_015658	CCA	2	6	182736	182741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251898
4609	NC_015658	ACC	2	6	182753	182758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251898
4610	NC_015658	ACGA	2	8	182824	182831	50 %	0 %	25 %	25 %	336251898
4611	NC_015658	GAC	2	6	182917	182922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4612	NC_015658	AGG	2	6	182954	182959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251898
4613	NC_015658	CCGTCA	2	12	182960	182971	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336251898
4614	NC_015658	CCG	2	6	182972	182977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251898
4615	NC_015658	CGT	2	6	182993	182998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4616	NC_015658	GAG	2	6	183025	183030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251898
4617	NC_015658	TAC	2	6	183070	183075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251898
4618	NC_015658	GCT	2	6	183078	183083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4619	NC_015658	CGA	2	6	183129	183134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251898
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4621	NC_015658	CGA	2	6	183162	183167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4622	NC_015658	CGA	2	6	183186	183191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251898
4623	NC_015658	GGC	2	6	183199	183204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251898
4624	NC_015658	TCG	3	9	183218	183226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251898
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4629	NC_015658	CGA	2	6	183538	183543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251899
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4649	NC_015658	TACCG	2	10	184370	184379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4651	NC_015658	TCG	2	6	184390	184395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4682	NC_015658	CGGCT	2	10	185649	185658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4699	NC_015658	CGA	2	6	186220	186225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251901
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4734	NC_015658	CGC	2	6	187555	187560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251901
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4740	NC_015658	TAAT	2	8	187925	187932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4741	NC_015658	TAA	2	6	187977	187982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_015658	CGG	2	6	188001	188006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251902
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4842	NC_015658	CGGC	2	8	192166	192173	0 %	0 %	50 %	50 %	336251903
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4844	NC_015658	TCCG	2	8	192309	192316	0 %	25 %	25 %	50 %	336251903
4845	NC_015658	GACC	2	8	192324	192331	25 %	0 %	25 %	50 %	336251903
4846	NC_015658	GATC	2	8	192398	192405	25 %	25 %	25 %	25 %	336251903
4847	NC_015658	GTC	2	6	192406	192411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251903
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4849	NC_015658	CGC	2	6	192474	192479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4850	NC_015658	CGT	2	6	192539	192544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4851	NC_015658	CTG	2	6	192582	192587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4852	NC_015658	GTG	2	6	192594	192599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4853	NC_015658	TTTG	2	8	192600	192607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4854	NC_015658	AACA	2	8	192613	192620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4855	NC_015658	A	6	6	192632	192637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4856	NC_015658	GA	3	6	192679	192684	50 %	0 %	50 %	0 %	336251904
4857	NC_015658	CGT	2	6	192744	192749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251904
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4859	NC_015658	CGT	2	6	192779	192784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251904
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4861	NC_015658	CGA	2	6	192867	192872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251904
4862	NC_015658	GGAT	2	8	192880	192887	25 %	25 %	50 %	0 %	336251904
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4864	NC_015658	CCG	2	6	192995	193000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251904
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4998	NC_015658	GCC	2	6	197998	198003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4999	NC_015658	TCG	2	6	198112	198117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251907
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