MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 4628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	AT	3	6	262	267	50 %	50 %	0 %	0 %	312142409
2	NC_014654	TA	3	6	3087	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	312142411
3	NC_014654	AT	3	6	3187	3192	50 %	50 %	0 %	0 %	312142412
4	NC_014654	AG	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	312142412
5	NC_014654	GA	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	312142412
6	NC_014654	CT	3	6	3642	3647	0 %	50 %	0 %	50 %	312142412
7	NC_014654	AT	3	6	3787	3792	50 %	50 %	0 %	0 %	312142412
8	NC_014654	CA	3	6	3907	3912	50 %	0 %	0 %	50 %	312142412
9	NC_014654	CA	3	6	4330	4335	50 %	0 %	0 %	50 %	312142413
10	NC_014654	GA	3	6	4416	4421	50 %	0 %	50 %	0 %	312142413
11	NC_014654	AT	3	6	4424	4429	50 %	50 %	0 %	0 %	312142413
12	NC_014654	AG	3	6	4512	4517	50 %	0 %	50 %	0 %	312142414
13	NC_014654	TA	3	6	4588	4593	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
14	NC_014654	TA	3	6	4931	4936	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
15	NC_014654	TA	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
16	NC_014654	TA	3	6	6119	6124	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
17	NC_014654	TA	3	6	6434	6439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014654	TA	3	6	7411	7416	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
19	NC_014654	AT	3	6	7991	7996	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
20	NC_014654	AT	3	6	8089	8094	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
21	NC_014654	TA	3	6	9470	9475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014654	CA	3	6	9712	9717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014654	CT	3	6	10257	10262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014654	AC	3	6	10749	10754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014654	AC	3	6	10918	10923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014654	GT	3	6	10980	10985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014654	GA	3	6	11057	11062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014654	AG	3	6	11878	11883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014654	AG	3	6	12805	12810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014654	TG	3	6	12823	12828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014654	GA	3	6	12871	12876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014654	GC	3	6	13272	13277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014654	GA	3	6	13278	13283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014654	AC	3	6	14288	14293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014654	AT	3	6	14686	14691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014654	TA	3	6	14943	14948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014654	AT	3	6	15220	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014654	TA	3	6	18512	18517	50 %	50 %	0 %	0 %	312142418
39	NC_014654	AG	3	6	21602	21607	50 %	0 %	50 %	0 %	312142421
40	NC_014654	AG	4	8	21822	21829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014654	TA	3	6	22350	22355	50 %	50 %	0 %	0 %	312142422
42	NC_014654	AT	3	6	22807	22812	50 %	50 %	0 %	0 %	312142422
43	NC_014654	TA	3	6	23209	23214	50 %	50 %	0 %	0 %	312142423
44	NC_014654	GA	3	6	23488	23493	50 %	0 %	50 %	0 %	312142423
45	NC_014654	TA	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	312142423
46	NC_014654	TA	3	6	24105	24110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014654	TA	3	6	24455	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	312142425
48	NC_014654	AG	3	6	25553	25558	50 %	0 %	50 %	0 %	312142426
49	NC_014654	AT	3	6	26707	26712	50 %	50 %	0 %	0 %	312142428
50	NC_014654	AG	3	6	27328	27333	50 %	0 %	50 %	0 %	312142428
51	NC_014654	AG	3	6	27908	27913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014654	AG	3	6	29032	29037	50 %	0 %	50 %	0 %	312142429
53	NC_014654	AG	3	6	29073	29078	50 %	0 %	50 %	0 %	312142429
54	NC_014654	TA	3	6	29558	29563	50 %	50 %	0 %	0 %	312142430
55	NC_014654	AG	4	8	30228	30235	50 %	0 %	50 %	0 %	312142430
56	NC_014654	AT	3	6	30432	30437	50 %	50 %	0 %	0 %	312142430
57	NC_014654	AG	3	6	30593	30598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014654	TG	3	6	31105	31110	0 %	50 %	50 %	0 %	312142431
59	NC_014654	AG	3	6	31329	31334	50 %	0 %	50 %	0 %	312142431
60	NC_014654	AT	3	6	32055	32060	50 %	50 %	0 %	0 %	312142431
61	NC_014654	AT	3	6	32605	32610	50 %	50 %	0 %	0 %	312142432
62	NC_014654	GA	3	6	33047	33052	50 %	0 %	50 %	0 %	312142433
63	NC_014654	AT	3	6	33883	33888	50 %	50 %	0 %	0 %	312142433
64	NC_014654	TA	3	6	34058	34063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014654	AT	3	6	34258	34263	50 %	50 %	0 %	0 %	312142434
66	NC_014654	TA	3	6	34535	34540	50 %	50 %	0 %	0 %	312142434
67	NC_014654	GA	4	8	34984	34991	50 %	0 %	50 %	0 %	312142434
68	NC_014654	AG	3	6	35345	35350	50 %	0 %	50 %	0 %	312142435
69	NC_014654	TA	3	6	35555	35560	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
70	NC_014654	TA	3	6	35562	35567	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
71	NC_014654	TA	3	6	36539	36544	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
72	NC_014654	AG	3	6	37031	37036	50 %	0 %	50 %	0 %	312142435
73	NC_014654	TA	3	6	37178	37183	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
74	NC_014654	AT	3	6	37621	37626	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
75	NC_014654	TA	3	6	37901	37906	50 %	50 %	0 %	0 %	312142436
76	NC_014654	AT	3	6	38070	38075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014654	TA	3	6	38237	38242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014654	GA	3	6	38407	38412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014654	GA	3	6	39423	39428	50 %	0 %	50 %	0 %	312142437
80	NC_014654	GA	3	6	39574	39579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014654	TC	3	6	39650	39655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014654	AT	3	6	40397	40402	50 %	50 %	0 %	0 %	312142439
83	NC_014654	TA	3	6	40564	40569	50 %	50 %	0 %	0 %	312142439
84	NC_014654	AT	3	6	40694	40699	50 %	50 %	0 %	0 %	312142439
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86	NC_014654	AT	4	8	42034	42041	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
87	NC_014654	TA	5	10	42076	42085	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
88	NC_014654	TA	4	8	42322	42329	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
89	NC_014654	TA	3	6	43263	43268	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
90	NC_014654	TA	3	6	43541	43546	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
91	NC_014654	TA	3	6	43659	43664	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
92	NC_014654	AT	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
93	NC_014654	GA	3	6	43829	43834	50 %	0 %	50 %	0 %	312142441
94	NC_014654	AT	3	6	43943	43948	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
95	NC_014654	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
96	NC_014654	AT	3	6	44394	44399	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
97	NC_014654	AG	3	6	44462	44467	50 %	0 %	50 %	0 %	312142441
98	NC_014654	TA	3	6	44621	44626	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
99	NC_014654	TA	3	6	44672	44677	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
100	NC_014654	TA	3	6	45037	45042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014654	TA	7	14	45307	45320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014654	AT	3	6	45565	45570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014654	TA	4	8	45885	45892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014654	TA	3	6	46050	46055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014654	AT	3	6	46083	46088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014654	AT	3	6	46856	46861	50 %	50 %	0 %	0 %	312142442
107	NC_014654	TA	3	6	47492	47497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014654	AT	3	6	47744	47749	50 %	50 %	0 %	0 %	312142443
109	NC_014654	AT	3	6	47932	47937	50 %	50 %	0 %	0 %	312142443
110	NC_014654	AT	3	6	48156	48161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014654	AG	3	6	48501	48506	50 %	0 %	50 %	0 %	312142444
112	NC_014654	AT	3	6	48515	48520	50 %	50 %	0 %	0 %	312142444
113	NC_014654	TA	3	6	48756	48761	50 %	50 %	0 %	0 %	312142444
114	NC_014654	AT	3	6	48828	48833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014654	AT	3	6	48854	48859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014654	TA	3	6	49075	49080	50 %	50 %	0 %	0 %	312142445
117	NC_014654	AT	3	6	49244	49249	50 %	50 %	0 %	0 %	312142445
118	NC_014654	AT	4	8	50215	50222	50 %	50 %	0 %	0 %	312142445
119	NC_014654	GA	3	6	50608	50613	50 %	0 %	50 %	0 %	312142445
120	NC_014654	AT	3	6	52089	52094	50 %	50 %	0 %	0 %	312142446
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123	NC_014654	AT	4	8	52997	53004	50 %	50 %	0 %	0 %	312142447
124	NC_014654	AT	3	6	53315	53320	50 %	50 %	0 %	0 %	312142447
125	NC_014654	AG	3	6	53360	53365	50 %	0 %	50 %	0 %	312142447
126	NC_014654	TA	3	6	53511	53516	50 %	50 %	0 %	0 %	312142448
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128	NC_014654	AT	3	6	54245	54250	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
129	NC_014654	AT	3	6	54407	54412	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
130	NC_014654	AT	3	6	54441	54446	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
131	NC_014654	AT	3	6	54636	54641	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
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136	NC_014654	AT	3	6	55585	55590	50 %	50 %	0 %	0 %	312142450
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141	NC_014654	AT	3	6	56599	56604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014654	TA	3	6	56710	56715	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
143	NC_014654	AT	3	6	56753	56758	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
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145	NC_014654	AT	3	6	57096	57101	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
146	NC_014654	TA	3	6	57178	57183	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
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