MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 7780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	AATG	2	8	305	312	50 %	25 %	25 %	0 %	312142409
2	NC_014654	TTTA	2	8	587	594	25 %	75 %	0 %	0 %	312142409
3	NC_014654	ACAG	2	8	864	871	50 %	0 %	25 %	25 %	312142409
4	NC_014654	TTAT	2	8	1047	1054	25 %	75 %	0 %	0 %	312142409
5	NC_014654	TAGA	2	8	1539	1546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014654	TATT	2	8	1855	1862	25 %	75 %	0 %	0 %	312142410
7	NC_014654	AAAT	2	8	2052	2059	75 %	25 %	0 %	0 %	312142410
8	NC_014654	AATT	2	8	2632	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	312142410
9	NC_014654	GAAG	2	8	2645	2652	50 %	0 %	50 %	0 %	312142410
10	NC_014654	ATTT	3	12	2833	2844	25 %	75 %	0 %	0 %	312142410
11	NC_014654	ATGG	2	8	4893	4900	25 %	25 %	50 %	0 %	312142414
12	NC_014654	AGAT	2	8	5051	5058	50 %	25 %	25 %	0 %	312142414
13	NC_014654	TAAA	2	8	5894	5901	75 %	25 %	0 %	0 %	312142414
14	NC_014654	ATAA	2	8	5971	5978	75 %	25 %	0 %	0 %	312142414
15	NC_014654	GTAG	2	8	6543	6550	25 %	25 %	50 %	0 %	312142415
16	NC_014654	ATAA	2	8	6867	6874	75 %	25 %	0 %	0 %	312142415
17	NC_014654	ATTA	2	8	7043	7050	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
18	NC_014654	TAAA	2	8	7255	7262	75 %	25 %	0 %	0 %	312142415
19	NC_014654	AAAG	2	8	7526	7533	75 %	0 %	25 %	0 %	312142415
20	NC_014654	TAGA	2	8	7573	7580	50 %	25 %	25 %	0 %	312142415
21	NC_014654	AGAA	2	8	7757	7764	75 %	0 %	25 %	0 %	312142415
22	NC_014654	AAGG	2	8	8137	8144	50 %	0 %	50 %	0 %	312142415
23	NC_014654	TTAA	2	8	8310	8317	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
24	NC_014654	AATT	2	8	8389	8396	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
25	NC_014654	TTAG	2	8	8433	8440	25 %	50 %	25 %	0 %	312142415
26	NC_014654	GTAG	2	8	8487	8494	25 %	25 %	50 %	0 %	312142415
27	NC_014654	TAGC	2	8	9767	9774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014654	GTGA	2	8	9926	9933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014654	TGGT	2	8	10764	10771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014654	AAAT	2	8	11132	11139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014654	GCCT	2	8	11313	11320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014654	AACT	2	8	11417	11424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014654	GCGA	2	8	11732	11739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014654	CATT	2	8	12640	12647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014654	ATTG	2	8	13036	13043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014654	ACAA	2	8	13967	13974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014654	AAAC	2	8	14377	14384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014654	ATTT	2	8	14514	14521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014654	AATT	2	8	15263	15270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014654	ATTT	2	8	15416	15423	25 %	75 %	0 %	0 %	312142416
41	NC_014654	AAGT	2	8	15802	15809	50 %	25 %	25 %	0 %	312142416
42	NC_014654	AATT	2	8	15871	15878	50 %	50 %	0 %	0 %	312142416
43	NC_014654	AATT	2	8	16233	16240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014654	ATGA	2	8	17578	17585	50 %	25 %	25 %	0 %	312142417
45	NC_014654	TTTA	2	8	17931	17938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014654	TGGT	2	8	18254	18261	0 %	50 %	50 %	0 %	312142418
47	NC_014654	ATCC	2	8	18643	18650	25 %	25 %	0 %	50 %	312142418
48	NC_014654	ATCA	2	8	18697	18704	50 %	25 %	0 %	25 %	312142418
49	NC_014654	AAAG	2	8	19080	19087	75 %	0 %	25 %	0 %	312142418
50	NC_014654	TGAT	2	8	19439	19446	25 %	50 %	25 %	0 %	312142418
51	NC_014654	AGAA	2	8	19810	19817	75 %	0 %	25 %	0 %	312142419
52	NC_014654	CTGT	2	8	19998	20005	0 %	50 %	25 %	25 %	312142419
53	NC_014654	GTTA	2	8	20471	20478	25 %	50 %	25 %	0 %	312142419
54	NC_014654	TTCT	2	8	20602	20609	0 %	75 %	0 %	25 %	312142419
55	NC_014654	GAAA	2	8	20731	20738	75 %	0 %	25 %	0 %	312142420
56	NC_014654	TGGA	2	8	21337	21344	25 %	25 %	50 %	0 %	312142421
57	NC_014654	ATTA	2	8	21627	21634	50 %	50 %	0 %	0 %	312142421
58	NC_014654	GTTT	2	8	21672	21679	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014654	AATT	2	8	21839	21846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014654	AAAT	2	8	21888	21895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014654	AGAA	2	8	22594	22601	75 %	0 %	25 %	0 %	312142422
62	NC_014654	TGTT	2	8	22731	22738	0 %	75 %	25 %	0 %	312142422
63	NC_014654	AAAG	2	8	23362	23369	75 %	0 %	25 %	0 %	312142423
64	NC_014654	TAAT	2	8	23578	23585	50 %	50 %	0 %	0 %	312142423
65	NC_014654	ATTG	2	8	23590	23597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014654	GAGT	2	8	23598	23605	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014654	AAAT	2	8	25273	25280	75 %	25 %	0 %	0 %	312142426
68	NC_014654	TTCT	2	8	25363	25370	0 %	75 %	0 %	25 %	312142426
69	NC_014654	TAAA	2	8	25390	25397	75 %	25 %	0 %	0 %	312142426
70	NC_014654	ATTA	2	8	25894	25901	50 %	50 %	0 %	0 %	312142426
71	NC_014654	TTAA	2	8	25945	25952	50 %	50 %	0 %	0 %	312142427
72	NC_014654	TGAT	2	8	25997	26004	25 %	50 %	25 %	0 %	312142427
73	NC_014654	TTAT	2	8	26205	26212	25 %	75 %	0 %	0 %	312142427
74	NC_014654	TATT	2	8	26376	26383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014654	TATT	2	8	26392	26399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014654	TTAA	2	8	26756	26763	50 %	50 %	0 %	0 %	312142428
77	NC_014654	AAAG	2	8	26844	26851	75 %	0 %	25 %	0 %	312142428
78	NC_014654	GAAA	2	8	27190	27197	75 %	0 %	25 %	0 %	312142428
79	NC_014654	TAAA	2	8	27420	27427	75 %	25 %	0 %	0 %	312142428
80	NC_014654	AGAT	2	8	27547	27554	50 %	25 %	25 %	0 %	312142428
81	NC_014654	ATTG	2	8	27998	28005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014654	CAGG	2	8	28226	28233	25 %	0 %	50 %	25 %	312142429
83	NC_014654	ACAG	2	8	28313	28320	50 %	0 %	25 %	25 %	312142429
84	NC_014654	AATT	2	8	28333	28340	50 %	50 %	0 %	0 %	312142429
85	NC_014654	AAGT	2	8	28420	28427	50 %	25 %	25 %	0 %	312142429
86	NC_014654	GAAT	2	8	29051	29058	50 %	25 %	25 %	0 %	312142429
87	NC_014654	ATAA	2	8	29107	29114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014654	AATC	2	8	29284	29291	50 %	25 %	0 %	25 %	312142430
89	NC_014654	GTGG	2	8	29458	29465	0 %	25 %	75 %	0 %	312142430
90	NC_014654	ATAA	2	8	29896	29903	75 %	25 %	0 %	0 %	312142430
91	NC_014654	TTTG	2	8	30012	30019	0 %	75 %	25 %	0 %	312142430
92	NC_014654	TAAT	2	8	30518	30525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014654	AAAT	2	8	30531	30538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014654	TGCT	2	8	31584	31591	0 %	50 %	25 %	25 %	312142431
95	NC_014654	TAGG	2	8	31976	31983	25 %	25 %	50 %	0 %	312142431
96	NC_014654	AATC	2	8	32121	32128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014654	AGTC	2	8	32225	32232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014654	TTAT	2	8	33113	33120	25 %	75 %	0 %	0 %	312142433
99	NC_014654	TATT	2	8	33285	33292	25 %	75 %	0 %	0 %	312142433
100	NC_014654	GCCA	2	8	33307	33314	25 %	0 %	25 %	50 %	312142433
101	NC_014654	ATTT	2	8	34082	34089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014654	TGAT	2	8	34170	34177	25 %	50 %	25 %	0 %	312142434
103	NC_014654	TTAA	2	8	34436	34443	50 %	50 %	0 %	0 %	312142434
104	NC_014654	CTTT	2	8	34605	34612	0 %	75 %	0 %	25 %	312142434
105	NC_014654	GTAA	2	8	34916	34923	50 %	25 %	25 %	0 %	312142434
106	NC_014654	TAAG	2	8	35179	35186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014654	ATTT	2	8	35692	35699	25 %	75 %	0 %	0 %	312142435
108	NC_014654	ATTT	2	8	35967	35974	25 %	75 %	0 %	0 %	312142435
109	NC_014654	AAGC	2	8	36702	36709	50 %	0 %	25 %	25 %	312142435
110	NC_014654	GATT	2	8	36939	36946	25 %	50 %	25 %	0 %	312142435
111	NC_014654	ACAA	2	8	38526	38533	75 %	0 %	0 %	25 %	312142437
112	NC_014654	GAAA	2	8	38904	38911	75 %	0 %	25 %	0 %	312142437
113	NC_014654	TGAT	2	8	39114	39121	25 %	50 %	25 %	0 %	312142437
114	NC_014654	TAAT	2	8	39159	39166	50 %	50 %	0 %	0 %	312142437
115	NC_014654	TCTT	2	8	39478	39485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014654	TTAA	2	8	39810	39817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014654	TAAT	2	8	39835	39842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014654	ATTG	2	8	39936	39943	25 %	50 %	25 %	0 %	312142438
119	NC_014654	TCTT	2	8	40035	40042	0 %	75 %	0 %	25 %	312142438
120	NC_014654	TTCT	2	8	40190	40197	0 %	75 %	0 %	25 %	312142439
121	NC_014654	TCTT	2	8	40259	40266	0 %	75 %	0 %	25 %	312142439
122	NC_014654	ATTT	2	8	40465	40472	25 %	75 %	0 %	0 %	312142439
123	NC_014654	ACCT	2	8	40921	40928	25 %	25 %	0 %	50 %	312142439
124	NC_014654	ATAG	2	8	42014	42021	50 %	25 %	25 %	0 %	312142441
125	NC_014654	ATAA	2	8	42122	42129	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
126	NC_014654	AAGT	2	8	42462	42469	50 %	25 %	25 %	0 %	312142441
127	NC_014654	AAAT	2	8	42628	42635	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
128	NC_014654	AAAT	2	8	43158	43165	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
129	NC_014654	AATT	2	8	43386	43393	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
130	NC_014654	AAAT	2	8	43503	43510	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
131	NC_014654	AAAT	2	8	43533	43540	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
132	NC_014654	ATTT	2	8	43563	43570	25 %	75 %	0 %	0 %	312142441
133	NC_014654	AAAC	2	8	43726	43733	75 %	0 %	0 %	25 %	312142441
134	NC_014654	AATA	2	8	43955	43962	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
135	NC_014654	GAAA	2	8	44356	44363	75 %	0 %	25 %	0 %	312142441
136	NC_014654	GATA	2	8	44365	44372	50 %	25 %	25 %	0 %	312142441
137	NC_014654	GAAA	2	8	44434	44441	75 %	0 %	25 %	0 %	312142441
138	NC_014654	TAAA	2	8	44763	44770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014654	TATT	2	8	44862	44869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014654	GTGG	2	8	45447	45454	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014654	GAAG	2	8	45662	45669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014654	TAAT	2	8	45686	45693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014654	AGTT	2	8	45783	45790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014654	GAAA	2	8	45898	45905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014654	AACA	2	8	46285	46292	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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