MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 92913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014532	CAG	2	6	198096	198101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4502	NC_014532	GCG	2	6	198137	198142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543758
4503	NC_014532	GGC	2	6	198273	198278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543758
4504	NC_014532	GTC	2	6	198324	198329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4505	NC_014532	GCGG	2	8	198341	198348	0 %	0 %	75 %	25 %	307543758
4506	NC_014532	CTG	2	6	198349	198354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4507	NC_014532	GCC	3	9	198369	198377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543758
4508	NC_014532	GAA	2	6	198378	198383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543758
4509	NC_014532	TCC	2	6	198406	198411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543758
4510	NC_014532	TGATC	2	10	198413	198422	20 %	40 %	20 %	20 %	307543758
4511	NC_014532	TGA	2	6	198542	198547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543758
4512	NC_014532	CTG	2	6	198573	198578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4513	NC_014532	GGT	2	6	198686	198691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543758
4514	NC_014532	GCC	2	6	198708	198713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543758
4515	NC_014532	GTG	2	6	198763	198768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543758
4516	NC_014532	GCT	2	6	198791	198796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543758
4517	NC_014532	TG	3	6	198814	198819	0 %	50 %	50 %	0 %	307543758
4518	NC_014532	CGT	2	6	198926	198931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_014532	TCGC	2	8	198979	198986	0 %	25 %	25 %	50 %	307543759
4520	NC_014532	GCG	2	6	198995	199000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543759
4521	NC_014532	CG	3	6	199015	199020	0 %	0 %	50 %	50 %	307543759
4522	NC_014532	GCCGA	2	10	199052	199061	20 %	0 %	40 %	40 %	307543759
4523	NC_014532	CGG	2	6	199143	199148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543759
4524	NC_014532	CG	3	6	199162	199167	0 %	0 %	50 %	50 %	307543759
4525	NC_014532	TCG	2	6	199190	199195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543759
4526	NC_014532	ACC	2	6	199196	199201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543759
4527	NC_014532	TCA	2	6	199239	199244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543759
4528	NC_014532	CG	3	6	199433	199438	0 %	0 %	50 %	50 %	307543759
4529	NC_014532	GGC	2	6	199441	199446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543759
4530	NC_014532	CGC	2	6	199533	199538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543759
4531	NC_014532	GCG	2	6	199567	199572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543759
4532	NC_014532	CAG	2	6	199588	199593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543759
4533	NC_014532	CGG	2	6	199605	199610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543759
4534	NC_014532	CAG	2	6	199642	199647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543759
4535	NC_014532	AGC	2	6	199736	199741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543759
4536	NC_014532	GCGG	2	8	199884	199891	0 %	0 %	75 %	25 %	307543759
4537	NC_014532	CTC	2	6	199921	199926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543760
4538	NC_014532	GTC	2	6	199935	199940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543760
4539	NC_014532	GGC	2	6	199944	199949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543760
4540	NC_014532	TGGCG	2	10	200047	200056	0 %	20 %	60 %	20 %	307543760
4541	NC_014532	CAG	2	6	200067	200072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543760
4542	NC_014532	ACC	2	6	200122	200127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543760
4543	NC_014532	CTC	2	6	200163	200168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543760
4544	NC_014532	GCC	2	6	200169	200174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543760
4545	NC_014532	GGC	2	6	200177	200182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543760
4546	NC_014532	TAG	2	6	200188	200193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543760
4547	NC_014532	GGC	2	6	200328	200333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543760
4548	NC_014532	GGA	2	6	200479	200484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543760
4549	NC_014532	CATCGG	2	12	200528	200539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543760
4550	NC_014532	GCTG	2	8	200549	200556	0 %	25 %	50 %	25 %	307543760
4551	NC_014532	GCG	2	6	200557	200562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543760
4552	NC_014532	CGA	2	6	200572	200577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543760
4553	NC_014532	GGT	2	6	200688	200693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543760
4554	NC_014532	GTC	2	6	200715	200720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543760
4555	NC_014532	GCC	2	6	200801	200806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543760
4556	NC_014532	GA	3	6	200875	200880	50 %	0 %	50 %	0 %	307543760
4557	NC_014532	TCG	2	6	200916	200921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543760
4558	NC_014532	GGC	2	6	200944	200949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543760
4559	NC_014532	GAT	2	6	200963	200968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543761
4560	NC_014532	GTTC	2	8	201009	201016	0 %	50 %	25 %	25 %	307543761
4561	NC_014532	GTCG	2	8	201062	201069	0 %	25 %	50 %	25 %	307543761
4562	NC_014532	GTG	2	6	201081	201086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543761
4563	NC_014532	TGC	2	6	201228	201233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543761
4564	NC_014532	CGT	2	6	201280	201285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543761
4565	NC_014532	GC	3	6	201344	201349	0 %	0 %	50 %	50 %	307543761
4566	NC_014532	CGG	2	6	201380	201385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543761
4567	NC_014532	GGT	2	6	201427	201432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543761
4568	NC_014532	TCG	2	6	201474	201479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543761
4569	NC_014532	CGAG	2	8	201493	201500	25 %	0 %	50 %	25 %	307543761
4570	NC_014532	AGC	2	6	201507	201512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543761
4571	NC_014532	AGGC	2	8	201518	201525	25 %	0 %	50 %	25 %	307543761
4572	NC_014532	CGC	2	6	201526	201531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543761
4573	NC_014532	CGG	2	6	201565	201570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543761
4574	NC_014532	AGG	2	6	201598	201603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543761
4575	NC_014532	CAG	2	6	201605	201610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543761
4576	NC_014532	GCC	2	6	201767	201772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543761
4577	NC_014532	CGG	2	6	201817	201822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543761
4578	NC_014532	GCT	2	6	201835	201840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543761
4579	NC_014532	GA	3	6	201852	201857	50 %	0 %	50 %	0 %	307543761
4580	NC_014532	CGCTCG	2	12	201858	201869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307543761
4581	NC_014532	TGG	2	6	201931	201936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543761
4582	NC_014532	GC	3	6	201999	202004	0 %	0 %	50 %	50 %	307543761
4583	NC_014532	AG	3	6	202205	202210	50 %	0 %	50 %	0 %	307543762
4584	NC_014532	CG	4	8	202213	202220	0 %	0 %	50 %	50 %	307543762
4585	NC_014532	GCA	3	9	202243	202251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543762
4586	NC_014532	GT	3	6	202357	202362	0 %	50 %	50 %	0 %	307543762
4587	NC_014532	TCG	2	6	202371	202376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543762
4588	NC_014532	GC	3	6	202394	202399	0 %	0 %	50 %	50 %	307543762
4589	NC_014532	TCC	2	6	202533	202538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543762
4590	NC_014532	GTA	2	6	202556	202561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543762
4591	NC_014532	GTA	2	6	202568	202573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543762
4592	NC_014532	GAA	2	6	202583	202588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543762
4593	NC_014532	GAT	2	6	202612	202617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543762
4594	NC_014532	CT	3	6	202726	202731	0 %	50 %	0 %	50 %	307543762
4595	NC_014532	CGG	2	6	202752	202757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543762
4596	NC_014532	GAT	2	6	202769	202774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543762
4597	NC_014532	GTC	2	6	202832	202837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543762
4598	NC_014532	GGT	2	6	202892	202897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543762
4599	NC_014532	AT	3	6	202911	202916	50 %	50 %	0 %	0 %	307543762
4600	NC_014532	TGA	2	6	202927	202932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014532	CCTGG	2	10	202971	202980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4602	NC_014532	TGAA	2	8	202983	202990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014532	GCA	2	6	203193	203198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543763
4604	NC_014532	GAT	2	6	203224	203229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543763
4605	NC_014532	CGG	2	6	203274	203279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543763
4606	NC_014532	GAA	2	6	203311	203316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543763
4607	NC_014532	GAC	2	6	203454	203459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543763
4608	NC_014532	CGG	2	6	203471	203476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543763
4609	NC_014532	ACT	2	6	203501	203506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543763
4610	NC_014532	AAG	2	6	203533	203538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543763
4611	NC_014532	GGC	2	6	203596	203601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543763
4612	NC_014532	GGA	2	6	203619	203624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543763
4613	NC_014532	TCA	2	6	203649	203654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543763
4614	NC_014532	GCCGA	2	10	203782	203791	20 %	0 %	40 %	40 %	307543763
4615	NC_014532	CCG	2	6	203818	203823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543763
4616	NC_014532	ATC	2	6	203831	203836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543763
4617	NC_014532	CGA	2	6	203883	203888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543763
4618	NC_014532	CTTC	2	8	203897	203904	0 %	50 %	0 %	50 %	307543763
4619	NC_014532	CTT	2	6	203919	203924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543763
4620	NC_014532	TCT	2	6	204014	204019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543763
4621	NC_014532	GCT	2	6	204062	204067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543763
4622	NC_014532	GCG	2	6	204109	204114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543763
4623	NC_014532	GAA	2	6	204120	204125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543763
4624	NC_014532	GTCG	2	8	204172	204179	0 %	25 %	50 %	25 %	307543763
4625	NC_014532	TACG	2	8	204197	204204	25 %	25 %	25 %	25 %	307543763
4626	NC_014532	TCG	2	6	204221	204226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543763
4627	NC_014532	ACC	2	6	204280	204285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543763
4628	NC_014532	ATGTC	2	10	204380	204389	20 %	40 %	20 %	20 %	307543763
4629	NC_014532	GCCC	2	8	204390	204397	0 %	0 %	25 %	75 %	307543763
4630	NC_014532	GTG	2	6	204427	204432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543763
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4634	NC_014532	GCC	2	6	204676	204681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543764
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4642	NC_014532	AGGA	2	8	205100	205107	50 %	0 %	50 %	0 %	307543764
4643	NC_014532	TCG	2	6	205144	205149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543764
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4653	NC_014532	ACG	2	6	205351	205356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543764
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4662	NC_014532	CTG	2	6	205657	205662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543764
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4670	NC_014532	CT	3	6	206022	206027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4720	NC_014532	CTG	2	6	208329	208334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543767
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4722	NC_014532	AC	3	6	208435	208440	50 %	0 %	0 %	50 %	307543767
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4728	NC_014532	CAT	2	6	208697	208702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543767
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4734	NC_014532	TGGC	2	8	208849	208856	0 %	25 %	50 %	25 %	307543767
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4737	NC_014532	GCC	2	6	208980	208985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543767
4738	NC_014532	GGTGC	2	10	208998	209007	0 %	20 %	60 %	20 %	307543767
4739	NC_014532	TGG	2	6	209020	209025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543767
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4741	NC_014532	TG	3	6	209081	209086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_014532	TGC	3	9	209193	209201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543768
4743	NC_014532	TCCG	2	8	209209	209216	0 %	25 %	25 %	50 %	307543768
4744	NC_014532	CAT	2	6	209219	209224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543768
4745	NC_014532	ACCT	2	8	209231	209238	25 %	25 %	0 %	50 %	307543768
4746	NC_014532	TG	3	6	209291	209296	0 %	50 %	50 %	0 %	307543768
4747	NC_014532	GTT	2	6	209326	209331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543768
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4749	NC_014532	GCT	2	6	209380	209385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543768
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4751	NC_014532	TGC	2	6	209571	209576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543768
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4753	NC_014532	TG	3	6	209637	209642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_014532	CGGC	2	8	209653	209660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4755	NC_014532	CGG	2	6	209747	209752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543769
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4850	NC_014532	G	6	6	214147	214152	0 %	0 %	100 %	0 %	307543772
4851	NC_014532	CAA	2	6	214204	214209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543772
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4863	NC_014532	GGC	2	6	214733	214738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543773
4864	NC_014532	GATCAG	2	12	214772	214783	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307543773
4865	NC_014532	GCC	2	6	214817	214822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543773
4866	NC_014532	TGC	2	6	214842	214847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4867	NC_014532	GCG	2	6	214920	214925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543773
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4882	NC_014532	CGGC	2	8	215547	215554	0 %	0 %	50 %	50 %	307543773
4883	NC_014532	TCC	2	6	215583	215588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543773
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4894	NC_014532	GTC	2	6	215897	215902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
4895	NC_014532	GCT	2	6	215926	215931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543773
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4909	NC_014532	CGG	2	6	216725	216730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543774
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4912	NC_014532	CGAC	2	8	216871	216878	25 %	0 %	25 %	50 %	307543774
4913	NC_014532	GGCCTG	2	12	216915	216926	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307543774
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4923	NC_014532	TCGCG	2	10	217490	217499	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4930	NC_014532	GTC	2	6	217734	217739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543775
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4947	NC_014532	GCCGAT	2	12	218598	218609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543776
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4952	NC_014532	TGT	2	6	218837	218842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543776
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4954	NC_014532	CCACG	2	10	218870	218879	20 %	0 %	20 %	60 %	307543776
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4963	NC_014532	GTT	2	6	219189	219194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4964	NC_014532	GTC	2	6	219195	219200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4965	NC_014532	TGGCC	2	10	219205	219214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4966	NC_014532	GTC	2	6	219278	219283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4967	NC_014532	GAG	2	6	219310	219315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4968	NC_014532	TTCT	2	8	219338	219345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4969	NC_014532	TTTG	2	8	219366	219373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4970	NC_014532	T	6	6	219394	219399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4971	NC_014532	CG	3	6	219561	219566	0 %	0 %	50 %	50 %	307543777
4972	NC_014532	GAG	2	6	219590	219595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543777
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4977	NC_014532	ATG	2	6	219869	219874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543777
4978	NC_014532	TGGAG	2	10	219906	219915	20 %	20 %	60 %	0 %	307543777
4979	NC_014532	GC	3	6	219985	219990	0 %	0 %	50 %	50 %	307543777
4980	NC_014532	TGA	2	6	220146	220151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543778
4981	NC_014532	TCG	2	6	220269	220274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543778
4982	NC_014532	CGT	2	6	220331	220336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543778
4983	NC_014532	TGG	2	6	220356	220361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543778
4984	NC_014532	ATC	2	6	220419	220424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543778
4985	NC_014532	TCG	2	6	220452	220457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543778
4986	NC_014532	TCGT	2	8	220526	220533	0 %	50 %	25 %	25 %	307543778
4987	NC_014532	GT	3	6	220532	220537	0 %	50 %	50 %	0 %	307543778
4988	NC_014532	GGC	2	6	220544	220549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543778
4989	NC_014532	GGT	2	6	220613	220618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543778
4990	NC_014532	GCG	2	6	220717	220722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543778
4991	NC_014532	ATG	2	6	220841	220846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543778
4992	NC_014532	TTGCCA	2	12	220950	220961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307543778
4993	NC_014532	GCC	2	6	220976	220981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543778
4994	NC_014532	GCC	2	6	221078	221083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543778
4995	NC_014532	TGC	2	6	221128	221133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_014532	T	6	6	221165	221170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_014532	ACA	2	6	221199	221204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4998	NC_014532	GC	3	6	221529	221534	0 %	0 %	50 %	50 %	307543779
4999	NC_014532	CAT	2	6	221659	221664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543779
5000	NC_014532	CGTGC	2	10	221677	221686	0 %	20 %	40 %	40 %	307543779

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