MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 8008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	CGAC	2	8	92	99	25 %	0 %	25 %	50 %	313124789
2	NC_014729	CCGG	2	8	298	305	0 %	0 %	50 %	50 %	313124789
3	NC_014729	TCGC	2	8	521	528	0 %	25 %	25 %	50 %	313124789
4	NC_014729	CGAC	2	8	559	566	25 %	0 %	25 %	50 %	313124789
5	NC_014729	CGCC	2	8	1236	1243	0 %	0 %	25 %	75 %	313124790
6	NC_014729	CACC	2	8	1360	1367	25 %	0 %	0 %	75 %	313124790
7	NC_014729	CTCG	2	8	1523	1530	0 %	25 %	25 %	50 %	313124790
8	NC_014729	AGTC	2	8	1644	1651	25 %	25 %	25 %	25 %	313124790
9	NC_014729	GTTC	2	8	2263	2270	0 %	50 %	25 %	25 %	313124792
10	NC_014729	GTCT	2	8	2273	2280	0 %	50 %	25 %	25 %	313124792
11	NC_014729	AGCG	2	8	2495	2502	25 %	0 %	50 %	25 %	313124793
12	NC_014729	GGCG	2	8	2649	2656	0 %	0 %	75 %	25 %	313124793
13	NC_014729	CGGT	2	8	2984	2991	0 %	25 %	50 %	25 %	313124793
14	NC_014729	CGAA	2	8	3216	3223	50 %	0 %	25 %	25 %	313124793
15	NC_014729	GACG	2	8	3324	3331	25 %	0 %	50 %	25 %	313124793
16	NC_014729	CCGA	2	8	3552	3559	25 %	0 %	25 %	50 %	313124793
17	NC_014729	TTCG	2	8	3747	3754	0 %	50 %	25 %	25 %	313124794
18	NC_014729	GACC	2	8	4010	4017	25 %	0 %	25 %	50 %	313124795
19	NC_014729	GACG	2	8	4220	4227	25 %	0 %	50 %	25 %	313124795
20	NC_014729	CTTT	2	8	4579	4586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014729	GACG	2	8	4588	4595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014729	CCGC	2	8	5120	5127	0 %	0 %	25 %	75 %	313124797
23	NC_014729	GTTT	2	8	5196	5203	0 %	75 %	25 %	0 %	313124797
24	NC_014729	TCGT	2	8	5243	5250	0 %	50 %	25 %	25 %	313124797
25	NC_014729	GCGA	2	8	6033	6040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014729	CATC	2	8	6183	6190	25 %	25 %	0 %	50 %	313124798
27	NC_014729	CGAC	2	8	6582	6589	25 %	0 %	25 %	50 %	313124798
28	NC_014729	AGCG	2	8	7216	7223	25 %	0 %	50 %	25 %	313124799
29	NC_014729	CGGG	2	8	7326	7333	0 %	0 %	75 %	25 %	313124799
30	NC_014729	AACG	2	8	7430	7437	50 %	0 %	25 %	25 %	313124799
31	NC_014729	ACGT	2	8	7475	7482	25 %	25 %	25 %	25 %	313124799
32	NC_014729	CGTG	2	8	8021	8028	0 %	25 %	50 %	25 %	313124800
33	NC_014729	CGGC	2	8	8746	8753	0 %	0 %	50 %	50 %	313124800
34	NC_014729	GCGG	2	8	9011	9018	0 %	0 %	75 %	25 %	313124800
35	NC_014729	GAAC	2	8	9257	9264	50 %	0 %	25 %	25 %	313124801
36	NC_014729	GCAG	2	8	10253	10260	25 %	0 %	50 %	25 %	313124801
37	NC_014729	CACT	2	8	10579	10586	25 %	25 %	0 %	50 %	313124802
38	NC_014729	CTGT	2	8	10728	10735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014729	CAAT	2	8	10796	10803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014729	ATCT	2	8	11067	11074	25 %	50 %	0 %	25 %	313124803
41	NC_014729	TCGT	2	8	11259	11266	0 %	50 %	25 %	25 %	313124803
42	NC_014729	CGTC	2	8	11861	11868	0 %	25 %	25 %	50 %	313124806
43	NC_014729	CGGA	2	8	11954	11961	25 %	0 %	50 %	25 %	313124806
44	NC_014729	CCGT	2	8	12065	12072	0 %	25 %	25 %	50 %	313124806
45	NC_014729	ACGA	2	8	12149	12156	50 %	0 %	25 %	25 %	313124806
46	NC_014729	CTGA	2	8	12610	12617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014729	ATAC	2	8	12917	12924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014729	CGAA	2	8	13249	13256	50 %	0 %	25 %	25 %	313124807
49	NC_014729	AACC	2	8	13388	13395	50 %	0 %	0 %	50 %	313124807
50	NC_014729	CGAC	2	8	13714	13721	25 %	0 %	25 %	50 %	313124807
51	NC_014729	CGAG	2	8	13754	13761	25 %	0 %	50 %	25 %	313124807
52	NC_014729	CTGT	2	8	13839	13846	0 %	50 %	25 %	25 %	313124807
53	NC_014729	AACG	2	8	14192	14199	50 %	0 %	25 %	25 %	313124808
54	NC_014729	CACT	2	8	14327	14334	25 %	25 %	0 %	50 %	313124808
55	NC_014729	GAAC	2	8	14508	14515	50 %	0 %	25 %	25 %	313124808
56	NC_014729	GAGT	2	8	14585	14592	25 %	25 %	50 %	0 %	313124808
57	NC_014729	CGGC	2	8	15754	15761	0 %	0 %	50 %	50 %	313124811
58	NC_014729	GGTC	2	8	17093	17100	0 %	25 %	50 %	25 %	313124812
59	NC_014729	CGCC	2	8	17185	17192	0 %	0 %	25 %	75 %	313124812
60	NC_014729	CGAC	2	8	17273	17280	25 %	0 %	25 %	50 %	313124812
61	NC_014729	GGCA	2	8	17290	17297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014729	TCAC	2	8	17390	17397	25 %	25 %	0 %	50 %	313124813
63	NC_014729	GTCG	2	8	17780	17787	0 %	25 %	50 %	25 %	313124813
64	NC_014729	TCGT	2	8	19282	19289	0 %	50 %	25 %	25 %	313124815
65	NC_014729	GACT	2	8	19438	19445	25 %	25 %	25 %	25 %	313124815
66	NC_014729	TGTA	2	8	19483	19490	25 %	50 %	25 %	0 %	313124815
67	NC_014729	CCCA	2	8	19512	19519	25 %	0 %	0 %	75 %	313124815
68	NC_014729	GGTG	2	8	19524	19531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014729	CAGG	2	8	19605	19612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014729	GCTA	2	8	20132	20139	25 %	25 %	25 %	25 %	313124817
71	NC_014729	TCGC	2	8	20498	20505	0 %	25 %	25 %	50 %	313124818
72	NC_014729	TCGC	2	8	20754	20761	0 %	25 %	25 %	50 %	313124819
73	NC_014729	TTTC	2	8	20848	20855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014729	TCAC	2	8	21598	21605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014729	TAGG	2	8	21928	21935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014729	CCGA	2	8	21979	21986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014729	GCAA	2	8	22747	22754	50 %	0 %	25 %	25 %	313124821
78	NC_014729	GACG	2	8	22911	22918	25 %	0 %	50 %	25 %	313124821
79	NC_014729	GTAC	2	8	24005	24012	25 %	25 %	25 %	25 %	313124821
80	NC_014729	CGTT	2	8	24231	24238	0 %	50 %	25 %	25 %	313124821
81	NC_014729	GTCG	2	8	24455	24462	0 %	25 %	50 %	25 %	313124822
82	NC_014729	GTCG	2	8	24860	24867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014729	CAGT	2	8	25127	25134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014729	ATCC	2	8	25213	25220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014729	CGTC	2	8	25310	25317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014729	CTTC	2	8	25319	25326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014729	CGCT	2	8	25819	25826	0 %	25 %	25 %	50 %	313124823
88	NC_014729	GAAG	2	8	26749	26756	50 %	0 %	50 %	0 %	313124824
89	NC_014729	CGCT	2	8	26795	26802	0 %	25 %	25 %	50 %	313124824
90	NC_014729	GCAC	2	8	27033	27040	25 %	0 %	25 %	50 %	313124824
91	NC_014729	CCAG	2	8	27260	27267	25 %	0 %	25 %	50 %	313124824
92	NC_014729	CGAC	2	8	27414	27421	25 %	0 %	25 %	50 %	313124824
93	NC_014729	TGCG	2	8	27490	27497	0 %	25 %	50 %	25 %	313124824
94	NC_014729	GGCG	2	8	28966	28973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014729	CGCC	2	8	29113	29120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_014729	CGTC	2	8	29906	29913	0 %	25 %	25 %	50 %	313124827
97	NC_014729	GATC	2	8	30191	30198	25 %	25 %	25 %	25 %	313124827
98	NC_014729	CCGA	2	8	31510	31517	25 %	0 %	25 %	50 %	313124828
99	NC_014729	AGAC	2	8	31823	31830	50 %	0 %	25 %	25 %	313124828
100	NC_014729	GACG	2	8	31926	31933	25 %	0 %	50 %	25 %	313124828
101	NC_014729	TGGT	2	8	32662	32669	0 %	50 %	50 %	0 %	313124828
102	NC_014729	CGCC	2	8	32670	32677	0 %	0 %	25 %	75 %	313124828
103	NC_014729	TTAG	2	8	32827	32834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014729	TCCG	2	8	33133	33140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014729	GTCG	2	8	33160	33167	0 %	25 %	50 %	25 %	313124829
106	NC_014729	TCAG	2	8	33284	33291	25 %	25 %	25 %	25 %	313124829
107	NC_014729	CCGA	2	8	33706	33713	25 %	0 %	25 %	50 %	313124829
108	NC_014729	AGCG	2	8	34009	34016	25 %	0 %	50 %	25 %	313124829
109	NC_014729	ACCG	2	8	34425	34432	25 %	0 %	25 %	50 %	313124830
110	NC_014729	CGAA	2	8	34472	34479	50 %	0 %	25 %	25 %	313124830
111	NC_014729	CGAA	2	8	34913	34920	50 %	0 %	25 %	25 %	313124830
112	NC_014729	TCCG	2	8	35281	35288	0 %	25 %	25 %	50 %	313124830
113	NC_014729	CCAA	2	8	36235	36242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014729	CGCT	2	8	36478	36485	0 %	25 %	25 %	50 %	313124831
115	NC_014729	ACCG	2	8	37196	37203	25 %	0 %	25 %	50 %	313124832
116	NC_014729	CGGT	2	8	37616	37623	0 %	25 %	50 %	25 %	313124832
117	NC_014729	GAGC	2	8	38415	38422	25 %	0 %	50 %	25 %	313124833
118	NC_014729	ACGG	2	8	38788	38795	25 %	0 %	50 %	25 %	313124834
119	NC_014729	ACAA	2	8	39261	39268	75 %	0 %	0 %	25 %	313124834
120	NC_014729	GAAA	2	8	39570	39577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014729	GAGG	2	8	39869	39876	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014729	TAGG	2	8	39964	39971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014729	CGGA	2	8	40143	40150	25 %	0 %	50 %	25 %	313124836
124	NC_014729	CGGT	2	8	40350	40357	0 %	25 %	50 %	25 %	313124836
125	NC_014729	ACGC	2	8	40740	40747	25 %	0 %	25 %	50 %	313124836
126	NC_014729	AAGT	2	8	40923	40930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014729	ACGA	2	8	41293	41300	50 %	0 %	25 %	25 %	313124838
128	NC_014729	GTCG	2	8	41398	41405	0 %	25 %	50 %	25 %	313124838
129	NC_014729	CGCC	2	8	41465	41472	0 %	0 %	25 %	75 %	313124838
130	NC_014729	GGAC	2	8	41984	41991	25 %	0 %	50 %	25 %	313124838
131	NC_014729	ACGA	2	8	43102	43109	50 %	0 %	25 %	25 %	313124841
132	NC_014729	CTCG	2	8	43199	43206	0 %	25 %	25 %	50 %	313124841
133	NC_014729	GACC	2	8	43272	43279	25 %	0 %	25 %	50 %	313124841
134	NC_014729	CCGC	2	8	44431	44438	0 %	0 %	25 %	75 %	313124842
135	NC_014729	CCGG	2	8	44909	44916	0 %	0 %	50 %	50 %	313124843
136	NC_014729	TCCG	2	8	44990	44997	0 %	25 %	25 %	50 %	313124843
137	NC_014729	ACCG	2	8	45791	45798	25 %	0 %	25 %	50 %	313124845
138	NC_014729	TCGC	2	8	46034	46041	0 %	25 %	25 %	50 %	313124845
139	NC_014729	GCCC	2	8	46432	46439	0 %	0 %	25 %	75 %	313124845
140	NC_014729	CGGT	2	8	46564	46571	0 %	25 %	50 %	25 %	313124845
141	NC_014729	CGAA	2	8	46655	46662	50 %	0 %	25 %	25 %	313124845
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143	NC_014729	AGCG	2	8	48691	48698	25 %	0 %	50 %	25 %	313124846
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