MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 34689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014560	TTAA	2	8	143377	143384	50 %	50 %	0 %	0 %	308183929
3002	NC_014560	TCTT	2	8	143396	143403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_014560	T	9	9	143410	143418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014560	T	6	6	143470	143475	0 %	100 %	0 %	0 %	308183930
3005	NC_014560	TGT	2	6	143493	143498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183930
3006	NC_014560	A	6	6	143519	143524	100 %	0 %	0 %	0 %	308183930
3007	NC_014560	A	6	6	143562	143567	100 %	0 %	0 %	0 %	308183930
3008	NC_014560	AAAAAT	2	12	143586	143597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	308183930
3009	NC_014560	A	6	6	143637	143642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014560	GTC	2	6	143654	143659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_014560	CAAA	2	8	143736	143743	75 %	0 %	0 %	25 %	308183931
3012	NC_014560	A	7	7	143748	143754	100 %	0 %	0 %	0 %	308183931
3013	NC_014560	T	6	6	143758	143763	0 %	100 %	0 %	0 %	308183931
3014	NC_014560	GA	3	6	143770	143775	50 %	0 %	50 %	0 %	308183931
3015	NC_014560	A	6	6	143782	143787	100 %	0 %	0 %	0 %	308183931
3016	NC_014560	CT	3	6	143831	143836	0 %	50 %	0 %	50 %	308183931
3017	NC_014560	TGA	3	9	143904	143912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183932
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3019	NC_014560	T	6	6	143989	143994	0 %	100 %	0 %	0 %	308183932
3020	NC_014560	ACA	2	6	144083	144088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308183932
3021	NC_014560	TTTTC	2	10	144093	144102	0 %	80 %	0 %	20 %	308183932
3022	NC_014560	CAC	2	6	144181	144186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183932
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3024	NC_014560	TAG	2	6	144293	144298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183933
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3026	NC_014560	T	6	6	144469	144474	0 %	100 %	0 %	0 %	308183933
3027	NC_014560	TGA	2	6	144498	144503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183933
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3030	NC_014560	ATTCAA	2	12	144673	144684	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	308183933
3031	NC_014560	T	6	6	144703	144708	0 %	100 %	0 %	0 %	308183933
3032	NC_014560	TTGC	2	8	144738	144745	0 %	50 %	25 %	25 %	308183933
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3035	NC_014560	ATT	2	6	145298	145303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183934
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3037	NC_014560	ACC	2	6	145326	145331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308183934
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3040	NC_014560	TAA	2	6	145481	145486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183934
3041	NC_014560	ATG	2	6	145488	145493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183934
3042	NC_014560	CTT	2	6	145498	145503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183934
3043	NC_014560	ATC	2	6	145517	145522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183934
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3047	NC_014560	CTA	2	6	145627	145632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183934
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3052	NC_014560	TTC	2	6	145850	145855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183934
3053	NC_014560	TTGC	2	8	145871	145878	0 %	50 %	25 %	25 %	308183934
3054	NC_014560	ATGG	2	8	145886	145893	25 %	25 %	50 %	0 %	308183934
3055	NC_014560	ACG	2	6	145899	145904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183934
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3057	NC_014560	GAT	2	6	145934	145939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308183934
3058	NC_014560	TTTC	2	8	145978	145985	0 %	75 %	0 %	25 %	308183934
3059	NC_014560	TCGC	2	8	146010	146017	0 %	25 %	25 %	50 %	308183934
3060	NC_014560	TTCTT	2	10	146049	146058	0 %	80 %	0 %	20 %	308183934
3061	NC_014560	T	7	7	146136	146142	0 %	100 %	0 %	0 %	308183934
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3084	NC_014560	AGTT	2	8	147284	147291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_014560	ATT	2	6	147325	147330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_014560	CTTT	2	8	147555	147562	0 %	75 %	0 %	25 %	308183936
3092	NC_014560	AAAG	2	8	147649	147656	75 %	0 %	25 %	0 %	308183936
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3099	NC_014560	T	6	6	147960	147965	0 %	100 %	0 %	0 %	308183936
3100	NC_014560	ATGG	2	8	147979	147986	25 %	25 %	50 %	0 %	308183936
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3107	NC_014560	GCC	2	6	148459	148464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308183936
3108	NC_014560	TTG	2	6	148480	148485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308183936
3109	NC_014560	GCGAT	2	10	148499	148508	20 %	20 %	40 %	20 %	308183936
3110	NC_014560	CGCT	2	8	148613	148620	0 %	25 %	25 %	50 %	308183936
3111	NC_014560	CTTT	2	8	148652	148659	0 %	75 %	0 %	25 %	308183936
3112	NC_014560	GGCT	2	8	148672	148679	0 %	25 %	50 %	25 %	308183936
3113	NC_014560	CA	3	6	148749	148754	50 %	0 %	0 %	50 %	308183936
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3119	NC_014560	CAT	2	6	148977	148982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183936
3120	NC_014560	T	6	6	149041	149046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014560	TCA	2	6	149059	149064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183937
3122	NC_014560	TAT	2	6	149124	149129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183937
3123	NC_014560	ATT	2	6	149201	149206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183937
3124	NC_014560	TGG	2	6	149238	149243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183937
3125	NC_014560	ATC	2	6	149294	149299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183937
3126	NC_014560	T	7	7	149310	149316	0 %	100 %	0 %	0 %	308183937
3127	NC_014560	AAAG	2	8	149357	149364	75 %	0 %	25 %	0 %	308183937
3128	NC_014560	TTTTG	2	10	149414	149423	0 %	80 %	20 %	0 %	308183937
3129	NC_014560	GCT	2	6	149513	149518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308183937
3130	NC_014560	T	8	8	149643	149650	0 %	100 %	0 %	0 %	308183937
3131	NC_014560	ATGG	2	8	149687	149694	25 %	25 %	50 %	0 %	308183937
3132	NC_014560	TTTC	2	8	149742	149749	0 %	75 %	0 %	25 %	308183937
3133	NC_014560	GC	3	6	149754	149759	0 %	0 %	50 %	50 %	308183937
3134	NC_014560	ATT	2	6	149775	149780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308183937
3135	NC_014560	CAT	2	6	149912	149917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183937
3136	NC_014560	T	7	7	149989	149995	0 %	100 %	0 %	0 %	308183937
3137	NC_014560	GCCC	2	8	150081	150088	0 %	0 %	25 %	75 %	308183937
3138	NC_014560	GGT	2	6	150121	150126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183937
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3140	NC_014560	TTC	2	6	150319	150324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183937
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3142	NC_014560	GTGG	2	8	150509	150516	0 %	25 %	75 %	0 %	308183937
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3145	NC_014560	GCG	2	6	150563	150568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308183937
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3153	NC_014560	CTT	2	6	151038	151043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308183938
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3155	NC_014560	GT	3	6	151070	151075	0 %	50 %	50 %	0 %	308183938
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3157	NC_014560	GTG	2	6	151405	151410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183938
3158	NC_014560	T	8	8	151434	151441	0 %	100 %	0 %	0 %	308183938
3159	NC_014560	AAT	2	6	151458	151463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183938
3160	NC_014560	A	6	6	151541	151546	100 %	0 %	0 %	0 %	308183938
3161	NC_014560	TCA	2	6	151593	151598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183938
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3193	NC_014560	TTA	2	6	153226	153231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3195	NC_014560	TAC	2	6	153311	153316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3240	NC_014560	A	8	8	155617	155624	100 %	0 %	0 %	0 %	308183942
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3245	NC_014560	GCA	2	6	155782	155787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308183943
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3247	NC_014560	AAT	2	6	155911	155916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308183943
3248	NC_014560	TG	3	6	155955	155960	0 %	50 %	50 %	0 %	308183943
3249	NC_014560	T	6	6	155973	155978	0 %	100 %	0 %	0 %	308183943
3250	NC_014560	TGG	2	6	156089	156094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308183943
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3486	NC_014560	CA	3	6	166992	166997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3487	NC_014560	T	6	6	167013	167018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3491	NC_014560	A	6	6	167123	167128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_014560	T	6	6	167142	167147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_014560	A	7	7	167148	167154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3498	NC_014560	TTG	2	6	167289	167294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_014560	CAT	3	9	167358	167366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308183959
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