MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 1284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	308182191
2	NC_014555	TTTTA	2	10	4915	4924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014555	TTGCT	2	10	6186	6195	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014555	GTCGT	2	10	6492	6501	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014555	TTTTA	2	10	7235	7244	20 %	80 %	0 %	0 %	308182195
6	NC_014555	TTTCT	2	10	8164	8173	0 %	80 %	0 %	20 %	308182196
7	NC_014555	TTTTG	2	10	11698	11707	0 %	80 %	20 %	0 %	308182199
8	NC_014555	GGGTT	2	10	11920	11929	0 %	40 %	60 %	0 %	308182199
9	NC_014555	TGGTG	2	10	12537	12546	0 %	40 %	60 %	0 %	308182200
10	NC_014555	GCTTT	2	10	13364	13373	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014555	CAAAA	2	10	18397	18406	80 %	0 %	0 %	20 %	308182205
12	NC_014555	AAGCT	2	10	19300	19309	40 %	20 %	20 %	20 %	308182206
13	NC_014555	CATCA	2	10	19773	19782	40 %	20 %	0 %	40 %	308182206
14	NC_014555	TGAAA	2	10	20744	20753	60 %	20 %	20 %	0 %	308182207
15	NC_014555	CCATG	2	10	22925	22934	20 %	20 %	20 %	40 %	308182209
16	NC_014555	TCGGA	2	10	24644	24653	20 %	20 %	40 %	20 %	308182209
17	NC_014555	ATGAA	2	10	24886	24895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014555	CAAGC	2	10	27558	27567	40 %	0 %	20 %	40 %	308182211
19	NC_014555	GCTGG	2	10	27931	27940	0 %	20 %	60 %	20 %	308182211
20	NC_014555	TGGGT	2	10	27995	28004	0 %	40 %	60 %	0 %	308182211
21	NC_014555	TTTTA	2	10	28484	28493	20 %	80 %	0 %	0 %	308182212
22	NC_014555	GTGGG	2	10	32069	32078	0 %	20 %	80 %	0 %	308182217
23	NC_014555	TGGGG	2	10	33320	33329	0 %	20 %	80 %	0 %	308182219
24	NC_014555	AGAAA	2	10	40389	40398	80 %	0 %	20 %	0 %	308182227
25	NC_014555	TACTC	2	10	41242	41251	20 %	40 %	0 %	40 %	308182228
26	NC_014555	CTTAG	2	10	42321	42330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014555	TAAAA	2	10	43100	43109	80 %	20 %	0 %	0 %	308182229
28	NC_014555	TCCCA	2	10	44112	44121	20 %	20 %	0 %	60 %	308182230
29	NC_014555	GCTCC	2	10	44433	44442	0 %	20 %	20 %	60 %	308182230
30	NC_014555	TCGCA	2	10	44970	44979	20 %	20 %	20 %	40 %	308182230
31	NC_014555	AGGGC	2	10	45213	45222	20 %	0 %	60 %	20 %	308182230
32	NC_014555	TGCCT	2	10	47225	47234	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014555	TGAAA	2	10	48625	48634	60 %	20 %	20 %	0 %	308182233
34	NC_014555	TCAAA	2	10	48879	48888	60 %	20 %	0 %	20 %	308182233
35	NC_014555	CGTTT	2	10	49690	49699	0 %	60 %	20 %	20 %	308182233
36	NC_014555	TCGCC	2	10	51622	51631	0 %	20 %	20 %	60 %	308182234
37	NC_014555	TAAAA	2	10	51918	51927	80 %	20 %	0 %	0 %	308182234
38	NC_014555	TCAAA	2	10	52634	52643	60 %	20 %	0 %	20 %	308182234
39	NC_014555	ATTAT	2	10	53601	53610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014555	TTAAA	2	10	53655	53664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014555	AAAGA	2	10	54266	54275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014555	GGTGG	2	10	62490	62499	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014555	ATACC	2	10	63161	63170	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014555	TCAAT	2	10	65725	65734	40 %	40 %	0 %	20 %	308182244
45	NC_014555	CTTGG	2	10	66514	66523	0 %	40 %	40 %	20 %	308182245
46	NC_014555	CTTCT	2	10	66568	66577	0 %	60 %	0 %	40 %	308182245
47	NC_014555	TGCCT	2	10	66645	66654	0 %	40 %	20 %	40 %	308182245
48	NC_014555	TCCAA	2	10	67057	67066	40 %	20 %	0 %	40 %	308182246
49	NC_014555	CGCCA	2	10	69774	69783	20 %	0 %	20 %	60 %	308182249
50	NC_014555	CATCA	2	10	69786	69795	40 %	20 %	0 %	40 %	308182249
51	NC_014555	TTTTG	2	10	70367	70376	0 %	80 %	20 %	0 %	308182250
52	NC_014555	ATGGC	2	10	70561	70570	20 %	20 %	40 %	20 %	308182250
53	NC_014555	ACGCC	2	10	70673	70682	20 %	0 %	20 %	60 %	308182250
54	NC_014555	AAAGC	2	10	71439	71448	60 %	0 %	20 %	20 %	308182251
55	NC_014555	CTCAT	2	10	77566	77575	20 %	40 %	0 %	40 %	308182257
56	NC_014555	ATGCC	2	10	79612	79621	20 %	20 %	20 %	40 %	308182259
57	NC_014555	TTGAT	2	10	80697	80706	20 %	60 %	20 %	0 %	308182261
58	NC_014555	GGCGT	2	10	82511	82520	0 %	20 %	60 %	20 %	308182263
59	NC_014555	ATTTT	2	10	85554	85563	20 %	80 %	0 %	0 %	308182264
60	NC_014555	TAAGA	2	10	85721	85730	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014555	TAAAA	2	10	85792	85801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014555	CTTTC	2	10	86076	86085	0 %	60 %	0 %	40 %	308182265
63	NC_014555	TGATT	2	10	89056	89065	20 %	60 %	20 %	0 %	308182268
64	NC_014555	GGCTT	2	10	90377	90386	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014555	AATTT	2	10	95070	95079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014555	ACGAT	2	10	95517	95526	40 %	20 %	20 %	20 %	308182273
67	NC_014555	AATTG	2	10	97359	97368	40 %	40 %	20 %	0 %	308182274
68	NC_014555	TCGTT	2	10	99158	99167	0 %	60 %	20 %	20 %	308182275
69	NC_014555	AAAAT	2	10	101756	101765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014555	TCTTT	2	10	102474	102483	0 %	80 %	0 %	20 %	308182278
71	NC_014555	TTTTA	2	10	104237	104246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014555	AAAGC	2	10	105239	105248	60 %	0 %	20 %	20 %	308182280
73	NC_014555	CAAAT	2	10	107235	107244	60 %	20 %	0 %	20 %	308182283
74	NC_014555	ACCCT	2	10	108664	108673	20 %	20 %	0 %	60 %	308182284
75	NC_014555	ATGCC	2	10	108796	108805	20 %	20 %	20 %	40 %	308182284
76	NC_014555	TGATT	2	10	110797	110806	20 %	60 %	20 %	0 %	308182286
77	NC_014555	CTAAA	2	10	111283	111292	60 %	20 %	0 %	20 %	308182288
78	NC_014555	AAGCC	2	10	117216	117225	40 %	0 %	20 %	40 %	308182291
79	NC_014555	GTTTG	2	10	118586	118595	0 %	60 %	40 %	0 %	308182292
80	NC_014555	TTGAT	2	10	118907	118916	20 %	60 %	20 %	0 %	308182292
81	NC_014555	CAATC	2	10	119292	119301	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014555	CGCTG	2	10	121488	121497	0 %	20 %	40 %	40 %	308182294
83	NC_014555	TTTGA	2	10	121635	121644	20 %	60 %	20 %	0 %	308182294
84	NC_014555	ATCTC	2	10	122920	122929	20 %	40 %	0 %	40 %	308182294
85	NC_014555	TTTGT	2	10	123432	123441	0 %	80 %	20 %	0 %	308182295
86	NC_014555	TGCGT	2	10	125465	125474	0 %	40 %	40 %	20 %	308182297
87	NC_014555	GAAAA	2	10	125626	125635	80 %	0 %	20 %	0 %	308182297
88	NC_014555	GAAAA	2	10	125944	125953	80 %	0 %	20 %	0 %	308182297
89	NC_014555	ATTTT	2	10	128908	128917	20 %	80 %	0 %	0 %	308182302
90	NC_014555	ATGTT	2	10	128990	128999	20 %	60 %	20 %	0 %	308182302
91	NC_014555	AAAAG	2	10	129402	129411	80 %	0 %	20 %	0 %	308182302
92	NC_014555	AAATC	2	10	131674	131683	60 %	20 %	0 %	20 %	308182304
93	NC_014555	AAAAT	2	10	133146	133155	80 %	20 %	0 %	0 %	308182305
94	NC_014555	CAAAT	2	10	133198	133207	60 %	20 %	0 %	20 %	308182305
95	NC_014555	ATAAA	2	10	134923	134932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014555	TTTTC	2	10	135707	135716	0 %	80 %	0 %	20 %	308182310
97	NC_014555	TTCTT	2	10	137663	137672	0 %	80 %	0 %	20 %	308182312
98	NC_014555	TCTTT	2	10	138158	138167	0 %	80 %	0 %	20 %	308182313
99	NC_014555	TTTTG	2	10	139321	139330	0 %	80 %	20 %	0 %	308182314
100	NC_014555	GCGAT	2	10	140114	140123	20 %	20 %	40 %	20 %	308182314
101	NC_014555	GCTTG	2	10	140370	140379	0 %	40 %	40 %	20 %	308182314
102	NC_014555	TTTTG	2	10	141030	141039	0 %	80 %	20 %	0 %	308182315
103	NC_014555	CCAAA	2	10	142870	142879	60 %	0 %	0 %	40 %	308182316
104	NC_014555	TAAAA	2	10	144473	144482	80 %	20 %	0 %	0 %	308182317
105	NC_014555	ACGCC	2	10	146393	146402	20 %	0 %	20 %	60 %	308182318
106	NC_014555	TTATT	2	10	148289	148298	20 %	80 %	0 %	0 %	308182322
107	NC_014555	GCGTT	2	10	148656	148665	0 %	40 %	40 %	20 %	308182324
108	NC_014555	ATTTG	2	10	149631	149640	20 %	60 %	20 %	0 %	308182325
109	NC_014555	TGTTT	2	10	151359	151368	0 %	80 %	20 %	0 %	308182327
110	NC_014555	CAAAT	2	10	151527	151536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014555	AAAAC	2	10	152251	152260	80 %	0 %	0 %	20 %	308182328
112	NC_014555	AGATT	2	10	154149	154158	40 %	40 %	20 %	0 %	308182330
113	NC_014555	AAGCC	2	10	155487	155496	40 %	0 %	20 %	40 %	308182333
114	NC_014555	TAAAA	2	10	156490	156499	80 %	20 %	0 %	0 %	308182334
115	NC_014555	GGCAT	2	10	157287	157296	20 %	20 %	40 %	20 %	308182334
116	NC_014555	ATTTT	2	10	157523	157532	20 %	80 %	0 %	0 %	308182335
117	NC_014555	GGGTG	2	10	157879	157888	0 %	20 %	80 %	0 %	308182335
118	NC_014555	CAAAA	2	10	158782	158791	80 %	0 %	0 %	20 %	308182336
119	NC_014555	AATAA	2	10	158802	158811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014555	ATTCA	2	10	159272	159281	40 %	40 %	0 %	20 %	308182337
121	NC_014555	ATCTT	2	10	162675	162684	20 %	60 %	0 %	20 %	308182340
122	NC_014555	TCTTA	2	10	163185	163194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014555	TAAAA	2	10	163288	163297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014555	AAAAC	2	10	163319	163328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014555	TATCA	2	10	171119	171128	40 %	40 %	0 %	20 %	308182349
126	NC_014555	ATTTG	2	10	172127	172136	20 %	60 %	20 %	0 %	308182350
127	NC_014555	AATTG	2	10	172283	172292	40 %	40 %	20 %	0 %	308182351
128	NC_014555	AAATC	2	10	172366	172375	60 %	20 %	0 %	20 %	308182351
129	NC_014555	TTTCT	2	10	172940	172949	0 %	80 %	0 %	20 %	308182352
130	NC_014555	AAATG	2	10	173277	173286	60 %	20 %	20 %	0 %	308182352
131	NC_014555	TGTAA	2	10	174067	174076	40 %	40 %	20 %	0 %	308182353
132	NC_014555	ATAAA	2	10	175563	175572	80 %	20 %	0 %	0 %	308182354
133	NC_014555	TTTAA	2	10	175926	175935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014555	AAAAG	2	10	176718	176727	80 %	0 %	20 %	0 %	308182355
135	NC_014555	ACCCC	2	10	176783	176792	20 %	0 %	0 %	80 %	308182355
136	NC_014555	TGAAT	2	10	177099	177108	40 %	40 %	20 %	0 %	308182356
137	NC_014555	GAGAT	2	10	181528	181537	40 %	20 %	40 %	0 %	308182360
138	NC_014555	AGAGG	2	10	182417	182426	40 %	0 %	60 %	0 %	308182360
139	NC_014555	TTCAA	2	10	184177	184186	40 %	40 %	0 %	20 %	308182362
140	NC_014555	GCGAA	2	10	186750	186759	40 %	0 %	40 %	20 %	308182364
141	NC_014555	TTCAA	2	10	189004	189013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_014555	TATTT	2	10	195486	195495	20 %	80 %	0 %	0 %	308182374
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151	NC_014555	TGGGG	2	10	202349	202358	0 %	20 %	80 %	0 %	308182381
152	NC_014555	ATTCT	2	10	204782	204791	20 %	60 %	0 %	20 %	308182382
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159	NC_014555	TTACA	2	10	211306	211315	40 %	40 %	0 %	20 %	308182387
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182	NC_014555	CATCG	2	10	243628	243637	20 %	20 %	20 %	40 %	308182422
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236	NC_014555	TCGCT	2	10	315594	315603	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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253	NC_014555	TTATA	2	10	335023	335032	40 %	60 %	0 %	0 %	308182509
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267	NC_014555	CGGCG	2	10	346253	346262	0 %	0 %	60 %	40 %	308182521
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