MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 34689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014560	T	8	8	189195	189202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014560	TTA	2	6	189211	189216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014560	AT	3	6	189302	189307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014560	GA	3	6	189308	189313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014560	TGG	3	9	189360	189368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183982
4006	NC_014560	GTGA	2	8	189404	189411	25 %	25 %	50 %	0 %	308183982
4007	NC_014560	ATTT	2	8	189480	189487	25 %	75 %	0 %	0 %	308183982
4008	NC_014560	T	6	6	189538	189543	0 %	100 %	0 %	0 %	308183982
4009	NC_014560	T	8	8	189569	189576	0 %	100 %	0 %	0 %	308183982
4010	NC_014560	T	6	6	189651	189656	0 %	100 %	0 %	0 %	308183982
4011	NC_014560	T	6	6	189670	189675	0 %	100 %	0 %	0 %	308183982
4012	NC_014560	CTTT	2	8	189680	189687	0 %	75 %	0 %	25 %	308183982
4013	NC_014560	CT	3	6	189701	189706	0 %	50 %	0 %	50 %	308183982
4014	NC_014560	TGA	2	6	189717	189722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183982
4015	NC_014560	CCA	2	6	189765	189770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183982
4016	NC_014560	GAA	2	6	189845	189850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183982
4017	NC_014560	TAA	2	6	189904	189909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183982
4018	NC_014560	AAAAG	2	10	189937	189946	80 %	0 %	20 %	0 %	308183982
4019	NC_014560	ACCCC	2	10	190002	190011	20 %	0 %	0 %	80 %	308183982
4020	NC_014560	TAA	2	6	190015	190020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183982
4021	NC_014560	CAA	2	6	190064	190069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183983
4022	NC_014560	GA	3	6	190093	190098	50 %	0 %	50 %	0 %	308183983
4023	NC_014560	TGC	2	6	190147	190152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183983
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4030	NC_014560	AATC	2	8	190780	190787	50 %	25 %	0 %	25 %	308183983
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4032	NC_014560	TTGA	2	8	190877	190884	25 %	50 %	25 %	0 %	308183983
4033	NC_014560	ACT	2	6	190905	190910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183983
4034	NC_014560	ATC	2	6	190940	190945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183983
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4036	NC_014560	GAAA	2	8	191341	191348	75 %	0 %	25 %	0 %	308183983
4037	NC_014560	GAA	2	6	191357	191362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183983
4038	NC_014560	TG	3	6	191386	191391	0 %	50 %	50 %	0 %	308183983
4039	NC_014560	C	6	6	191411	191416	0 %	0 %	0 %	100 %	308183983
4040	NC_014560	AGGCAT	2	12	191428	191439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308183983
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4042	NC_014560	T	6	6	191556	191561	0 %	100 %	0 %	0 %	308183984
4043	NC_014560	GAA	2	6	191599	191604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183984
4044	NC_014560	AGCG	2	8	191637	191644	25 %	0 %	50 %	25 %	308183984
4045	NC_014560	AATA	2	8	191695	191702	75 %	25 %	0 %	0 %	308183984
4046	NC_014560	TAT	2	6	191728	191733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183984
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4049	NC_014560	GAA	2	6	192004	192009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183984
4050	NC_014560	TG	3	6	192048	192053	0 %	50 %	50 %	0 %	308183984
4051	NC_014560	GATT	2	8	192078	192085	25 %	50 %	25 %	0 %	308183984
4052	NC_014560	TGA	2	6	192108	192113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183984
4053	NC_014560	TAC	2	6	192125	192130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183984
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4056	NC_014560	G	6	6	192244	192249	0 %	0 %	100 %	0 %	308183984
4057	NC_014560	ATG	2	6	192263	192268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183984
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4063	NC_014560	CAA	2	6	192781	192786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183984
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4070	NC_014560	GGA	2	6	193047	193052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308183985
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4073	NC_014560	AATG	2	8	193262	193269	50 %	25 %	25 %	0 %	308183985
4074	NC_014560	CCTTA	2	10	193293	193302	20 %	40 %	0 %	40 %	308183985
4075	NC_014560	TGAA	2	8	193392	193399	50 %	25 %	25 %	0 %	308183986
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4093	NC_014560	AAG	2	6	193932	193937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183986
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4095	NC_014560	AACC	2	8	193960	193967	50 %	0 %	0 %	50 %	308183986
4096	NC_014560	ATT	2	6	193980	193985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183986
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4098	NC_014560	CTA	2	6	194073	194078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183986
4099	NC_014560	AGCA	2	8	194105	194112	50 %	0 %	25 %	25 %	308183986
4100	NC_014560	ATGC	2	8	194123	194130	25 %	25 %	25 %	25 %	308183986
4101	NC_014560	AAG	2	6	194144	194149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183986
4102	NC_014560	TGT	2	6	194161	194166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183986
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4104	NC_014560	T	7	7	194310	194316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014560	AAT	2	6	194351	194356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014560	CATT	2	8	194385	194392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_014560	ATT	2	6	194448	194453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014560	AGA	2	6	194485	194490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014560	AG	3	6	194539	194544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014560	CT	3	6	194557	194562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_014560	GCG	2	6	194586	194591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183987
4112	NC_014560	A	6	6	194600	194605	100 %	0 %	0 %	0 %	308183987
4113	NC_014560	TCA	2	6	194631	194636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183987
4114	NC_014560	TTA	2	6	194644	194649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183987
4115	NC_014560	TTG	2	6	194658	194663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183987
4116	NC_014560	TAC	2	6	194701	194706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183987
4117	NC_014560	T	7	7	194721	194727	0 %	100 %	0 %	0 %	308183987
4118	NC_014560	T	6	6	194816	194821	0 %	100 %	0 %	0 %	308183987
4119	NC_014560	TAA	2	6	194867	194872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183987
4120	NC_014560	GAT	2	6	194882	194887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183987
4121	NC_014560	T	6	6	194927	194932	0 %	100 %	0 %	0 %	308183987
4122	NC_014560	AGA	2	6	194971	194976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308183987
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4124	NC_014560	GTT	2	6	195005	195010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183987
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4126	NC_014560	TCA	2	6	195099	195104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183987
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