MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 70333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014729	CGT	2	6	38624	38629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124833
1002	NC_014729	TCG	2	6	38644	38649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124833
1003	NC_014729	CGA	2	6	38678	38683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124833
1004	NC_014729	CG	3	6	38711	38716	0 %	0 %	50 %	50 %	313124834
1005	NC_014729	ACGG	2	8	38788	38795	25 %	0 %	50 %	25 %	313124834
1006	NC_014729	CGG	2	6	38799	38804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124834
1007	NC_014729	ACC	2	6	38808	38813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124834
1008	NC_014729	CGT	2	6	38815	38820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124834
1009	NC_014729	CGC	2	6	38869	38874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124834
1010	NC_014729	TGC	2	6	38938	38943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124834
1011	NC_014729	CCG	2	6	38952	38957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124834
1012	NC_014729	ACC	2	6	38963	38968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124834
1013	NC_014729	ACG	2	6	38983	38988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124834
1014	NC_014729	CGA	3	9	39052	39060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124834
1015	NC_014729	CCA	2	6	39074	39079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124834
1016	NC_014729	CGG	2	6	39086	39091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124834
1017	NC_014729	GC	4	8	39126	39133	0 %	0 %	50 %	50 %	313124834
1018	NC_014729	GCG	2	6	39138	39143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124834
1019	NC_014729	CA	3	6	39165	39170	50 %	0 %	0 %	50 %	313124834
1020	NC_014729	TAG	2	6	39252	39257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124834
1021	NC_014729	ACAA	2	8	39261	39268	75 %	0 %	0 %	25 %	313124834
1022	NC_014729	GGC	2	6	39329	39334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124834
1023	NC_014729	GTC	2	6	39338	39343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124834
1024	NC_014729	CGA	2	6	39409	39414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124834
1025	NC_014729	GCG	2	6	39426	39431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124834
1026	NC_014729	GCG	2	6	39462	39467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124834
1027	NC_014729	GTC	2	6	39552	39557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014729	GAAA	2	8	39570	39577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014729	CGG	2	6	39644	39649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124835
1030	NC_014729	GCG	2	6	39650	39655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124835
1031	NC_014729	TCG	2	6	39680	39685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124835
1032	NC_014729	CGT	2	6	39690	39695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124835
1033	NC_014729	TAA	2	6	39791	39796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014729	GCC	2	6	39811	39816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_014729	TA	3	6	39863	39868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014729	GAGG	2	8	39869	39876	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014729	AG	3	6	39884	39889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014729	TAGG	2	8	39964	39971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014729	CGG	2	6	40041	40046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124836
1040	NC_014729	TC	3	6	40060	40065	0 %	50 %	0 %	50 %	313124836
1041	NC_014729	CGA	2	6	40074	40079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1042	NC_014729	CGC	2	6	40099	40104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124836
1043	NC_014729	ACG	2	6	40114	40119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1044	NC_014729	CGGA	2	8	40143	40150	25 %	0 %	50 %	25 %	313124836
1045	NC_014729	GGC	2	6	40177	40182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124836
1046	NC_014729	GAC	2	6	40226	40231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1047	NC_014729	CGT	2	6	40246	40251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1048	NC_014729	AC	3	6	40254	40259	50 %	0 %	0 %	50 %	313124836
1049	NC_014729	TCG	2	6	40305	40310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1050	NC_014729	CCG	2	6	40331	40336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124836
1051	NC_014729	CGGT	2	8	40350	40357	0 %	25 %	50 %	25 %	313124836
1052	NC_014729	CGG	2	6	40366	40371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124836
1053	NC_014729	GGC	2	6	40387	40392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124836
1054	NC_014729	CG	3	6	40437	40442	0 %	0 %	50 %	50 %	313124836
1055	NC_014729	ACC	2	6	40482	40487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124836
1056	NC_014729	GCG	2	6	40502	40507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124836
1057	NC_014729	TCG	2	6	40515	40520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1058	NC_014729	GCC	2	6	40523	40528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124836
1059	NC_014729	GGT	2	6	40552	40557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124836
1060	NC_014729	TCG	2	6	40566	40571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124836
1061	NC_014729	ACGC	2	8	40740	40747	25 %	0 %	25 %	50 %	313124836
1062	NC_014729	TTC	2	6	40804	40809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014729	GA	3	6	40810	40815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014729	ACGCGC	2	12	40900	40911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_014729	AAGT	2	8	40923	40930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014729	TGG	2	6	40960	40965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014729	CG	3	6	41103	41108	0 %	0 %	50 %	50 %	313124837
1068	NC_014729	ACC	2	6	41149	41154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014729	TCC	2	6	41285	41290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124838
1070	NC_014729	ACGA	2	8	41293	41300	50 %	0 %	25 %	25 %	313124838
1071	NC_014729	GAA	2	6	41338	41343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124838
1072	NC_014729	GTGAC	2	10	41357	41366	20 %	20 %	40 %	20 %	313124838
1073	NC_014729	GTCG	2	8	41398	41405	0 %	25 %	50 %	25 %	313124838
1074	NC_014729	CGG	2	6	41420	41425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124838
1075	NC_014729	CGCC	2	8	41465	41472	0 %	0 %	25 %	75 %	313124838
1076	NC_014729	GTC	2	6	41521	41526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124838
1077	NC_014729	ACG	2	6	41537	41542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124838
1078	NC_014729	CGT	2	6	41562	41567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124838
1079	NC_014729	GCC	2	6	41602	41607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124838
1080	NC_014729	TTC	2	6	41656	41661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124838
1081	NC_014729	CCG	2	6	41668	41673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124838
1082	NC_014729	GC	3	6	41698	41703	0 %	0 %	50 %	50 %	313124838
1083	NC_014729	ACG	3	9	41747	41755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124838
1084	NC_014729	CTG	2	6	41761	41766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124838
1085	NC_014729	CCG	2	6	41797	41802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124838
1086	NC_014729	GAG	2	6	41845	41850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124838
1087	NC_014729	CGAAGA	2	12	41853	41864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313124838
1088	NC_014729	CGA	2	6	41865	41870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124838
1089	NC_014729	CGC	2	6	41887	41892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124838
1090	NC_014729	AC	3	6	41959	41964	50 %	0 %	0 %	50 %	313124838
1091	NC_014729	GGAC	2	8	41984	41991	25 %	0 %	50 %	25 %	313124838
1092	NC_014729	TGG	2	6	42002	42007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124838
1093	NC_014729	CGC	2	6	42009	42014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124838
1094	NC_014729	GC	3	6	42061	42066	0 %	0 %	50 %	50 %	313124838
1095	NC_014729	GTG	2	6	42111	42116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014729	CTACGT	2	12	42136	42147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313124839
1097	NC_014729	GAC	2	6	42161	42166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124839
1098	NC_014729	CCG	2	6	42199	42204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124839
1099	NC_014729	ACG	2	6	42216	42221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124839
1100	NC_014729	CGG	2	6	42338	42343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124839
1101	NC_014729	CG	3	6	42393	42398	0 %	0 %	50 %	50 %	313124840
1102	NC_014729	GCC	2	6	42409	42414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124840
1103	NC_014729	CAA	2	6	42440	42445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124840
1104	NC_014729	CGC	2	6	42521	42526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124840
1105	NC_014729	GAC	2	6	42546	42551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124840
1106	NC_014729	CGC	2	6	42563	42568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124840
1107	NC_014729	CCG	2	6	42610	42615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124840
1108	NC_014729	CGA	2	6	42626	42631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124840
1109	NC_014729	AGT	2	6	42668	42673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124840
1110	NC_014729	GAG	2	6	42694	42699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124840
1111	NC_014729	GAT	2	6	42726	42731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124840
1112	NC_014729	CGAGT	2	10	42752	42761	20 %	20 %	40 %	20 %	313124840
1113	NC_014729	CCA	2	6	42830	42835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124840
1114	NC_014729	GTC	2	6	42838	42843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124840
1115	NC_014729	GCG	2	6	42862	42867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124840
1116	NC_014729	CGA	2	6	42962	42967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014729	CCG	2	6	42986	42991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_014729	CGG	2	6	43025	43030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_014729	GC	3	6	43076	43081	0 %	0 %	50 %	50 %	313124841
1120	NC_014729	ACGA	2	8	43102	43109	50 %	0 %	25 %	25 %	313124841
1121	NC_014729	TC	3	6	43142	43147	0 %	50 %	0 %	50 %	313124841
1122	NC_014729	TCG	2	6	43174	43179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124841
1123	NC_014729	CTCG	2	8	43199	43206	0 %	25 %	25 %	50 %	313124841
1124	NC_014729	CTG	2	6	43257	43262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124841
1125	NC_014729	GACC	2	8	43272	43279	25 %	0 %	25 %	50 %	313124841
1126	NC_014729	TCG	2	6	43303	43308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124841
1127	NC_014729	CCG	2	6	43353	43358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124841
1128	NC_014729	GC	3	6	43393	43398	0 %	0 %	50 %	50 %	313124841
1129	NC_014729	TCG	2	6	43426	43431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124841
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1243	NC_014729	CGG	2	6	47425	47430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124846
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1247	NC_014729	ATA	2	6	47589	47594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313124846
1248	NC_014729	GTT	2	6	47630	47635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313124846
1249	NC_014729	CGG	2	6	47686	47691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124846
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1251	NC_014729	TCC	2	6	47748	47753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124846
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1365	NC_014729	CCCGT	2	10	52552	52561	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1366	NC_014729	GTCCTT	2	12	52679	52690	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313124849
1367	NC_014729	CGGAT	2	10	52708	52717	20 %	20 %	40 %	20 %	313124849
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1372	NC_014729	TCA	2	6	52851	52856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124849
1373	NC_014729	TTCG	2	8	52867	52874	0 %	50 %	25 %	25 %	313124849
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