MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 1793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015513	GCG	2	6	23718	23723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668466
502	NC_015513	GAAAT	2	10	23803	23812	60 %	20 %	20 %	0 %	332668466
503	NC_015513	ACC	2	6	23836	23841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668466
504	NC_015513	GTTG	2	8	23860	23867	0 %	50 %	50 %	0 %	332668466
505	NC_015513	AAGTG	2	10	24020	24029	40 %	20 %	40 %	0 %	332668466
506	NC_015513	GC	4	8	24095	24102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015513	TCA	2	6	24131	24136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668467
508	NC_015513	AT	3	6	24145	24150	50 %	50 %	0 %	0 %	332668467
509	NC_015513	TCC	2	6	24182	24187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668467
510	NC_015513	T	6	6	24263	24268	0 %	100 %	0 %	0 %	332668467
511	NC_015513	A	7	7	24353	24359	100 %	0 %	0 %	0 %	332668467
512	NC_015513	AACCTG	2	12	24364	24375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332668467
513	NC_015513	GCC	2	6	24392	24397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668467
514	NC_015513	TGG	2	6	24480	24485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668467
515	NC_015513	CAT	2	6	24507	24512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668467
516	NC_015513	TCA	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668467
517	NC_015513	GAA	2	6	24571	24576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668467
518	NC_015513	GTA	2	6	24646	24651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668467
519	NC_015513	AAG	2	6	24674	24679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668467
520	NC_015513	ACC	2	6	24700	24705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668467
521	NC_015513	AAC	2	6	24787	24792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
522	NC_015513	CGT	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668467
523	NC_015513	AGC	2	6	24982	24987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668467
524	NC_015513	A	6	6	25000	25005	100 %	0 %	0 %	0 %	332668467
525	NC_015513	AGA	2	6	25087	25092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668467
526	NC_015513	CTG	2	6	25097	25102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668467
527	NC_015513	AGC	2	6	25132	25137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668467
528	NC_015513	ACG	2	6	25153	25158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668467
529	NC_015513	TTG	2	6	25174	25179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668467
530	NC_015513	CGG	2	6	25230	25235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668467
531	NC_015513	ACA	3	9	25286	25294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
532	NC_015513	AGC	2	6	25331	25336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668467
533	NC_015513	GT	3	6	25361	25366	0 %	50 %	50 %	0 %	332668467
534	NC_015513	CAA	2	6	25383	25388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
535	NC_015513	G	6	6	25445	25450	0 %	0 %	100 %	0 %	332668467
536	NC_015513	GAG	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668467
537	NC_015513	T	6	6	25551	25556	0 %	100 %	0 %	0 %	332668467
538	NC_015513	ATG	2	6	25603	25608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668467
539	NC_015513	AAC	2	6	25609	25614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
540	NC_015513	A	6	6	25784	25789	100 %	0 %	0 %	0 %	332668467
541	NC_015513	CTT	2	6	25797	25802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668467
542	NC_015513	GGAT	2	8	25819	25826	25 %	25 %	50 %	0 %	332668467
543	NC_015513	T	6	6	25869	25874	0 %	100 %	0 %	0 %	332668467
544	NC_015513	TGG	2	6	25898	25903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668467
545	NC_015513	CAT	2	6	25911	25916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668467
546	NC_015513	TGGGGG	2	12	25962	25973	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	332668467
547	NC_015513	T	7	7	25977	25983	0 %	100 %	0 %	0 %	332668467
548	NC_015513	TGG	2	6	26004	26009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668467
549	NC_015513	CAA	3	9	26031	26039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
550	NC_015513	GAAAAA	2	12	26050	26061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332668467
551	NC_015513	CTT	2	6	26088	26093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668467
552	NC_015513	TGGT	2	8	26147	26154	0 %	50 %	50 %	0 %	332668467
553	NC_015513	CAA	3	9	26217	26225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
554	NC_015513	TTTGC	2	10	26236	26245	0 %	60 %	20 %	20 %	332668467
555	NC_015513	T	6	6	26278	26283	0 %	100 %	0 %	0 %	332668467
556	NC_015513	CCG	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668467
557	NC_015513	TCGA	2	8	26440	26447	25 %	25 %	25 %	25 %	332668467
558	NC_015513	CGG	2	6	26514	26519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668467
559	NC_015513	AGCC	2	8	26581	26588	25 %	0 %	25 %	50 %	332668467
560	NC_015513	AC	3	6	26607	26612	50 %	0 %	0 %	50 %	332668467
561	NC_015513	GATTT	2	10	26630	26639	20 %	60 %	20 %	0 %	332668467
562	NC_015513	CAA	2	6	26805	26810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668467
563	NC_015513	CTTC	2	8	26822	26829	0 %	50 %	0 %	50 %	332668467
564	NC_015513	TCA	2	6	26849	26854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668467
565	NC_015513	TCA	2	6	26933	26938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668467
566	NC_015513	TGAAA	2	10	27066	27075	60 %	20 %	20 %	0 %	332668468
567	NC_015513	AT	3	6	27076	27081	50 %	50 %	0 %	0 %	332668468
568	NC_015513	CGG	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
569	NC_015513	ATG	2	6	27262	27267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668468
570	NC_015513	TGC	2	6	27270	27275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668468
571	NC_015513	CGG	2	6	27296	27301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
572	NC_015513	TTTG	2	8	27361	27368	0 %	75 %	25 %	0 %	332668468
573	NC_015513	TGT	2	6	27410	27415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668468
574	NC_015513	GGC	2	6	27492	27497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
575	NC_015513	CGG	2	6	27567	27572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
576	NC_015513	AGTG	2	8	27664	27671	25 %	25 %	50 %	0 %	332668468
577	NC_015513	CGG	2	6	27677	27682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
578	NC_015513	GGC	2	6	27723	27728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
579	NC_015513	GGGTA	2	10	27738	27747	20 %	20 %	60 %	0 %	332668468
580	NC_015513	TTG	2	6	27784	27789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668468
581	NC_015513	CAA	2	6	27810	27815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668468
582	NC_015513	CCT	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668468
583	NC_015513	TGCC	2	8	27860	27867	0 %	25 %	25 %	50 %	332668468
584	NC_015513	GCC	2	6	27904	27909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668468
585	NC_015513	CGC	2	6	27924	27929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668468
586	NC_015513	GTT	2	6	27960	27965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668468
587	NC_015513	CAA	2	6	27975	27980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668468
588	NC_015513	ATT	2	6	27988	27993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668468
589	NC_015513	CCG	2	6	27999	28004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668468
590	NC_015513	CGG	2	6	28127	28132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
591	NC_015513	GGC	2	6	28161	28166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668468
592	NC_015513	ATG	2	6	28217	28222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668468
593	NC_015513	AAC	3	9	28348	28356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668468
594	NC_015513	ATTT	2	8	28399	28406	25 %	75 %	0 %	0 %	332668468
595	NC_015513	A	6	6	28556	28561	100 %	0 %	0 %	0 %	332668468
596	NC_015513	CGC	2	6	28603	28608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668468
597	NC_015513	AGC	2	6	28709	28714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668468
598	NC_015513	TGTACC	2	12	28733	28744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332668468
599	NC_015513	TAA	2	6	28811	28816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015513	A	6	6	28815	28820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015513	A	6	6	28830	28835	100 %	0 %	0 %	0 %	332668469
602	NC_015513	TTC	2	6	28842	28847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668469
603	NC_015513	CCT	2	6	28894	28899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668469
604	NC_015513	CAA	2	6	28905	28910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668469
605	NC_015513	CGC	2	6	29011	29016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668469
606	NC_015513	TCA	2	6	29041	29046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668469
607	NC_015513	CCA	2	6	29056	29061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668469
608	NC_015513	A	6	6	29061	29066	100 %	0 %	0 %	0 %	332668469
609	NC_015513	AGTC	2	8	29099	29106	25 %	25 %	25 %	25 %	332668469
610	NC_015513	GT	3	6	29128	29133	0 %	50 %	50 %	0 %	332668469
611	NC_015513	CAA	2	6	29171	29176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668469
612	NC_015513	CGAT	2	8	29290	29297	25 %	25 %	25 %	25 %	332668469
613	NC_015513	T	6	6	29303	29308	0 %	100 %	0 %	0 %	332668469
614	NC_015513	A	7	7	29334	29340	100 %	0 %	0 %	0 %	332668469
615	NC_015513	CAC	2	6	29408	29413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668469
616	NC_015513	GGC	3	9	29447	29455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668469
617	NC_015513	TCGT	2	8	29466	29473	0 %	50 %	25 %	25 %	332668469
618	NC_015513	ACC	2	6	29565	29570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668469
619	NC_015513	TGC	2	6	29591	29596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668469
620	NC_015513	CCT	2	6	29643	29648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668469
621	NC_015513	CT	4	8	29713	29720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_015513	CAA	2	6	29758	29763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668470
623	NC_015513	TTG	2	6	29857	29862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668470
624	NC_015513	C	6	6	29903	29908	0 %	0 %	0 %	100 %	332668470
625	NC_015513	GCAG	2	8	29979	29986	25 %	0 %	50 %	25 %	332668470
626	NC_015513	TTCA	2	8	30057	30064	25 %	50 %	0 %	25 %	332668470
627	NC_015513	TGC	3	9	30399	30407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668470
628	NC_015513	TGAT	2	8	30452	30459	25 %	50 %	25 %	0 %	332668470
629	NC_015513	CCA	2	6	30533	30538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668470
630	NC_015513	GGT	2	6	30615	30620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668470
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