MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 165634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	CAT	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015510	CT	3	6	46	51	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015510	TATT	2	8	67	74	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015510	CAA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
5	NC_015510	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
6	NC_015510	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662000
7	NC_015510	GA	3	6	373	378	50 %	0 %	50 %	0 %	332662000
8	NC_015510	ACT	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662000
9	NC_015510	CAATGG	2	12	420	431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332662000
10	NC_015510	TAC	2	6	463	468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662000
11	NC_015510	AAT	2	6	469	474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662000
12	NC_015510	GC	3	6	598	603	0 %	0 %	50 %	50 %	332662000
13	NC_015510	CTT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662000
14	NC_015510	TCG	2	6	757	762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662000
15	NC_015510	ATC	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662000
16	NC_015510	CAAA	2	8	936	943	75 %	0 %	0 %	25 %	332662000
17	NC_015510	GAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662000
18	NC_015510	CGG	2	6	1025	1030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662000
19	NC_015510	ATG	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662000
20	NC_015510	ACA	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
21	NC_015510	ACA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
22	NC_015510	TCG	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662000
23	NC_015510	ATCGAT	2	12	1213	1224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332662000
24	NC_015510	GTG	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662000
25	NC_015510	ATT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662000
26	NC_015510	GC	3	6	1369	1374	0 %	0 %	50 %	50 %	332662000
27	NC_015510	GACC	2	8	1404	1411	25 %	0 %	25 %	50 %	332662000
28	NC_015510	TGG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662000
29	NC_015510	GTGA	2	8	1525	1532	25 %	25 %	50 %	0 %	332662000
30	NC_015510	GAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662000
31	NC_015510	ACAA	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015510	AAT	2	6	1646	1651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015510	CA	3	6	1726	1731	50 %	0 %	0 %	50 %	332662001
34	NC_015510	TTC	2	6	1734	1739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662001
35	NC_015510	CTT	2	6	1830	1835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662001
36	NC_015510	TGA	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
37	NC_015510	GTT	2	6	1928	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662001
38	NC_015510	AGT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
39	NC_015510	T	6	6	2030	2035	0 %	100 %	0 %	0 %	332662001
40	NC_015510	TGA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
41	NC_015510	ATG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
42	NC_015510	TTC	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662001
43	NC_015510	T	7	7	2388	2394	0 %	100 %	0 %	0 %	332662002
44	NC_015510	GTT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662002
45	NC_015510	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662002
46	NC_015510	T	6	6	2658	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	332662002
47	NC_015510	ATC	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662002
48	NC_015510	CTG	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662002
49	NC_015510	CTT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662002
50	NC_015510	CGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662002
51	NC_015510	ACAA	2	8	2948	2955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015510	TGT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015510	A	6	6	2990	2995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015510	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015510	AAT	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015510	A	6	6	3043	3048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015510	ACC	2	6	3069	3074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015510	CCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015510	TGC	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662003
60	NC_015510	ATC	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662003
61	NC_015510	CAA	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
62	NC_015510	GCGG	2	8	3420	3427	0 %	0 %	75 %	25 %	332662003
63	NC_015510	CAA	3	9	3476	3484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
64	NC_015510	GGCAA	2	10	3544	3553	40 %	0 %	40 %	20 %	332662003
65	NC_015510	GGC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662003
66	NC_015510	TA	3	6	3790	3795	50 %	50 %	0 %	0 %	332662003
67	NC_015510	GAA	2	6	3843	3848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662003
68	NC_015510	A	7	7	3907	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	332662003
69	NC_015510	AAC	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
70	NC_015510	GAA	2	6	3921	3926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662003
71	NC_015510	CAG	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
72	NC_015510	GCA	3	9	3982	3990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
73	NC_015510	CCAAT	2	10	3993	4002	40 %	20 %	0 %	40 %	332662003
74	NC_015510	CAA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
75	NC_015510	TAT	2	6	4110	4115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662003
76	NC_015510	AAAT	2	8	4133	4140	75 %	25 %	0 %	0 %	332662003
77	NC_015510	ATGA	2	8	4251	4258	50 %	25 %	25 %	0 %	332662003
78	NC_015510	CAG	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
79	NC_015510	TTG	2	6	4278	4283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662003
80	NC_015510	ACCT	2	8	4305	4312	25 %	25 %	0 %	50 %	332662003
81	NC_015510	TGGT	2	8	4417	4424	0 %	50 %	50 %	0 %	332662003
82	NC_015510	GGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662003
83	NC_015510	ACCT	2	8	4449	4456	25 %	25 %	0 %	50 %	332662003
84	NC_015510	AGC	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
85	NC_015510	CTT	2	6	4468	4473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662003
86	NC_015510	CA	3	6	4573	4578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015510	ATG	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015510	TG	3	6	4601	4606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015510	CAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662004
90	NC_015510	TGA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662004
91	NC_015510	ACC	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662004
92	NC_015510	A	6	6	4955	4960	100 %	0 %	0 %	0 %	332662004
93	NC_015510	CGG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662004
94	NC_015510	GGA	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332662004
95	NC_015510	AAAG	2	8	5066	5073	75 %	0 %	25 %	0 %	332662004
96	NC_015510	ACG	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662004
97	NC_015510	CGCC	2	8	5127	5134	0 %	0 %	25 %	75 %	332662004
98	NC_015510	AAAC	2	8	5137	5144	75 %	0 %	0 %	25 %	332662004
99	NC_015510	CAA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662004
100	NC_015510	TA	3	6	5205	5210	50 %	50 %	0 %	0 %	332662004
101	NC_015510	C	6	6	5229	5234	0 %	0 %	0 %	100 %	332662004
102	NC_015510	CA	3	6	5274	5279	50 %	0 %	0 %	50 %	332662004
103	NC_015510	CTT	2	6	5356	5361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662005
104	NC_015510	T	6	6	5372	5377	0 %	100 %	0 %	0 %	332662005
105	NC_015510	AGA	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662005
106	NC_015510	TC	3	6	5515	5520	0 %	50 %	0 %	50 %	332662005
107	NC_015510	A	6	6	5546	5551	100 %	0 %	0 %	0 %	332662005
108	NC_015510	CGG	2	6	5575	5580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662005
109	NC_015510	ATC	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662005
110	NC_015510	A	6	6	5743	5748	100 %	0 %	0 %	0 %	332662005
111	NC_015510	T	8	8	5785	5792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015510	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015510	T	6	6	5829	5834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015510	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015510	T	6	6	5918	5923	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
116	NC_015510	AATA	2	8	5932	5939	75 %	25 %	0 %	0 %	332662006
117	NC_015510	CAGT	2	8	5965	5972	25 %	25 %	25 %	25 %	332662006
118	NC_015510	T	7	7	5972	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
119	NC_015510	TGA	2	6	6112	6117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
120	NC_015510	TG	3	6	6142	6147	0 %	50 %	50 %	0 %	332662006
121	NC_015510	ACA	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662006
122	NC_015510	AAC	2	6	6254	6259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662006
123	NC_015510	T	6	6	6289	6294	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
124	NC_015510	TGG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662006
125	NC_015510	T	6	6	6490	6495	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
126	NC_015510	GCA	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662006
127	NC_015510	CCA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662006
128	NC_015510	CCGAA	2	10	6569	6578	40 %	0 %	20 %	40 %	332662006
129	NC_015510	G	6	6	6595	6600	0 %	0 %	100 %	0 %	332662006
130	NC_015510	CAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662006
131	NC_015510	AGA	2	6	6760	6765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662006
132	NC_015510	CCAG	2	8	6798	6805	25 %	0 %	25 %	50 %	332662006
133	NC_015510	GAT	2	6	6854	6859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
134	NC_015510	A	6	6	6899	6904	100 %	0 %	0 %	0 %	332662006
135	NC_015510	T	6	6	6923	6928	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
136	NC_015510	T	6	6	6934	6939	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
137	NC_015510	TTG	2	6	6957	6962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662006
138	NC_015510	AAC	2	6	7059	7064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662006
139	NC_015510	GAT	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
140	NC_015510	ATG	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
141	NC_015510	CAG	2	6	7193	7198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662006
142	NC_015510	CAAA	2	8	7234	7241	75 %	0 %	0 %	25 %	332662006
143	NC_015510	A	7	7	7239	7245	100 %	0 %	0 %	0 %	332662006
144	NC_015510	T	7	7	7298	7304	0 %	100 %	0 %	0 %	332662006
145	NC_015510	TTC	2	6	7361	7366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662006
146	NC_015510	CTC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_015510	GCT	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662007
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149	NC_015510	GTTG	2	8	7777	7784	0 %	50 %	50 %	0 %	332662007
150	NC_015510	AGC	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662007
151	NC_015510	AGC	2	6	7876	7881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662007
152	NC_015510	TCG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662007
153	NC_015510	GCTTG	2	10	7925	7934	0 %	40 %	40 %	20 %	332662007
154	NC_015510	A	6	6	7960	7965	100 %	0 %	0 %	0 %	332662007
155	NC_015510	CCA	2	6	8005	8010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662007
156	NC_015510	TGT	2	6	8022	8027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662007
157	NC_015510	AG	3	6	8124	8129	50 %	0 %	50 %	0 %	332662007
158	NC_015510	CTTT	2	8	8138	8145	0 %	75 %	0 %	25 %	332662007
159	NC_015510	TGT	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662007
160	NC_015510	ATC	2	6	8207	8212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662007
161	NC_015510	GAA	2	6	8266	8271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662007
162	NC_015510	TGC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662007
163	NC_015510	GAA	3	9	8366	8374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662007
164	NC_015510	ATG	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662007
165	NC_015510	TGA	2	6	8391	8396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662007
166	NC_015510	TTC	2	6	8420	8425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662007
167	NC_015510	GAA	2	6	8452	8457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662008
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171	NC_015510	GC	3	6	8816	8821	0 %	0 %	50 %	50 %	332662009
172	NC_015510	GCT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662009
173	NC_015510	CA	3	6	9185	9190	50 %	0 %	0 %	50 %	332662009
174	NC_015510	GAT	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662009
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176	NC_015510	CAG	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662009
177	NC_015510	AATG	2	8	9440	9447	50 %	25 %	25 %	0 %	332662009
178	NC_015510	ATC	2	6	9480	9485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662009
179	NC_015510	A	6	6	9500	9505	100 %	0 %	0 %	0 %	332662009
180	NC_015510	ACC	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662009
181	NC_015510	AATGG	2	10	9642	9651	40 %	20 %	40 %	0 %	332662009
182	NC_015510	ACC	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662009
183	NC_015510	CTC	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332662009
184	NC_015510	C	8	8	9977	9984	0 %	0 %	0 %	100 %	332662009
185	NC_015510	AAG	2	6	10045	10050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662009
186	NC_015510	ACA	2	6	10054	10059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662009
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198	NC_015510	GCTATG	2	12	10431	10442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332662009
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200	NC_015510	AAT	2	6	10517	10522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662009
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213	NC_015510	A	6	6	11212	11217	100 %	0 %	0 %	0 %	332662011
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223	NC_015510	AAC	2	6	11870	11875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662011
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241	NC_015510	T	6	6	12771	12776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_015510	T	6	6	12811	12816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015510	GCT	2	6	12835	12840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_015510	TAC	2	6	13050	13055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662013
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246	NC_015510	A	7	7	13227	13233	100 %	0 %	0 %	0 %	332662013
247	NC_015510	TGC	2	6	13298	13303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662013
248	NC_015510	ATG	2	6	13312	13317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662013
249	NC_015510	TGG	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662013
250	NC_015510	CATT	2	8	13439	13446	25 %	50 %	0 %	25 %	332662013
251	NC_015510	GAG	2	6	13622	13627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332662013
252	NC_015510	CAAAA	2	10	13643	13652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
253	NC_015510	ATT	2	6	13681	13686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662014
254	NC_015510	AGCTC	2	10	13836	13845	20 %	20 %	20 %	40 %	332662014
255	NC_015510	CTT	2	6	13905	13910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662014
256	NC_015510	TCT	2	6	14082	14087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662014
257	NC_015510	CAG	2	6	14143	14148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662014
258	NC_015510	ACC	2	6	14183	14188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662014
259	NC_015510	GCA	2	6	14214	14219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662014
260	NC_015510	GCA	2	6	14233	14238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662014
261	NC_015510	AT	3	6	14316	14321	50 %	50 %	0 %	0 %	332662014
262	NC_015510	TAA	2	6	14339	14344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662014
263	NC_015510	TGA	2	6	14395	14400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662014
264	NC_015510	CCAAA	2	10	14419	14428	60 %	0 %	0 %	40 %	332662014
265	NC_015510	CGAT	2	8	14430	14437	25 %	25 %	25 %	25 %	332662014
266	NC_015510	T	6	6	14449	14454	0 %	100 %	0 %	0 %	332662014
267	NC_015510	AAT	2	6	14529	14534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662014
268	NC_015510	GAAG	2	8	14564	14571	50 %	0 %	50 %	0 %	332662014
269	NC_015510	TCA	2	6	14625	14630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662014
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285	NC_015510	TTGG	2	8	15694	15701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015510	AAT	2	6	15712	15717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015510	CAA	2	6	15781	15786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662015
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397	NC_015510	GGA	2	6	20811	20816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332662019
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399	NC_015510	A	6	6	20840	20845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_015510	CCA	2	6	20872	20877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662020
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