MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 1635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	319774952
2	NC_014922	AATTT	2	10	1074	1083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014922	CAATT	2	10	1633	1642	40 %	40 %	0 %	20 %	319774953
4	NC_014922	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	319774954
5	NC_014922	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	319774955
6	NC_014922	TAAAA	2	10	4770	4779	80 %	20 %	0 %	0 %	319774956
7	NC_014922	TAAAA	2	10	6167	6176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014922	TTATT	2	10	12965	12974	20 %	80 %	0 %	0 %	319774963
9	NC_014922	TTTAG	2	10	16159	16168	20 %	60 %	20 %	0 %	319774965
10	NC_014922	GTCGT	2	10	16220	16229	0 %	40 %	40 %	20 %	319774965
11	NC_014922	ATCTT	2	10	18090	18099	20 %	60 %	0 %	20 %	319774967
12	NC_014922	TCAAG	2	10	20526	20535	40 %	20 %	20 %	20 %	319774968
13	NC_014922	CCGAT	2	10	20633	20642	20 %	20 %	20 %	40 %	319774968
14	NC_014922	AAAAC	2	10	21207	21216	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014922	ACCAA	2	10	22093	22102	60 %	0 %	0 %	40 %	319774970
16	NC_014922	CACAA	2	10	23556	23565	60 %	0 %	0 %	40 %	319774971
17	NC_014922	TTAAA	2	10	24363	24372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014922	AATAC	2	10	24980	24989	60 %	20 %	0 %	20 %	319774972
19	NC_014922	CAATT	2	10	29196	29205	40 %	40 %	0 %	20 %	319774975
20	NC_014922	AACAT	2	10	31233	31242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014922	AAAAT	2	10	35925	35934	80 %	20 %	0 %	0 %	319774983
22	NC_014922	TAAAC	2	10	36984	36993	60 %	20 %	0 %	20 %	319774984
23	NC_014922	TGTGG	2	10	38908	38917	0 %	40 %	60 %	0 %	319774985
24	NC_014922	CAATC	2	10	39292	39301	40 %	20 %	0 %	40 %	319774986
25	NC_014922	AATTA	2	10	39359	39368	60 %	40 %	0 %	0 %	319774986
26	NC_014922	AAGAA	2	10	39973	39982	80 %	0 %	20 %	0 %	319774987
27	NC_014922	TTACC	2	10	42737	42746	20 %	40 %	0 %	40 %	319774988
28	NC_014922	TGGTA	2	10	44288	44297	20 %	40 %	40 %	0 %	319774989
29	NC_014922	CCCCT	2	10	44570	44579	0 %	20 %	0 %	80 %	319774990
30	NC_014922	AATGC	2	10	46989	46998	40 %	20 %	20 %	20 %	319774993
31	NC_014922	ATTTT	2	10	48475	48484	20 %	80 %	0 %	0 %	319774995
32	NC_014922	GCCAA	2	10	49315	49324	40 %	0 %	20 %	40 %	319774995
33	NC_014922	TTCCA	2	10	49932	49941	20 %	40 %	0 %	40 %	319774996
34	NC_014922	AATCA	2	10	52039	52048	60 %	20 %	0 %	20 %	319774999
35	NC_014922	AATGC	2	10	52657	52666	40 %	20 %	20 %	20 %	319775000
36	NC_014922	CCTGC	2	10	52723	52732	0 %	20 %	20 %	60 %	319775000
37	NC_014922	GATTG	2	10	56475	56484	20 %	40 %	40 %	0 %	319775003
38	NC_014922	TCTGT	2	10	57412	57421	0 %	60 %	20 %	20 %	319775003
39	NC_014922	TTGCC	2	10	57862	57871	0 %	40 %	20 %	40 %	319775003
40	NC_014922	TAAAT	2	10	59091	59100	60 %	40 %	0 %	0 %	319775004
41	NC_014922	AATCC	2	10	59728	59737	40 %	20 %	0 %	40 %	319775004
42	NC_014922	ATTTT	2	10	63823	63832	20 %	80 %	0 %	0 %	319775009
43	NC_014922	TGAAA	2	10	68904	68913	60 %	20 %	20 %	0 %	319775012
44	NC_014922	ATGTT	2	10	70761	70770	20 %	60 %	20 %	0 %	319775012
45	NC_014922	TGCAG	2	10	71951	71960	20 %	20 %	40 %	20 %	319775013
46	NC_014922	ATTTA	2	10	72695	72704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014922	CAACG	2	10	75808	75817	40 %	0 %	20 %	40 %	319775018
48	NC_014922	TGGTG	2	10	76646	76655	0 %	40 %	60 %	0 %	319775018
49	NC_014922	AGAAA	2	10	77168	77177	80 %	0 %	20 %	0 %	319775018
50	NC_014922	GAAGA	2	10	77522	77531	60 %	0 %	40 %	0 %	319775018
51	NC_014922	ACATC	2	10	79636	79645	40 %	20 %	0 %	40 %	319775019
52	NC_014922	TTACA	2	10	80172	80181	40 %	40 %	0 %	20 %	319775020
53	NC_014922	TGATT	2	10	80962	80971	20 %	60 %	20 %	0 %	319775021
54	NC_014922	AATTT	2	10	81120	81129	40 %	60 %	0 %	0 %	319775021
55	NC_014922	CACAT	2	10	84262	84271	40 %	20 %	0 %	40 %	319775025
56	NC_014922	TAAAA	2	10	85523	85532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014922	AGTTA	2	10	86107	86116	40 %	40 %	20 %	0 %	319775026
58	NC_014922	ATGCC	2	10	89313	89322	20 %	20 %	20 %	40 %	319775028
59	NC_014922	TTTGA	2	10	90004	90013	20 %	60 %	20 %	0 %	319775028
60	NC_014922	AAATT	2	10	91433	91442	60 %	40 %	0 %	0 %	319775030
61	NC_014922	CTTGC	2	10	92346	92355	0 %	40 %	20 %	40 %	319775030
62	NC_014922	GCAAT	2	10	93040	93049	40 %	20 %	20 %	20 %	319775031
63	NC_014922	CCAAT	2	10	96478	96487	40 %	20 %	0 %	40 %	319775034
64	NC_014922	GTTTT	2	10	99607	99616	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014922	TACGC	2	10	102983	102992	20 %	20 %	20 %	40 %	319775039
66	NC_014922	GCAAA	2	10	103654	103663	60 %	0 %	20 %	20 %	319775040
67	NC_014922	TGCCT	2	10	103889	103898	0 %	40 %	20 %	40 %	319775040
68	NC_014922	TGTAA	2	10	106296	106305	40 %	40 %	20 %	0 %	319775043
69	NC_014922	GTGAT	2	10	108938	108947	20 %	40 %	40 %	0 %	319775045
70	NC_014922	TACTT	2	10	108978	108987	20 %	60 %	0 %	20 %	319775045
71	NC_014922	TTACC	2	10	109859	109868	20 %	40 %	0 %	40 %	319775045
72	NC_014922	CAAAC	2	10	110853	110862	60 %	0 %	0 %	40 %	319775045
73	NC_014922	GTAAT	2	10	112279	112288	40 %	40 %	20 %	0 %	319775046
74	NC_014922	GATTT	2	10	115733	115742	20 %	60 %	20 %	0 %	319775048
75	NC_014922	ATTTT	2	10	118834	118843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014922	AATAT	2	10	119399	119408	60 %	40 %	0 %	0 %	319775050
77	NC_014922	TTATG	2	10	119772	119781	20 %	60 %	20 %	0 %	319775050
78	NC_014922	TGTTC	2	10	120956	120965	0 %	60 %	20 %	20 %	319775052
79	NC_014922	AGGCT	2	10	121562	121571	20 %	20 %	40 %	20 %	319775052
80	NC_014922	TTGAT	2	10	122802	122811	20 %	60 %	20 %	0 %	319775054
81	NC_014922	TAAAA	2	10	123357	123366	80 %	20 %	0 %	0 %	319775054
82	NC_014922	TAAAC	2	10	125849	125858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014922	TATCT	2	10	127014	127023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014922	CCCCG	2	10	127620	127629	0 %	0 %	20 %	80 %	319775057
85	NC_014922	CAAGC	2	10	128952	128961	40 %	0 %	20 %	40 %	319775058
86	NC_014922	CAAAT	2	10	132454	132463	60 %	20 %	0 %	20 %	319775062
87	NC_014922	AATTT	2	10	132987	132996	40 %	60 %	0 %	0 %	319775063
88	NC_014922	AATAA	2	10	133054	133063	80 %	20 %	0 %	0 %	319775063
89	NC_014922	TAAAA	2	10	134013	134022	80 %	20 %	0 %	0 %	319775063
90	NC_014922	CAACC	2	10	138724	138733	40 %	0 %	0 %	60 %	319775066
91	NC_014922	TGAAT	2	10	139997	140006	40 %	40 %	20 %	0 %	319775068
92	NC_014922	AAATA	2	10	140735	140744	80 %	20 %	0 %	0 %	319775070
93	NC_014922	TACCC	2	10	141119	141128	20 %	20 %	0 %	60 %	319775070
94	NC_014922	TTGGT	2	10	143403	143412	0 %	60 %	40 %	0 %	319775071
95	NC_014922	CAGCC	2	10	146242	146251	20 %	0 %	20 %	60 %	319775072
96	NC_014922	GGCAT	2	10	146409	146418	20 %	20 %	40 %	20 %	319775072
97	NC_014922	GAAAT	2	10	146614	146623	60 %	20 %	20 %	0 %	319775072
98	NC_014922	ATCTC	2	10	147167	147176	20 %	40 %	0 %	40 %	319775073
99	NC_014922	TTACA	2	10	153417	153426	40 %	40 %	0 %	20 %	319775076
100	NC_014922	AGAAA	2	10	154294	154303	80 %	0 %	20 %	0 %	319775076
101	NC_014922	TTCTA	2	10	155489	155498	20 %	60 %	0 %	20 %	319775076
102	NC_014922	AAGTT	2	10	159314	159323	40 %	40 %	20 %	0 %	319775079
103	NC_014922	AGTTA	2	10	159704	159713	40 %	40 %	20 %	0 %	319775080
104	NC_014922	GTGCG	2	10	161118	161127	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014922	TGGGG	2	10	161755	161764	0 %	20 %	80 %	0 %	319775081
106	NC_014922	ACCAA	2	10	162224	162233	60 %	0 %	0 %	40 %	319775081
107	NC_014922	TCAAG	2	10	162402	162411	40 %	20 %	20 %	20 %	319775081
108	NC_014922	TTTAA	2	10	162648	162657	40 %	60 %	0 %	0 %	319775081
109	NC_014922	CAAGG	2	10	165076	165085	40 %	0 %	40 %	20 %	319775084
110	NC_014922	AGGCA	2	10	165580	165589	40 %	0 %	40 %	20 %	319775085
111	NC_014922	GTTAT	2	10	165603	165612	20 %	60 %	20 %	0 %	319775085
112	NC_014922	GCAAA	2	10	165747	165756	60 %	0 %	20 %	20 %	319775085
113	NC_014922	CTTTT	2	10	166535	166544	0 %	80 %	0 %	20 %	319775087
114	NC_014922	TCCAT	2	10	167784	167793	20 %	40 %	0 %	40 %	319775088
115	NC_014922	CTGTT	24	120	168468	168587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014922	AAAAG	2	10	172211	172220	80 %	0 %	20 %	0 %	319775091
117	NC_014922	ACGTG	2	10	173733	173742	20 %	20 %	40 %	20 %	319775093
118	NC_014922	TTGAA	2	10	175905	175914	40 %	40 %	20 %	0 %	319775096
119	NC_014922	TTTCA	2	10	176349	176358	20 %	60 %	0 %	20 %	319775096
120	NC_014922	CAGAA	2	10	177328	177337	60 %	0 %	20 %	20 %	319775097
121	NC_014922	CTCAT	2	10	178986	178995	20 %	40 %	0 %	40 %	319775100
122	NC_014922	AAAAT	2	10	181463	181472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014922	ATCTT	2	10	183769	183778	20 %	60 %	0 %	20 %	319775102
124	NC_014922	ACTTA	2	10	184828	184837	40 %	40 %	0 %	20 %	319775104
125	NC_014922	AAATT	2	10	185829	185838	60 %	40 %	0 %	0 %	319775105
126	NC_014922	ATTAA	2	10	186971	186980	60 %	40 %	0 %	0 %	319775106
127	NC_014922	TTCCA	2	10	189149	189158	20 %	40 %	0 %	40 %	319775109
128	NC_014922	TCTGT	2	10	191364	191373	0 %	60 %	20 %	20 %	319775112
129	NC_014922	CCACT	2	10	193095	193104	20 %	20 %	0 %	60 %	319775115
130	NC_014922	TAAAA	2	10	196601	196610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014922	TGAAG	2	10	198581	198590	40 %	20 %	40 %	0 %	319775120
132	NC_014922	CGCAT	2	10	202052	202061	20 %	20 %	20 %	40 %	319775123
133	NC_014922	TCGCA	2	10	202207	202216	20 %	20 %	20 %	40 %	319775123
134	NC_014922	TAGGT	2	10	203179	203188	20 %	40 %	40 %	0 %	319775123
135	NC_014922	TTTAT	3	15	207466	207480	20 %	80 %	0 %	0 %	319775129
136	NC_014922	TGGCG	2	10	208521	208530	0 %	20 %	60 %	20 %	319775129
137	NC_014922	AAGTG	2	10	208767	208776	40 %	20 %	40 %	0 %	319775129
138	NC_014922	TTTAC	2	10	210065	210074	20 %	60 %	0 %	20 %	319775131
139	NC_014922	TCAAA	2	10	213135	213144	60 %	20 %	0 %	20 %	319775133
140	NC_014922	AAAGG	2	10	213345	213354	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014922	ATTAA	2	10	217400	217409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014922	TTGGG	2	10	217970	217979	0 %	40 %	60 %	0 %	319775138
143	NC_014922	CAAGT	2	10	223959	223968	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014922	TATTT	2	10	224414	224423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014922	GTTGC	2	10	227985	227994	0 %	40 %	40 %	20 %	319775147
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147	NC_014922	AAAAT	2	10	228978	228987	80 %	20 %	0 %	0 %	319775148
148	NC_014922	ATTTT	2	10	230831	230840	20 %	80 %	0 %	0 %	319775150
149	NC_014922	ATTGG	2	10	231610	231619	20 %	40 %	40 %	0 %	319775150
150	NC_014922	TCGAT	2	10	232066	232075	20 %	40 %	20 %	20 %	319775151
151	NC_014922	AAAAC	2	10	232186	232195	80 %	0 %	0 %	20 %	319775151
152	NC_014922	TAATT	2	10	234291	234300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014922	AATCA	2	10	235061	235070	60 %	20 %	0 %	20 %	319775153
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155	NC_014922	TTTAC	2	10	236056	236065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014922	AATTA	2	10	238166	238175	60 %	40 %	0 %	0 %	319775156
157	NC_014922	TAAAA	2	10	238808	238817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014922	ACATC	2	10	242769	242778	40 %	20 %	0 %	40 %	319775159
159	NC_014922	GCAAA	2	10	244399	244408	60 %	0 %	20 %	20 %	319775160
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163	NC_014922	AATTG	2	10	250145	250154	40 %	40 %	20 %	0 %	319775168
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180	NC_014922	TAAAG	2	10	267363	267372	60 %	20 %	20 %	0 %	319775182
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195	NC_014922	TTAAC	2	10	285296	285305	40 %	40 %	0 %	20 %	319775200
196	NC_014922	TAAAA	2	10	285360	285369	80 %	20 %	0 %	0 %	319775200
197	NC_014922	GATAA	2	10	285373	285382	60 %	20 %	20 %	0 %	319775200
198	NC_014922	TAATA	2	10	285794	285803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014922	CATCG	2	10	286901	286910	20 %	20 %	20 %	40 %	319775201
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202	NC_014922	ACTGT	2	10	292569	292578	20 %	40 %	20 %	20 %	319775205
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232	NC_014922	TATTC	2	10	338546	338555	20 %	60 %	0 %	20 %	319775250
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249	NC_014922	AAGGA	2	10	365274	365283	60 %	0 %	40 %	0 %	319775285
250	NC_014922	TTTAA	2	10	365318	365327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014922	AATTA	2	10	369355	369364	60 %	40 %	0 %	0 %	319775292
252	NC_014922	GCATC	2	10	370368	370377	20 %	20 %	20 %	40 %	319775293
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254	NC_014922	TGTGC	2	10	373147	373156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
255	NC_014922	ATATA	2	10	373197	373206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014922	GCCCT	2	10	374152	374161	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
257	NC_014922	CATTT	2	10	376532	376541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_014922	AAAAG	2	10	379152	379161	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_014922	GTTTT	2	10	379575	379584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014922	TAATT	2	10	379639	379648	40 %	60 %	0 %	0 %	319775303
261	NC_014922	CATTC	2	10	380258	380267	20 %	40 %	0 %	40 %	319775303
262	NC_014922	GGCAG	2	10	381591	381600	20 %	0 %	60 %	20 %	319775304
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265	NC_014922	ATTTC	2	10	383670	383679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_014922	AACTT	2	10	384195	384204	40 %	40 %	0 %	20 %	319775307
267	NC_014922	CAAAC	2	10	384256	384265	60 %	0 %	0 %	40 %	319775307
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