MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 41978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014920	CTT	2	6	24211	24216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896441
502	NC_014920	CACAA	2	10	24233	24242	60 %	0 %	0 %	40 %	319896441
503	NC_014920	TATT	2	8	24252	24259	25 %	75 %	0 %	0 %	319896441
504	NC_014920	ACG	2	6	24354	24359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896441
505	NC_014920	CCA	2	6	24369	24374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896441
506	NC_014920	ATA	2	6	24426	24431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896441
507	NC_014920	CTT	2	6	24466	24471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896441
508	NC_014920	GCC	2	6	24485	24490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319896441
509	NC_014920	ATT	2	6	24512	24517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896441
510	NC_014920	TGG	2	6	24546	24551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896441
511	NC_014920	TAA	3	9	24593	24601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896441
512	NC_014920	CTT	2	6	24610	24615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896441
513	NC_014920	TAA	2	6	24650	24655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896441
514	NC_014920	ATTC	2	8	24682	24689	25 %	50 %	0 %	25 %	319896441
515	NC_014920	AAT	2	6	24757	24762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014920	TAAA	2	8	24767	24774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014920	A	7	7	24879	24885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014920	TTAAA	2	10	25039	25048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014920	AT	3	6	25079	25084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014920	ACT	2	6	25094	25099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014920	CTA	2	6	25104	25109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014920	A	6	6	25135	25140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014920	TAA	2	6	25169	25174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896442
524	NC_014920	CCA	2	6	25178	25183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896442
525	NC_014920	CCA	2	6	25244	25249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896442
526	NC_014920	ACC	2	6	25319	25324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896442
527	NC_014920	AGCA	2	8	25352	25359	50 %	0 %	25 %	25 %	319896442
528	NC_014920	AATA	2	8	25440	25447	75 %	25 %	0 %	0 %	319896442
529	NC_014920	CAT	2	6	25487	25492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896442
530	NC_014920	CAAG	2	8	25561	25568	50 %	0 %	25 %	25 %	319896442
531	NC_014920	GAT	2	6	25580	25585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896442
532	NC_014920	ACC	2	6	25586	25591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896442
533	NC_014920	AATAC	2	10	25656	25665	60 %	20 %	0 %	20 %	319896442
534	NC_014920	CAA	2	6	25687	25692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896442
535	NC_014920	AAT	2	6	25734	25739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896442
536	NC_014920	TTC	2	6	25793	25798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896442
537	NC_014920	T	6	6	25805	25810	0 %	100 %	0 %	0 %	319896442
538	NC_014920	TAT	2	6	25822	25827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896442
539	NC_014920	T	6	6	25832	25837	0 %	100 %	0 %	0 %	319896442
540	NC_014920	TGG	2	6	25844	25849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896442
541	NC_014920	ACC	2	6	26022	26027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896442
542	NC_014920	AT	3	6	26028	26033	50 %	50 %	0 %	0 %	319896442
543	NC_014920	TCA	3	9	26038	26046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896442
544	NC_014920	T	6	6	26060	26065	0 %	100 %	0 %	0 %	319896442
545	NC_014920	T	6	6	26071	26076	0 %	100 %	0 %	0 %	319896442
546	NC_014920	CG	3	6	26139	26144	0 %	0 %	50 %	50 %	319896442
547	NC_014920	TGT	2	6	26312	26317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896442
548	NC_014920	GAT	2	6	26384	26389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896442
549	NC_014920	AAAG	2	8	26499	26506	75 %	0 %	25 %	0 %	319896442
550	NC_014920	GTA	2	6	26521	26526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896442
551	NC_014920	ATTA	2	8	26588	26595	50 %	50 %	0 %	0 %	319896443
552	NC_014920	TAA	2	6	26628	26633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896443
553	NC_014920	ACC	2	6	26784	26789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896443
554	NC_014920	TCA	2	6	26878	26883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896443
555	NC_014920	CAA	2	6	26892	26897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896443
556	NC_014920	CAA	2	6	27041	27046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896443
557	NC_014920	T	6	6	27095	27100	0 %	100 %	0 %	0 %	319896443
558	NC_014920	AAT	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896443
559	NC_014920	AC	3	6	27126	27131	50 %	0 %	0 %	50 %	319896443
560	NC_014920	A	6	6	27143	27148	100 %	0 %	0 %	0 %	319896443
561	NC_014920	TAA	2	6	27204	27209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896443
562	NC_014920	AG	3	6	27228	27233	50 %	0 %	50 %	0 %	319896443
563	NC_014920	TCA	2	6	27260	27265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896443
564	NC_014920	A	7	7	27288	27294	100 %	0 %	0 %	0 %	319896443
565	NC_014920	AT	3	6	27433	27438	50 %	50 %	0 %	0 %	319896443
566	NC_014920	GA	3	6	27462	27467	50 %	0 %	50 %	0 %	319896443
567	NC_014920	TCA	2	6	27487	27492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896443
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569	NC_014920	ATC	2	6	27655	27660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896443
570	NC_014920	ACGG	2	8	27722	27729	25 %	0 %	50 %	25 %	319896443
571	NC_014920	CTG	2	6	27743	27748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896443
572	NC_014920	CAA	2	6	27810	27815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896443
573	NC_014920	T	9	9	27820	27828	0 %	100 %	0 %	0 %	319896443
574	NC_014920	CCAC	2	8	27832	27839	25 %	0 %	0 %	75 %	319896443
575	NC_014920	TGT	3	9	27889	27897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896443
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577	NC_014920	TGC	2	6	27979	27984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896443
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579	NC_014920	ATCA	2	8	28191	28198	50 %	25 %	0 %	25 %	319896444
580	NC_014920	AAC	2	6	28218	28223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896444
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583	NC_014920	TCAA	2	8	28336	28343	50 %	25 %	0 %	25 %	319896444
584	NC_014920	CCA	2	6	28433	28438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896444
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587	NC_014920	TAA	2	6	28728	28733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896444
588	NC_014920	T	6	6	28734	28739	0 %	100 %	0 %	0 %	319896444
589	NC_014920	CCA	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896444
590	NC_014920	ACG	2	6	28815	28820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896444
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592	NC_014920	TGC	2	6	28854	28859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896444
593	NC_014920	C	7	7	28859	28865	0 %	0 %	0 %	100 %	319896444
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596	NC_014920	GTG	2	6	29058	29063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896444
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598	NC_014920	AG	3	6	29137	29142	50 %	0 %	50 %	0 %	319896444
599	NC_014920	A	6	6	29206	29211	100 %	0 %	0 %	0 %	319896444
600	NC_014920	CCA	2	6	29257	29262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896444
601	NC_014920	GAAT	2	8	29266	29273	50 %	25 %	25 %	0 %	319896444
602	NC_014920	TTCA	2	8	29283	29290	25 %	50 %	0 %	25 %	319896444
603	NC_014920	GA	3	6	29300	29305	50 %	0 %	50 %	0 %	319896444
604	NC_014920	AGA	2	6	29334	29339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896444
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608	NC_014920	ATG	2	6	29493	29498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896444
609	NC_014920	CTT	2	6	29543	29548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896444
610	NC_014920	AG	3	6	29551	29556	50 %	0 %	50 %	0 %	319896444
611	NC_014920	GTT	2	6	29651	29656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896444
612	NC_014920	TTG	2	6	29660	29665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896444
613	NC_014920	AAT	2	6	29738	29743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896445
614	NC_014920	ACA	2	6	29775	29780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896445
615	NC_014920	AAT	2	6	29816	29821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896445
616	NC_014920	CAATT	2	10	29873	29882	40 %	40 %	0 %	20 %	319896445
617	NC_014920	TTAA	2	8	29925	29932	50 %	50 %	0 %	0 %	319896445
618	NC_014920	AAG	2	6	29946	29951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896445
619	NC_014920	CTT	2	6	29953	29958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896445
620	NC_014920	AAC	2	6	30028	30033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896445
621	NC_014920	TACG	2	8	30082	30089	25 %	25 %	25 %	25 %	319896445
622	NC_014920	AAGCGA	2	12	30130	30141	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319896445
623	NC_014920	TTGG	2	8	30143	30150	0 %	50 %	50 %	0 %	319896445
624	NC_014920	GGC	2	6	30179	30184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896445
625	NC_014920	GC	3	6	30265	30270	0 %	0 %	50 %	50 %	319896445
626	NC_014920	CGCA	2	8	30305	30312	25 %	0 %	25 %	50 %	319896445
627	NC_014920	TAA	2	6	30416	30421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896445
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629	NC_014920	TAAA	2	8	30489	30496	75 %	25 %	0 %	0 %	319896445
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631	NC_014920	TCA	2	6	30584	30589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896446
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