MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 165634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015510	GAT	2	6	302429	302434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662239
6002	NC_015510	GTA	2	6	302579	302584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662239
6003	NC_015510	TCG	2	6	302625	302630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662239
6004	NC_015510	TTG	2	6	302662	302667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662239
6005	NC_015510	TGA	2	6	302671	302676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662239
6006	NC_015510	GC	3	6	302691	302696	0 %	0 %	50 %	50 %	332662239
6007	NC_015510	T	6	6	302733	302738	0 %	100 %	0 %	0 %	332662239
6008	NC_015510	CCG	2	6	302743	302748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662239
6009	NC_015510	GGC	2	6	302756	302761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662239
6010	NC_015510	TGT	2	6	302932	302937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662239
6011	NC_015510	TGC	2	6	302961	302966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662239
6012	NC_015510	GGT	2	6	303035	303040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662239
6013	NC_015510	TGG	3	9	303076	303084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662239
6014	NC_015510	CTT	2	6	303175	303180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662239
6015	NC_015510	TGT	2	6	303223	303228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662239
6016	NC_015510	CTCC	2	8	303343	303350	0 %	25 %	0 %	75 %	332662239
6017	NC_015510	CACCTC	2	12	303403	303414	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	332662239
6018	NC_015510	CAA	2	6	303479	303484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662239
6019	NC_015510	TCA	2	6	303612	303617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662239
6020	NC_015510	T	7	7	303647	303653	0 %	100 %	0 %	0 %	332662239
6021	NC_015510	ACA	2	6	303677	303682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662239
6022	NC_015510	T	6	6	303710	303715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015510	A	6	6	303740	303745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015510	TGC	2	6	303852	303857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_015510	ATG	2	6	303867	303872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015510	GGC	2	6	303897	303902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_015510	TCA	2	6	303925	303930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662240
6028	NC_015510	A	6	6	303946	303951	100 %	0 %	0 %	0 %	332662240
6029	NC_015510	ATT	2	6	303984	303989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662240
6030	NC_015510	T	8	8	304017	304024	0 %	100 %	0 %	0 %	332662240
6031	NC_015510	GAT	2	6	304032	304037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662240
6032	NC_015510	GCA	2	6	304057	304062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662240
6033	NC_015510	TTG	2	6	304087	304092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662240
6034	NC_015510	A	6	6	304228	304233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015510	TTG	2	6	304247	304252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015510	TAA	2	6	304370	304375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015510	A	6	6	304374	304379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015510	A	7	7	304419	304425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015510	T	7	7	304443	304449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015510	A	6	6	304457	304462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015510	A	6	6	304581	304586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015510	T	6	6	304713	304718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015510	TGC	2	6	304743	304748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015510	ACT	2	6	304873	304878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_015510	TTAT	2	8	304902	304909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015510	TGC	2	6	304932	304937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015510	CAAAC	2	10	304960	304969	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6048	NC_015510	ACA	2	6	305042	305047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_015510	GCA	2	6	305125	305130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_015510	CTGG	2	8	305172	305179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_015510	CCA	2	6	305189	305194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_015510	AGC	2	6	305207	305212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_015510	CAT	2	6	305253	305258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_015510	GAT	2	6	305260	305265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015510	GTT	3	9	305286	305294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015510	A	6	6	305304	305309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015510	CGAC	2	8	305312	305319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_015510	CGC	2	6	305413	305418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_015510	TGA	2	6	305429	305434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015510	CGA	2	6	305499	305504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_015510	CAA	2	6	305575	305580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_015510	AGT	2	6	305681	305686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015510	TCCT	2	8	305694	305701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_015510	AAC	2	6	305718	305723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662241
6065	NC_015510	CTC	2	6	305738	305743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332662241
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6067	NC_015510	ACA	2	6	305847	305852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662241
6068	NC_015510	GTC	2	6	305980	305985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662241
6069	NC_015510	T	6	6	306000	306005	0 %	100 %	0 %	0 %	332662241
6070	NC_015510	CAA	2	6	306007	306012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662241
6071	NC_015510	TC	3	6	306017	306022	0 %	50 %	0 %	50 %	332662241
6072	NC_015510	TCA	2	6	306041	306046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662241
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6074	NC_015510	TTC	2	6	306118	306123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662241
6075	NC_015510	CAT	2	6	306138	306143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662241
6076	NC_015510	TGA	2	6	306294	306299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662241
6077	NC_015510	GAA	3	9	306345	306353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662241
6078	NC_015510	CCT	2	6	306461	306466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332662241
6079	NC_015510	TGGC	2	8	306473	306480	0 %	25 %	50 %	25 %	332662241
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6081	NC_015510	TGG	2	6	306506	306511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662241
6082	NC_015510	CA	3	6	306538	306543	50 %	0 %	0 %	50 %	332662241
6083	NC_015510	GTG	2	6	306610	306615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662241
6084	NC_015510	AAC	2	6	306651	306656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_015510	CCG	2	6	306774	306779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662242
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6087	NC_015510	CCAA	2	8	307074	307081	50 %	0 %	0 %	50 %	332662242
6088	NC_015510	GC	3	6	307128	307133	0 %	0 %	50 %	50 %	332662242
6089	NC_015510	AC	3	6	307158	307163	50 %	0 %	0 %	50 %	332662242
6090	NC_015510	GTA	2	6	307239	307244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662242
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6097	NC_015510	TTG	2	6	307584	307589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662242
6098	NC_015510	TGG	2	6	307612	307617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_015510	CAC	2	6	307630	307635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_015510	A	6	6	307664	307669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015510	GTG	2	6	307692	307697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015510	GTT	2	6	307774	307779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662243
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6105	NC_015510	TTCT	2	8	308021	308028	0 %	75 %	0 %	25 %	332662243
6106	NC_015510	TGCAC	2	10	308071	308080	20 %	20 %	20 %	40 %	332662243
6107	NC_015510	GC	3	6	308108	308113	0 %	0 %	50 %	50 %	332662243
6108	NC_015510	GTC	2	6	308138	308143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662243
6109	NC_015510	GTG	2	6	308159	308164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662243
6110	NC_015510	ACA	2	6	308251	308256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662243
6111	NC_015510	CCT	2	6	308307	308312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332662243
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6114	NC_015510	AC	3	6	308576	308581	50 %	0 %	0 %	50 %	332662243
6115	NC_015510	GCTG	2	8	308599	308606	0 %	25 %	50 %	25 %	332662243
6116	NC_015510	ATG	2	6	308607	308612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662243
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6121	NC_015510	AAT	2	6	308788	308793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015510	AAT	2	6	308821	308826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015510	A	7	7	308884	308890	100 %	0 %	0 %	0 %	332662244
6124	NC_015510	TGCA	2	8	308931	308938	25 %	25 %	25 %	25 %	332662244
6125	NC_015510	GAT	2	6	308950	308955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662244
6126	NC_015510	T	6	6	308997	309002	0 %	100 %	0 %	0 %	332662244
6127	NC_015510	TCA	2	6	309125	309130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662244
6128	NC_015510	AC	3	6	309176	309181	50 %	0 %	0 %	50 %	332662244
6129	NC_015510	CA	3	6	309348	309353	50 %	0 %	0 %	50 %	332662244
6130	NC_015510	CTGC	2	8	309363	309370	0 %	25 %	25 %	50 %	332662244
6131	NC_015510	TTG	2	6	309376	309381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662244
6132	NC_015510	GAG	2	6	309385	309390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332662244
6133	NC_015510	CAT	2	6	309408	309413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662244
6134	NC_015510	CAC	2	6	309465	309470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662244
6135	NC_015510	ACT	2	6	309504	309509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662244
6136	NC_015510	ACC	2	6	309512	309517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662244
6137	NC_015510	ACA	2	6	309543	309548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662244
6138	NC_015510	T	8	8	309602	309609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_015510	TAC	2	6	309622	309627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_015510	GAC	2	6	309690	309695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662245
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6142	NC_015510	CAA	2	6	309843	309848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662245
6143	NC_015510	GAT	2	6	309863	309868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662245
6144	NC_015510	ATT	2	6	309922	309927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662245
6145	NC_015510	ACCT	2	8	309945	309952	25 %	25 %	0 %	50 %	332662245
6146	NC_015510	TGG	2	6	309995	310000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662245
6147	NC_015510	CG	3	6	310020	310025	0 %	0 %	50 %	50 %	332662245
6148	NC_015510	AAC	2	6	310051	310056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662245
6149	NC_015510	CTG	2	6	310074	310079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662245
6150	NC_015510	TGA	2	6	310114	310119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662245
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6155	NC_015510	GAC	2	6	310307	310312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662245
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6159	NC_015510	CAG	2	6	310470	310475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662245
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6165	NC_015510	TGC	2	6	310684	310689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662245
6166	NC_015510	AAG	2	6	310723	310728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662245
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6174	NC_015510	TCT	2	6	311029	311034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662245
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6177	NC_015510	T	6	6	311206	311211	0 %	100 %	0 %	0 %	332662245
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6193	NC_015510	ATG	2	6	312014	312019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6196	NC_015510	TGC	2	6	312227	312232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662246
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6200	NC_015510	GCCA	2	8	312496	312503	25 %	0 %	25 %	50 %	332662246
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6205	NC_015510	CAAT	2	8	312908	312915	50 %	25 %	0 %	25 %	332662246
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6217	NC_015510	AATC	2	8	313693	313700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6220	NC_015510	CCG	2	6	313813	313818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6222	NC_015510	ATC	2	6	313899	313904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6223	NC_015510	CGG	2	6	313920	313925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6224	NC_015510	CGC	2	6	313935	313940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6225	NC_015510	GTC	2	6	313951	313956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6229	NC_015510	T	7	7	314092	314098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6234	NC_015510	CTTTG	2	10	314462	314471	0 %	60 %	20 %	20 %	332662247
6235	NC_015510	C	7	7	314476	314482	0 %	0 %	0 %	100 %	332662247
6236	NC_015510	GTAG	2	8	314509	314516	25 %	25 %	50 %	0 %	332662247
6237	NC_015510	T	6	6	314523	314528	0 %	100 %	0 %	0 %	332662247
6238	NC_015510	G	6	6	314625	314630	0 %	0 %	100 %	0 %	332662247
6239	NC_015510	A	7	7	314685	314691	100 %	0 %	0 %	0 %	332662247
6240	NC_015510	CACCAG	2	12	314784	314795	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332662247
6241	NC_015510	TCG	2	6	314803	314808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662247
6242	NC_015510	AAC	2	6	314911	314916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662247
6243	NC_015510	GC	3	6	315005	315010	0 %	0 %	50 %	50 %	332662247
6244	NC_015510	CAGG	2	8	315097	315104	25 %	0 %	50 %	25 %	332662247
6245	NC_015510	CCAA	2	8	315254	315261	50 %	0 %	0 %	50 %	332662247
6246	NC_015510	ATTCA	2	10	315306	315315	40 %	40 %	0 %	20 %	332662247
6247	NC_015510	GAAGCC	2	12	315378	315389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662247
6248	NC_015510	TCT	2	6	315394	315399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662247
6249	NC_015510	TCA	2	6	315482	315487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662247
6250	NC_015510	AGC	2	6	315502	315507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662247
6251	NC_015510	A	7	7	315548	315554	100 %	0 %	0 %	0 %	332662247
6252	NC_015510	TGA	2	6	315573	315578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662247
6253	NC_015510	TAAC	2	8	315665	315672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6254	NC_015510	ACA	2	6	315676	315681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_015510	TCG	2	6	315735	315740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6256	NC_015510	GC	3	6	315809	315814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_015510	ATT	2	6	315837	315842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_015510	ACATC	2	10	315851	315860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6259	NC_015510	C	6	6	315860	315865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6260	NC_015510	A	8	8	315866	315873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_015510	TGC	2	6	315936	315941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662248
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6312	NC_015510	T	6	6	319200	319205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6313	NC_015510	T	6	6	319245	319250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6374	NC_015510	ATT	2	6	322082	322087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662255
6375	NC_015510	ATTT	2	8	322108	322115	25 %	75 %	0 %	0 %	332662255
6376	NC_015510	GTC	2	6	322211	322216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662255
6377	NC_015510	CT	3	6	322286	322291	0 %	50 %	0 %	50 %	332662255
6378	NC_015510	TCCTT	2	10	322341	322350	0 %	60 %	0 %	40 %	332662255
6379	NC_015510	GTT	3	9	322354	322362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662255
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6382	NC_015510	CTG	2	6	322406	322411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662255
6383	NC_015510	T	7	7	322418	322424	0 %	100 %	0 %	0 %	332662255
6384	NC_015510	CGC	2	6	322435	322440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662255
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6387	NC_015510	T	6	6	322559	322564	0 %	100 %	0 %	0 %	332662255
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6391	NC_015510	GTT	2	6	322693	322698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662255
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6410	NC_015510	CAT	2	6	323424	323429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662256
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6413	NC_015510	CAC	2	6	323484	323489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6414	NC_015510	CA	3	6	323505	323510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6415	NC_015510	A	6	6	323565	323570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6416	NC_015510	TGC	2	6	323603	323608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662257
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6453	NC_015510	A	6	6	325325	325330	100 %	0 %	0 %	0 %	332662257
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6462	NC_015510	ATG	2	6	325713	325718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662258
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6470	NC_015510	A	6	6	326311	326316	100 %	0 %	0 %	0 %	332662258
6471	NC_015510	TGGC	3	12	326334	326345	0 %	25 %	50 %	25 %	332662258
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6481	NC_015510	AATT	2	8	326807	326814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6482	NC_015510	TAT	2	6	326838	326843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6483	NC_015510	T	7	7	326921	326927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6484	NC_015510	ATAA	2	8	327010	327017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6485	NC_015510	T	7	7	327027	327033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6486	NC_015510	T	7	7	327074	327080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6487	NC_015510	TGCGG	2	10	327090	327099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6488	NC_015510	TTAC	2	8	327291	327298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6489	NC_015510	TTA	3	9	327310	327318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6490	NC_015510	CAG	2	6	327424	327429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662259
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6493	NC_015510	TAC	2	6	327551	327556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662259
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6495	NC_015510	TAT	2	6	327584	327589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662259
6496	NC_015510	AAC	2	6	327728	327733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662259
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6498	NC_015510	CAA	2	6	327956	327961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662259
6499	NC_015510	GGC	2	6	328067	328072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662259
6500	NC_015510	GCA	2	6	328113	328118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662259

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