MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR04

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014732	GA	3	6	251	256	50 %	0 %	50 %	0 %	313122370
2	NC_014732	GC	3	6	442	447	0 %	0 %	50 %	50 %	313122370
3	NC_014732	GA	3	6	1183	1188	50 %	0 %	50 %	0 %	313122370
4	NC_014732	CG	3	6	1222	1227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014732	AG	3	6	1696	1701	50 %	0 %	50 %	0 %	313122371
6	NC_014732	AC	3	6	1919	1924	50 %	0 %	0 %	50 %	313122371
7	NC_014732	TG	3	6	2692	2697	0 %	50 %	50 %	0 %	313122372
8	NC_014732	AG	3	6	3098	3103	50 %	0 %	50 %	0 %	313122372
9	NC_014732	CA	3	6	3305	3310	50 %	0 %	0 %	50 %	313122372
10	NC_014732	CG	3	6	4391	4396	0 %	0 %	50 %	50 %	313122373
11	NC_014732	GC	3	6	4588	4593	0 %	0 %	50 %	50 %	313122374
12	NC_014732	CG	3	6	4663	4668	0 %	0 %	50 %	50 %	313122374
13	NC_014732	CG	3	6	4740	4745	0 %	0 %	50 %	50 %	313122374
14	NC_014732	CG	3	6	4864	4869	0 %	0 %	50 %	50 %	313122374
15	NC_014732	CG	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	313122374
16	NC_014732	CG	3	6	5654	5659	0 %	0 %	50 %	50 %	313122375
17	NC_014732	GT	3	6	5753	5758	0 %	50 %	50 %	0 %	313122375
18	NC_014732	GC	3	6	5960	5965	0 %	0 %	50 %	50 %	313122375
19	NC_014732	GT	3	6	5972	5977	0 %	50 %	50 %	0 %	313122375
20	NC_014732	GA	3	6	6059	6064	50 %	0 %	50 %	0 %	313122375
21	NC_014732	TC	3	6	6186	6191	0 %	50 %	0 %	50 %	313122375
22	NC_014732	CG	3	6	6885	6890	0 %	0 %	50 %	50 %	313122376
23	NC_014732	GA	3	6	6938	6943	50 %	0 %	50 %	0 %	313122376
24	NC_014732	GA	3	6	7092	7097	50 %	0 %	50 %	0 %	313122376
25	NC_014732	CA	3	6	7190	7195	50 %	0 %	0 %	50 %	313122376
26	NC_014732	GA	3	6	7594	7599	50 %	0 %	50 %	0 %	313122377
27	NC_014732	AC	3	6	8261	8266	50 %	0 %	0 %	50 %	313122377
28	NC_014732	TC	3	6	8951	8956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014732	GT	3	6	9037	9042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014732	CA	3	6	9077	9082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014732	GT	3	6	9579	9584	0 %	50 %	50 %	0 %	313122379
32	NC_014732	AC	3	6	9764	9769	50 %	0 %	0 %	50 %	313122379
33	NC_014732	CT	3	6	10502	10507	0 %	50 %	0 %	50 %	313122379
34	NC_014732	TC	3	6	10579	10584	0 %	50 %	0 %	50 %	313122379
35	NC_014732	TC	3	6	12784	12789	0 %	50 %	0 %	50 %	313122381
36	NC_014732	CG	3	6	13312	13317	0 %	0 %	50 %	50 %	313122381
37	NC_014732	GC	3	6	13347	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	313122381
38	NC_014732	GC	3	6	13745	13750	0 %	0 %	50 %	50 %	313122381
39	NC_014732	CA	3	6	15779	15784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014732	AC	3	6	17088	17093	50 %	0 %	0 %	50 %	313122383
41	NC_014732	TC	3	6	18135	18140	0 %	50 %	0 %	50 %	313122383
42	NC_014732	CG	4	8	18778	18785	0 %	0 %	50 %	50 %	313122384
43	NC_014732	CG	3	6	19874	19879	0 %	0 %	50 %	50 %	313122385
44	NC_014732	TC	3	6	20040	20045	0 %	50 %	0 %	50 %	313122385
45	NC_014732	CG	3	6	20957	20962	0 %	0 %	50 %	50 %	313122386
46	NC_014732	GC	3	6	21153	21158	0 %	0 %	50 %	50 %	313122386
47	NC_014732	CG	3	6	21719	21724	0 %	0 %	50 %	50 %	313122387
48	NC_014732	CG	3	6	23354	23359	0 %	0 %	50 %	50 %	313122388
49	NC_014732	CG	3	6	23689	23694	0 %	0 %	50 %	50 %	313122388
50	NC_014732	CA	3	6	24066	24071	50 %	0 %	0 %	50 %	313122388
51	NC_014732	CG	3	6	24923	24928	0 %	0 %	50 %	50 %	313122389
52	NC_014732	GA	3	6	25635	25640	50 %	0 %	50 %	0 %	313122390
53	NC_014732	CT	3	6	25671	25676	0 %	50 %	0 %	50 %	313122390
54	NC_014732	AG	3	6	25862	25867	50 %	0 %	50 %	0 %	313122390
55	NC_014732	AC	3	6	26515	26520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014732	GA	3	6	26723	26728	50 %	0 %	50 %	0 %	313122391
57	NC_014732	GT	3	6	28127	28132	0 %	50 %	50 %	0 %	313122392
58	NC_014732	GA	3	6	28829	28834	50 %	0 %	50 %	0 %	313122393
59	NC_014732	CG	3	6	29092	29097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014732	CG	3	6	29427	29432	0 %	0 %	50 %	50 %	313122394
61	NC_014732	GT	3	6	29612	29617	0 %	50 %	50 %	0 %	313122394
62	NC_014732	CG	3	6	30619	30624	0 %	0 %	50 %	50 %	313122396
63	NC_014732	CT	3	6	31423	31428	0 %	50 %	0 %	50 %	313122397
64	NC_014732	CG	3	6	31553	31558	0 %	0 %	50 %	50 %	313122397
65	NC_014732	TG	3	6	32126	32131	0 %	50 %	50 %	0 %	313122399
66	NC_014732	CT	3	6	32174	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	313122399
67	NC_014732	GC	3	6	32268	32273	0 %	0 %	50 %	50 %	313122399
68	NC_014732	CG	3	6	33120	33125	0 %	0 %	50 %	50 %	313122399
69	NC_014732	TG	3	6	33582	33587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014732	GC	3	6	33653	33658	0 %	0 %	50 %	50 %	313122400
71	NC_014732	TC	3	6	34028	34033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014732	GC	3	6	35086	35091	0 %	0 %	50 %	50 %	313122401
73	NC_014732	TC	4	8	35359	35366	0 %	50 %	0 %	50 %	313122401
74	NC_014732	AC	3	6	35462	35467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014732	CG	3	6	35777	35782	0 %	0 %	50 %	50 %	313122402
76	NC_014732	CG	3	6	36168	36173	0 %	0 %	50 %	50 %	313122402
77	NC_014732	GA	3	6	36388	36393	50 %	0 %	50 %	0 %	313122403
78	NC_014732	CG	4	8	36417	36424	0 %	0 %	50 %	50 %	313122403
79	NC_014732	TG	3	6	36588	36593	0 %	50 %	50 %	0 %	313122403
80	NC_014732	CG	3	6	37083	37088	0 %	0 %	50 %	50 %	313122404
81	NC_014732	CG	3	6	37348	37353	0 %	0 %	50 %	50 %	313122404
82	NC_014732	GC	3	6	37453	37458	0 %	0 %	50 %	50 %	313122404
83	NC_014732	CG	3	6	39723	39728	0 %	0 %	50 %	50 %	313122405
84	NC_014732	GA	3	6	39882	39887	50 %	0 %	50 %	0 %	313122405
85	NC_014732	GT	3	6	40220	40225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014732	AC	3	6	40235	40240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014732	CT	3	6	41024	41029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014732	CG	3	6	41167	41172	0 %	0 %	50 %	50 %	313122407
89	NC_014732	AC	3	6	41434	41439	50 %	0 %	0 %	50 %	313122407
90	NC_014732	GC	3	6	41875	41880	0 %	0 %	50 %	50 %	313122408
91	NC_014732	CG	3	6	42505	42510	0 %	0 %	50 %	50 %	313122408
92	NC_014732	TC	3	6	42734	42739	0 %	50 %	0 %	50 %	313122408
93	NC_014732	AG	3	6	44021	44026	50 %	0 %	50 %	0 %	313122410
94	NC_014732	CG	3	6	44189	44194	0 %	0 %	50 %	50 %	313122410
95	NC_014732	GT	3	6	44458	44463	0 %	50 %	50 %	0 %	313122410
96	NC_014732	GA	3	6	44723	44728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014732	TA	3	6	44800	44805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014732	GC	3	6	44905	44910	0 %	0 %	50 %	50 %	313122411
99	NC_014732	AT	3	6	45178	45183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014732	CT	3	6	45503	45508	0 %	50 %	0 %	50 %	313122412
101	NC_014732	AC	3	6	45903	45908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014732	GA	3	6	45953	45958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014732	AG	3	6	46240	46245	50 %	0 %	50 %	0 %	313122414
104	NC_014732	AG	3	6	46791	46796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014732	AG	3	6	46902	46907	50 %	0 %	50 %	0 %	313122416
106	NC_014732	TA	3	6	47232	47237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014732	AC	3	6	47583	47588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014732	TA	3	6	47619	47624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014732	AG	3	6	48253	48258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014732	AG	3	6	48446	48451	50 %	0 %	50 %	0 %	313122417
111	NC_014732	CG	3	6	48551	48556	0 %	0 %	50 %	50 %	313122417
112	NC_014732	CA	3	6	48790	48795	50 %	0 %	0 %	50 %	313122418
113	NC_014732	AC	3	6	49729	49734	50 %	0 %	0 %	50 %	313122418
114	NC_014732	GC	3	6	50365	50370	0 %	0 %	50 %	50 %	313122419
115	NC_014732	TG	3	6	50447	50452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014732	TC	3	6	50602	50607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014732	GC	4	8	50731	50738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014732	GC	3	6	51116	51121	0 %	0 %	50 %	50 %	313122420
119	NC_014732	CG	3	6	51477	51482	0 %	0 %	50 %	50 %	313122420
120	NC_014732	TG	3	6	51520	51525	0 %	50 %	50 %	0 %	313122420
121	NC_014732	AG	3	6	51615	51620	50 %	0 %	50 %	0 %	313122420
122	NC_014732	CG	3	6	51863	51868	0 %	0 %	50 %	50 %	313122420
123	NC_014732	GT	3	6	52345	52350	0 %	50 %	50 %	0 %	313122420
124	NC_014732	CA	3	6	52553	52558	50 %	0 %	0 %	50 %	313122420
125	NC_014732	CG	3	6	52781	52786	0 %	0 %	50 %	50 %	313122421
126	NC_014732	GA	3	6	54100	54105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014732	GA	3	6	55065	55070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014732	AC	3	6	55091	55096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014732	CG	4	8	55292	55299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014732	CG	3	6	55475	55480	0 %	0 %	50 %	50 %	313122423
131	NC_014732	CT	3	6	55570	55575	0 %	50 %	0 %	50 %	313122423
132	NC_014732	CG	3	6	55889	55894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014732	CA	4	8	57212	57219	50 %	0 %	0 %	50 %	313122426
134	NC_014732	TG	3	6	57844	57849	0 %	50 %	50 %	0 %	313122426
135	NC_014732	GC	3	6	58325	58330	0 %	0 %	50 %	50 %	313122427
136	NC_014732	CG	3	6	58786	58791	0 %	0 %	50 %	50 %	313122427
137	NC_014732	GA	3	6	60073	60078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014732	CG	3	6	60533	60538	0 %	0 %	50 %	50 %	313122429
139	NC_014732	GA	3	6	61387	61392	50 %	0 %	50 %	0 %	313122430
140	NC_014732	GC	3	6	61920	61925	0 %	0 %	50 %	50 %	313122430
141	NC_014732	CG	4	8	62133	62140	0 %	0 %	50 %	50 %	313122430
142	NC_014732	CG	3	6	62299	62304	0 %	0 %	50 %	50 %	313122430
143	NC_014732	CG	3	6	64447	64452	0 %	0 %	50 %	50 %	313122433
144	NC_014732	CT	3	6	65077	65082	0 %	50 %	0 %	50 %	313122433
145	NC_014732	AC	3	6	65295	65300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014732	GC	3	6	65842	65847	0 %	0 %	50 %	50 %	313122434
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433	NC_014732	GT	3	6	194815	194820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.