MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 4616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	308182189
2	NC_014555	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	308182189
3	NC_014555	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	308182189
4	NC_014555	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	308182190
5	NC_014555	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	308182191
6	NC_014555	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	308182191
7	NC_014555	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	308182192
8	NC_014555	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	308182192
9	NC_014555	TCTT	2	8	1867	1874	0 %	75 %	0 %	25 %	308182192
10	NC_014555	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	308182192
11	NC_014555	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	308182192
12	NC_014555	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	308182193
13	NC_014555	GAAA	2	8	3246	3253	75 %	0 %	25 %	0 %	308182194
14	NC_014555	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	308182194
15	NC_014555	CAAG	2	8	3822	3829	50 %	0 %	25 %	25 %	308182194
16	NC_014555	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014555	TAAA	2	8	4687	4694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014555	GCTT	2	8	5205	5212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014555	CATT	2	8	5276	5283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014555	GTGC	2	8	5856	5863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014555	CTGG	2	8	6646	6653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014555	CGTT	2	8	6856	6863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014555	GTTT	2	8	7202	7209	0 %	75 %	25 %	0 %	308182195
24	NC_014555	TTCA	2	8	7628	7635	25 %	50 %	0 %	25 %	308182196
25	NC_014555	CGTT	2	8	8404	8411	0 %	50 %	25 %	25 %	308182196
26	NC_014555	AAGC	2	8	8737	8744	50 %	0 %	25 %	25 %	308182196
27	NC_014555	ATAA	2	8	9430	9437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014555	TATT	2	8	9629	9636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014555	AAAG	2	8	9680	9687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014555	TCAA	2	8	9841	9848	50 %	25 %	0 %	25 %	308182198
31	NC_014555	TTTG	2	8	10661	10668	0 %	75 %	25 %	0 %	308182198
32	NC_014555	ATTG	2	8	11636	11643	25 %	50 %	25 %	0 %	308182199
33	NC_014555	GCAA	2	8	11827	11834	50 %	0 %	25 %	25 %	308182199
34	NC_014555	TGCT	2	8	12032	12039	0 %	50 %	25 %	25 %	308182199
35	NC_014555	TATT	2	8	12410	12417	25 %	75 %	0 %	0 %	308182199
36	NC_014555	TCTT	2	8	13314	13321	0 %	75 %	0 %	25 %	308182200
37	NC_014555	TTAA	2	8	13462	13469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014555	AGCG	2	8	13785	13792	25 %	0 %	50 %	25 %	308182202
39	NC_014555	GATT	2	8	13893	13900	25 %	50 %	25 %	0 %	308182202
40	NC_014555	CAAA	2	8	14062	14069	75 %	0 %	0 %	25 %	308182203
41	NC_014555	CACT	2	8	14431	14438	25 %	25 %	0 %	50 %	308182203
42	NC_014555	ATGC	2	8	14477	14484	25 %	25 %	25 %	25 %	308182203
43	NC_014555	TTTA	2	8	15064	15071	25 %	75 %	0 %	0 %	308182203
44	NC_014555	ATTT	2	8	15143	15150	25 %	75 %	0 %	0 %	308182203
45	NC_014555	CAGG	2	8	16222	16229	25 %	0 %	50 %	25 %	308182203
46	NC_014555	TGAT	2	8	16266	16273	25 %	50 %	25 %	0 %	308182203
47	NC_014555	GCTT	2	8	17245	17252	0 %	50 %	25 %	25 %	308182204
48	NC_014555	TGAT	2	8	17479	17486	25 %	50 %	25 %	0 %	308182204
49	NC_014555	GCGA	2	8	17616	17623	25 %	0 %	50 %	25 %	308182204
50	NC_014555	ATCT	2	8	17802	17809	25 %	50 %	0 %	25 %	308182204
51	NC_014555	GTTT	2	8	18020	18027	0 %	75 %	25 %	0 %	308182204
52	NC_014555	TTGA	2	8	18361	18368	25 %	50 %	25 %	0 %	308182205
53	NC_014555	TGCT	2	8	18737	18744	0 %	50 %	25 %	25 %	308182205
54	NC_014555	AGCG	2	8	18909	18916	25 %	0 %	50 %	25 %	308182205
55	NC_014555	AGAA	2	8	19342	19349	75 %	0 %	25 %	0 %	308182206
56	NC_014555	TAAA	2	8	20418	20425	75 %	25 %	0 %	0 %	308182207
57	NC_014555	GCGA	2	8	20427	20434	25 %	0 %	50 %	25 %	308182207
58	NC_014555	AGGC	2	8	20859	20866	25 %	0 %	50 %	25 %	308182207
59	NC_014555	TGAT	2	8	21011	21018	25 %	50 %	25 %	0 %	308182208
60	NC_014555	CTTT	2	8	21278	21285	0 %	75 %	0 %	25 %	308182208
61	NC_014555	AAGT	2	8	21590	21597	50 %	25 %	25 %	0 %	308182208
62	NC_014555	GCTT	2	8	21717	21724	0 %	50 %	25 %	25 %	308182208
63	NC_014555	AACT	2	8	22335	22342	50 %	25 %	0 %	25 %	308182208
64	NC_014555	CTTT	2	8	22349	22356	0 %	75 %	0 %	25 %	308182208
65	NC_014555	AATC	2	8	22487	22494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014555	TTAG	2	8	22693	22700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014555	GTTT	2	8	23282	23289	0 %	75 %	25 %	0 %	308182209
68	NC_014555	CATT	2	8	23330	23337	25 %	50 %	0 %	25 %	308182209
69	NC_014555	ACTG	2	8	23579	23586	25 %	25 %	25 %	25 %	308182209
70	NC_014555	TTCC	2	8	24074	24081	0 %	50 %	0 %	50 %	308182209
71	NC_014555	ATTG	2	8	24240	24247	25 %	50 %	25 %	0 %	308182209
72	NC_014555	TCCC	2	8	24416	24423	0 %	25 %	0 %	75 %	308182209
73	NC_014555	ATTA	2	8	24990	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014555	CGCT	2	8	25280	25287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014555	ATAA	2	8	26114	26121	75 %	25 %	0 %	0 %	308182210
76	NC_014555	GACA	2	8	26666	26673	50 %	0 %	25 %	25 %	308182210
77	NC_014555	GCTC	2	8	27636	27643	0 %	25 %	25 %	50 %	308182211
78	NC_014555	ATGG	2	8	28084	28091	25 %	25 %	50 %	0 %	308182211
79	NC_014555	ATTC	2	8	28243	28250	25 %	50 %	0 %	25 %	308182212
80	NC_014555	GAAT	2	8	28341	28348	50 %	25 %	25 %	0 %	308182212
81	NC_014555	TGGC	2	8	28564	28571	0 %	25 %	50 %	25 %	308182212
82	NC_014555	AATA	2	8	29214	29221	75 %	25 %	0 %	0 %	308182213
83	NC_014555	AGTC	2	8	29516	29523	25 %	25 %	25 %	25 %	308182214
84	NC_014555	TCTT	2	8	29724	29731	0 %	75 %	0 %	25 %	308182214
85	NC_014555	GATC	2	8	29793	29800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014555	GGTT	2	8	29902	29909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014555	TTTA	2	8	30036	30043	25 %	75 %	0 %	0 %	308182215
88	NC_014555	TGAT	2	8	30181	30188	25 %	50 %	25 %	0 %	308182215
89	NC_014555	GAGC	2	8	30232	30239	25 %	0 %	50 %	25 %	308182215
90	NC_014555	ACCC	2	8	30358	30365	25 %	0 %	0 %	75 %	308182216
91	NC_014555	CATC	2	8	30484	30491	25 %	25 %	0 %	50 %	308182216
92	NC_014555	TCAA	2	8	30626	30633	50 %	25 %	0 %	25 %	308182217
93	NC_014555	CATG	2	8	31749	31756	25 %	25 %	25 %	25 %	308182217
94	NC_014555	GAAA	2	8	31857	31864	75 %	0 %	25 %	0 %	308182217
95	NC_014555	TTGC	2	8	32253	32260	0 %	50 %	25 %	25 %	308182217
96	NC_014555	GCTT	2	8	32764	32771	0 %	50 %	25 %	25 %	308182217
97	NC_014555	GAAA	2	8	32796	32803	75 %	0 %	25 %	0 %	308182217
98	NC_014555	GAAA	2	8	32823	32830	75 %	0 %	25 %	0 %	308182217
99	NC_014555	ATGA	2	8	33104	33111	50 %	25 %	25 %	0 %	308182218
100	NC_014555	TGGG	2	8	33208	33215	0 %	25 %	75 %	0 %	308182219
101	NC_014555	TTGT	2	8	34705	34712	0 %	75 %	25 %	0 %	308182221
102	NC_014555	CTTT	2	8	34852	34859	0 %	75 %	0 %	25 %	308182221
103	NC_014555	AATA	2	8	35529	35536	75 %	25 %	0 %	0 %	308182221
104	NC_014555	AAAT	2	8	35553	35560	75 %	25 %	0 %	0 %	308182221
105	NC_014555	GAAA	2	8	35682	35689	75 %	0 %	25 %	0 %	308182222
106	NC_014555	GTGA	2	8	35779	35786	25 %	25 %	50 %	0 %	308182223
107	NC_014555	ATGA	2	8	36259	36266	50 %	25 %	25 %	0 %	308182223
108	NC_014555	TTTG	2	8	36312	36319	0 %	75 %	25 %	0 %	308182223
109	NC_014555	GATA	2	8	36803	36810	50 %	25 %	25 %	0 %	308182224
110	NC_014555	AACC	2	8	37486	37493	50 %	0 %	0 %	50 %	308182225
111	NC_014555	CAAA	2	8	37776	37783	75 %	0 %	0 %	25 %	308182225
112	NC_014555	ATTG	2	8	38190	38197	25 %	50 %	25 %	0 %	308182225
113	NC_014555	ATTG	2	8	38256	38263	25 %	50 %	25 %	0 %	308182225
114	NC_014555	ATCA	2	8	38365	38372	50 %	25 %	0 %	25 %	308182225
115	NC_014555	TCAA	2	8	38378	38385	50 %	25 %	0 %	25 %	308182225
116	NC_014555	TGTT	2	8	39153	39160	0 %	75 %	25 %	0 %	308182226
117	NC_014555	AAAG	2	8	39473	39480	75 %	0 %	25 %	0 %	308182226
118	NC_014555	AAAT	2	8	39621	39628	75 %	25 %	0 %	0 %	308182226
119	NC_014555	CTTT	2	8	39746	39753	0 %	75 %	0 %	25 %	308182226
120	NC_014555	ATAA	2	8	40000	40007	75 %	25 %	0 %	0 %	308182226
121	NC_014555	GAAA	2	8	40020	40027	75 %	0 %	25 %	0 %	308182227
122	NC_014555	GATC	2	8	40149	40156	25 %	25 %	25 %	25 %	308182227
123	NC_014555	ATGA	2	8	41156	41163	50 %	25 %	25 %	0 %	308182227
124	NC_014555	CAAA	2	8	41995	42002	75 %	0 %	0 %	25 %	308182228
125	NC_014555	TTGA	2	8	42557	42564	25 %	50 %	25 %	0 %	308182229
126	NC_014555	AAAC	2	8	42571	42578	75 %	0 %	0 %	25 %	308182229
127	NC_014555	CATT	2	8	42699	42706	25 %	50 %	0 %	25 %	308182229
128	NC_014555	CGCT	2	8	42712	42719	0 %	25 %	25 %	50 %	308182229
129	NC_014555	GTTT	2	8	43334	43341	0 %	75 %	25 %	0 %	308182229
130	NC_014555	CAAA	2	8	43830	43837	75 %	0 %	0 %	25 %	308182230
131	NC_014555	TCGC	2	8	44645	44652	0 %	25 %	25 %	50 %	308182230
132	NC_014555	AGGG	2	8	44656	44663	25 %	0 %	75 %	0 %	308182230
133	NC_014555	GCAA	2	8	45309	45316	50 %	0 %	25 %	25 %	308182230
134	NC_014555	AGCG	3	12	46001	46012	25 %	0 %	50 %	25 %	308182231
135	NC_014555	AGCT	2	8	46682	46689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014555	CTTT	2	8	46967	46974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014555	AGGC	2	8	47663	47670	25 %	0 %	50 %	25 %	308182232
138	NC_014555	TGGT	2	8	47727	47734	0 %	50 %	50 %	0 %	308182232
139	NC_014555	TCTT	2	8	48020	48027	0 %	75 %	0 %	25 %	308182232
140	NC_014555	TTAA	2	8	48258	48265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014555	AAAC	2	8	48373	48380	75 %	0 %	0 %	25 %	308182233
142	NC_014555	AGCC	2	8	48573	48580	25 %	0 %	25 %	50 %	308182233
143	NC_014555	CAAG	2	8	49052	49059	50 %	0 %	25 %	25 %	308182233
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