MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	CGAG	2	8	677	684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014736	TGGA	2	8	967	974	25 %	25 %	50 %	0 %	313122550
3	NC_014736	GAGC	2	8	2300	2307	25 %	0 %	50 %	25 %	313122550
4	NC_014736	GGAC	2	8	2989	2996	25 %	0 %	50 %	25 %	313122551
5	NC_014736	TCCG	2	8	4066	4073	0 %	25 %	25 %	50 %	313122553
6	NC_014736	TTGC	2	8	4907	4914	0 %	50 %	25 %	25 %	313122554
7	NC_014736	TGGC	2	8	5523	5530	0 %	25 %	50 %	25 %	313122554
8	NC_014736	AGTG	2	8	6187	6194	25 %	25 %	50 %	0 %	313122555
9	NC_014736	CTGT	2	8	6923	6930	0 %	50 %	25 %	25 %	313122556
10	NC_014736	GTCA	2	8	8024	8031	25 %	25 %	25 %	25 %	313122556
11	NC_014736	GCGA	2	8	8903	8910	25 %	0 %	50 %	25 %	313122557
12	NC_014736	GATC	2	8	9021	9028	25 %	25 %	25 %	25 %	313122557
13	NC_014736	GACC	2	8	9108	9115	25 %	0 %	25 %	50 %	313122557
14	NC_014736	GTCG	2	8	9328	9335	0 %	25 %	50 %	25 %	313122557
15	NC_014736	GTAC	2	8	9475	9482	25 %	25 %	25 %	25 %	313122557
16	NC_014736	GCCA	2	8	9787	9794	25 %	0 %	25 %	50 %	313122558
17	NC_014736	TCGC	2	8	10380	10387	0 %	25 %	25 %	50 %	313122558
18	NC_014736	CGTG	2	8	10401	10408	0 %	25 %	50 %	25 %	313122558
19	NC_014736	GTCG	2	8	11336	11343	0 %	25 %	50 %	25 %	313122559
20	NC_014736	CTTT	2	8	11594	11601	0 %	75 %	0 %	25 %	313122559
21	NC_014736	CAGT	2	8	12694	12701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014736	GACC	2	8	12935	12942	25 %	0 %	25 %	50 %	313122560
23	NC_014736	CGCT	2	8	13960	13967	0 %	25 %	25 %	50 %	313122560
24	NC_014736	GATC	2	8	13994	14001	25 %	25 %	25 %	25 %	313122560
25	NC_014736	ACCG	2	8	14228	14235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014736	CTGT	2	8	14429	14436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014736	CTGT	2	8	14442	14449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014736	ACTA	2	8	14463	14470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014736	ACTC	2	8	14532	14539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014736	TCAC	2	8	14579	14586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014736	TAAC	2	8	14779	14786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014736	ATGG	2	8	14986	14993	25 %	25 %	50 %	0 %	313122561
33	NC_014736	AGCG	2	8	15748	15755	25 %	0 %	50 %	25 %	313122562
34	NC_014736	AGCC	2	8	15914	15921	25 %	0 %	25 %	50 %	313122562
35	NC_014736	GAAC	2	8	16506	16513	50 %	0 %	25 %	25 %	313122562
36	NC_014736	GACT	2	8	16738	16745	25 %	25 %	25 %	25 %	313122562
37	NC_014736	GGGT	2	8	16918	16925	0 %	25 %	75 %	0 %	313122562
38	NC_014736	TGGG	2	8	16998	17005	0 %	25 %	75 %	0 %	313122562
39	NC_014736	CCTC	3	12	17856	17867	0 %	25 %	0 %	75 %	313122563
40	NC_014736	ACGT	2	8	17938	17945	25 %	25 %	25 %	25 %	313122563
41	NC_014736	CAGC	2	8	18100	18107	25 %	0 %	25 %	50 %	313122563
42	NC_014736	ACGT	2	8	18462	18469	25 %	25 %	25 %	25 %	313122564
43	NC_014736	GTCA	2	8	18746	18753	25 %	25 %	25 %	25 %	313122564
44	NC_014736	GACT	2	8	19942	19949	25 %	25 %	25 %	25 %	313122565
45	NC_014736	ACGT	2	8	19992	19999	25 %	25 %	25 %	25 %	313122565
46	NC_014736	ACCA	2	8	20320	20327	50 %	0 %	0 %	50 %	313122566
47	NC_014736	GGTG	2	8	20445	20452	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014736	TGAT	2	8	20955	20962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014736	TACT	2	8	21271	21278	25 %	50 %	0 %	25 %	313122568
50	NC_014736	ATCC	2	8	21321	21328	25 %	25 %	0 %	50 %	313122568
51	NC_014736	CCTC	2	8	21468	21475	0 %	25 %	0 %	75 %	313122569
52	NC_014736	TGAG	2	8	21595	21602	25 %	25 %	50 %	0 %	313122569
53	NC_014736	GAAC	2	8	21656	21663	50 %	0 %	25 %	25 %	313122569
54	NC_014736	GCCA	2	8	22587	22594	25 %	0 %	25 %	50 %	313122570
55	NC_014736	CTAT	2	8	23370	23377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014736	GCCC	2	8	23573	23580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_014736	GGTC	2	8	23696	23703	0 %	25 %	50 %	25 %	313122571
58	NC_014736	TCGG	2	8	23921	23928	0 %	25 %	50 %	25 %	313122571
59	NC_014736	CCGC	2	8	23940	23947	0 %	0 %	25 %	75 %	313122571
60	NC_014736	AACG	2	8	24810	24817	50 %	0 %	25 %	25 %	313122572
61	NC_014736	TCGG	2	8	24897	24904	0 %	25 %	50 %	25 %	313122572
62	NC_014736	ACTG	2	8	24948	24955	25 %	25 %	25 %	25 %	313122572
63	NC_014736	ACCC	2	8	24994	25001	25 %	0 %	0 %	75 %	313122572
64	NC_014736	TGCT	2	8	25260	25267	0 %	50 %	25 %	25 %	313122572
65	NC_014736	AAAT	2	8	25326	25333	75 %	25 %	0 %	0 %	313122572
66	NC_014736	GGTA	2	8	25366	25373	25 %	25 %	50 %	0 %	313122572
67	NC_014736	CGGA	2	8	25513	25520	25 %	0 %	50 %	25 %	313122572
68	NC_014736	CTGG	2	8	25961	25968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014736	TCGG	2	8	26201	26208	0 %	25 %	50 %	25 %	313122573
70	NC_014736	TGGC	2	8	26428	26435	0 %	25 %	50 %	25 %	313122573
71	NC_014736	CATT	2	8	26582	26589	25 %	50 %	0 %	25 %	313122573
72	NC_014736	ATCT	2	8	26641	26648	25 %	50 %	0 %	25 %	313122573
73	NC_014736	TGTC	2	8	27377	27384	0 %	50 %	25 %	25 %	313122574
74	NC_014736	CGCC	2	8	27707	27714	0 %	0 %	25 %	75 %	313122574
75	NC_014736	GTCT	2	8	27951	27958	0 %	50 %	25 %	25 %	313122574
76	NC_014736	CGAG	2	8	27982	27989	25 %	0 %	50 %	25 %	313122574
77	NC_014736	CAAC	2	8	28016	28023	50 %	0 %	0 %	50 %	313122574
78	NC_014736	TGCC	2	8	28131	28138	0 %	25 %	25 %	50 %	313122574
79	NC_014736	TTGG	2	8	28394	28401	0 %	50 %	50 %	0 %	313122574
80	NC_014736	ATAA	2	8	28444	28451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014736	GTCG	2	8	29171	29178	0 %	25 %	50 %	25 %	313122575
82	NC_014736	CAGC	2	8	29380	29387	25 %	0 %	25 %	50 %	313122575
83	NC_014736	CGAC	2	8	29664	29671	25 %	0 %	25 %	50 %	313122576
84	NC_014736	CAGT	2	8	29980	29987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014736	TTTG	2	8	30929	30936	0 %	75 %	25 %	0 %	313122577
86	NC_014736	AAAG	2	8	31467	31474	75 %	0 %	25 %	0 %	313122577
87	NC_014736	GTCG	2	8	31510	31517	0 %	25 %	50 %	25 %	313122577
88	NC_014736	GACC	2	8	31977	31984	25 %	0 %	25 %	50 %	313122577
89	NC_014736	AGCA	2	8	32349	32356	50 %	0 %	25 %	25 %	313122578
90	NC_014736	CGAG	2	8	32572	32579	25 %	0 %	50 %	25 %	313122578
91	NC_014736	CTGA	2	8	32775	32782	25 %	25 %	25 %	25 %	313122578
92	NC_014736	CGAT	2	8	32789	32796	25 %	25 %	25 %	25 %	313122578
93	NC_014736	AACG	2	8	33267	33274	50 %	0 %	25 %	25 %	313122578
94	NC_014736	CGAG	2	8	33845	33852	25 %	0 %	50 %	25 %	313122578
95	NC_014736	CCGG	2	8	34055	34062	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
96	NC_014736	TCGT	2	8	34172	34179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014736	ATCT	2	8	34252	34259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014736	AGCC	2	8	34260	34267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014736	GCCC	2	8	35472	35479	0 %	0 %	25 %	75 %	313122580
100	NC_014736	CGCC	2	8	36428	36435	0 %	0 %	25 %	75 %	313122580
101	NC_014736	TCCC	2	8	36474	36481	0 %	25 %	0 %	75 %	313122580
102	NC_014736	CGAA	2	8	37386	37393	50 %	0 %	25 %	25 %	313122581
103	NC_014736	CCGG	2	8	37755	37762	0 %	0 %	50 %	50 %	313122581
104	NC_014736	CGAA	2	8	38503	38510	50 %	0 %	25 %	25 %	313122582
105	NC_014736	GACC	2	8	38718	38725	25 %	0 %	25 %	50 %	313122582
106	NC_014736	CCGA	2	8	39784	39791	25 %	0 %	25 %	50 %	313122582
107	NC_014736	CGCT	2	8	39915	39922	0 %	25 %	25 %	50 %	313122583
108	NC_014736	CCGG	2	8	39944	39951	0 %	0 %	50 %	50 %	313122583
109	NC_014736	CTCA	2	8	40064	40071	25 %	25 %	0 %	50 %	313122583
110	NC_014736	GGGA	2	8	40357	40364	25 %	0 %	75 %	0 %	313122583
111	NC_014736	CGAG	2	8	40804	40811	25 %	0 %	50 %	25 %	313122583
112	NC_014736	ACTC	2	8	40815	40822	25 %	25 %	0 %	50 %	313122583
113	NC_014736	GTTC	2	8	41877	41884	0 %	50 %	25 %	25 %	313122584
114	NC_014736	GCGT	2	8	42015	42022	0 %	25 %	50 %	25 %	313122584
115	NC_014736	GGCA	2	8	42218	42225	25 %	0 %	50 %	25 %	313122584
116	NC_014736	GATC	2	8	42272	42279	25 %	25 %	25 %	25 %	313122584
117	NC_014736	CCGC	2	8	43111	43118	0 %	0 %	25 %	75 %	313122584
118	NC_014736	GTCT	2	8	43227	43234	0 %	50 %	25 %	25 %	313122584
119	NC_014736	CGGA	2	8	43279	43286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014736	CGTG	2	8	43695	43702	0 %	25 %	50 %	25 %	313122585
121	NC_014736	GTTC	2	8	43917	43924	0 %	50 %	25 %	25 %	313122585
122	NC_014736	ACCG	2	8	44117	44124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014736	TCCA	2	8	44184	44191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014736	CTGA	2	8	44906	44913	25 %	25 %	25 %	25 %	313122586
125	NC_014736	CATC	2	8	45039	45046	25 %	25 %	0 %	50 %	313122586
126	NC_014736	GGTG	2	8	45531	45538	0 %	25 %	75 %	0 %	313122586
127	NC_014736	CGAG	2	8	45707	45714	25 %	0 %	50 %	25 %	313122586
128	NC_014736	AAAC	2	8	46421	46428	75 %	0 %	0 %	25 %	313122587
129	NC_014736	AGCA	2	8	46662	46669	50 %	0 %	25 %	25 %	313122588
130	NC_014736	CGAG	2	8	46712	46719	25 %	0 %	50 %	25 %	313122588
131	NC_014736	CAAT	2	8	46844	46851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014736	TAAT	2	8	46941	46948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014736	AGTA	2	8	46954	46961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014736	AGCA	2	8	47034	47041	50 %	0 %	25 %	25 %	313122589
135	NC_014736	CACG	2	8	47697	47704	25 %	0 %	25 %	50 %	313122589
136	NC_014736	GAAA	2	8	47974	47981	75 %	0 %	25 %	0 %	313122590
137	NC_014736	CTCA	2	8	48140	48147	25 %	25 %	0 %	50 %	313122590
138	NC_014736	ACCA	2	8	48164	48171	50 %	0 %	0 %	50 %	313122590
139	NC_014736	ACCG	2	8	48242	48249	25 %	0 %	25 %	50 %	313122590
140	NC_014736	TTTA	2	8	48538	48545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014736	CTCA	2	8	49023	49030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014736	GAAC	2	8	49160	49167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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