MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 7578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014731	TTCG	2	8	216685	216692	0 %	50 %	25 %	25 %	313117028
5002	NC_014731	TCG	2	6	216735	216740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117028
5003	NC_014731	GAA	2	6	216751	216756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117028
5004	NC_014731	ACGA	2	8	216812	216819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_014731	CCCT	2	8	216838	216845	0 %	25 %	0 %	75 %	313117029
5006	NC_014731	GAT	2	6	216868	216873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117029
5007	NC_014731	ACG	2	6	216887	216892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117029
5008	NC_014731	GCA	2	6	216939	216944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117029
5009	NC_014731	GAAC	2	8	217003	217010	50 %	0 %	25 %	25 %	313117029
5010	NC_014731	CGG	2	6	217100	217105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117029
5011	NC_014731	CGT	2	6	217112	217117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117029
5012	NC_014731	CGA	2	6	217151	217156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117029
5013	NC_014731	CAC	2	6	217225	217230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117029
5014	NC_014731	ACGA	2	8	217289	217296	50 %	0 %	25 %	25 %	313117029
5015	NC_014731	GACGA	2	10	217360	217369	40 %	0 %	40 %	20 %	313117029
5016	NC_014731	GCG	2	6	217393	217398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117029
5017	NC_014731	CTGG	2	8	217453	217460	0 %	25 %	50 %	25 %	313117030
5018	NC_014731	AC	3	6	217497	217502	50 %	0 %	0 %	50 %	313117030
5019	NC_014731	TC	3	6	217595	217600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_014731	ATCGA	2	10	217716	217725	40 %	20 %	20 %	20 %	313117031
5021	NC_014731	GCA	2	6	217740	217745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5022	NC_014731	TCGCGT	2	12	217801	217812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5023	NC_014731	GTT	3	9	217904	217912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117031
5024	NC_014731	CGA	2	6	217978	217983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5025	NC_014731	CGA	2	6	218014	218019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5026	NC_014731	TCG	2	6	218145	218150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5027	NC_014731	CCG	2	6	218194	218199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117031
5028	NC_014731	TCC	2	6	218220	218225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117031
5029	NC_014731	TCG	2	6	218233	218238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5030	NC_014731	CGA	2	6	218249	218254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5031	NC_014731	CAGC	2	8	218292	218299	25 %	0 %	25 %	50 %	313117031
5032	NC_014731	GAC	2	6	218306	218311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117031
5033	NC_014731	CA	3	6	218347	218352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_014731	CA	3	6	218385	218390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_014731	GGC	2	6	218415	218420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_014731	A	6	6	218423	218428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014731	CCTT	2	8	218486	218493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_014731	TGG	2	6	218513	218518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014731	CAG	2	6	218589	218594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_014731	GTC	2	6	218602	218607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_014731	CGA	2	6	218608	218613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_014731	GGT	2	6	218676	218681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117032
5043	NC_014731	GTC	2	6	218683	218688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117032
5044	NC_014731	TCG	2	6	218723	218728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117032
5045	NC_014731	CCG	2	6	218743	218748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117032
5046	NC_014731	GAG	2	6	218752	218757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117032
5047	NC_014731	GAC	2	6	218944	218949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117032
5048	NC_014731	CGG	2	6	218964	218969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117032
5049	NC_014731	GAC	2	6	218998	219003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117032
5050	NC_014731	GTC	2	6	219010	219015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117032
5051	NC_014731	ACG	2	6	219023	219028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117032
5052	NC_014731	AAGG	2	8	219040	219047	50 %	0 %	50 %	0 %	313117032
5053	NC_014731	GCG	2	6	219091	219096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117032
5054	NC_014731	CG	3	6	219123	219128	0 %	0 %	50 %	50 %	313117032
5055	NC_014731	TAC	2	6	219193	219198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117032
5056	NC_014731	TGA	2	6	219244	219249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117032
5057	NC_014731	TGT	2	6	219291	219296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117033
5058	NC_014731	GAC	2	6	219309	219314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117033
5059	NC_014731	G	6	6	219318	219323	0 %	0 %	100 %	0 %	313117033
5060	NC_014731	TCT	2	6	219337	219342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117033
5061	NC_014731	CG	3	6	219351	219356	0 %	0 %	50 %	50 %	313117033
5062	NC_014731	CGT	2	6	219366	219371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117033
5063	NC_014731	CTC	2	6	219384	219389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117033
5064	NC_014731	CGG	2	6	219398	219403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117033
5065	NC_014731	CGG	2	6	219409	219414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117033
5066	NC_014731	CG	3	6	219448	219453	0 %	0 %	50 %	50 %	313117033
5067	NC_014731	TCG	2	6	219502	219507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117033
5068	NC_014731	AAG	2	6	219625	219630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117033
5069	NC_014731	CGC	2	6	219674	219679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117033
5070	NC_014731	GCAC	2	8	219694	219701	25 %	0 %	25 %	50 %	313117033
5071	NC_014731	GAG	2	6	219723	219728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117033
5072	NC_014731	GTC	2	6	219789	219794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117033
5073	NC_014731	GCC	3	9	219800	219808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117033
5074	NC_014731	CGAG	2	8	219841	219848	25 %	0 %	50 %	25 %	313117033
5075	NC_014731	GGT	2	6	219894	219899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117033
5076	NC_014731	GAA	2	6	219926	219931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117034
5077	NC_014731	CGAG	2	8	219932	219939	25 %	0 %	50 %	25 %	313117034
5078	NC_014731	ACGG	2	8	219993	220000	25 %	0 %	50 %	25 %	313117034
5079	NC_014731	CCG	2	6	220023	220028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117034
5080	NC_014731	TCC	2	6	220038	220043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117034
5081	NC_014731	GCTC	2	8	220075	220082	0 %	25 %	25 %	50 %	313117034
5082	NC_014731	TTC	2	6	220106	220111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117034
5083	NC_014731	CGC	2	6	220150	220155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117034
5084	NC_014731	GAG	2	6	220166	220171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117034
5085	NC_014731	CCG	2	6	220234	220239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117034
5086	NC_014731	GGC	2	6	220252	220257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117034
5087	NC_014731	TCG	2	6	220266	220271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5088	NC_014731	TTC	2	6	220301	220306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117034
5089	NC_014731	CG	3	6	220326	220331	0 %	0 %	50 %	50 %	313117034
5090	NC_014731	GGT	2	6	220342	220347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117034
5091	NC_014731	CGA	2	6	220408	220413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5092	NC_014731	CGC	2	6	220417	220422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117034
5093	NC_014731	TCG	2	6	220467	220472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5094	NC_014731	GGT	2	6	220489	220494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117034
5095	NC_014731	CGG	2	6	220498	220503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117034
5096	NC_014731	CTT	2	6	220540	220545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117034
5097	NC_014731	TCGCCA	2	12	220566	220577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313117034
5098	NC_014731	AC	3	6	220618	220623	50 %	0 %	0 %	50 %	313117034
5099	NC_014731	ACG	3	9	220638	220646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5100	NC_014731	GTG	2	6	220650	220655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117034
5101	NC_014731	ACC	2	6	220660	220665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117034
5102	NC_014731	GTC	2	6	220748	220753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5103	NC_014731	GGC	2	6	220777	220782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117034
5104	NC_014731	CGT	2	6	220792	220797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5105	NC_014731	CTT	2	6	220798	220803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117034
5106	NC_014731	GGC	2	6	220822	220827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117034
5107	NC_014731	CTT	2	6	220837	220842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117034
5108	NC_014731	AAC	2	6	220874	220879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117034
5109	NC_014731	TCA	2	6	220899	220904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117034
5110	NC_014731	CGT	2	6	220953	220958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5111	NC_014731	CGT	2	6	220978	220983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5112	NC_014731	TCG	2	6	221007	221012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5113	NC_014731	GCG	2	6	221013	221018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117034
5114	NC_014731	TCA	2	6	221154	221159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117034
5115	NC_014731	AAC	2	6	221183	221188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117034
5116	NC_014731	TCG	2	6	221253	221258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5117	NC_014731	TTG	2	6	221276	221281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117034
5118	NC_014731	TCT	2	6	221290	221295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117034
5119	NC_014731	GAC	2	6	221318	221323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117034
5120	NC_014731	CGA	2	6	221346	221351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117035
5121	NC_014731	CG	3	6	221401	221406	0 %	0 %	50 %	50 %	313117035
5122	NC_014731	CTC	2	6	221413	221418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117035
5123	NC_014731	GCG	2	6	221453	221458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117035
5124	NC_014731	GTG	2	6	221485	221490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117035
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5128	NC_014731	CGA	2	6	221561	221566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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5133	NC_014731	CGG	2	6	221660	221665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117036
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5136	NC_014731	CGTC	2	8	221737	221744	0 %	25 %	25 %	50 %	313117036
5137	NC_014731	CGA	2	6	221771	221776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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5139	NC_014731	GGTG	2	8	221807	221814	0 %	25 %	75 %	0 %	313117036
5140	NC_014731	GGA	2	6	221846	221851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117036
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5142	NC_014731	CGA	2	6	221993	221998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
5143	NC_014731	CCCGA	2	10	222006	222015	20 %	0 %	20 %	60 %	313117036
5144	NC_014731	CG	3	6	222019	222024	0 %	0 %	50 %	50 %	313117036
5145	NC_014731	AGC	2	6	222067	222072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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5150	NC_014731	GTCA	2	8	222285	222292	25 %	25 %	25 %	25 %	313117036
5151	NC_014731	GCC	2	6	222320	222325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117036
5152	NC_014731	CAT	2	6	222395	222400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117036
5153	NC_014731	ACT	2	6	222499	222504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117036
5154	NC_014731	GCACTC	2	12	222561	222572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313117036
5155	NC_014731	ACG	2	6	222607	222612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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5189	NC_014731	CGA	2	6	224201	224206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
5190	NC_014731	GCC	2	6	224208	224213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117036
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5210	NC_014731	TAC	2	6	225119	225124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117037
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5214	NC_014731	TAC	2	6	225350	225355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117037
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5217	NC_014731	GCGA	2	8	225594	225601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5218	NC_014731	GAC	2	6	225616	225621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5222	NC_014731	GCA	2	6	225689	225694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117038
5223	NC_014731	TCG	2	6	225699	225704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117038
5224	NC_014731	CCG	2	6	225711	225716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117038
5225	NC_014731	GCG	2	6	225737	225742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117038
5226	NC_014731	GGA	2	6	225781	225786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117038
5227	NC_014731	GCC	2	6	226042	226047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117038
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5229	NC_014731	TGG	2	6	226126	226131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117038
5230	NC_014731	ACC	3	9	226139	226147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117038
5231	NC_014731	GTC	3	9	226156	226164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117038
5232	NC_014731	CGA	2	6	226176	226181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117038
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5234	NC_014731	GTC	3	9	226205	226213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117038
5235	NC_014731	TTCG	2	8	226249	226256	0 %	50 %	25 %	25 %	313117038
5236	NC_014731	ACG	2	6	226266	226271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117038
5237	NC_014731	TTCG	2	8	226279	226286	0 %	50 %	25 %	25 %	313117038
5238	NC_014731	CGGTCC	2	12	226357	226368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	313117038
5239	NC_014731	AAAC	2	8	226504	226511	75 %	0 %	0 %	25 %	313117039
5240	NC_014731	CGA	2	6	226519	226524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117039
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5242	NC_014731	CGC	2	6	226589	226594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117039
5243	NC_014731	CGAC	2	8	226679	226686	25 %	0 %	25 %	50 %	313117039
5244	NC_014731	CAGC	2	8	226729	226736	25 %	0 %	25 %	50 %	313117039
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5310	NC_014731	GC	3	6	229249	229254	0 %	0 %	50 %	50 %	313117042
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5323	NC_014731	ACG	2	6	229734	229739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117042
5324	NC_014731	GTC	3	9	229815	229823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117042
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5330	NC_014731	CGG	2	6	230011	230016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117042
5331	NC_014731	GCG	2	6	230122	230127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117042
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5334	NC_014731	CTCAC	2	10	230318	230327	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5337	NC_014731	CT	3	6	230403	230408	0 %	50 %	0 %	50 %	313117043
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5352	NC_014731	GCG	2	6	230924	230929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117043
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5357	NC_014731	TGA	2	6	231009	231014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117043
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5360	NC_014731	TCTG	2	8	231165	231172	0 %	50 %	25 %	25 %	313117043
5361	NC_014731	CGG	2	6	231176	231181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117043
5362	NC_014731	CAC	2	6	231186	231191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117043
5363	NC_014731	GCG	2	6	231313	231318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117043
5364	NC_014731	TCG	2	6	231323	231328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117043
5365	NC_014731	TCG	2	6	231332	231337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117043
5366	NC_014731	TCG	2	6	231431	231436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117043
5367	NC_014731	GCGG	2	8	231460	231467	0 %	0 %	75 %	25 %	313117043
5368	NC_014731	GTT	2	6	231475	231480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117043
5369	NC_014731	ATC	2	6	231520	231525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117043
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5372	NC_014731	CT	3	6	231619	231624	0 %	50 %	0 %	50 %	313117043
5373	NC_014731	AT	3	6	231712	231717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_014731	TAGA	2	8	231745	231752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_014731	ATCT	2	8	231769	231776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5376	NC_014731	CT	3	6	231864	231869	0 %	50 %	0 %	50 %	313117044
5377	NC_014731	TCGG	2	8	231981	231988	0 %	25 %	50 %	25 %	313117044
5378	NC_014731	CGT	2	6	232066	232071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117044
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5381	NC_014731	CAT	2	6	232292	232297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117044
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5385	NC_014731	CG	3	6	232487	232492	0 %	0 %	50 %	50 %	313117044
5386	NC_014731	CA	3	6	232534	232539	50 %	0 %	0 %	50 %	313117044
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5392	NC_014731	AAGG	2	8	233027	233034	50 %	0 %	50 %	0 %	313117045
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5400	NC_014731	ATG	2	6	233439	233444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117045
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5403	NC_014731	GTC	2	6	233492	233497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117045
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5428	NC_014731	CGTCT	2	10	234782	234791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5429	NC_014731	GTT	2	6	234904	234909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117047
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5450	NC_014731	CGAACG	2	12	235946	235957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117047
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5464	NC_014731	GC	3	6	236795	236800	0 %	0 %	50 %	50 %	313117047
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5470	NC_014731	CGG	2	6	237175	237180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5471	NC_014731	GAA	2	6	237229	237234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117048
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5474	NC_014731	CTG	2	6	237340	237345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117048
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5477	NC_014731	TTCG	2	8	237421	237428	0 %	50 %	25 %	25 %	313117048
5478	NC_014731	TCG	2	6	237440	237445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117048
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5485	NC_014731	GAG	2	6	237718	237723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117048
5486	NC_014731	CCG	2	6	237938	237943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117048
5487	NC_014731	GTGCG	2	10	237947	237956	0 %	20 %	60 %	20 %	313117048
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5489	NC_014731	CGT	2	6	238110	238115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117048
5490	NC_014731	GTA	2	6	238126	238131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117048
5491	NC_014731	TTC	2	6	238204	238209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117048
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