MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR05

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014737	TAC	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014737	TCT	3	9	225	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014737	GCT	2	6	317	322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014737	AGG	2	6	374	379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014737	GCC	2	6	534	539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122740
6	NC_014737	ATG	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122740
7	NC_014737	TCC	2	6	615	620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122740
8	NC_014737	CGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
9	NC_014737	TCG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
10	NC_014737	CGG	2	6	705	710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122740
11	NC_014737	ATC	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122740
12	NC_014737	CAG	2	6	783	788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
13	NC_014737	GAG	2	6	794	799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122740
14	NC_014737	TCG	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
15	NC_014737	TCG	2	6	864	869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
16	NC_014737	ATG	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122740
17	NC_014737	GAC	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
18	NC_014737	GTG	2	6	887	892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122740
19	NC_014737	ACC	2	6	928	933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122740
20	NC_014737	GTC	2	6	947	952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
21	NC_014737	CGT	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
22	NC_014737	GAC	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
23	NC_014737	AGG	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122740
24	NC_014737	GAC	2	6	1100	1105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
25	NC_014737	TCC	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122740
26	NC_014737	GTT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122740
27	NC_014737	CGG	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122740
28	NC_014737	CCG	2	6	1359	1364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122740
29	NC_014737	GAT	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122740
30	NC_014737	CTT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122740
31	NC_014737	GTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
32	NC_014737	CGT	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
33	NC_014737	GGT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122740
34	NC_014737	CGA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
35	NC_014737	CGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
36	NC_014737	AGG	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122741
37	NC_014737	TGA	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122741
38	NC_014737	ACG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
39	NC_014737	GAG	2	6	1954	1959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122741
40	NC_014737	CTC	3	9	1960	1968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122741
41	NC_014737	CTC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122741
42	NC_014737	TTC	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122741
43	NC_014737	AGG	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122741
44	NC_014737	TCG	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
45	NC_014737	CGA	2	6	2235	2240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
46	NC_014737	CGA	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
47	NC_014737	TCG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
48	NC_014737	CCT	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122741
49	NC_014737	CAG	2	6	2338	2343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
50	NC_014737	GAC	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
51	NC_014737	GTC	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
52	NC_014737	GTC	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
53	NC_014737	GCA	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122742
54	NC_014737	AAC	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122742
55	NC_014737	TCG	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
56	NC_014737	CCT	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122742
57	NC_014737	GAG	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122742
58	NC_014737	CTC	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122742
59	NC_014737	TCG	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
60	NC_014737	GTC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
61	NC_014737	GTC	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
62	NC_014737	CCA	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122742
63	NC_014737	CGG	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122742
64	NC_014737	CTG	2	6	3060	3065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
65	NC_014737	CGT	2	6	3074	3079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
66	NC_014737	AGA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122742
67	NC_014737	TCG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
68	NC_014737	CTC	3	9	3180	3188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122742
69	NC_014737	GCT	2	6	3240	3245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
70	NC_014737	CAG	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122743
71	NC_014737	AGG	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122743
72	NC_014737	GTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
73	NC_014737	TCG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
74	NC_014737	GTA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122743
75	NC_014737	GAT	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122743
76	NC_014737	CGT	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
77	NC_014737	CTC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
78	NC_014737	GTC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
79	NC_014737	CAT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122743
80	NC_014737	TCG	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
81	NC_014737	CAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122743
82	NC_014737	GCC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122743
83	NC_014737	CAT	3	9	3812	3820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122743
84	NC_014737	TCG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
85	NC_014737	CTC	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
86	NC_014737	CTC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
87	NC_014737	TCC	2	6	3912	3917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
88	NC_014737	CGT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
89	NC_014737	TTC	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122743
90	NC_014737	TCC	2	6	4371	4376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
91	NC_014737	GGT	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122743
92	NC_014737	GGT	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014737	GGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014737	GAC	2	6	4859	4864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122744
95	NC_014737	CCG	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122744
96	NC_014737	CCG	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122744
97	NC_014737	GAA	2	6	4955	4960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122744
98	NC_014737	GTG	2	6	5058	5063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122744
99	NC_014737	TCG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122745
100	NC_014737	CGG	2	6	5124	5129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122745
101	NC_014737	CGT	3	9	5160	5168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122745
102	NC_014737	CGC	2	6	5181	5186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122745
103	NC_014737	CTG	2	6	5187	5192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122745
104	NC_014737	GCT	2	6	5194	5199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122745
105	NC_014737	GGT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014737	CGT	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014737	ACG	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014737	CAT	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014737	CGA	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014737	CCA	2	6	5576	5581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014737	CGA	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014737	CGA	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
113	NC_014737	CTC	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122746
114	NC_014737	CGA	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
115	NC_014737	CTC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122746
116	NC_014737	GCC	2	6	5771	5776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122746
117	NC_014737	GAC	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
118	NC_014737	CGA	2	6	5929	5934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
119	NC_014737	AGC	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
120	NC_014737	AGG	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122746
121	NC_014737	GTC	2	6	5966	5971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122746
122	NC_014737	AGG	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122746
123	NC_014737	ACT	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122746
124	NC_014737	TCA	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122746
125	NC_014737	TCC	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122746
126	NC_014737	CAC	2	6	6339	6344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122746
127	NC_014737	CGA	3	9	6349	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
128	NC_014737	GCC	2	6	6365	6370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122746
129	NC_014737	CGG	2	6	6376	6381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122746
130	NC_014737	CCG	2	6	6579	6584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122746
131	NC_014737	TCG	2	6	6588	6593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122746
132	NC_014737	CCG	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122746
133	NC_014737	GGC	2	6	6619	6624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122746
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139	NC_014737	ACG	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
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144	NC_014737	GAC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122746
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148	NC_014737	CGG	2	6	7052	7057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122747
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157	NC_014737	AGG	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122747
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161	NC_014737	ACG	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122747
162	NC_014737	TTC	2	6	7729	7734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122747
163	NC_014737	TCC	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122747
164	NC_014737	GAG	2	6	7981	7986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122747
165	NC_014737	GCC	2	6	8044	8049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122747
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203	NC_014737	CGA	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122748
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212	NC_014737	ACT	2	6	10105	10110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122748
213	NC_014737	TCT	3	9	10140	10148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
214	NC_014737	TCC	2	6	10166	10171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
215	NC_014737	ACT	2	6	10296	10301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
216	NC_014737	GAG	2	6	10324	10329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
217	NC_014737	ACC	2	6	10399	10404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
218	NC_014737	GCC	2	6	10471	10476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
219	NC_014737	CAA	2	6	10644	10649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122749
220	NC_014737	GCC	2	6	10717	10722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122749
221	NC_014737	CTC	2	6	10762	10767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122749
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223	NC_014737	CGA	3	9	10824	10832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122749
224	NC_014737	GAA	2	6	10911	10916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122749
225	NC_014737	CAC	2	6	10978	10983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122749
226	NC_014737	TCC	2	6	11027	11032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122749
227	NC_014737	ACT	2	6	11036	11041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122749
228	NC_014737	AGG	2	6	11061	11066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122749
229	NC_014737	ACT	2	6	11081	11086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122749
230	NC_014737	CTC	2	6	11217	11222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122749
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232	NC_014737	GAC	2	6	11323	11328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122750
233	NC_014737	AGC	2	6	11362	11367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122750
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235	NC_014737	CTG	2	6	11424	11429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122750
236	NC_014737	GTC	2	6	11484	11489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122750
237	NC_014737	GAC	2	6	11553	11558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122750
238	NC_014737	CGA	2	6	11639	11644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122750
239	NC_014737	CGT	2	6	11648	11653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122750
240	NC_014737	ACT	2	6	11668	11673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122750
241	NC_014737	TCG	2	6	11882	11887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122750
242	NC_014737	TCG	2	6	11899	11904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122750
243	NC_014737	ACG	2	6	12004	12009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122750
244	NC_014737	TCA	2	6	12016	12021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122750
245	NC_014737	CGA	2	6	12031	12036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122750
246	NC_014737	TCG	2	6	12064	12069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122750
247	NC_014737	ACA	2	6	12172	12177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_014737	GTT	2	6	12200	12205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014737	GTC	2	6	12378	12383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122751
250	NC_014737	CGT	2	6	12404	12409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122751
251	NC_014737	TCC	2	6	12433	12438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122751
252	NC_014737	GCT	2	6	12440	12445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122751
253	NC_014737	GCA	2	6	12469	12474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122751
254	NC_014737	CGG	2	6	12561	12566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122751
255	NC_014737	TCC	2	6	12589	12594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122751
256	NC_014737	GTC	2	6	12606	12611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122751
257	NC_014737	ACG	2	6	12655	12660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122751
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.