MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 92913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014532	CG	3	6	175790	175795	0 %	0 %	50 %	50 %	307543740
4003	NC_014532	GGC	2	6	175811	175816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543740
4004	NC_014532	GCA	2	6	175846	175851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4005	NC_014532	CGCC	2	8	175892	175899	0 %	0 %	25 %	75 %	307543740
4006	NC_014532	GTGG	2	8	175955	175962	0 %	25 %	75 %	0 %	307543740
4007	NC_014532	GAC	2	6	175968	175973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4008	NC_014532	CGGC	2	8	175986	175993	0 %	0 %	50 %	50 %	307543740
4009	NC_014532	GCT	2	6	176078	176083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4010	NC_014532	GAC	2	6	176139	176144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4011	NC_014532	TGG	2	6	176146	176151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543740
4012	NC_014532	CTG	2	6	176154	176159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4013	NC_014532	CGC	2	6	176160	176165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543740
4014	NC_014532	CGA	2	6	176174	176179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4015	NC_014532	GCA	2	6	176279	176284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4016	NC_014532	GCTG	2	8	176320	176327	0 %	25 %	50 %	25 %	307543740
4017	NC_014532	CGG	2	6	176354	176359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543740
4018	NC_014532	GCC	2	6	176388	176393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543740
4019	NC_014532	GCCG	2	8	176424	176431	0 %	0 %	50 %	50 %	307543740
4020	NC_014532	CGA	2	6	176492	176497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543740
4021	NC_014532	GGA	2	6	176531	176536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543740
4022	NC_014532	CCCG	2	8	176543	176550	0 %	0 %	25 %	75 %	307543740
4023	NC_014532	ACC	2	6	176598	176603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543740
4024	NC_014532	GCC	2	6	176634	176639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543740
4025	NC_014532	CG	3	6	176642	176647	0 %	0 %	50 %	50 %	307543740
4026	NC_014532	AC	3	6	176675	176680	50 %	0 %	0 %	50 %	307543741
4027	NC_014532	CCG	2	6	176698	176703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543741
4028	NC_014532	CGA	2	6	176717	176722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4029	NC_014532	GAT	2	6	176819	176824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543741
4030	NC_014532	GGC	2	6	176828	176833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543741
4031	NC_014532	GGT	2	6	176849	176854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543741
4032	NC_014532	AAG	2	6	176883	176888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543741
4033	NC_014532	CGC	2	6	176915	176920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543741
4034	NC_014532	GGC	2	6	176945	176950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543741
4035	NC_014532	CCTGG	2	10	177011	177020	0 %	20 %	40 %	40 %	307543741
4036	NC_014532	GCGCT	2	10	177042	177051	0 %	20 %	40 %	40 %	307543741
4037	NC_014532	CGC	2	6	177068	177073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543741
4038	NC_014532	CTG	2	6	177087	177092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4039	NC_014532	GC	3	6	177093	177098	0 %	0 %	50 %	50 %	307543741
4040	NC_014532	GCC	2	6	177171	177176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543741
4041	NC_014532	CGAT	2	8	177274	177281	25 %	25 %	25 %	25 %	307543741
4042	NC_014532	CCAT	2	8	177361	177368	25 %	25 %	0 %	50 %	307543741
4043	NC_014532	CGA	2	6	177371	177376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4044	NC_014532	CCG	2	6	177378	177383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543741
4045	NC_014532	GTC	2	6	177408	177413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4046	NC_014532	CCGGC	2	10	177415	177424	0 %	0 %	40 %	60 %	307543741
4047	NC_014532	GCT	2	6	177437	177442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4048	NC_014532	TGG	2	6	177517	177522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543741
4049	NC_014532	GC	3	6	177566	177571	0 %	0 %	50 %	50 %	307543741
4050	NC_014532	ACGCG	2	10	177578	177587	20 %	0 %	40 %	40 %	307543741
4051	NC_014532	CAT	2	6	177615	177620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543741
4052	NC_014532	CGG	2	6	177623	177628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543741
4053	NC_014532	GTC	2	6	177648	177653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4054	NC_014532	CGA	2	6	177665	177670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4055	NC_014532	GCG	2	6	177674	177679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543741
4056	NC_014532	GGC	2	6	177693	177698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543741
4057	NC_014532	CGA	2	6	177740	177745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4058	NC_014532	CAG	2	6	177747	177752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543741
4059	NC_014532	GCGTG	2	10	177809	177818	0 %	20 %	60 %	20 %	307543741
4060	NC_014532	ATC	2	6	177848	177853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543741
4061	NC_014532	CGG	2	6	177889	177894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_014532	CAG	2	6	177909	177914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_014532	TCCC	2	8	177952	177959	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4064	NC_014532	CTT	2	6	177976	177981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_014532	TAT	2	6	178080	178085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307543742
4066	NC_014532	TGCCG	2	10	178093	178102	0 %	20 %	40 %	40 %	307543742
4067	NC_014532	GGC	2	6	178225	178230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543742
4068	NC_014532	GCTC	2	8	178273	178280	0 %	25 %	25 %	50 %	307543742
4069	NC_014532	ACC	2	6	178520	178525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543742
4070	NC_014532	TGC	2	6	178616	178621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
4071	NC_014532	CGAT	2	8	178659	178666	25 %	25 %	25 %	25 %	307543742
4072	NC_014532	TCG	2	6	178694	178699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
4073	NC_014532	GTC	2	6	178744	178749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
4074	NC_014532	GA	3	6	178781	178786	50 %	0 %	50 %	0 %	307543742
4075	NC_014532	ACCG	2	8	178859	178866	25 %	0 %	25 %	50 %	307543742
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4079	NC_014532	GGA	2	6	178984	178989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543742
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4081	NC_014532	GTC	2	6	179164	179169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
4082	NC_014532	TGC	2	6	179295	179300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
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4091	NC_014532	GTA	2	6	179773	179778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543742
4092	NC_014532	GCT	2	6	179862	179867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
4093	NC_014532	TGA	2	6	179883	179888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543742
4094	NC_014532	AGGC	2	8	179898	179905	25 %	0 %	50 %	25 %	307543742
4095	NC_014532	CGT	2	6	179959	179964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
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4100	NC_014532	ACC	2	6	180123	180128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543742
4101	NC_014532	GAA	2	6	180264	180269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014532	TAT	2	6	180301	180306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014532	TCG	2	6	180365	180370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_014532	GAA	2	6	180383	180388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014532	CCA	2	6	180435	180440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_014532	GCG	2	6	180512	180517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543743
4107	NC_014532	TC	3	6	180520	180525	0 %	50 %	0 %	50 %	307543743
4108	NC_014532	CCG	2	6	180531	180536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543743
4109	NC_014532	GGC	2	6	180562	180567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543743
4110	NC_014532	TGC	2	6	180705	180710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543743
4111	NC_014532	TCT	2	6	180715	180720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543743
4112	NC_014532	G	6	6	180763	180768	0 %	0 %	100 %	0 %	307543743
4113	NC_014532	GCCG	2	8	180773	180780	0 %	0 %	50 %	50 %	307543743
4114	NC_014532	CCT	2	6	180834	180839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543743
4115	NC_014532	CGG	2	6	180970	180975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543743
4116	NC_014532	GGCAT	2	10	180982	180991	20 %	20 %	40 %	20 %	307543743
4117	NC_014532	CTTC	2	8	181057	181064	0 %	50 %	0 %	50 %	307543743
4118	NC_014532	CGG	3	9	181135	181143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543743
4119	NC_014532	TGA	2	6	181183	181188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543743
4120	NC_014532	TTC	2	6	181397	181402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543743
4121	NC_014532	CGAG	2	8	181447	181454	25 %	0 %	50 %	25 %	307543743
4122	NC_014532	TTTG	2	8	181528	181535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014532	T	6	6	181560	181565	0 %	100 %	0 %	0 %	307543744
4124	NC_014532	GTGA	2	8	181686	181693	25 %	25 %	50 %	0 %	307543744
4125	NC_014532	TGG	2	6	181771	181776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543744
4126	NC_014532	CTG	2	6	181791	181796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543744
4127	NC_014532	GCT	2	6	181836	181841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543744
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4149	NC_014532	CTC	2	6	182829	182834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543745
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4156	NC_014532	C	6	6	183026	183031	0 %	0 %	0 %	100 %	307543745
4157	NC_014532	TGG	2	6	183059	183064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543745
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4181	NC_014532	TGAG	2	8	184319	184326	25 %	25 %	50 %	0 %	307543746
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4227	NC_014532	GGGACT	2	12	185966	185977	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307543747
4228	NC_014532	GCG	2	6	186005	186010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543747
4229	NC_014532	GAGG	2	8	186058	186065	25 %	0 %	75 %	0 %	307543747
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4231	NC_014532	GAA	2	6	186223	186228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543747
4232	NC_014532	CAA	2	6	186336	186341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543747
4233	NC_014532	GGA	2	6	186378	186383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543747
4234	NC_014532	GATG	2	8	186493	186500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_014532	C	6	6	186522	186527	0 %	0 %	0 %	100 %	307543748
4236	NC_014532	CGG	2	6	186547	186552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543748
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4239	NC_014532	TTCTC	2	10	186622	186631	0 %	60 %	0 %	40 %	307543748
4240	NC_014532	TCG	2	6	186712	186717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543748
4241	NC_014532	GCT	2	6	186737	186742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543748
4242	NC_014532	TC	3	6	186796	186801	0 %	50 %	0 %	50 %	307543748
4243	NC_014532	GCT	2	6	186836	186841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543748
4244	NC_014532	TTCT	2	8	186885	186892	0 %	75 %	0 %	25 %	307543748
4245	NC_014532	GGC	2	6	186914	186919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543748
4246	NC_014532	ATG	2	6	187077	187082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543748
4247	NC_014532	CGC	2	6	187091	187096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543748
4248	NC_014532	GGC	2	6	187127	187132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543748
4249	NC_014532	GAT	2	6	187184	187189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543748
4250	NC_014532	TGG	2	6	187201	187206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543748
4251	NC_014532	CTT	2	6	187214	187219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543748
4252	NC_014532	CAT	2	6	187223	187228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543748
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4256	NC_014532	GTG	2	6	187365	187370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543748
4257	NC_014532	CTT	2	6	187397	187402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543748
4258	NC_014532	TAC	2	6	187412	187417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543748
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4261	NC_014532	CGA	3	9	187449	187457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543749
4262	NC_014532	CTG	2	6	187481	187486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543749
4263	NC_014532	TGG	2	6	187491	187496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543749
4264	NC_014532	CTT	2	6	187524	187529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543749
4265	NC_014532	GGT	2	6	187535	187540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543749
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4270	NC_014532	CTG	3	9	187766	187774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543749
4271	NC_014532	CGG	2	6	187794	187799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543749
4272	NC_014532	TCA	2	6	187815	187820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543749
4273	NC_014532	CTG	2	6	187901	187906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543749
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4275	NC_014532	GGC	2	6	187948	187953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543749
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4280	NC_014532	TC	3	6	188099	188104	0 %	50 %	0 %	50 %	307543749
4281	NC_014532	ATG	2	6	188123	188128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543749
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4283	NC_014532	TCG	2	6	188232	188237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543749
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4288	NC_014532	CCAG	2	8	188460	188467	25 %	0 %	25 %	50 %	307543750
4289	NC_014532	CACC	2	8	188610	188617	25 %	0 %	0 %	75 %	307543750
4290	NC_014532	ACG	2	6	188682	188687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543750
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4292	NC_014532	G	6	6	188740	188745	0 %	0 %	100 %	0 %	307543750
4293	NC_014532	CGG	2	6	188755	188760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543750
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4300	NC_014532	GGCC	2	8	189028	189035	0 %	0 %	50 %	50 %	307543750
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4309	NC_014532	TGG	2	6	189405	189410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543750
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4316	NC_014532	CGA	2	6	189760	189765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543750
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4319	NC_014532	GCAC	2	8	189893	189900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4320	NC_014532	AGACG	2	10	189924	189933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4321	NC_014532	TCGAAA	2	12	189958	189969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307543751
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4327	NC_014532	CGA	2	6	190283	190288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543751
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4332	NC_014532	GTC	2	6	190947	190952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543751
4333	NC_014532	TGA	3	9	191000	191008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4334	NC_014532	AGGC	2	8	191056	191063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4335	NC_014532	AAT	2	6	191164	191169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4336	NC_014532	TTC	2	6	191199	191204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4337	NC_014532	T	6	6	191224	191229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4338	NC_014532	AGG	2	6	191231	191236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4339	NC_014532	ATC	2	6	191252	191257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
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4342	NC_014532	AGA	2	6	191505	191510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543752
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4347	NC_014532	GCCTG	2	10	191780	191789	0 %	20 %	40 %	40 %	307543752
4348	NC_014532	ACGA	2	8	191800	191807	50 %	0 %	25 %	25 %	307543752
4349	NC_014532	CAA	2	6	191832	191837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543752
4350	NC_014532	TAC	2	6	191956	191961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
4351	NC_014532	AAGCC	2	10	191967	191976	40 %	0 %	20 %	40 %	307543752
4352	NC_014532	CAT	2	6	192066	192071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
4353	NC_014532	ACG	2	6	192109	192114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543752
4354	NC_014532	TCA	2	6	192149	192154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
4355	NC_014532	TG	3	6	192165	192170	0 %	50 %	50 %	0 %	307543752
4356	NC_014532	GCC	2	6	192202	192207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543752
4357	NC_014532	TGA	2	6	192228	192233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543752
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4360	NC_014532	GCG	2	6	192397	192402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543752
4361	NC_014532	CGGC	2	8	192503	192510	0 %	0 %	50 %	50 %	307543752
4362	NC_014532	GATG	2	8	192567	192574	25 %	25 %	50 %	0 %	307543752
4363	NC_014532	TGG	2	6	192577	192582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543752
4364	NC_014532	TGCT	2	8	192599	192606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4365	NC_014532	T	6	6	192642	192647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_014532	TA	3	6	192694	192699	50 %	50 %	0 %	0 %	307543753
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4484	NC_014532	CAG	2	6	197341	197346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543757
4485	NC_014532	CGCTGA	2	12	197349	197360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543757
4486	NC_014532	ATC	2	6	197378	197383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543757
4487	NC_014532	CGC	2	6	197408	197413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543757
4488	NC_014532	CAGG	2	8	197467	197474	25 %	0 %	50 %	25 %	307543757
4489	NC_014532	CG	3	6	197517	197522	0 %	0 %	50 %	50 %	307543757
4490	NC_014532	GCA	2	6	197553	197558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543757
4491	NC_014532	ATC	2	6	197582	197587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543757
4492	NC_014532	CAG	2	6	197692	197697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543757
4493	NC_014532	CAG	2	6	197701	197706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543757
4494	NC_014532	GGC	2	6	197773	197778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4495	NC_014532	TCT	2	6	197849	197854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543758
4496	NC_014532	CGA	2	6	197882	197887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4497	NC_014532	CGA	2	6	197960	197965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4498	NC_014532	GGC	2	6	198030	198035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543758
4499	NC_014532	CTG	3	9	198048	198056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4500	NC_014532	TCG	2	6	198061	198066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543758

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