MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 41978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014920	ATTT	2	8	239205	239212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014920	ACA	2	6	239230	239235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896620
5003	NC_014920	TC	3	6	239246	239251	0 %	50 %	0 %	50 %	319896620
5004	NC_014920	CGG	2	6	239319	239324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896620
5005	NC_014920	TTA	2	6	239456	239461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896620
5006	NC_014920	CTG	2	6	239583	239588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896620
5007	NC_014920	GAA	2	6	239607	239612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896620
5008	NC_014920	TGG	2	6	239709	239714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896620
5009	NC_014920	T	6	6	239719	239724	0 %	100 %	0 %	0 %	319896620
5010	NC_014920	CTA	2	6	239730	239735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896620
5011	NC_014920	TTA	2	6	239741	239746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896620
5012	NC_014920	CAG	2	6	239760	239765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896620
5013	NC_014920	TTAT	2	8	239809	239816	25 %	75 %	0 %	0 %	319896620
5014	NC_014920	GTC	2	6	239898	239903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896620
5015	NC_014920	TGA	2	6	239907	239912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896620
5016	NC_014920	GGC	2	6	240020	240025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896620
5017	NC_014920	ATT	2	6	240037	240042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896620
5018	NC_014920	AT	3	6	240058	240063	50 %	50 %	0 %	0 %	319896620
5019	NC_014920	ACA	2	6	240206	240211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896620
5020	NC_014920	T	6	6	240220	240225	0 %	100 %	0 %	0 %	319896620
5021	NC_014920	ATT	2	6	240232	240237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896620
5022	NC_014920	GGC	2	6	240292	240297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896620
5023	NC_014920	CTT	2	6	240326	240331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896620
5024	NC_014920	AAGC	2	8	240336	240343	50 %	0 %	25 %	25 %	319896620
5025	NC_014920	CAAG	2	8	240359	240366	50 %	0 %	25 %	25 %	319896620
5026	NC_014920	CGG	2	6	240379	240384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896620
5027	NC_014920	ATT	2	6	240409	240414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896620
5028	NC_014920	GGTT	2	8	240455	240462	0 %	50 %	50 %	0 %	319896620
5029	NC_014920	TAAATT	2	12	240493	240504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014920	ATT	2	6	240574	240579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014920	TTA	2	6	240587	240592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896621
5032	NC_014920	AAT	2	6	240599	240604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896621
5033	NC_014920	TGG	2	6	240709	240714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896621
5034	NC_014920	GCG	2	6	240716	240721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896621
5035	NC_014920	ATTG	2	8	240740	240747	25 %	50 %	25 %	0 %	319896621
5036	NC_014920	ACTTGA	2	12	240786	240797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319896621
5037	NC_014920	GCC	2	6	240903	240908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319896621
5038	NC_014920	ATC	2	6	240990	240995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896621
5039	NC_014920	TAA	2	6	241004	241009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896621
5040	NC_014920	AAT	2	6	241076	241081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896621
5041	NC_014920	CGCA	2	8	241084	241091	25 %	0 %	25 %	50 %	319896621
5042	NC_014920	CTG	2	6	241123	241128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896621
5043	NC_014920	TTC	2	6	241133	241138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896621
5044	NC_014920	TTGC	2	8	241207	241214	0 %	50 %	25 %	25 %	319896621
5045	NC_014920	ACG	2	6	241238	241243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896621
5046	NC_014920	TG	3	6	241277	241282	0 %	50 %	50 %	0 %	319896621
5047	NC_014920	T	7	7	241467	241473	0 %	100 %	0 %	0 %	319896621
5048	NC_014920	ACC	3	9	241508	241516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896621
5049	NC_014920	AAT	2	6	241522	241527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896621
5050	NC_014920	TCA	2	6	241557	241562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896621
5051	NC_014920	A	6	6	241599	241604	100 %	0 %	0 %	0 %	319896621
5052	NC_014920	ATT	2	6	241622	241627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896621
5053	NC_014920	GTTT	2	8	241680	241687	0 %	75 %	25 %	0 %	319896621
5054	NC_014920	ATA	2	6	241755	241760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896621
5055	NC_014920	AGT	2	6	241829	241834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896621
5056	NC_014920	GTC	2	6	241862	241867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896621
5057	NC_014920	GACC	2	8	241894	241901	25 %	0 %	25 %	50 %	319896621
5058	NC_014920	TAA	2	6	241995	242000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896622
5059	NC_014920	AAC	2	6	242007	242012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896622
5060	NC_014920	ATC	2	6	242125	242130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896622
5061	NC_014920	GCC	2	6	242142	242147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319896622
5062	NC_014920	TAA	2	6	242180	242185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896622
5063	NC_014920	TAA	2	6	242205	242210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896622
5064	NC_014920	GAA	2	6	242211	242216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896622
5065	NC_014920	T	6	6	242238	242243	0 %	100 %	0 %	0 %	319896622
5066	NC_014920	GAA	2	6	242316	242321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896622
5067	NC_014920	CAA	2	6	242345	242350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896622
5068	NC_014920	AT	3	6	242368	242373	50 %	50 %	0 %	0 %	319896622
5069	NC_014920	AAGA	2	8	242395	242402	75 %	0 %	25 %	0 %	319896622
5070	NC_014920	TGC	2	6	242427	242432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896622
5071	NC_014920	TTC	2	6	242439	242444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896622
5072	NC_014920	GAA	2	6	242475	242480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896622
5073	NC_014920	GTT	2	6	242647	242652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896622
5074	NC_014920	CTG	2	6	242663	242668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896622
5075	NC_014920	ATA	2	6	242681	242686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896622
5076	NC_014920	AGAA	2	8	242718	242725	75 %	0 %	25 %	0 %	319896622
5077	NC_014920	AG	3	6	242829	242834	50 %	0 %	50 %	0 %	319896622
5078	NC_014920	ATGCC	2	10	242852	242861	20 %	20 %	20 %	40 %	319896622
5079	NC_014920	TACCGT	2	12	242900	242911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319896622
5080	NC_014920	A	6	6	242938	242943	100 %	0 %	0 %	0 %	319896622
5081	NC_014920	TAA	2	6	242954	242959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896622
5082	NC_014920	TTC	2	6	242985	242990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896622
5083	NC_014920	ACT	2	6	242992	242997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896622
5084	NC_014920	T	6	6	243019	243024	0 %	100 %	0 %	0 %	319896622
5085	NC_014920	CGA	2	6	243077	243082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896622
5086	NC_014920	CCG	2	6	243158	243163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319896622
5087	NC_014920	TAT	2	6	243303	243308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014920	T	7	7	243369	243375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014920	A	7	7	243403	243409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_014920	GAC	2	6	243420	243425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_014920	AAAT	2	8	243441	243448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014920	T	6	6	243465	243470	0 %	100 %	0 %	0 %	319896623
5093	NC_014920	TCA	2	6	243485	243490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896623
5094	NC_014920	AGC	2	6	243516	243521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896623
5095	NC_014920	A	6	6	243591	243596	100 %	0 %	0 %	0 %	319896623
5096	NC_014920	TTTG	2	8	243602	243609	0 %	75 %	25 %	0 %	319896623
5097	NC_014920	CAT	2	6	243758	243763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896623
5098	NC_014920	CCA	2	6	243847	243852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896623
5099	NC_014920	TTG	2	6	243900	243905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896623
5100	NC_014920	TGT	3	9	243937	243945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896623
5101	NC_014920	T	6	6	243973	243978	0 %	100 %	0 %	0 %	319896623
5102	NC_014920	AAT	2	6	244088	244093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896623
5103	NC_014920	A	6	6	244166	244171	100 %	0 %	0 %	0 %	319896623
5104	NC_014920	T	6	6	244193	244198	0 %	100 %	0 %	0 %	319896623
5105	NC_014920	GGT	2	6	244232	244237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896623
5106	NC_014920	CTG	2	6	244253	244258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896623
5107	NC_014920	TCT	2	6	244276	244281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896623
5108	NC_014920	TCC	2	6	244387	244392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319896623
5109	NC_014920	TGC	2	6	244395	244400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896623
5110	NC_014920	ACCA	2	8	244443	244450	50 %	0 %	0 %	50 %	319896623
5111	NC_014920	GCAA	2	8	244488	244495	50 %	0 %	25 %	25 %	319896623
5112	NC_014920	AC	3	6	244529	244534	50 %	0 %	0 %	50 %	319896623
5113	NC_014920	TCA	2	6	244670	244675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896623
5114	NC_014920	GATA	2	8	244715	244722	50 %	25 %	25 %	0 %	319896623
5115	NC_014920	TCT	2	6	244777	244782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896623
5116	NC_014920	TCA	2	6	244810	244815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896623
5117	NC_014920	CCAT	2	8	244818	244825	25 %	25 %	0 %	50 %	319896623
5118	NC_014920	ATT	2	6	244837	244842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896623
5119	NC_014920	T	6	6	244947	244952	0 %	100 %	0 %	0 %	319896623
5120	NC_014920	CAC	2	6	245171	245176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896623
5121	NC_014920	TAC	2	6	245180	245185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896623
5122	NC_014920	AATGG	2	10	245203	245212	40 %	20 %	40 %	0 %	319896623
5123	NC_014920	TGCT	2	8	245231	245238	0 %	50 %	25 %	25 %	319896623
5124	NC_014920	CGG	2	6	245256	245261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896623
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5250	NC_014920	TTTC	2	8	250666	250673	0 %	75 %	0 %	25 %	319896631
5251	NC_014920	TTA	2	6	250816	250821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896631
5252	NC_014920	AGT	2	6	250875	250880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896631
5253	NC_014920	CTG	2	6	250901	250906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896631
5254	NC_014920	GTT	2	6	250915	250920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896631
5255	NC_014920	CAT	2	6	250945	250950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896631
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5271	NC_014920	TAAG	2	8	251653	251660	50 %	25 %	25 %	0 %	319896631
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5300	NC_014920	A	7	7	252575	252581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_014920	A	6	6	252584	252589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5312	NC_014920	TAT	2	6	253185	253190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5314	NC_014920	ACA	2	6	253281	253286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5317	NC_014920	TTC	2	6	253403	253408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5319	NC_014920	TATT	2	8	253471	253478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5320	NC_014920	TGT	2	6	253606	253611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5321	NC_014920	T	8	8	253718	253725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5322	NC_014920	ACG	2	6	253779	253784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896634
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5324	NC_014920	A	6	6	253817	253822	100 %	0 %	0 %	0 %	319896634
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5327	NC_014920	A	6	6	253867	253872	100 %	0 %	0 %	0 %	319896634
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5343	NC_014920	TGA	2	6	254440	254445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896634
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5351	NC_014920	TTATT	2	10	254714	254723	20 %	80 %	0 %	0 %	319896635
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5355	NC_014920	TGG	2	6	254921	254926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896635
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5358	NC_014920	ATT	2	6	255403	255408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896635
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5360	NC_014920	T	6	6	255522	255527	0 %	100 %	0 %	0 %	319896635
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5363	NC_014920	ACT	2	6	255627	255632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896635
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5369	NC_014920	ATG	2	6	255913	255918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896635
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5371	NC_014920	CAA	2	6	256006	256011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896635
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5373	NC_014920	AAGGT	2	10	256042	256051	40 %	20 %	40 %	0 %	319896635
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5495	NC_014920	AGTT	2	8	261473	261480	25 %	50 %	25 %	0 %	319896642
5496	NC_014920	ACA	2	6	261507	261512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896642
5497	NC_014920	GTG	2	6	261517	261522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896642
5498	NC_014920	GAA	2	6	261568	261573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896642
5499	NC_014920	GCT	2	6	261574	261579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896642
5500	NC_014920	GTC	2	6	261608	261613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896642

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