MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR05

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014737	TTTTCT	2	12	216	227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014737	TCTTCC	2	12	1697	1708	0 %	50 %	0 %	50 %	313122741
3	NC_014737	CTCTTC	2	12	2496	2507	0 %	50 %	0 %	50 %	313122742
4	NC_014737	GACGGT	2	12	2847	2858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	313122742
5	NC_014737	CTCGAC	2	12	3932	3943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313122743
6	NC_014737	AGTCGA	2	12	4183	4194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313122743
7	NC_014737	GCGAAC	2	12	5804	5815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
8	NC_014737	ATCGTC	2	12	7666	7677	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313122747
9	NC_014737	GACCTC	2	12	7738	7749	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313122747
10	NC_014737	CGGGTC	2	12	8448	8459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313122747
11	NC_014737	TCGACA	2	12	9622	9633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122748
12	NC_014737	GACCGC	2	12	10032	10043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	313122748
13	NC_014737	TCGAGA	2	12	11815	11826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313122750
14	NC_014737	GCTTCG	2	12	12451	12462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122751
15	NC_014737	AAGGCT	2	12	16484	16495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313122759
16	NC_014737	CGAGGA	2	12	16546	16557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313122759
17	NC_014737	ACCGAC	2	12	17246	17257	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	313122762

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.