MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	GC	3	6	2161	2166	0 %	0 %	50 %	50 %	332668454
2	NC_015513	AG	3	6	2707	2712	50 %	0 %	50 %	0 %	332668454
3	NC_015513	CG	3	6	3145	3150	0 %	0 %	50 %	50 %	332668454
4	NC_015513	CA	3	6	8306	8311	50 %	0 %	0 %	50 %	332668458
5	NC_015513	TC	3	6	9530	9535	0 %	50 %	0 %	50 %	332668459
6	NC_015513	TC	3	6	9549	9554	0 %	50 %	0 %	50 %	332668459
7	NC_015513	TG	3	6	10239	10244	0 %	50 %	50 %	0 %	332668460
8	NC_015513	TG	3	6	12009	12014	0 %	50 %	50 %	0 %	332668461
9	NC_015513	GC	3	6	12542	12547	0 %	0 %	50 %	50 %	332668461
10	NC_015513	TG	3	6	16360	16365	0 %	50 %	50 %	0 %	332668462
11	NC_015513	CG	3	6	16485	16490	0 %	0 %	50 %	50 %	332668462
12	NC_015513	AG	3	6	17164	17169	50 %	0 %	50 %	0 %	332668463
13	NC_015513	GA	3	6	18085	18090	50 %	0 %	50 %	0 %	332668464
14	NC_015513	AG	3	6	22397	22402	50 %	0 %	50 %	0 %	332668466
15	NC_015513	TC	3	6	22474	22479	0 %	50 %	0 %	50 %	332668466
16	NC_015513	TG	3	6	22851	22856	0 %	50 %	50 %	0 %	332668466
17	NC_015513	GC	4	8	24095	24102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015513	AT	3	6	24145	24150	50 %	50 %	0 %	0 %	332668467
19	NC_015513	GT	3	6	25361	25366	0 %	50 %	50 %	0 %	332668467
20	NC_015513	AC	3	6	26607	26612	50 %	0 %	0 %	50 %	332668467
21	NC_015513	AT	3	6	27076	27081	50 %	50 %	0 %	0 %	332668468
22	NC_015513	GT	3	6	29128	29133	0 %	50 %	50 %	0 %	332668469
23	NC_015513	CT	4	8	29713	29720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015513	TC	3	6	33259	33264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015513	TC	3	6	33516	33521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015513	GC	3	6	35288	35293	0 %	0 %	50 %	50 %	332668474
27	NC_015513	CG	3	6	37868	37873	0 %	0 %	50 %	50 %	332668475
28	NC_015513	AC	3	6	40022	40027	50 %	0 %	0 %	50 %	332668477
29	NC_015513	GC	3	6	43286	43291	0 %	0 %	50 %	50 %	332668479
30	NC_015513	AC	3	6	47331	47336	50 %	0 %	0 %	50 %	332668482
31	NC_015513	GC	3	6	50038	50043	0 %	0 %	50 %	50 %	332668483
32	NC_015513	AG	3	6	50045	50050	50 %	0 %	50 %	0 %	332668483
33	NC_015513	TC	3	6	51050	51055	0 %	50 %	0 %	50 %	332668484
34	NC_015513	TG	3	6	51365	51370	0 %	50 %	50 %	0 %	332668485
35	NC_015513	TG	3	6	54916	54921	0 %	50 %	50 %	0 %	332668489
36	NC_015513	AT	3	6	56299	56304	50 %	50 %	0 %	0 %	332668491
37	NC_015513	TG	3	6	56829	56834	0 %	50 %	50 %	0 %	332668491
38	NC_015513	CT	3	6	59455	59460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015513	GA	3	6	60999	61004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015513	CG	3	6	63016	63021	0 %	0 %	50 %	50 %	332668494
41	NC_015513	TG	3	6	63216	63221	0 %	50 %	50 %	0 %	332668494
42	NC_015513	AC	3	6	64945	64950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015513	AG	3	6	66016	66021	50 %	0 %	50 %	0 %	332668495
44	NC_015513	AC	3	6	69848	69853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015513	CA	3	6	71167	71172	50 %	0 %	0 %	50 %	332668501
46	NC_015513	TG	3	6	72826	72831	0 %	50 %	50 %	0 %	332668502
47	NC_015513	AG	4	8	74804	74811	50 %	0 %	50 %	0 %	332668505
48	NC_015513	TC	3	6	75378	75383	0 %	50 %	0 %	50 %	332668506
49	NC_015513	TA	3	6	77674	77679	50 %	50 %	0 %	0 %	332668510
50	NC_015513	TG	3	6	80172	80177	0 %	50 %	50 %	0 %	332668512
51	NC_015513	TA	3	6	82344	82349	50 %	50 %	0 %	0 %	332668514
52	NC_015513	GC	3	6	84878	84883	0 %	0 %	50 %	50 %	332668517
53	NC_015513	CA	3	6	85942	85947	50 %	0 %	0 %	50 %	332668518
54	NC_015513	CA	3	6	85966	85971	50 %	0 %	0 %	50 %	332668518
55	NC_015513	GT	3	6	87965	87970	0 %	50 %	50 %	0 %	332668520
56	NC_015513	AC	3	6	89658	89663	50 %	0 %	0 %	50 %	332668521
57	NC_015513	TC	3	6	91295	91300	0 %	50 %	0 %	50 %	332668522
58	NC_015513	CA	3	6	91801	91806	50 %	0 %	0 %	50 %	332668523

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.