MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 70333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014729	TC	3	6	216055	216060	0 %	50 %	0 %	50 %	313125020
5502	NC_014729	GCC	2	6	216061	216066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125020
5503	NC_014729	CGC	2	6	216080	216085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125020
5504	NC_014729	GAG	2	6	216093	216098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125020
5505	NC_014729	GTC	2	6	216117	216122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5506	NC_014729	GTC	2	6	216180	216185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5507	NC_014729	TTTC	2	8	216201	216208	0 %	75 %	0 %	25 %	313125020
5508	NC_014729	CGA	2	6	216260	216265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5509	NC_014729	CGT	2	6	216353	216358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5510	NC_014729	CGG	2	6	216373	216378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125020
5511	NC_014729	TTC	2	6	216382	216387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125020
5512	NC_014729	CGGC	2	8	216415	216422	0 %	0 %	50 %	50 %	313125020
5513	NC_014729	GAACGC	2	12	216428	216439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5514	NC_014729	TCG	3	9	216472	216480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5515	NC_014729	GAG	2	6	216495	216500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125020
5516	NC_014729	GTA	2	6	216528	216533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125020
5517	NC_014729	CCT	2	6	216574	216579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125020
5518	NC_014729	CCT	2	6	216719	216724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125020
5519	NC_014729	CGC	2	6	216774	216779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125020
5520	NC_014729	GCC	2	6	216802	216807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125020
5521	NC_014729	GAC	2	6	217026	217031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5522	NC_014729	CTC	2	6	217080	217085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125020
5523	NC_014729	GAT	2	6	217118	217123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125020
5524	NC_014729	GTC	2	6	217152	217157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125020
5525	NC_014729	GAG	3	9	217209	217217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125020
5526	NC_014729	CG	3	6	217260	217265	0 %	0 %	50 %	50 %	313125020
5527	NC_014729	CGC	2	6	217289	217294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125020
5528	NC_014729	GGTC	2	8	217400	217407	0 %	25 %	50 %	25 %	313125020
5529	NC_014729	TCGC	2	8	217423	217430	0 %	25 %	25 %	50 %	313125020
5530	NC_014729	CGA	2	6	217477	217482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_014729	TCG	2	6	217502	217507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_014729	CAG	2	6	217550	217555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125021
5533	NC_014729	CGT	2	6	217569	217574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125021
5534	NC_014729	CGC	2	6	217584	217589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125021
5535	NC_014729	TGT	2	6	217638	217643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313125021
5536	NC_014729	GTCGA	2	10	217669	217678	20 %	20 %	40 %	20 %	313125021
5537	NC_014729	GTC	2	6	217684	217689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125021
5538	NC_014729	CTT	2	6	217702	217707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125021
5539	NC_014729	GCG	2	6	217718	217723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125021
5540	NC_014729	CAA	2	6	217741	217746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125021
5541	NC_014729	CGT	2	6	217752	217757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125021
5542	NC_014729	TGGTC	2	10	217770	217779	0 %	40 %	40 %	20 %	313125021
5543	NC_014729	CCG	2	6	217787	217792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125021
5544	NC_014729	T	6	6	217837	217842	0 %	100 %	0 %	0 %	313125021
5545	NC_014729	GAT	2	6	217851	217856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125021
5546	NC_014729	GCA	2	6	217872	217877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125021
5547	NC_014729	CGC	2	6	217901	217906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125021
5548	NC_014729	GT	3	6	217995	218000	0 %	50 %	50 %	0 %	313125021
5549	NC_014729	TCCC	2	8	218009	218016	0 %	25 %	0 %	75 %	313125021
5550	NC_014729	GGTA	2	8	218099	218106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014729	GGA	2	6	218157	218162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125022
5552	NC_014729	ACGT	2	8	218187	218194	25 %	25 %	25 %	25 %	313125022
5553	NC_014729	ACCG	2	8	218197	218204	25 %	0 %	25 %	50 %	313125022
5554	NC_014729	CGTC	2	8	218247	218254	0 %	25 %	25 %	50 %	313125022
5555	NC_014729	CGA	2	6	218270	218275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125022
5556	NC_014729	CCG	2	6	218303	218308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125022
5557	NC_014729	GAC	2	6	218347	218352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125022
5558	NC_014729	GAC	2	6	218410	218415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125022
5559	NC_014729	AGCG	2	8	218497	218504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_014729	CCGA	2	8	218505	218512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_014729	AGGG	2	8	218528	218535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_014729	T	6	6	218603	218608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_014729	ACC	2	6	218689	218694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125023
5564	NC_014729	CAC	2	6	218702	218707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125023
5565	NC_014729	GAG	2	6	218733	218738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125023
5566	NC_014729	ATTC	2	8	218747	218754	25 %	50 %	0 %	25 %	313125023
5567	NC_014729	TCA	2	6	218761	218766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125023
5568	NC_014729	GAC	2	6	218817	218822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125023
5569	NC_014729	TCA	2	6	218872	218877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125023
5570	NC_014729	CCGC	2	8	218896	218903	0 %	0 %	25 %	75 %	313125023
5571	NC_014729	TAC	2	6	219049	219054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125024
5572	NC_014729	GAG	2	6	219094	219099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125024
5573	NC_014729	GTG	2	6	219231	219236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125024
5574	NC_014729	GAC	2	6	219238	219243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5575	NC_014729	CGT	2	6	219276	219281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5576	NC_014729	GCC	2	6	219360	219365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125024
5577	NC_014729	AAG	2	6	219415	219420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125024
5578	NC_014729	CGA	2	6	219489	219494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5579	NC_014729	AAG	2	6	219520	219525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125024
5580	NC_014729	GACG	2	8	219531	219538	25 %	0 %	50 %	25 %	313125024
5581	NC_014729	ACC	2	6	219576	219581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125024
5582	NC_014729	CGGCG	2	10	219654	219663	0 %	0 %	60 %	40 %	313125024
5583	NC_014729	AAC	2	6	219745	219750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125024
5584	NC_014729	TAC	2	6	219835	219840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125024
5585	NC_014729	GAT	2	6	219888	219893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125024
5586	NC_014729	GAC	2	6	220011	220016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5587	NC_014729	CGT	2	6	220028	220033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5588	NC_014729	GCG	2	6	220034	220039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125024
5589	NC_014729	CGAC	2	8	220043	220050	25 %	0 %	25 %	50 %	313125024
5590	NC_014729	CGT	2	6	220227	220232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5591	NC_014729	GTAGG	2	10	220284	220293	20 %	20 %	60 %	0 %	313125024
5592	NC_014729	GCC	2	6	220410	220415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125025
5593	NC_014729	GAG	2	6	220446	220451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125025
5594	NC_014729	G	7	7	220451	220457	0 %	0 %	100 %	0 %	313125025
5595	NC_014729	CGA	3	9	220591	220599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5596	NC_014729	CTC	2	6	220608	220613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125025
5597	NC_014729	TTCG	2	8	220617	220624	0 %	50 %	25 %	25 %	313125025
5598	NC_014729	CGC	2	6	220760	220765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125025
5599	NC_014729	GCG	2	6	220794	220799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125025
5600	NC_014729	ACG	2	6	220800	220805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5601	NC_014729	GCC	3	9	220887	220895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125025
5602	NC_014729	AGG	2	6	220910	220915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125025
5603	NC_014729	TCG	3	9	221041	221049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5604	NC_014729	ACG	2	6	221067	221072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5605	NC_014729	TTC	2	6	221076	221081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125025
5606	NC_014729	TCG	2	6	221149	221154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5607	NC_014729	GAC	2	6	221231	221236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5608	NC_014729	GAC	2	6	221298	221303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5609	NC_014729	CG	3	6	221392	221397	0 %	0 %	50 %	50 %	313125025
5610	NC_014729	AGG	2	6	221488	221493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125025
5611	NC_014729	CGA	2	6	221533	221538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5612	NC_014729	TCGC	2	8	221545	221552	0 %	25 %	25 %	50 %	313125026
5613	NC_014729	TCT	2	6	221574	221579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125026
5614	NC_014729	TCG	2	6	221589	221594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
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5616	NC_014729	CTG	2	6	221606	221611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5617	NC_014729	TATC	2	8	221623	221630	25 %	50 %	0 %	25 %	313125026
5618	NC_014729	TTC	2	6	221666	221671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125026
5619	NC_014729	TC	3	6	221692	221697	0 %	50 %	0 %	50 %	313125026
5620	NC_014729	CT	3	6	221738	221743	0 %	50 %	0 %	50 %	313125026
5621	NC_014729	TCG	2	6	221829	221834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5622	NC_014729	CTC	2	6	221840	221845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125026
5623	NC_014729	CGT	2	6	221857	221862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5624	NC_014729	TCG	2	6	221898	221903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5625	NC_014729	TCGT	2	8	221939	221946	0 %	50 %	25 %	25 %	313125026
5626	NC_014729	GAT	2	6	221950	221955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125026
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5628	NC_014729	TAC	2	6	222236	222241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125026
5629	NC_014729	ACG	2	6	222272	222277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125026
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5631	NC_014729	ATG	2	6	222344	222349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125026
5632	NC_014729	TCC	2	6	222354	222359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125026
5633	NC_014729	CGT	3	9	222379	222387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
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5640	NC_014729	TCG	2	6	222701	222706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
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5642	NC_014729	GAA	2	6	222787	222792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125027
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5645	NC_014729	CTC	2	6	222844	222849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125027
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5647	NC_014729	CCG	2	6	222914	222919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5648	NC_014729	CGA	2	6	222939	222944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125027
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5661	NC_014729	CGG	2	6	223583	223588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125027
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5664	NC_014729	CGAC	2	8	223683	223690	25 %	0 %	25 %	50 %	313125027
5665	NC_014729	TCGT	2	8	223700	223707	0 %	50 %	25 %	25 %	313125027
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5694	NC_014729	TGC	2	6	224574	224579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5696	NC_014729	CGC	2	6	224614	224619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5697	NC_014729	CTGA	2	8	224622	224629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5698	NC_014729	TG	3	6	224635	224640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5699	NC_014729	TCAAT	2	10	224649	224658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5700	NC_014729	CGTC	2	8	224734	224741	0 %	25 %	25 %	50 %	313125028
5701	NC_014729	GTC	2	6	224785	224790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
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5744	NC_014729	CGCGGC	2	12	225937	225948	0 %	0 %	50 %	50 %	313125028
5745	NC_014729	GAC	2	6	226021	226026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125028
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5747	NC_014729	CCG	2	6	226139	226144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125028
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5853	NC_014729	CGT	2	6	230174	230179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5854	NC_014729	GAC	3	9	230202	230210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125032
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5861	NC_014729	CGGCG	2	10	230441	230450	0 %	0 %	60 %	40 %	313125032
5862	NC_014729	ACA	2	6	230512	230517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125032
5863	NC_014729	CGT	2	6	230527	230532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125032
5864	NC_014729	CGG	2	6	230540	230545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125032
5865	NC_014729	ACCT	2	8	230553	230560	25 %	25 %	0 %	50 %	313125032
5866	NC_014729	CGC	2	6	230577	230582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125032
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5985	NC_014729	CG	3	6	235162	235167	0 %	0 %	50 %	50 %	313125036
5986	NC_014729	TCGC	2	8	235232	235239	0 %	25 %	25 %	50 %	313125036
5987	NC_014729	GCC	2	6	235251	235256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125036
5988	NC_014729	GAC	3	9	235264	235272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5989	NC_014729	ACG	2	6	235334	235339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5990	NC_014729	CGA	2	6	235380	235385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5991	NC_014729	CGG	2	6	235444	235449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125036
5992	NC_014729	GCG	3	9	235478	235486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125036
5993	NC_014729	CGA	2	6	235492	235497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5994	NC_014729	TCG	2	6	235614	235619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5995	NC_014729	TCG	2	6	235662	235667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5996	NC_014729	GGCG	2	8	235694	235701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5997	NC_014729	GCG	2	6	235755	235760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125037
5998	NC_014729	CGG	2	6	235781	235786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125037
5999	NC_014729	CCT	2	6	235814	235819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125037
6000	NC_014729	CTG	2	6	235841	235846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125037

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