MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 3121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	AAC	2	6	41	46	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014736	ACA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014736	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014736	TCT	2	6	245	250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014736	TAT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014736	TCG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014736	CAT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014736	GAT	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014736	AGA	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014736	GTC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122550
11	NC_014736	CGA	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
12	NC_014736	AGC	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
13	NC_014736	CAT	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122550
14	NC_014736	GAA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122550
15	NC_014736	CAC	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
16	NC_014736	CCG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
17	NC_014736	TGA	2	6	1112	1117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
18	NC_014736	CAG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
19	NC_014736	ATG	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
20	NC_014736	CCG	2	6	1264	1269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
21	NC_014736	GAC	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
22	NC_014736	CGA	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
23	NC_014736	CCA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
24	NC_014736	CCA	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
25	NC_014736	AGC	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
26	NC_014736	TCG	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122550
27	NC_014736	GCA	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
28	NC_014736	CGT	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122550
29	NC_014736	GCC	2	6	1755	1760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
30	NC_014736	TAG	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
31	NC_014736	CGA	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
32	NC_014736	GAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
33	NC_014736	CGG	3	9	2004	2012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122550
34	NC_014736	CCG	2	6	2131	2136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
35	NC_014736	ACA	2	6	2176	2181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122550
36	NC_014736	GAG	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122550
37	NC_014736	ACC	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
38	NC_014736	ACG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
39	NC_014736	TCT	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122550
40	NC_014736	ACC	2	6	2444	2449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014736	TGT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014736	GAC	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014736	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122551
44	NC_014736	ATC	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122551
45	NC_014736	TCG	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122551
46	NC_014736	TCG	2	6	2973	2978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122551
47	NC_014736	AGC	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014736	CGA	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014736	GTG	2	6	3289	3294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014736	GTA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014736	TCG	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014736	GCG	2	6	3343	3348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122552
53	NC_014736	GCC	2	6	3513	3518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122552
54	NC_014736	TCA	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122552
55	NC_014736	CGA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122552
56	NC_014736	TCG	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122552
57	NC_014736	TAA	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122552
58	NC_014736	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122552
59	NC_014736	CGC	2	6	3771	3776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122552
60	NC_014736	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122553
61	NC_014736	GAT	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
62	NC_014736	CGA	3	9	3991	3999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
63	NC_014736	AGA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122553
64	NC_014736	CGG	2	6	4033	4038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122553
65	NC_014736	ACT	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122553
66	NC_014736	GTG	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122553
67	NC_014736	GTA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
68	NC_014736	GTT	2	6	4130	4135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122553
69	NC_014736	GAC	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
70	NC_014736	TGA	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
71	NC_014736	CCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122553
72	NC_014736	GAC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
73	NC_014736	CGA	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
74	NC_014736	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122553
75	NC_014736	CAG	2	6	4430	4435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
76	NC_014736	CCG	2	6	4485	4490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122553
77	NC_014736	GAT	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
78	NC_014736	TGA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
79	NC_014736	GAA	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122553
80	NC_014736	CGT	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122553
81	NC_014736	ACG	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
82	NC_014736	CAG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
83	NC_014736	CCA	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122553
84	NC_014736	GGA	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122554
85	NC_014736	TGA	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
86	NC_014736	TGA	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
87	NC_014736	AGT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
88	NC_014736	CCG	3	9	4931	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122554
89	NC_014736	GAT	3	9	4996	5004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
90	NC_014736	GCA	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
91	NC_014736	GCC	2	6	5072	5077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122554
92	NC_014736	CGT	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
93	NC_014736	GTC	2	6	5150	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
94	NC_014736	GAT	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
95	NC_014736	CAT	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122554
96	NC_014736	GAT	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
97	NC_014736	CAG	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
98	NC_014736	CGC	2	6	5359	5364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122554
99	NC_014736	GTC	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
100	NC_014736	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
101	NC_014736	TGA	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
102	NC_014736	TCG	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
103	NC_014736	CGA	2	6	5565	5570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
104	NC_014736	CAG	3	9	5578	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
105	NC_014736	GCA	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
106	NC_014736	CGT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
107	NC_014736	ATT	2	6	5696	5701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313122554
108	NC_014736	CCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
109	NC_014736	TGT	2	6	5864	5869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122555
110	NC_014736	CGA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
111	NC_014736	ACG	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
112	NC_014736	CGG	2	6	5949	5954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122555
113	NC_014736	CCG	2	6	6019	6024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
114	NC_014736	TTG	2	6	6085	6090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122555
115	NC_014736	TCA	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122555
116	NC_014736	GCC	2	6	6178	6183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
117	NC_014736	CAG	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
118	NC_014736	CCG	2	6	6358	6363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
119	NC_014736	CTC	2	6	6426	6431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122555
120	NC_014736	GCA	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
121	NC_014736	CGT	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122555
122	NC_014736	CGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
123	NC_014736	CGT	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122555
124	NC_014736	CGA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
125	NC_014736	GAA	2	6	6793	6798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014736	GTC	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
127	NC_014736	GAC	2	6	6962	6967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
128	NC_014736	TGC	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
129	NC_014736	GTC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
130	NC_014736	CGC	2	6	7096	7101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
131	NC_014736	CTT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122556
132	NC_014736	CCT	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122556
133	NC_014736	GCA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
134	NC_014736	CGT	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
135	NC_014736	CGC	2	6	7400	7405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
136	NC_014736	GTC	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
137	NC_014736	ACG	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
138	NC_014736	ACG	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
139	NC_014736	GTC	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
140	NC_014736	TGG	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122556
141	NC_014736	CGT	2	6	7795	7800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
142	NC_014736	GGT	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122556
143	NC_014736	CGT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
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145	NC_014736	CGC	3	9	7936	7944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
146	NC_014736	GTC	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
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148	NC_014736	GAT	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014736	TCA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014736	TGA	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122557
151	NC_014736	TGA	2	6	8744	8749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122557
152	NC_014736	GAG	2	6	8804	8809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122557
153	NC_014736	TCG	3	9	8834	8842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122557
154	NC_014736	AGT	2	6	9044	9049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122557
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157	NC_014736	GGC	2	6	9229	9234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122557
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159	NC_014736	GCC	3	9	9256	9264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122557
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161	NC_014736	ACG	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122557
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163	NC_014736	GCT	2	6	9491	9496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122557
164	NC_014736	TAG	2	6	9601	9606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014736	TGC	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122558
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221	NC_014736	AAC	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_014736	GAC	2	6	12670	12675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
223	NC_014736	CTC	2	6	12708	12713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
224	NC_014736	ATA	2	6	12818	12823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_014736	TAC	2	6	12863	12868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
226	NC_014736	ATG	2	6	12891	12896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122560
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234	NC_014736	TCG	2	6	13261	13266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122560
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243	NC_014736	GGC	2	6	13737	13742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122560
244	NC_014736	CCG	2	6	13878	13883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122560
245	NC_014736	TGC	2	6	13928	13933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122560
246	NC_014736	CGA	2	6	14153	14158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122560
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248	NC_014736	CGA	2	6	14210	14215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122560
249	NC_014736	CTC	2	6	14288	14293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_014736	CTG	2	6	14301	14306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_014736	CTA	2	6	14344	14349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_014736	ATC	2	6	14410	14415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_014736	GTC	2	6	14740	14745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_014736	TGT	2	6	14752	14757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014736	AAC	2	6	15003	15008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122561
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261	NC_014736	CGC	2	6	15249	15254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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489	NC_014736	CGA	2	6	31343	31348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
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499	NC_014736	CGC	2	6	32061	32066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
500	NC_014736	TCG	2	6	32122	32127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577

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