MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 453

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	T	6	6	30	35	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015512	T	6	6	74	79	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015512	A	7	7	277	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015512	G	6	6	407	412	0 %	0 %	100 %	0 %	332661891
5	NC_015512	G	7	7	415	421	0 %	0 %	100 %	0 %	332661891
6	NC_015512	G	7	7	479	485	0 %	0 %	100 %	0 %	332661891
7	NC_015512	T	8	8	491	498	0 %	100 %	0 %	0 %	332661891
8	NC_015512	T	7	7	674	680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015512	A	6	6	701	706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015512	T	6	6	914	919	0 %	100 %	0 %	0 %	332661892
11	NC_015512	T	7	7	1496	1502	0 %	100 %	0 %	0 %	332661892
12	NC_015512	T	6	6	2119	2124	0 %	100 %	0 %	0 %	332661893
13	NC_015512	G	6	6	2959	2964	0 %	0 %	100 %	0 %	332661893
14	NC_015512	A	6	6	3430	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	332661893
15	NC_015512	A	7	7	3462	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	332661894
16	NC_015512	T	7	7	3478	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	332661894
17	NC_015512	G	6	6	3709	3714	0 %	0 %	100 %	0 %	332661894
18	NC_015512	G	6	6	5612	5617	0 %	0 %	100 %	0 %	332661894
19	NC_015512	A	6	6	5631	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	332661894
20	NC_015512	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	332661895
21	NC_015512	T	6	6	5941	5946	0 %	100 %	0 %	0 %	332661895
22	NC_015512	G	8	8	6095	6102	0 %	0 %	100 %	0 %	332661895
23	NC_015512	G	6	6	7496	7501	0 %	0 %	100 %	0 %	332661895
24	NC_015512	T	6	6	7768	7773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015512	T	6	6	7883	7888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015512	A	6	6	8148	8153	100 %	0 %	0 %	0 %	332661896
27	NC_015512	T	7	7	8230	8236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015512	A	6	6	8403	8408	100 %	0 %	0 %	0 %	332661897
29	NC_015512	A	7	7	9069	9075	100 %	0 %	0 %	0 %	332661898
30	NC_015512	T	6	6	9090	9095	0 %	100 %	0 %	0 %	332661898
31	NC_015512	T	6	6	9192	9197	0 %	100 %	0 %	0 %	332661898
32	NC_015512	A	7	7	9492	9498	100 %	0 %	0 %	0 %	332661898
33	NC_015512	A	7	7	10257	10263	100 %	0 %	0 %	0 %	332661899
34	NC_015512	A	6	6	10361	10366	100 %	0 %	0 %	0 %	332661899
35	NC_015512	A	6	6	10546	10551	100 %	0 %	0 %	0 %	332661899
36	NC_015512	A	6	6	10789	10794	100 %	0 %	0 %	0 %	332661899
37	NC_015512	A	6	6	11258	11263	100 %	0 %	0 %	0 %	332661900
38	NC_015512	A	6	6	11686	11691	100 %	0 %	0 %	0 %	332661900
39	NC_015512	G	6	6	11726	11731	0 %	0 %	100 %	0 %	332661900
40	NC_015512	A	6	6	12494	12499	100 %	0 %	0 %	0 %	332661900
41	NC_015512	A	7	7	12738	12744	100 %	0 %	0 %	0 %	332661900
42	NC_015512	A	6	6	12746	12751	100 %	0 %	0 %	0 %	332661900
43	NC_015512	A	6	6	13113	13118	100 %	0 %	0 %	0 %	332661900
44	NC_015512	T	6	6	13830	13835	0 %	100 %	0 %	0 %	332661901
45	NC_015512	A	6	6	14511	14516	100 %	0 %	0 %	0 %	332661901
46	NC_015512	A	7	7	14664	14670	100 %	0 %	0 %	0 %	332661901
47	NC_015512	A	6	6	14764	14769	100 %	0 %	0 %	0 %	332661901
48	NC_015512	A	6	6	15387	15392	100 %	0 %	0 %	0 %	332661901
49	NC_015512	A	7	7	15423	15429	100 %	0 %	0 %	0 %	332661901
50	NC_015512	T	6	6	15843	15848	0 %	100 %	0 %	0 %	332661902
51	NC_015512	G	7	7	16500	16506	0 %	0 %	100 %	0 %	332661903
52	NC_015512	G	6	6	16618	16623	0 %	0 %	100 %	0 %	332661903
53	NC_015512	T	7	7	18132	18138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015512	T	6	6	18171	18176	0 %	100 %	0 %	0 %	332661904
55	NC_015512	A	6	6	18507	18512	100 %	0 %	0 %	0 %	332661904
56	NC_015512	T	6	6	19485	19490	0 %	100 %	0 %	0 %	332661904
57	NC_015512	T	7	7	21326	21332	0 %	100 %	0 %	0 %	332661905
58	NC_015512	G	6	6	21592	21597	0 %	0 %	100 %	0 %	332661905
59	NC_015512	T	6	6	22446	22451	0 %	100 %	0 %	0 %	332661906
60	NC_015512	T	6	6	22887	22892	0 %	100 %	0 %	0 %	332661906
61	NC_015512	A	7	7	23773	23779	100 %	0 %	0 %	0 %	332661906
62	NC_015512	T	6	6	24023	24028	0 %	100 %	0 %	0 %	332661906
63	NC_015512	C	6	6	24299	24304	0 %	0 %	0 %	100 %	332661907
64	NC_015512	T	6	6	25205	25210	0 %	100 %	0 %	0 %	332661907
65	NC_015512	A	6	6	25259	25264	100 %	0 %	0 %	0 %	332661907
66	NC_015512	T	6	6	25552	25557	0 %	100 %	0 %	0 %	332661907
67	NC_015512	T	6	6	25923	25928	0 %	100 %	0 %	0 %	332661907
68	NC_015512	A	7	7	26011	26017	100 %	0 %	0 %	0 %	332661907
69	NC_015512	T	6	6	26130	26135	0 %	100 %	0 %	0 %	332661907
70	NC_015512	T	7	7	26359	26365	0 %	100 %	0 %	0 %	332661907
71	NC_015512	T	6	6	27812	27817	0 %	100 %	0 %	0 %	332661908
72	NC_015512	T	6	6	27878	27883	0 %	100 %	0 %	0 %	332661908
73	NC_015512	T	6	6	28370	28375	0 %	100 %	0 %	0 %	332661908
74	NC_015512	A	6	6	28662	28667	100 %	0 %	0 %	0 %	332661908
75	NC_015512	T	6	6	28798	28803	0 %	100 %	0 %	0 %	332661908
76	NC_015512	T	6	6	28964	28969	0 %	100 %	0 %	0 %	332661908
77	NC_015512	A	6	6	30158	30163	100 %	0 %	0 %	0 %	332661908
78	NC_015512	A	6	6	30412	30417	100 %	0 %	0 %	0 %	332661908
79	NC_015512	A	6	6	30474	30479	100 %	0 %	0 %	0 %	332661908
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83	NC_015512	A	6	6	31853	31858	100 %	0 %	0 %	0 %	332661910
84	NC_015512	T	7	7	32003	32009	0 %	100 %	0 %	0 %	332661910
85	NC_015512	A	6	6	32023	32028	100 %	0 %	0 %	0 %	332661910
86	NC_015512	A	8	8	32157	32164	100 %	0 %	0 %	0 %	332661910
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90	NC_015512	T	9	9	32838	32846	0 %	100 %	0 %	0 %	332661912
91	NC_015512	T	8	8	32927	32934	0 %	100 %	0 %	0 %	332661912
92	NC_015512	A	6	6	33354	33359	100 %	0 %	0 %	0 %	332661912
93	NC_015512	A	7	7	33523	33529	100 %	0 %	0 %	0 %	332661912
94	NC_015512	A	6	6	33718	33723	100 %	0 %	0 %	0 %	332661912
95	NC_015512	T	6	6	34624	34629	0 %	100 %	0 %	0 %	332661912
96	NC_015512	T	6	6	34951	34956	0 %	100 %	0 %	0 %	332661912
97	NC_015512	A	7	7	34983	34989	100 %	0 %	0 %	0 %	332661912
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99	NC_015512	G	6	6	35618	35623	0 %	0 %	100 %	0 %	332661912
100	NC_015512	T	8	8	36616	36623	0 %	100 %	0 %	0 %	332661914
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103	NC_015512	T	8	8	37372	37379	0 %	100 %	0 %	0 %	332661914
104	NC_015512	T	7	7	37611	37617	0 %	100 %	0 %	0 %	332661915
105	NC_015512	A	6	6	37781	37786	100 %	0 %	0 %	0 %	332661915
106	NC_015512	A	6	6	38647	38652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015512	A	6	6	38661	38666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015512	A	6	6	39190	39195	100 %	0 %	0 %	0 %	332661916
109	NC_015512	T	6	6	39374	39379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015512	T	6	6	39500	39505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_015512	G	6	6	41192	41197	0 %	0 %	100 %	0 %	332661919
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114	NC_015512	G	8	8	41375	41382	0 %	0 %	100 %	0 %	332661919
115	NC_015512	A	6	6	41421	41426	100 %	0 %	0 %	0 %	332661919
116	NC_015512	A	6	6	41671	41676	100 %	0 %	0 %	0 %	332661919
117	NC_015512	T	6	6	42694	42699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015512	G	6	6	42886	42891	0 %	0 %	100 %	0 %	332661920
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121	NC_015512	T	8	8	43387	43394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015512	A	6	6	43473	43478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015512	T	7	7	43497	43503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015512	A	6	6	43548	43553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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127	NC_015512	A	6	6	45270	45275	100 %	0 %	0 %	0 %	332661922
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145	NC_015512	A	7	7	49871	49877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015512	A	6	6	50549	50554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.