MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 34689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014560	ATC	2	6	213963	213968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184006
4502	NC_014560	GAA	2	6	214071	214076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184006
4503	NC_014560	CCA	2	6	214158	214163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308184006
4504	NC_014560	TGA	2	6	214222	214227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184006
4505	NC_014560	CTA	2	6	214314	214319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184006
4506	NC_014560	ATG	2	6	214353	214358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184006
4507	NC_014560	A	6	6	214398	214403	100 %	0 %	0 %	0 %	308184006
4508	NC_014560	TGA	2	6	214435	214440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184006
4509	NC_014560	ATG	2	6	214456	214461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184006
4510	NC_014560	GCGA	2	8	214499	214506	25 %	0 %	50 %	25 %	308184006
4511	NC_014560	ATT	2	6	214527	214532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184006
4512	NC_014560	G	6	6	214534	214539	0 %	0 %	100 %	0 %	308184006
4513	NC_014560	TGG	3	9	214552	214560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184006
4514	NC_014560	TAC	2	6	214634	214639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184006
4515	NC_014560	TG	3	6	214739	214744	0 %	50 %	50 %	0 %	308184006
4516	NC_014560	AG	3	6	214760	214765	50 %	0 %	50 %	0 %	308184006
4517	NC_014560	ATT	2	6	214796	214801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184006
4518	NC_014560	G	7	7	214860	214866	0 %	0 %	100 %	0 %	308184006
4519	NC_014560	TC	3	6	214888	214893	0 %	50 %	0 %	50 %	308184006
4520	NC_014560	A	6	6	214924	214929	100 %	0 %	0 %	0 %	308184006
4521	NC_014560	AG	4	8	214955	214962	50 %	0 %	50 %	0 %	308184006
4522	NC_014560	GAAAAA	2	12	214965	214976	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	308184006
4523	NC_014560	ATA	2	6	214984	214989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184006
4524	NC_014560	TGCT	2	8	215015	215022	0 %	50 %	25 %	25 %	308184006
4525	NC_014560	A	6	6	215047	215052	100 %	0 %	0 %	0 %	308184007
4526	NC_014560	TTTG	2	8	215077	215084	0 %	75 %	25 %	0 %	308184007
4527	NC_014560	AGA	2	6	215117	215122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184007
4528	NC_014560	AGA	2	6	215133	215138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184007
4529	NC_014560	TTA	2	6	215178	215183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184007
4530	NC_014560	T	6	6	215303	215308	0 %	100 %	0 %	0 %	308184007
4531	NC_014560	GCA	2	6	215356	215361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308184007
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4533	NC_014560	CA	3	6	215454	215459	50 %	0 %	0 %	50 %	308184007
4534	NC_014560	TAAA	2	8	215482	215489	75 %	25 %	0 %	0 %	308184007
4535	NC_014560	CAAT	2	8	215518	215525	50 %	25 %	0 %	25 %	308184007
4536	NC_014560	TTC	2	6	215540	215545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184007
4537	NC_014560	AGT	2	6	215587	215592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184007
4538	NC_014560	CTT	2	6	215611	215616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184007
4539	NC_014560	TC	3	6	215721	215726	0 %	50 %	0 %	50 %	308184007
4540	NC_014560	A	6	6	215759	215764	100 %	0 %	0 %	0 %	308184007
4541	NC_014560	ATC	2	6	215777	215782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184007
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4543	NC_014560	ATC	2	6	215811	215816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184007
4544	NC_014560	T	6	6	215912	215917	0 %	100 %	0 %	0 %	308184007
4545	NC_014560	TAA	2	6	215949	215954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184007
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4547	NC_014560	TCT	2	6	216033	216038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184007
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4549	NC_014560	CT	9	18	216103	216120	0 %	50 %	0 %	50 %	308184008
4550	NC_014560	AAT	2	6	216170	216175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184008
4551	NC_014560	TAT	2	6	216176	216181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184008
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4553	NC_014560	TGCA	2	8	216211	216218	25 %	25 %	25 %	25 %	308184008
4554	NC_014560	A	7	7	216254	216260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014560	T	6	6	216266	216271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014560	T	14	14	216284	216297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_014560	GTTT	2	8	216315	216322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_014560	ATA	2	6	216329	216334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_014560	A	6	6	216347	216352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014560	CAAT	2	8	216483	216490	50 %	25 %	0 %	25 %	308184009
4561	NC_014560	A	6	6	216501	216506	100 %	0 %	0 %	0 %	308184009
4562	NC_014560	TGGGG	2	10	216605	216614	0 %	20 %	80 %	0 %	308184009
4563	NC_014560	G	6	6	216611	216616	0 %	0 %	100 %	0 %	308184009
4564	NC_014560	GATG	2	8	216656	216663	25 %	25 %	50 %	0 %	308184009
4565	NC_014560	CAGC	2	8	216687	216694	25 %	0 %	25 %	50 %	308184009
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4570	NC_014560	ATT	2	6	217204	217209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184009
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4573	NC_014560	ATA	2	6	217555	217560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184009
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4575	NC_014560	T	6	6	217635	217640	0 %	100 %	0 %	0 %	308184009
4576	NC_014560	TGA	2	6	217693	217698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184009
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4578	NC_014560	TTTA	2	8	217804	217811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014560	TGA	2	6	217878	217883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184010
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4582	NC_014560	AG	3	6	217919	217924	50 %	0 %	50 %	0 %	308184010
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4585	NC_014560	A	7	7	218039	218045	100 %	0 %	0 %	0 %	308184010
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4589	NC_014560	GTGA	2	8	218279	218286	25 %	25 %	50 %	0 %	308184010
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4591	NC_014560	A	6	6	218486	218491	100 %	0 %	0 %	0 %	308184010
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4595	NC_014560	TGA	3	9	218761	218769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184010
4596	NC_014560	TTG	2	6	218777	218782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184010
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4598	NC_014560	A	7	7	218940	218946	100 %	0 %	0 %	0 %	308184010
4599	NC_014560	AAG	2	6	218985	218990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184010
4600	NC_014560	TTG	2	6	219032	219037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184010
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4602	NC_014560	A	6	6	219108	219113	100 %	0 %	0 %	0 %	308184010
4603	NC_014560	TAC	2	6	219119	219124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184010
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4607	NC_014560	GAA	2	6	219311	219316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184010
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4610	NC_014560	ATC	2	6	219408	219413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184010
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4615	NC_014560	T	6	6	219837	219842	0 %	100 %	0 %	0 %	308184011
4616	NC_014560	CTT	2	6	219921	219926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_014560	CTT	2	6	220065	220070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184012
4618	NC_014560	T	6	6	220090	220095	0 %	100 %	0 %	0 %	308184012
4619	NC_014560	GCTT	2	8	220109	220116	0 %	50 %	25 %	25 %	308184012
4620	NC_014560	AACG	2	8	220206	220213	50 %	0 %	25 %	25 %	308184012
4621	NC_014560	CCT	2	6	220218	220223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308184012
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4627	NC_014560	CTT	2	6	220560	220565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184012
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4629	NC_014560	CTT	2	6	220654	220659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184012
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4631	NC_014560	T	6	6	220758	220763	0 %	100 %	0 %	0 %	308184012
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4633	NC_014560	A	7	7	220795	220801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4637	NC_014560	GTT	2	6	220900	220905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4640	NC_014560	C	7	7	220983	220989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4737	NC_014560	AGAT	2	8	225453	225460	50 %	25 %	25 %	0 %	308184016
4738	NC_014560	ATTG	2	8	225539	225546	25 %	50 %	25 %	0 %	308184016
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4741	NC_014560	TGC	2	6	225576	225581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308184016
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4745	NC_014560	ACC	2	6	225807	225812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308184016
4746	NC_014560	CCACC	2	10	225876	225885	20 %	0 %	0 %	80 %	308184016
4747	NC_014560	GTT	2	6	225965	225970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184016
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4749	NC_014560	A	6	6	226025	226030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4750	NC_014560	AGA	2	6	226036	226041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184017
4751	NC_014560	TTACA	2	10	226063	226072	40 %	40 %	0 %	20 %	308184017
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