MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	GTTGA	2	10	3194	3203	20 %	40 %	40 %	0 %	332668454
2	NC_015513	CGTTG	2	10	4562	4571	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015513	GCGCA	2	10	4748	4757	20 %	0 %	40 %	40 %	332668455
4	NC_015513	AGCCC	2	10	5509	5518	20 %	0 %	20 %	60 %	332668456
5	NC_015513	CATGA	2	10	7455	7464	40 %	20 %	20 %	20 %	332668457
6	NC_015513	TTTGA	2	10	9361	9370	20 %	60 %	20 %	0 %	332668459
7	NC_015513	GTTTT	2	10	9615	9624	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015513	TAAGA	2	10	9896	9905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015513	CAAAA	2	10	13819	13828	80 %	0 %	0 %	20 %	332668462
10	NC_015513	TCGGG	2	10	14668	14677	0 %	20 %	60 %	20 %	332668462
11	NC_015513	CAATC	2	10	17783	17792	40 %	20 %	0 %	40 %	332668464
12	NC_015513	ACTGC	2	10	19906	19915	20 %	20 %	20 %	40 %	332668465
13	NC_015513	TATTT	2	10	20155	20164	20 %	80 %	0 %	0 %	332668465
14	NC_015513	GAAAT	2	10	23803	23812	60 %	20 %	20 %	0 %	332668466
15	NC_015513	AAGTG	2	10	24020	24029	40 %	20 %	40 %	0 %	332668466
16	NC_015513	TTTGC	2	10	26236	26245	0 %	60 %	20 %	20 %	332668467
17	NC_015513	GATTT	2	10	26630	26639	20 %	60 %	20 %	0 %	332668467
18	NC_015513	TGAAA	2	10	27066	27075	60 %	20 %	20 %	0 %	332668468
19	NC_015513	GGGTA	2	10	27738	27747	20 %	20 %	60 %	0 %	332668468
20	NC_015513	CTGAA	2	10	30776	30785	40 %	20 %	20 %	20 %	332668470
21	NC_015513	TGGCC	2	10	32229	32238	0 %	20 %	40 %	40 %	332668472
22	NC_015513	AAATC	2	10	32900	32909	60 %	20 %	0 %	20 %	332668472
23	NC_015513	TGGAA	2	10	34428	34437	40 %	20 %	40 %	0 %	332668473
24	NC_015513	TTGCT	2	10	35061	35070	0 %	60 %	20 %	20 %	332668474
25	NC_015513	GACGA	2	10	35952	35961	40 %	0 %	40 %	20 %	332668474
26	NC_015513	TCATG	2	10	37874	37883	20 %	40 %	20 %	20 %	332668475
27	NC_015513	TGATT	2	10	40755	40764	20 %	60 %	20 %	0 %	332668477
28	NC_015513	TTGTT	2	10	42127	42136	0 %	80 %	20 %	0 %	332668479
29	NC_015513	AAACC	2	10	42557	42566	60 %	0 %	0 %	40 %	332668479
30	NC_015513	GCGCC	2	10	43115	43124	0 %	0 %	40 %	60 %	332668479
31	NC_015513	CCTTA	2	10	44123	44132	20 %	40 %	0 %	40 %	332668479
32	NC_015513	GGGCT	2	10	45006	45015	0 %	20 %	60 %	20 %	332668480
33	NC_015513	CGTTG	2	10	47916	47925	0 %	40 %	40 %	20 %	332668482
34	NC_015513	CCTCT	2	10	48619	48628	0 %	40 %	0 %	60 %	332668483
35	NC_015513	AACCC	2	10	50893	50902	40 %	0 %	0 %	60 %	332668484
36	NC_015513	TCAAC	2	10	53114	53123	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015513	GCGAT	2	10	53672	53681	20 %	20 %	40 %	20 %	332668488
38	NC_015513	TTGCC	2	10	56500	56509	0 %	40 %	20 %	40 %	332668491
39	NC_015513	TTGGT	2	10	56935	56944	0 %	60 %	40 %	0 %	332668491
40	NC_015513	TTCAG	2	10	58687	58696	20 %	40 %	20 %	20 %	332668492
41	NC_015513	GAAAA	2	10	59483	59492	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015513	GACTT	2	10	59913	59922	20 %	40 %	20 %	20 %	332668493
43	NC_015513	AAATT	2	10	60458	60467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015513	ATGTA	2	10	61005	61014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015513	TAAAA	2	10	61381	61390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015513	TCAAC	2	10	62099	62108	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015513	TTCCA	2	10	62251	62260	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015513	TTACA	2	10	62408	62417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015513	GTTTG	2	10	68520	68529	0 %	60 %	40 %	0 %	332668496
50	NC_015513	CTTCC	2	10	70033	70042	0 %	40 %	0 %	60 %	332668499
51	NC_015513	CAGTG	2	10	70092	70101	20 %	20 %	40 %	20 %	332668499
52	NC_015513	ATAGC	2	10	71879	71888	40 %	20 %	20 %	20 %	332668501
53	NC_015513	AGAAA	2	10	72662	72671	80 %	0 %	20 %	0 %	332668502
54	NC_015513	AAAAC	2	10	73434	73443	80 %	0 %	0 %	20 %	332668503
55	NC_015513	TTGAA	2	10	73608	73617	40 %	40 %	20 %	0 %	332668503
56	NC_015513	AATCA	2	10	75049	75058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015513	TTTGG	2	10	75086	75095	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015513	TGGCT	2	10	75968	75977	0 %	40 %	40 %	20 %	332668506
59	NC_015513	AAAAC	2	10	76363	76372	80 %	0 %	0 %	20 %	332668507
60	NC_015513	AAAGA	2	10	78811	78820	80 %	0 %	20 %	0 %	332668511
61	NC_015513	CTTAT	2	10	80785	80794	20 %	60 %	0 %	20 %	332668514
62	NC_015513	GTAAG	2	10	82479	82488	40 %	20 %	40 %	0 %	332668514
63	NC_015513	ATCCA	2	10	84243	84252	40 %	20 %	0 %	40 %	332668516
64	NC_015513	CGATT	2	10	85321	85330	20 %	40 %	20 %	20 %	332668518
65	NC_015513	TAGGG	2	10	86090	86099	20 %	20 %	60 %	0 %	332668518
66	NC_015513	AAAAT	2	10	86660	86669	80 %	20 %	0 %	0 %	332668519
67	NC_015513	TGGCG	2	10	88690	88699	0 %	20 %	60 %	20 %	332668521

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.