MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	TTGG	2	8	941	948	0 %	50 %	50 %	0 %	332668453
2	NC_015513	CTGC	2	8	1054	1061	0 %	25 %	25 %	50 %	332668453
3	NC_015513	AAAC	2	8	1102	1109	75 %	0 %	0 %	25 %	332668453
4	NC_015513	CACC	2	8	2185	2192	25 %	0 %	0 %	75 %	332668454
5	NC_015513	TGGG	2	8	4080	4087	0 %	25 %	75 %	0 %	332668454
6	NC_015513	AAAC	2	8	4456	4463	75 %	0 %	0 %	25 %	332668454
7	NC_015513	TTGT	2	8	5138	5145	0 %	75 %	25 %	0 %	332668455
8	NC_015513	GGCT	2	8	5172	5179	0 %	25 %	50 %	25 %	332668455
9	NC_015513	TCCA	2	8	5201	5208	25 %	25 %	0 %	50 %	332668455
10	NC_015513	ATGG	2	8	5255	5262	25 %	25 %	50 %	0 %	332668455
11	NC_015513	TCAA	2	8	5676	5683	50 %	25 %	0 %	25 %	332668456
12	NC_015513	TGGT	2	8	6146	6153	0 %	50 %	50 %	0 %	332668456
13	NC_015513	AAAC	2	8	6329	6336	75 %	0 %	0 %	25 %	332668456
14	NC_015513	ACTG	2	8	6693	6700	25 %	25 %	25 %	25 %	332668457
15	NC_015513	ATTT	2	8	6835	6842	25 %	75 %	0 %	0 %	332668457
16	NC_015513	TGGA	2	8	7018	7025	25 %	25 %	50 %	0 %	332668457
17	NC_015513	CAAC	2	8	7580	7587	50 %	0 %	0 %	50 %	332668458
18	NC_015513	CGTT	2	8	7762	7769	0 %	50 %	25 %	25 %	332668458
19	NC_015513	GCAA	2	8	8002	8009	50 %	0 %	25 %	25 %	332668458
20	NC_015513	CGGG	2	8	8817	8824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015513	TCGG	2	8	9273	9280	0 %	25 %	50 %	25 %	332668459
22	NC_015513	GCAA	2	8	9498	9505	50 %	0 %	25 %	25 %	332668459
23	NC_015513	CAGC	2	8	9800	9807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015513	TCCA	2	8	10096	10103	25 %	25 %	0 %	50 %	332668460
25	NC_015513	TTTA	2	8	10590	10597	25 %	75 %	0 %	0 %	332668460
26	NC_015513	TGAG	2	8	10951	10958	25 %	25 %	50 %	0 %	332668460
27	NC_015513	ATCA	2	8	10997	11004	50 %	25 %	0 %	25 %	332668460
28	NC_015513	GAAC	2	8	11380	11387	50 %	0 %	25 %	25 %	332668460
29	NC_015513	ATTT	2	8	11765	11772	25 %	75 %	0 %	0 %	332668461
30	NC_015513	CAGC	2	8	12079	12086	25 %	0 %	25 %	50 %	332668461
31	NC_015513	CCTG	2	8	12148	12155	0 %	25 %	25 %	50 %	332668461
32	NC_015513	ACCC	2	8	12294	12301	25 %	0 %	0 %	75 %	332668461
33	NC_015513	CCGA	2	8	12617	12624	25 %	0 %	25 %	50 %	332668461
34	NC_015513	TGGC	2	8	12816	12823	0 %	25 %	50 %	25 %	332668461
35	NC_015513	CGAT	2	8	13844	13851	25 %	25 %	25 %	25 %	332668462
36	NC_015513	CAAA	2	8	13904	13911	75 %	0 %	0 %	25 %	332668462
37	NC_015513	GTTC	2	8	13972	13979	0 %	50 %	25 %	25 %	332668462
38	NC_015513	AGGA	2	8	14285	14292	50 %	0 %	50 %	0 %	332668462
39	NC_015513	GGCT	2	8	15091	15098	0 %	25 %	50 %	25 %	332668462
40	NC_015513	GCCA	2	8	15150	15157	25 %	0 %	25 %	50 %	332668462
41	NC_015513	GATG	2	8	15411	15418	25 %	25 %	50 %	0 %	332668462
42	NC_015513	TCCC	2	8	15930	15937	0 %	25 %	0 %	75 %	332668462
43	NC_015513	TGGC	2	8	15955	15962	0 %	25 %	50 %	25 %	332668462
44	NC_015513	GTTT	2	8	16559	16566	0 %	75 %	25 %	0 %	332668462
45	NC_015513	CAAG	2	8	16763	16770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015513	AGGA	2	8	16844	16851	50 %	0 %	50 %	0 %	332668463
47	NC_015513	CCAT	2	8	16980	16987	25 %	25 %	0 %	50 %	332668463
48	NC_015513	TTGT	2	8	16991	16998	0 %	75 %	25 %	0 %	332668463
49	NC_015513	CTAT	2	8	17050	17057	25 %	50 %	0 %	25 %	332668463
50	NC_015513	ACAA	2	8	17199	17206	75 %	0 %	0 %	25 %	332668463
51	NC_015513	ATGA	2	8	17312	17319	50 %	25 %	25 %	0 %	332668463
52	NC_015513	TCCA	2	8	17893	17900	25 %	25 %	0 %	50 %	332668464
53	NC_015513	TCTG	2	8	18097	18104	0 %	50 %	25 %	25 %	332668464
54	NC_015513	ATGT	2	8	18652	18659	25 %	50 %	25 %	0 %	332668464
55	NC_015513	GTTT	2	8	19604	19611	0 %	75 %	25 %	0 %	332668465
56	NC_015513	ATTC	2	8	19898	19905	25 %	50 %	0 %	25 %	332668465
57	NC_015513	CCAC	2	8	19943	19950	25 %	0 %	0 %	75 %	332668465
58	NC_015513	TCCT	2	8	21049	21056	0 %	50 %	0 %	50 %	332668465
59	NC_015513	CTAC	2	8	21176	21183	25 %	25 %	0 %	50 %	332668465
60	NC_015513	GCAT	2	8	22429	22436	25 %	25 %	25 %	25 %	332668466
61	NC_015513	CTTC	2	8	22587	22594	0 %	50 %	0 %	50 %	332668466
62	NC_015513	TTGA	2	8	23142	23149	25 %	50 %	25 %	0 %	332668466
63	NC_015513	TTCT	2	8	23339	23346	0 %	75 %	0 %	25 %	332668466
64	NC_015513	AAAC	2	8	23475	23482	75 %	0 %	0 %	25 %	332668466
65	NC_015513	GTTG	2	8	23860	23867	0 %	50 %	50 %	0 %	332668466
66	NC_015513	GGAT	2	8	25819	25826	25 %	25 %	50 %	0 %	332668467
67	NC_015513	TGGT	2	8	26147	26154	0 %	50 %	50 %	0 %	332668467
68	NC_015513	TCGA	2	8	26440	26447	25 %	25 %	25 %	25 %	332668467
69	NC_015513	AGCC	2	8	26581	26588	25 %	0 %	25 %	50 %	332668467
70	NC_015513	CTTC	2	8	26822	26829	0 %	50 %	0 %	50 %	332668467
71	NC_015513	TTTG	2	8	27361	27368	0 %	75 %	25 %	0 %	332668468
72	NC_015513	AGTG	2	8	27664	27671	25 %	25 %	50 %	0 %	332668468
73	NC_015513	TGCC	2	8	27860	27867	0 %	25 %	25 %	50 %	332668468
74	NC_015513	ATTT	2	8	28399	28406	25 %	75 %	0 %	0 %	332668468
75	NC_015513	AGTC	2	8	29099	29106	25 %	25 %	25 %	25 %	332668469
76	NC_015513	CGAT	2	8	29290	29297	25 %	25 %	25 %	25 %	332668469
77	NC_015513	TCGT	2	8	29466	29473	0 %	50 %	25 %	25 %	332668469
78	NC_015513	GCAG	2	8	29979	29986	25 %	0 %	50 %	25 %	332668470
79	NC_015513	TTCA	2	8	30057	30064	25 %	50 %	0 %	25 %	332668470
80	NC_015513	TGAT	2	8	30452	30459	25 %	50 %	25 %	0 %	332668470
81	NC_015513	TGCG	2	8	30803	30810	0 %	25 %	50 %	25 %	332668470
82	NC_015513	GGTT	2	8	31526	31533	0 %	50 %	50 %	0 %	332668471
83	NC_015513	AGGT	2	8	32336	32343	25 %	25 %	50 %	0 %	332668472
84	NC_015513	ATCC	2	8	32469	32476	25 %	25 %	0 %	50 %	332668472
85	NC_015513	GATT	2	8	32616	32623	25 %	50 %	25 %	0 %	332668472
86	NC_015513	AGCA	2	8	33501	33508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015513	TCGA	2	8	34002	34009	25 %	25 %	25 %	25 %	332668473
88	NC_015513	TTTG	2	8	34037	34044	0 %	75 %	25 %	0 %	332668473
89	NC_015513	CGTC	2	8	35319	35326	0 %	25 %	25 %	50 %	332668474
90	NC_015513	TTGC	2	8	35418	35425	0 %	50 %	25 %	25 %	332668474
91	NC_015513	ACCT	2	8	36782	36789	25 %	25 %	0 %	50 %	332668474
92	NC_015513	CAGC	2	8	38416	38423	25 %	0 %	25 %	50 %	332668476
93	NC_015513	CCAA	2	8	38446	38453	50 %	0 %	0 %	50 %	332668476
94	NC_015513	TTGG	2	8	39958	39965	0 %	50 %	50 %	0 %	332668477
95	NC_015513	TTTG	2	8	40788	40795	0 %	75 %	25 %	0 %	332668477
96	NC_015513	ATTG	2	8	41343	41350	25 %	50 %	25 %	0 %	332668478
97	NC_015513	ATTG	2	8	41574	41581	25 %	50 %	25 %	0 %	332668478
98	NC_015513	TTTG	2	8	41631	41638	0 %	75 %	25 %	0 %	332668478
99	NC_015513	GTTC	2	8	41643	41650	0 %	50 %	25 %	25 %	332668478
100	NC_015513	TGGC	2	8	41695	41702	0 %	25 %	50 %	25 %	332668478
101	NC_015513	ACAA	2	8	41816	41823	75 %	0 %	0 %	25 %	332668478
102	NC_015513	CCAC	2	8	42805	42812	25 %	0 %	0 %	75 %	332668479
103	NC_015513	AACC	2	8	43977	43984	50 %	0 %	0 %	50 %	332668479
104	NC_015513	CTGG	2	8	44214	44221	0 %	25 %	50 %	25 %	332668479
105	NC_015513	ACTC	2	8	44419	44426	25 %	25 %	0 %	50 %	332668479
106	NC_015513	GTTG	2	8	44674	44681	0 %	50 %	50 %	0 %	332668479
107	NC_015513	CTAC	2	8	45132	45139	25 %	25 %	0 %	50 %	332668480
108	NC_015513	CAAC	2	8	45385	45392	50 %	0 %	0 %	50 %	332668480
109	NC_015513	CACC	2	8	46641	46648	25 %	0 %	0 %	75 %	332668481
110	NC_015513	GCAG	2	8	47673	47680	25 %	0 %	50 %	25 %	332668482
111	NC_015513	CTTT	2	8	47796	47803	0 %	75 %	0 %	25 %	332668482
112	NC_015513	CCAA	2	8	48267	48274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015513	ACCG	2	8	49525	49532	25 %	0 %	25 %	50 %	332668483
114	NC_015513	ACCT	2	8	49856	49863	25 %	25 %	0 %	50 %	332668483
115	NC_015513	ACCT	2	8	49913	49920	25 %	25 %	0 %	50 %	332668483
116	NC_015513	GATT	2	8	50074	50081	25 %	50 %	25 %	0 %	332668483
117	NC_015513	AGGA	2	8	50417	50424	50 %	0 %	50 %	0 %	332668484
118	NC_015513	GTGA	2	8	50827	50834	25 %	25 %	50 %	0 %	332668484
119	NC_015513	TGCC	2	8	51015	51022	0 %	25 %	25 %	50 %	332668484
120	NC_015513	TTTC	2	8	51300	51307	0 %	75 %	0 %	25 %	332668485
121	NC_015513	AGGA	2	8	51353	51360	50 %	0 %	50 %	0 %	332668485
122	NC_015513	TTGC	2	8	51730	51737	0 %	50 %	25 %	25 %	332668485
123	NC_015513	GAAC	2	8	51991	51998	50 %	0 %	25 %	25 %	332668485
124	NC_015513	GTTT	2	8	52076	52083	0 %	75 %	25 %	0 %	332668485
125	NC_015513	ATTT	2	8	52859	52866	25 %	75 %	0 %	0 %	332668486
126	NC_015513	ACCT	2	8	53155	53162	25 %	25 %	0 %	50 %	332668488
127	NC_015513	CAGG	2	8	53785	53792	25 %	0 %	50 %	25 %	332668488
128	NC_015513	GCCC	2	8	54494	54501	0 %	0 %	25 %	75 %	332668489
129	NC_015513	GAAG	2	8	54869	54876	50 %	0 %	50 %	0 %	332668489
130	NC_015513	CACG	2	8	55076	55083	25 %	0 %	25 %	50 %	332668489
131	NC_015513	ATCG	2	8	55675	55682	25 %	25 %	25 %	25 %	332668490
132	NC_015513	GGTA	2	8	56079	56086	25 %	25 %	50 %	0 %	332668490
133	NC_015513	ACTA	2	8	56148	56155	50 %	25 %	0 %	25 %	332668490
134	NC_015513	CATT	2	8	58152	58159	25 %	50 %	0 %	25 %	332668492
135	NC_015513	CATT	2	8	59566	59573	25 %	50 %	0 %	25 %	332668493
136	NC_015513	CCTT	2	8	59802	59809	0 %	50 %	0 %	50 %	332668493
137	NC_015513	GGTC	2	8	60235	60242	0 %	25 %	50 %	25 %	332668493
138	NC_015513	CGCT	2	8	60243	60250	0 %	25 %	25 %	50 %	332668493
139	NC_015513	TTAC	2	8	60579	60586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015513	GTAG	2	8	61306	61313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015513	CTTG	2	8	61506	61513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.