MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 4704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	308183797
2	NC_014560	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	308183797
3	NC_014560	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	308183798
4	NC_014560	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	308183799
5	NC_014560	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	308183799
6	NC_014560	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	308183800
7	NC_014560	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	308183800
8	NC_014560	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	308183800
9	NC_014560	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	308183800
10	NC_014560	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	308183800
11	NC_014560	GTTT	2	8	2427	2434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014560	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	308183802
13	NC_014560	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	308183802
14	NC_014560	AGAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	308183802
15	NC_014560	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014560	GTTT	2	8	4916	4923	0 %	75 %	25 %	0 %	308183803
17	NC_014560	GCTT	2	8	5034	5041	0 %	50 %	25 %	25 %	308183803
18	NC_014560	CAAA	2	8	5137	5144	75 %	0 %	0 %	25 %	308183804
19	NC_014560	CAAA	2	8	5269	5276	75 %	0 %	0 %	25 %	308183805
20	NC_014560	ACCC	2	8	5290	5297	25 %	0 %	0 %	75 %	308183805
21	NC_014560	TCGC	2	8	5532	5539	0 %	25 %	25 %	50 %	308183806
22	NC_014560	CATT	2	8	5605	5612	25 %	50 %	0 %	25 %	308183806
23	NC_014560	GCTT	2	8	6998	7005	0 %	50 %	25 %	25 %	308183806
24	NC_014560	ATCG	2	8	7151	7158	25 %	25 %	25 %	25 %	308183806
25	NC_014560	CGTT	2	8	7186	7193	0 %	50 %	25 %	25 %	308183806
26	NC_014560	GTTT	2	8	7535	7542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014560	TTCA	2	8	7962	7969	25 %	50 %	0 %	25 %	308183808
28	NC_014560	TCTT	2	8	8256	8263	0 %	75 %	0 %	25 %	308183808
29	NC_014560	ATAA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014560	TATT	2	8	9959	9966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014560	TCAA	2	8	10166	10173	50 %	25 %	0 %	25 %	308183810
32	NC_014560	TTTG	2	8	10986	10993	0 %	75 %	25 %	0 %	308183810
33	NC_014560	GTTT	2	8	11082	11089	0 %	75 %	25 %	0 %	308183810
34	NC_014560	CTTT	2	8	11614	11621	0 %	75 %	0 %	25 %	308183810
35	NC_014560	TCAA	2	8	12082	12089	50 %	25 %	0 %	25 %	308183811
36	NC_014560	GCAA	2	8	12152	12159	50 %	0 %	25 %	25 %	308183811
37	NC_014560	TGCT	2	8	12357	12364	0 %	50 %	25 %	25 %	308183811
38	NC_014560	GCCG	2	8	12621	12628	0 %	0 %	50 %	50 %	308183811
39	NC_014560	TGCA	2	8	12836	12843	25 %	25 %	25 %	25 %	308183812
40	NC_014560	AGCA	2	8	12891	12898	50 %	0 %	25 %	25 %	308183812
41	NC_014560	GTTT	2	8	13249	13256	0 %	75 %	25 %	0 %	308183812
42	NC_014560	TCTT	2	8	13636	13643	0 %	75 %	0 %	25 %	308183812
43	NC_014560	TTAA	2	8	13785	13792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014560	AGCG	2	8	14108	14115	25 %	0 %	50 %	25 %	308183814
45	NC_014560	GATT	2	8	14216	14223	25 %	50 %	25 %	0 %	308183814
46	NC_014560	CAAA	2	8	14385	14392	75 %	0 %	0 %	25 %	308183815
47	NC_014560	ATGC	2	8	14800	14807	25 %	25 %	25 %	25 %	308183815
48	NC_014560	TCAA	2	8	15059	15066	50 %	25 %	0 %	25 %	308183815
49	NC_014560	GAGC	2	8	15105	15112	25 %	0 %	50 %	25 %	308183815
50	NC_014560	TTTA	2	8	15387	15394	25 %	75 %	0 %	0 %	308183815
51	NC_014560	TGAT	2	8	16589	16596	25 %	50 %	25 %	0 %	308183815
52	NC_014560	ATCT	2	8	18125	18132	25 %	50 %	0 %	25 %	308183816
53	NC_014560	GTTT	2	8	18343	18350	0 %	75 %	25 %	0 %	308183816
54	NC_014560	TTGA	2	8	18691	18698	25 %	50 %	25 %	0 %	308183817
55	NC_014560	AGCG	2	8	19239	19246	25 %	0 %	50 %	25 %	308183817
56	NC_014560	TAAA	2	8	20745	20752	75 %	25 %	0 %	0 %	308183819
57	NC_014560	GCGA	2	8	20754	20761	25 %	0 %	50 %	25 %	308183819
58	NC_014560	GCGT	2	8	21054	21061	0 %	25 %	50 %	25 %	308183819
59	NC_014560	CTTT	2	8	21611	21618	0 %	75 %	0 %	25 %	308183820
60	NC_014560	AAGT	2	8	21923	21930	50 %	25 %	25 %	0 %	308183820
61	NC_014560	AACT	2	8	22674	22681	50 %	25 %	0 %	25 %	308183820
62	NC_014560	CTTT	2	8	22688	22695	0 %	75 %	0 %	25 %	308183820
63	NC_014560	AATC	2	8	22826	22833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014560	TTTA	2	8	23193	23200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014560	GTTT	2	8	23859	23866	0 %	75 %	25 %	0 %	308183823
66	NC_014560	TCCC	2	8	25008	25015	0 %	25 %	0 %	75 %	308183823
67	NC_014560	ATTA	2	8	25582	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014560	GCTT	2	8	25991	25998	0 %	50 %	25 %	25 %	308183825
69	NC_014560	ATAA	2	8	26807	26814	75 %	25 %	0 %	0 %	308183826
70	NC_014560	GCTC	2	8	28332	28339	0 %	25 %	25 %	50 %	308183827
71	NC_014560	GATG	2	8	28779	28786	25 %	25 %	50 %	0 %	308183827
72	NC_014560	GAAT	2	8	29037	29044	50 %	25 %	25 %	0 %	308183828
73	NC_014560	TGGC	2	8	29260	29267	0 %	25 %	50 %	25 %	308183828
74	NC_014560	GCGT	2	8	29394	29401	0 %	25 %	50 %	25 %	308183828
75	NC_014560	TTTA	2	8	29413	29420	25 %	75 %	0 %	0 %	308183828
76	NC_014560	TGGT	2	8	29931	29938	0 %	50 %	50 %	0 %	308183829
77	NC_014560	TGCT	2	8	30320	30327	0 %	50 %	25 %	25 %	308183830
78	NC_014560	AGCA	2	8	30437	30444	50 %	0 %	25 %	25 %	308183830
79	NC_014560	CAAT	2	8	30451	30458	50 %	25 %	0 %	25 %	308183830
80	NC_014560	AGAA	2	8	30803	30810	75 %	0 %	25 %	0 %	308183830
81	NC_014560	AGCA	2	8	30959	30966	50 %	0 %	25 %	25 %	308183830
82	NC_014560	GGTT	2	8	31982	31989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014560	TTTA	2	8	32116	32123	25 %	75 %	0 %	0 %	308183831
84	NC_014560	GCGA	2	8	32314	32321	25 %	0 %	50 %	25 %	308183831
85	NC_014560	ACCC	2	8	32425	32432	25 %	0 %	0 %	75 %	308183832
86	NC_014560	CATC	2	8	32551	32558	25 %	25 %	0 %	50 %	308183832
87	NC_014560	TGAA	2	8	32705	32712	50 %	25 %	25 %	0 %	308183833
88	NC_014560	CCAA	2	8	32905	32912	50 %	0 %	0 %	50 %	308183833
89	NC_014560	TCGT	2	8	33063	33070	0 %	50 %	25 %	25 %	308183833
90	NC_014560	CATC	2	8	33317	33324	25 %	25 %	0 %	50 %	308183833
91	NC_014560	CATG	2	8	33819	33826	25 %	25 %	25 %	25 %	308183833
92	NC_014560	CGCT	2	8	33935	33942	0 %	25 %	25 %	50 %	308183833
93	NC_014560	TCAT	2	8	34760	34767	25 %	50 %	0 %	25 %	308183833
94	NC_014560	TTGC	3	12	34832	34843	0 %	50 %	25 %	25 %	308183833
95	NC_014560	GAAA	2	8	34893	34900	75 %	0 %	25 %	0 %	308183833
96	NC_014560	ATGA	2	8	35174	35181	50 %	25 %	25 %	0 %	308183834
97	NC_014560	GGGC	2	8	35274	35281	0 %	0 %	75 %	25 %	308183835
98	NC_014560	CGAG	2	8	35788	35795	25 %	0 %	50 %	25 %	308183836
99	NC_014560	TTGT	2	8	36769	36776	0 %	75 %	25 %	0 %	308183837
100	NC_014560	CTTT	2	8	36916	36923	0 %	75 %	0 %	25 %	308183837
101	NC_014560	AATA	2	8	37593	37600	75 %	25 %	0 %	0 %	308183837
102	NC_014560	TAAA	2	8	37615	37622	75 %	25 %	0 %	0 %	308183837
103	NC_014560	ATTT	2	8	37776	37783	25 %	75 %	0 %	0 %	308183839
104	NC_014560	TTTG	2	8	38375	38382	0 %	75 %	25 %	0 %	308183839
105	NC_014560	CGAA	2	8	38565	38572	50 %	0 %	25 %	25 %	308183840
106	NC_014560	TGAT	2	8	38865	38872	25 %	50 %	25 %	0 %	308183840
107	NC_014560	AAAC	2	8	39775	39782	75 %	0 %	0 %	25 %	308183841
108	NC_014560	CAAA	2	8	39851	39858	75 %	0 %	0 %	25 %	308183841
109	NC_014560	ATTG	2	8	40265	40272	25 %	50 %	25 %	0 %	308183841
110	NC_014560	ATTG	2	8	40331	40338	25 %	50 %	25 %	0 %	308183841
111	NC_014560	ATCA	2	8	40440	40447	50 %	25 %	0 %	25 %	308183841
112	NC_014560	TCAA	2	8	40453	40460	50 %	25 %	0 %	25 %	308183841
113	NC_014560	TGTT	2	8	41227	41234	0 %	75 %	25 %	0 %	308183842
114	NC_014560	AAAG	2	8	41547	41554	75 %	0 %	25 %	0 %	308183842
115	NC_014560	CTTT	2	8	41820	41827	0 %	75 %	0 %	25 %	308183842
116	NC_014560	GAAA	2	8	42108	42115	75 %	0 %	25 %	0 %	308183843
117	NC_014560	GATC	2	8	42237	42244	25 %	25 %	25 %	25 %	308183843
118	NC_014560	ATGA	2	8	43244	43251	50 %	25 %	25 %	0 %	308183843
119	NC_014560	CAAA	2	8	44083	44090	75 %	0 %	0 %	25 %	308183844
120	NC_014560	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014560	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014560	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014560	AAAT	2	8	44641	44648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014560	GATT	2	8	44727	44734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014560	TTTC	2	8	44934	44941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014560	TTGA	2	8	45211	45218	25 %	50 %	25 %	0 %	308183847
127	NC_014560	CGCT	2	8	45366	45373	0 %	25 %	25 %	50 %	308183847
128	NC_014560	GTTT	2	8	45988	45995	0 %	75 %	25 %	0 %	308183847
129	NC_014560	CAAA	2	8	46484	46491	75 %	0 %	0 %	25 %	308183848
130	NC_014560	TCGC	2	8	47299	47306	0 %	25 %	25 %	50 %	308183848
131	NC_014560	AGGG	2	8	47310	47317	25 %	0 %	75 %	0 %	308183848
132	NC_014560	GCAA	2	8	47963	47970	50 %	0 %	25 %	25 %	308183848
133	NC_014560	TAAA	2	8	48232	48239	75 %	25 %	0 %	0 %	308183848
134	NC_014560	AGCG	3	12	48655	48666	25 %	0 %	50 %	25 %	308183849
135	NC_014560	TTCA	2	8	49275	49282	25 %	50 %	0 %	25 %	308183849
136	NC_014560	CTTT	2	8	49621	49628	0 %	75 %	0 %	25 %	308183850
137	NC_014560	TTGC	2	8	50098	50105	0 %	50 %	25 %	25 %	308183851
138	NC_014560	TGGT	2	8	50381	50388	0 %	50 %	50 %	0 %	308183851
139	NC_014560	TCTT	2	8	50674	50681	0 %	75 %	0 %	25 %	308183851
140	NC_014560	AAAT	2	8	51067	51074	75 %	25 %	0 %	0 %	308183851
141	NC_014560	AAAG	2	8	51376	51383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_014560	AAAT	2	8	51736	51743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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